FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5722, 870 aa 1>>>pF1KE5722 870 - 870 aa - 870 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8061+/-0.00127; mu= 8.8953+/- 0.075 mean_var=173.3352+/-36.702, 0's: 0 Z-trim(105.8): 174 B-trim: 5 in 1/51 Lambda= 0.097416 statistics sampled from 8427 (8612) to 8427 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 2.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41696.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 870) 5787 826.9 0 CCDS44690.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 975) 5685 812.6 0 CCDS55782.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 909) 5332 763.0 0 CCDS73357.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 852) 4158 598.0 2.4e-170 CCDS44691.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 749) 1680 249.7 1.5e-65 CCDS75072.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 ( 892) 1606 239.3 2.3e-62 CCDS44692.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 334) 1408 211.2 2.6e-54 CCDS56300.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 ( 788) 1336 201.3 5.5e-51 CCDS56301.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 ( 800) 1336 201.3 5.6e-51 CCDS43194.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 ( 904) 1332 200.8 9e-51 CCDS3327.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 ( 926) 1332 200.8 9.2e-51 CCDS45600.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 721) 1294 195.4 3.1e-49 CCDS43967.1 DLG3 gene_id:1741|Hs108|chrX ( 512) 1287 194.3 4.7e-49 CCDS82050.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 724) 1278 193.2 1.5e-48 CCDS45599.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 767) 1278 193.2 1.5e-48 CCDS55439.1 DLG3 gene_id:1741|Hs108|chrX ( 366) 1217 184.3 3.3e-46 CCDS14403.1 DLG3 gene_id:1741|Hs108|chrX ( 817) 1201 182.4 2.9e-45 CCDS7158.1 MPP7 gene_id:143098|Hs108|chr10 ( 576) 577 94.6 5.6e-19 CCDS58325.1 MPP5 gene_id:64398|Hs108|chr14 ( 641) 507 84.8 5.6e-16 CCDS9779.1 MPP5 gene_id:64398|Hs108|chr14 ( 675) 507 84.8 5.8e-16 CCDS42344.1 MPP3 gene_id:4356|Hs108|chr17 ( 585) 435 74.6 5.8e-13 CCDS82135.1 MPP3 gene_id:4356|Hs108|chr17 ( 610) 435 74.6 6e-13 CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630) 440 75.7 7.7e-13 CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655) 440 75.7 7.8e-13 >>CCDS41696.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 (870 aa) initn: 5787 init1: 5787 opt: 5787 Z-score: 4409.0 bits: 826.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5787; 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CCDS44 GVIPSKRRVERKERARLKTVKFNAKPGVIDSKGDI--------------PGLGDDGYGTK 500 510 520 530 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 ETSDPERGQEDLILSYEPVTRQEINYTRPVIILGPMKDRINDDLISEFPDKFGSCVPHTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 TL----RGQEDLILSYEPVTRQEINYTRPVIILGPMKDRINDDLISEFPDKFGSCVPHTT 540 550 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 RPKRDYEVDGRDYHFVISREQMEKDIQEHKFIEAGQYNDNLYGTSVQSVRFVAERGKHCI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 RPKRDYEVDGRDYHFVISREQMEKDIQEHKFIEAGQYNDNLYGTSVQSVRFVAERGKHCI 600 610 620 630 640 650 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 LDVSGNAIKRLQVAQLYPIAIFIKPRSLEPLMEMNKRLTEEQAKKTYDRAIKLEQEFGEY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 LDVSGNAIKRLQVAQLYPIAIFIKPRSLEPLMEMNKRLTEEQAKKTYDRAIKLEQEFGEY 660 670 680 690 700 710 840 850 860 870 pF1KE5 FTAIVQGDTLEDIYNQCKLVIEEQSGPFIWIPSKEKL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FTAIVQGDTLEDIYNQCKLVIEEQSGPFIWIPSKEKL 720 730 740 >>CCDS75072.