Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9655
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9655, 682 aa
1>>>pF1KB9655 682 - 682 aa - 682 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0979+/-0.000957; mu= 7.8084+/- 0.058
mean_var=158.8520+/-31.969, 0's: 0 Z-trim(111.3): 31 B-trim: 296 in 1/49
Lambda= 0.101760
statistics sampled from 12254 (12283) to 12254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 4706 703.0 3.5e-202
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 1465 227.2 6.1e-59
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 1268 198.3 3e-50
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 1220 191.1 2.6e-48
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 1127 177.6 4.2e-44
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 677 111.4 2.8e-24
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 673 110.9 4.8e-24
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 664 109.5 1.1e-23
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 663 109.5 1.7e-23
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 651 107.7 4.3e-23
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 653 108.0 4.8e-23
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 650 107.6 5.6e-23
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 648 107.2 6.3e-23
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 648 107.2 6.3e-23
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 628 104.2 3.6e-22
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 635 105.7 9.3e-22
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 635 105.8 9.9e-22
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 616 102.4 1.2e-21
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 616 102.5 1.3e-21
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 608 101.3 3.4e-21
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 608 101.4 4e-21
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 600 100.2 8e-21
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 583 97.6 4e-20
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 512 87.2 5.4e-17
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 500 85.4 1.6e-16
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 489 83.8 5.7e-16
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 404 71.5 5e-12
>>CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 (682 aa)
initn: 4706 init1: 4706 opt: 4706 Z-score: 3743.3 bits: 703.0 E(32554): 3.5e-202
Smith-Waterman score: 4706; 100.0% identity (100.0% similar) in 682 aa overlap (1-682:1-682)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQLEHCLSPSIMLSKKFLNVSSSYPHSGGSELVLHDHPIISTTDNLERSSPLKKITRGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MQLEHCLSPSIMLSKKFLNVSSSYPHSGGSELVLHDHPIISTTDNLERSSPLKKITRGMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NQSDTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQSDTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQSAATAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SAMFPYPGQHGPAHPAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SAMFPYPGQHGPAHPAFSIGSPSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYPTAGYPYPQQY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHSYQGAPFYQFSSTQPGLVPGKAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 RQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 PGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 DPSGWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPSGWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 AEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQAKRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQAKRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLA
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 QRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
670 680
>>CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 (705 aa)
initn: 1677 init1: 1363 opt: 1465 Z-score: 1171.6 bits: 227.2 E(32554): 6.1e-59
Smith-Waterman score: 1902; 52.6% identity (71.6% similar) in 624 aa overlap (94-680:133-703)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQ-SAATAPSA
:.:.:. ...:: : :: :: : .:: .
CCDS63 GRKGSPCGEEELPSAAAAAAAAAAAAAATARYSMDSLSSERYYL-QSPGPQGSELAAPCS
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170
pF1KB9 MFPYPGQ----HGPAHPA-----FSIGS---PSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYP
.::: . :::..:: . :: :. . : . .. . .: :
CCDS63 LFPYQAAAGAPHGPVYPAPNGARYPYGSMLPPGGFPAAVCPPGRAQFGPGAGAGSGAGGS
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210
pF1KB9 TAGYPYPQQYGHSYQGAPFY------QFSSTQPGL----VPG---KAQVYLCNRPLWLKF
..: : : .: ::::.: ... :: ::: .:.::::::::::::
CCDS63 SGGGGGPGTYQYS-QGAPLYGPYPGAAAAGSCGGLGGLGVPGSGFRAHVYLCNRPLWLKF
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKA
::::::::::::::::::::::::.::.::::::.::.:.::::::::::::::: ::::
CCDS63 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPNHWRFQGGKWVTCGKA
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 DTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRL
:.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::
CCDS63 DNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNTQMIVLQSLHKYQPRL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDT
:.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS63 HIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 IYTGCDMDRLTPSPNDSPRS-QIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPG
.::. . :::::::.::::: :::::.::.. ::. . ::.. .::.. :
CCDS63 MYTASENDRLTPSPTDSPRSHQIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLPQARYYNG--------
470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAASAYDTATDFAGNAAT
.:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::.. :.::. :.:.. ...:
CCDS63 -ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--SSYESEY----TSST
520 530 540 550 560
520 530 540 550 560
pF1KB9 LLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPN
:: : :.:.:::: :.. :::: ::. :::.:. : : .. :: : .
