Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8470, 822 aa
1>>>pF1KB8470 822 - 822 aa - 822 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0124+/-0.00193; mu= -18.2095+/- 0.106
mean_var=633.9392+/-147.817, 0's: 0 Z-trim(105.4): 324 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.050939
statistics sampled from 8120 (8394) to 8120 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 5638 431.4 3e-120
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 3621 283.0 9.4e-76
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 3209 252.6 1.1e-66
CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 553) 3204 252.3 1.6e-66
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 3204 252.5 2.1e-66
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 2118 172.7 2.2e-42
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 2104 171.7 4.5e-42
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 1622 136.2 2e-31
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 1622 136.3 2e-31
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 1615 135.7 2.9e-31
CCDS32322.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 839) 1425 121.8 4.8e-27
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 1385 118.7 3e-26
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 860 80.3 1.6e-14
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 847 79.6 4.1e-14
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 847 79.6 4.1e-14
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 847 79.6 4.1e-14
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 847 79.6 4.1e-14
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 831 78.1 6.3e-14
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 831 78.2 6.9e-14
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 831 78.2 7e-14
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 831 78.2 7.1e-14
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 820 77.4 1.3e-13
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 822 77.7 1.4e-13
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 808 76.5 2.2e-13
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 793 75.7 7.2e-13
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 783 74.7 8.2e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 764 73.2 2e-12
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 761 73.0 2.3e-12
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 761 73.0 2.4e-12
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 757 72.7 2.8e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 752 72.3 3.3e-12
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 749 72.2 4.7e-12
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 732 70.8 9.1e-12
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 734 71.1 1.1e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 730 70.7 1.1e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 724 70.1 1.2e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 726 70.4 1.3e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 726 70.4 1.3e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 725 70.3 1.3e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 726 70.4 1.4e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 726 70.4 1.4e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 724 70.2 1.4e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 725 70.3 1.4e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 726 70.4 1.4e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 724 70.2 1.4e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 725 70.3 1.4e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 725 70.4 1.5e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 725 70.4 1.5e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 724 70.3 1.5e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 720 69.9 1.7e-11
>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (822 aa)
initn: 5638 init1: 5638 opt: 5638 Z-score: 2272.4 bits: 431.4 E(32554): 3e-120
Smith-Waterman score: 5638; 100.0% identity (100.0% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 VKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPTELTQSQMLHIAQQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPTELTQSQMLHIAQQI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 AAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 PPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB8 EVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
790 800 810 820
>>CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (537 aa)
initn: 3649 init1: 3621 opt: 3621 Z-score: 1473.5 bits: 283.0 E(32554): 9.4e-76
Smith-Waterman score: 3621; 99.8% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
>>CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (477 aa)
initn: 3209 init1: 3209 opt: 3209 Z-score: 1310.4 bits: 252.6 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 3209; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGFVLFHKIPLDG
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
>>CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (553 aa)
initn: 3607 init1: 3201 opt: 3204 Z-score: 1307.7 bits: 252.3 E(32554): 1.6e-66
Smith-Waterman score: 3579; 96.9% identity (97.1% similar) in 545 aa overlap (1-529:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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470 480 490 500 510 520
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
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:: :: : .: .::: : : : . :. .: :.: :.::..::: .:
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::. . .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: : : :.::::: :..
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:: .... ..:.:::.: .....:: ..: .: :: ... ::::.:: . ...:.
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.:.:.:.. : : .: .. : .: :. .: ..:..:.:.: ..:.:::.:: .
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. :: :::.. : .. :: : . :: :.:.::: :.:.:..:: : ::: : :
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: . : .::: ...:::.:::.::::::: : .. :..::. : .
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:. : .... : : :: : .. ..: .: .:. . : :::.:
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:.. : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
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:::::::: .. ::::.::::::..::::::::::::::::::::::: : .::.::
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:::.::: . :::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
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:::::::.....:.: :: :::::::.:::.:::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS10 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEI
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pF1KB8 FTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTL
::::::::.::::.::::::::::::.:::.::.:::..:::::::::..: ::: :. .
CCDS10 FTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKI
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810 820
pF1KB8 LQNLAKASPVYLDILG
:. :.::.:.::::::
CCDS10 LHALGKATPIYLDILG
810 820
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::. . .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: : : :.::::: :..
CCDS58 GLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQL
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pF1KB8 LQE-AKSSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSV
:: .... ..:.:::.: .....:: ..: .: :: ... ::::.:: . ...:.
CCDS58 WQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 AGDPVPNMYWDVGNL--VSKH---MNETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGED
.:.:.:.. : : .: .. : .: :. .: ..:..:.:.: ..:.:::.:: .
CCDS58 SGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 QDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIH
. :: :::.. : .. :: : . :: :.:.::: :.:.:..:: : ::: : :
CCDS58 NASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKII----H
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: . : .::: ...:::.:::.::::::: : .. :..::. : .
CCDS58 VEYYQEGEISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEP---------F
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: ..... : : :: : .. ..: .: .:. . : :::.:
CCDS58 P----------VDEVSPT-------PPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFA--CVLLVVL
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pF1KB8 FLL--KLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIP
:.. : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
CCDS58 FVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIP
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:::::::: .. ::::.::::::..::::::::::::::::::::::: : .::.::
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:::.::: . :::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
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:::::::.....:.: :: :::::::.:::.:::::::::::::::::::::::
CCDS58 RAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGA
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pF1KB8 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS58 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEI
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pF1KB8 FTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTL
::::::::.::::.::::::::::::.:::.::.:::..:::::::::..: ::: :. .
CCDS58 FTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKI
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pF1KB8 LQNLAKASPVYLDILG
:. :.::.:.::::::
CCDS58 LHALGKATPIYLDILG
810
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pF1KB8 RIWCSDPSPGIVAFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDS
.: ::..:. .. :... ::::::: :
CCDS30 SVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKS
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pF1KB8 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
::.::: :: . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :..
CCDS30 GLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQR
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pF1KB8 LQEAK--SSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCS
.: . :. : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.
CCDS30 WEEEGLGGVPE-QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQ
140 150 160 170 180
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pF1KB8 VAGDPVPNMYWDVGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQD
: : . . : . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. .
CCDS30 VEGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEV
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CCDS11 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
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pF1KB8 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
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CCDS11 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
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pF1KB8 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
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CCDS11 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSF-PAS
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CCDS11 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR
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CCDS11 PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGS----GL-QGHIIENPQYFS--------
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]