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 (892 aa) initn: 3955 init1: 1456 opt: 1606 Z-score: 1233.2 bits: 239.3 E(32554): 2.3e-62 Smith-Waterman score: 3974; 70.8% identity (83.5% similar) in 878 aa overlap (8-870:100-892) 10 20 30 pF1KE5 MFFACYCALRTNVKKYRYQDEDAP-HDHSLPRLTHEV .: .:.::::::::.: ..: :..:.:: CCDS75 SKPSEPIQPVNTWEISSLPSSTVTSETLPSSLSPSVEKYRYQDEDTPPQEHISPQITNEV 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 RGPELVHVSEKNLSQIENVHGYVLQSHISPLKASPAPIIVNTDTLDTIPYVNGTEIEYEF :::::::::::::.::::::.: .:::::.::.: :..::::.:.: :::::. .::. CCDS75 IGPELVHVSEKNLSEIENVHGFVSHSHISPIKANPPPVLVNTDSLETPTYVNGTDADYEY 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 EEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFITKIIPGGAAAEDGRLRVNDCILRVNEV :::::::::::::::::::::::::::: .::::::: :::::.:::::::::::::::: CCDS75 EEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDSSIFITKIITGGAAAQDGRLRVNDCILRVNEV 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 DVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRRPILETVVEIKLFKGPKGLGFSIAGGVGNQHI :: .:.:::::::::::::::::::.::.:. : ..::::.::::::::::::::::::: CCDS75 DVRDVTHSKAVEALKEAGSIVRLYVKRRKPVSEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHI 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 PGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGDRLLMVNNYSLEEVTHEEAVAILKNTSEVVYLKV ::::::::::::.::::.:::.::.::.:: ::: ::::::::::. :::::. ::::: CCDS75 PGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNNVCLEEVTHEEAVTALKNTSDFVYLKV 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 GKPTTIYMTDPYGPPDITHSYSPPMENHLLSGNNGTLEYKTSLPPISPGRYSPIPKHMLV .:::..::.: :.:::::.: : :..::. . ... .: : ::.::::. : .: CCDS75 AKPTSMYMNDGYAPPDITNSSSQPVDNHV---SPSSFLGQT---PASPARYSPVSKAVLG 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 DDDYTRPPEPVYSTVNKLCDKPASPRHYSPVECDKSFLLSAPYSHYHLGLLPDSEMTSHS ::. :: CCDS75 DDEITR------------------------------------------------------ 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 QHSTATRQPSMTLQRAVSLEGEPRKVVLHKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPAD ::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::: CCDS75 ---------------------EPRKVVLHRGSTGLGFNIVGGEDGEGIFISFILAGGPAD 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 LSGELQRGDQILSVNGIDLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPEDYARFEAKIHDLR :::::..::.:.:::..:::.:::::::::::.:::.:::.:::.::.:.:::::::::: CCDS75 LSGELRKGDRIISVNSVDLRAASHEQAAAALKNAGQAVTIVAQYRPEEYSRFEAKIHDLR 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 EQMMNHSMSSGSGSLRTNQKRSLYVRAMFDYDKSKDSGLPSQGLSFKYGDILHVINASDD ::::: :.:::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.::.:::::::::::: CCDS75 EQMMNSSISSGSGSLRTSQKRSLYVRALFDYDKTKDSGLPSQGLNFKFGDILHVINASDD 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 EWWQARRVMLEGDSEEMGVIPSKRRVERKERARLKTVKFNAKPGVIDSKGSFNDKRKKSF ::::::.: .:.:.:.::::::::::.::::::::::::.: .::::::::::. 