CCDS63 LLPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ---RKMAAGLP-WTS
570 580 590 600 610
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 SAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSS
. .: . : . :. : : :. ::::::: ::::.::.
CCDS63 RT---------SPTVFSEDQ-LSKE------------KVKEEIGSSWIETPPSIKSLDSN
620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 DSGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
:::.: .: ::::.::... .:.: .: : . .. :. .: ..:::.::.
CCDS63 DSGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKGMGGYYAFYTTP
660 670 680 690 700
>>CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 (686 aa)
initn: 1650 init1: 1219 opt: 1268 Z-score: 1015.5 bits: 198.3 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1768; 50.4% identity (69.0% similar) in 623 aa overlap (94-680:133-684)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DTDNFPDSKDSPGDVQRSKLSPVLDGVSELRHSFDGSAADRYLLSQSSQPQ-SAATAPSA
:.:.:. ...:: : :: :: : .:: .
CCDS26 GRKGSPCGEEELPSAAAAAAAAAAAAAATARYSMDSLSSERYYL-QSPGPQGSELAAPCS
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170
pF1KB9 MFPYPGQ----HGPAHPA-----FSIGS---PSRYMAHHPVITNGAYNSLLSNSSPQGYP
.::: . :::..:: . :: :. . : . .. . .: :
CCDS26 LFPYQAAAGAPHGPVYPAPNGARYPYGSMLPPGGFPAAVCPPGRAQFGPGAGAGSGAGGS
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210
pF1KB9 TAGYPYPQQYGHSYQGAPFY------QFSSTQPGL----VPG---KAQVYLCNRPLWLKF
..: : : .: ::::.: ... :: ::: .:.::::::::::::
CCDS26 SGGGGGPGTYQYS-QGAPLYGPYPGAAAAGSCGGLGGLGVPGSGFRAHVYLCNRPLWLKF
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKA
::::::::::::::::::::::::.::.::::::.::.:.::::::::::::::: ::::
CCDS26 HRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPNHWRFQGGKWVTCGKA
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 DTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNGQMVVLQSLHKYQPRL
:.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::
CCDS26 DNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNTQMIVLQSLHKYQPRL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDT
:.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS26 HIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 IYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKARFHPGAGAGPGPGT
. :::::.::.. ::. . ::.. .::.. :
CCDS26 SH------------------QIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLPQARYYNG---------
470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 DRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAASAYDTATDFAGNAATL
.:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::.. :.::. :.:.. ...::
CCDS26 ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--SSYESEY----TSSTL
500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KB9 LSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQYCGTKSGSVLPCWPNS
: : :.:.:::: :.. :::: ::. :::.:. : : .. :: : .
CCDS26 LPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ---RKMAAGLP-WTSR
550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 AAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDSSWIETPSSIKSIDSSD
. .: . : . :. : : :. ::::::: ::::.::.:
CCDS26 T---------SPTVFSEDQ-LSKE------------KVKEEIGSSWIETPPSIKSLDSND
600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 SGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKDISGYYGFYSHS
::.: .: ::::.::... .:.: .: : . .. :. .: ..:::.::.
CCDS26 SGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKGMGGYYAFYTTP
640 650 660 670 680
>>CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 (410 aa)
initn: 1418 init1: 1158 opt: 1220 Z-score: 980.7 bits: 191.1 E(32554): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 1585; 56.4% identity (76.0% similar) in 459 aa overlap (233-680:1-408)
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KAQVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPN
:::::::::.::.::::::.::.:.:::::
CCDS63 MFPFLSFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPN
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 HWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEISFGKLKLTNNKGASNNNG
:::::::::: :::::.:.:::..:.::.:::::.::::::::::::::::::::.:::
CCDS63 HWRFQGGKWVTCGKADNNMQGNKMYVHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNT
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 QMVVLQSLHKYQPRLHVVEVNEDGTEDTSQPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKI
::.:::::::::::::.:::.:::.:: ..:...::::: ::::::::::::::::::::
CCDS63 QMIVLQSLHKYQPRLHIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKI
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 DHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRS-QIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYA
::::::::::::::..::. . :::::::.::::: :::::.::.. ::. . ::..
CCDS63 DHNPFAKGFRDNYDSMYTASENDRLTPSPTDSPRSHQIVPGGRYGVQ-SFFPEPFVNTLP
160 170 180 190 200
450 460 470 480 490
pF1KB9 KARFHPGAGAGPGPGTDRSVPHTNGLLSPQQAEDPGAPSPQRWFVTPAN----NRLDFAA
.::.. : .:.::.:::::::::.:. . : ::::.:::.. :.::.
CCDS63 QARYYNG---------ERTVPQTNGLLSPQQSEEVANP-PQRWLVTPVQQPGTNKLDI--
210 220 230 240 250
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 SAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGCTGRPLGYYADPS-----GWGARSPPQ
:.:.. ...::: : :.:.:::: :.. :::: ::. :::.:. :
CCDS63 SSYESEY----TSSTLLPY---GIKSLPLQ----TSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQ
260 270 280 290 300
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 YCGTKSGSVLPCWPNSAAAAARMAGANPYLGEEAEGLAAERSPLPPGAAEDAKPKDLSDS
: .. :: : . .. : . : . :. : : :. :
CCDS63 R---KMAAGLP-WTSRTS---------PTVFSE-DQLSKE------------KVKEEIGS
310 320 330 340
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 SWIETPSSIKSIDSSDSGIYEQA-KRRRISPADTPVSESSSPLKSEVLAQRDCEKNCAKD
:::::: ::::.::.:::.: .: ::::.::... .:.: .: : . .. :. .:
CCDS63 SWIETPPSIKSLDSNDSGVYTSACKRRRLSPSNSS-NENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKG
350 360 370 380 390
680
pF1KB9 ISGYYGFYSHS
..:::.::.
CCDS63 MGGYYAFYTTP
400 410
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:::: :: :. .:. : : :
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: :: .:. .. .:: : :: :. . : : : ... :: : :: .:
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: :. :: ::..::::::::::::::::::::...::.::.:: .::::.:.: .:::.:
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.:::: ::::. .. :::.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::: ::.::
CCDS11 SGKWVQCGKAEGSMPGNRLYVHPDSPNTGAHWMRQEVSFGKLKLTNNKGASNNVTQMIVL
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:::::::::::.::::. : . . . .. ::: ::::::::::::..:::::::.:::
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:::::.:....::. : . ::: .: :.. : .:. .: .:. . .::.:
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:: . : . :: :. .: .. .:..
CCDS11 DL---PGQAKD---------VVPQA----------YWLGAPRDH-------SYEAE----
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. :...: : .: : ..:: : . .: .: ::
CCDS11 --------FRAVSMKPAFLPSA--PGPTMSYY---RGQEVLAPG------AG-----WPV
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. .:. :. . . . : : : ::..: :.: . : : . :. .:
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::::. : ..::::.:: . ..::::
CCDS11 SDSGLGEGDSKRRRVSPYPSS-GDSSSPAGAPSPFDKEAEGQFYNYFPN
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. :.:.::::::.:.:.. . .. . : . .: :::: ::.:::::: .::::::
CCDS10 I-LHSMHKYQPRIHLVRAAQLCSQ---HWGGMASFRFPETTFISVTAYQNPQITQLKIAA
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pF1KB9 NPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFLQDQFVSNYAKAR
::::::::.: .: .: :. .. . : . : . ..
CCDS10 NPFAKGFRENG----RNCKRER------DARVKRKLRGPEPAATEAY-------------
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:.: :: : .. .:.:: :: ::.: . ... ::
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..: . .. : : .: .: :.:: .. :: ...: .: : . : :
CCDS10 APSHLPTRSPSFPEAPD-SGRSAP---YSAAFLE-LP-HGSGGSGYPAAPPAVPFAPHFL
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CCDS10 QGGPFPLPYTAPGGYLDVGSKPMY
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::: . ...::.: ..: ...:.. :: ....: .:: :::. . : :.:.::::
CCDS91 MFPSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFADNKWSVTGKAEPAMPG-RLYVHPDS
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: :::::::: .:: :::::::. . :. ..:.:.::::::::.:...:. :...