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CCDS56 GFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNNVCLEEVTHEEAVT 220 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 ILKNTSEVVYLKVGKPTTIYMTDPYGPPDITHSYSPPMENHLLSGNNGTLEYKTSLPPIS :::::. :::::.:::..::.: :.:::::.: : :..::. . ... .: : : CCDS56 ALKNTSDFVYLKVAKPTSMYMNDGYAPPDITNSSSQPVDNHV---SPSSFLGQT---PAS 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 PGRYSPIPKHMLVDDDYTRPPEPVYSTVNKLCDKPASPRHYSPVECDKSFLLSAPYSHYH :.::::. : .: ::. :: CCDS56 PARYSPVSKAVLGDDEITR----------------------------------------- 330 340 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 LGLLPDSEMTSHSQHSTATRQPSMTLQRAVSLEGEPRKVVLHKGSTGLGFNIVGGEDGEG ::::::::.::::::::::::::::: CCDS56 ----------------------------------EPRKVVLHRGSTGLGFNIVGGEDGEG 350 360 370 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 IFVSFILAGGPADLSGELQRGDQILSVNGIDLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPE ::.:::::::::::::::..::.:.:::..:::.:::::::::::.:::.:::.:::.:: CCDS56 IFISFILAGGPADLSGELRKGDRIISVNSVDLRAASHEQAAAALKNAGQAVTIVAQYRPE 380 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 DYARFEAKIHDLREQMMNHSMSSGSGSLRTNQKRSLYVRAMFDYDKSKDSGLPSQGLSFK .:.::::::::::::::: :.:::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.:: CCDS56 EYSRFEAKIHDLREQMMNSSISSGSGSLRTSQKRSLYVRALFDYDKTKDSGLPSQGLNFK 440 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 pF1KE5 YGDILHVINASDDEWWQARRVMLEGDSEEMGVIPSKRRVERKERARLKTVKFNAKPGVID .::::::::::::::::::.: .:.:.:.::::::::::.::::::::::::.: CCDS56 FGDILHVINASDDEWWQARQVTPDGESDEVGVIPSKRRVEKKERARLKTVKFNSK---TR 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KE5 SKGSFNDKRKKSFIFSRKFPFYKNKEQSEQETSDPERGQEDLILSYEPVTRQEINYTRPV .:: . : . :. . . ... :..:.: ::::. .::::::..::.:::::: CCDS56 DKGEIPDD-----MGSKGLK-HVTSNASDSESS--YRGQEEYVLSYEPVNQQEVNYTRPV 550 560 570 580 590 600 690 700 710 720 730 740 pF1KE5 IILGPMKDRINDDLISEFPDKFGSCVPHTTRPKRDYEVDGRDYHFVISREQMEKDIQEHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: CCDS56 IILGPMKDRINDDLISEFPDKFGSCVPHTTRPKRDYEVDGRDYHFVTSREQMEKDIQEHK 610 620 630 640 650 660 750 760 770 780 790 800 pF1KE5 FIEAGQYNDNLYGTSVQSVRFVAERGKHCILDVSGNAIKRLQVAQLYPIAIFIKPRSLEP ::::::::..:::::::::: :::.:::::::::::::::::.::::::.:::::.:.: CCDS56 FIEAGQYNNHLYGTSVQSVREVAEKGKHCILDVSGNAIKRLQIAQLYPISIFIKPKSMEN 670 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KE5 LMEMNKRLTEEQAKKTYDRAIKLEQEFGEYFTAIVQGDTLEDIYNQCKLVIEEQSGPFIW .::::::::::::.::..::.:::::: :.:::::::::::::::: : .:::::: .:: CCDS56 IMEMNKRLTEEQARKTFERAMKLEQEFTEHFTAIVQGDTLEDIYNQVKQIIEEQSGSYIW 730 740 750 760 770 780 870 pF1KE5 IPSKEKL .:.:::: CCDS56 VPAKEKL >>CCDS56301.1 DLG1 gene_id:1739|Hs108|chr3 (800 aa) initn: 3724 init1: 1259 opt: 1336 Z-score: 1028.7 bits: 201.3 E(32554): 5.6e-51 Smith-Waterman score: 3527; 68.6% identity (81.4% similar) in 821 aa overlap (56-870:64-800) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 DHSLPRLTHEVRGPELVHVSEKNLSQIENVHGYV--LQSHISPLKASPAPIIVNTDTLDT :... .. : .:.: :..::::.:.: CCDS56 HWAKKGSSDELQAEPEPSRWQQIVAFFTRRHSFIDCISVATSSTQANPPPVLVNTDSLET 40 50 60 70 80 90 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 IPYVNGTEIEYEFEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFITKIIPGGAAAEDGR :::::. .::.:::::::::::::::::::::::::::: .::::::: :::::.::: CCDS56 PTYVNGTDADYEYEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDSSIFITKIITGGAAAQDGR 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 LRVNDCILRVNEVDVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRRPILETVVEIKLFKGPKGL ::::::::::::::: .:.:::::::::::::::::::.::.:. : ..::::.:::::: CCDS56 LRVNDCILRVNEVDVRDVTHSKAVEALKEAGSIVRLYVKRRKPVSEKIMEIKLIKGPKGL 160 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 GFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGDRLLMVNNYSLEEVTHEEAVA :::::::::::::::::::::::::.::::.:::.::.::.:: ::: ::::::::::. 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