CCDS91 PATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNH--LDPFGH-IILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKN
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:. : .:::: :::::.::: ::::::..:::::::: . : .. :.
CCDS91 TA----FCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDM-----ELHRM--
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: .: . .:: : : .... .::.. : . .:.. ...: :
CCDS91 SRMQSKEYPVVP--R-----STVRQKVASNHS-----------PFSSESRALSTSSNLGS
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: :. :. .:.. .. : :
CCDS91 QYQCEN-GVSGPSQDLLPPPNPYPLPQEHSQIYHCTKRKEEECSTTDHPYKKPYMETSPS
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CCDS91 MEGIKVFLHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRRMF
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pF1KB9 PFLSFNISGLDPTAHYNIFVDVILADPNHWRFQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPN
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CCDS91 PSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFADNKWSVTGKAEPAMPG-RLYVHPDSPA
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:::::::: .:: :::::::. . :. ..:.:.::::::::.:...:. :...:.
CCDS91 TGAHWMRQLVSFQKLKLTNNH--LDPFGH-IILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKNTA
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pF1KB9 QPGRVQTFTFPETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSP
: .:::: :::::.::: ::::::..:::::::: . : .. :. :
CCDS91 ----FCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDM-----ELHRM--SR
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.: . .:: : .... .::.. : . .:.. ...: :
CCDS91 MQSKEYPVVPR-------STVRQKVASNHS-----------PFSSESRALSTSSNLGSQY
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pF1KB9 QAEDPGAPSPQRWFVTPANNRLDFAASAYDTATDFAGNAATLLSYAAAGVKALPLQAAGC
: :. :. .:.. .. : :
CCDS91 QCEN-GVSGPSQDLLPPPNPYPLPQEHSQIYHCTKRKEEECSTTDHPYKKPYMETSPSEE
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CCDS11 MREPALAASAMAYHPFHAPRPADFPMSAFLAAAQP
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CCDS11 SFFPALALPPGALAK-PLPDPGLAGAAAAAAAAAAAAEAGL-HVSALGPHPPAAHLRSLK
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CCDS11 SLEPEDEVEDDPKVTLEAKELWDQFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYIL
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CCDS11 LMDIVAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEMP-KRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLT
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CCDS11 NN--ISDKHG-FTILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYST---FRTYVFPETDFIAVTAY
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pF1KB9 QNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGARYAMAGSFL
:: :::::::.:::::::::
CCDS11 QNDKITQLKIDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLPSLRLYEEHCKPERDGAESDASSCD
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CCDS13 MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPRE
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CCDS13 PP---PPPPRY---DPC-AAAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAA
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CCDS13 AA--KAPVKKNAKVAG-VSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDP
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pF1KB9 TAHYNIFVDVILADPNHWR--FQGGKWVPCGKADTNVQGNRVYMHPDSPNTGAHWMRQEI
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CCDS13 MADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADPATPG-RVHYHPDSPAKGAQWMKQIV
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:: ::::::: ..::. ..:.:.:.::::.::: :. . .::.: ::
CCDS13 SFDKLKLTNN--LLDDNGH-IILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEET
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pF1KB9 QFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPFAKGFRDNYDTIYTGCDMDRLTPSPNDSPRSQIVPGA-
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CCDS13 RFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRD--------CD-------PEDWPRNH-RPGAL
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CCDS13 PLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKDAAEARREFQRDAG-GPAVLGDPAHPPQLLARVLSP
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. . ::::. . .: : .: . : . . . ::. : .
CCDS13 SLPGAGGAGGLVPLPGAPGGRP---SPPNPELRLEAPGASEPLHHHPYKYPAAAYDHYLG
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: . : : :. ::. : .. :.. . : : .::::: :.:
CCDS13 AKSRPAPYPLPGLRGH--GYH--P-----HAHPHH---HHHPVSPAAAAAAAAAAAAAAA
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: : . : : :::. : :.
CCDS13 NMY---SSAGAA------PPGSY-DYCPR
480 490
682 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]