Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2239
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2239, 433 aa
  1>>>pF1KE2239 433 - 433 aa - 433 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1918+/-0.00112; mu= -0.5274+/- 0.068
 mean_var=192.3700+/-37.288, 0's: 0 Z-trim(109.5): 42  B-trim: 47 in 1/52
 Lambda= 0.092471
 statistics sampled from 10866 (10899) to 10866 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.335), width:  16
 Scan time:  2.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3997.1 CCNB1 gene_id:891|Hs108|chr5            ( 433) 2834 390.6 1.6e-108
CCDS10170.1 CCNB2 gene_id:9133|Hs108|chr15         ( 398) 1311 187.4 2.1e-47
CCDS3723.1 CCNA2 gene_id:890|Hs108|chr4            ( 432)  617 94.9 1.7e-19
CCDS14331.1 CCNB3 gene_id:85417|Hs108|chrX         (1395)  603 93.3 1.7e-18
CCDS45031.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13         ( 421)  584 90.5 3.5e-18
CCDS45030.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13         ( 464)  584 90.5 3.8e-18
CCDS9357.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13          ( 465)  584 90.5 3.8e-18
CCDS14332.1 CCNB3 gene_id:85417|Hs108|chrX         ( 291)  414 67.7 1.7e-11


>>CCDS3997.1 CCNB1 gene_id:891|Hs108|chr5                 (433 aa)
 initn: 2834 init1: 2834 opt: 2834  Z-score: 2062.0  bits: 390.6 E(32554): 1.6e-108
Smith-Waterman score: 2834; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MALRVTRNSKINAENKAKINMAGAKRVPTAPAATSKPGLRPRTALGDIGNKVSEQLQAKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MALRVTRNSKINAENKAKINMAGAKRVPTAPAATSKPGLRPRTALGDIGNKVSEQLQAKM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 PMKKEAKPSATGKVIDKKLPKPLEKVPMLVPVPVSEPVPEPEPEPEPEPVKEEKLSPEPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PMKKEAKPSATGKVIDKKLPKPLEKVPMLVPVPVSEPVPEPEPEPEPEPVKEEKLSPEPI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LVDTASPSPMETSGCAPAEEDLCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LVDTASPSPMETSGCAPAEEDLCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 LEEEQAVRPKYLLGREVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LEEEQAVRPKYLLGREVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KKMLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KKMLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 LPLHFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LPLHFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 WTPTLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 WTPTLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNS
              370       380       390       400       410       420

              430   
pF1KE2 ALVQDLAKAVAKV
       :::::::::::::
CCDS39 ALVQDLAKAVAKV
              430   

>>CCDS10170.1 CCNB2 gene_id:9133|Hs108|chr15              (398 aa)
 initn: 1228 init1: 1198 opt: 1311  Z-score: 964.5  bits: 187.4 E(32554): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1311; 52.7% identity (77.2% similar) in 395 aa overlap (40-427:6-391)

      10        20        30        40          50        60       
pF1KE2 KINAENKAKINMAGAKRVPTAPAATSKPGLRPRTA--LGDIGNKVSEQLQAKMPMKKEAK
                                     :: ..  : .: . :. ...... ... . 
CCDS10                          MALLRRPTVSSDLENIDTGVNSKVKSHVTIRRTVL
                                        10        20        30     

        70          80          90       100       110       120   
pF1KE2 PSATGKVIDK--KLPKPLE--KVPMLVPVPVSEPVPEPEPEPEPEPVKEEKLSPEPILVD
           ..:  .  .. :  .  :::.  :. ...   . .:    .::. :::.:.     
CCDS10 EEIGNRVTTRAAQVAKKAQNTKVPVQ-PTKTTNVNKQLKPTASVKPVQMEKLAPK-----
          40        50        60         70        80              

           130       140       150        160       170       180  
pF1KE2 TASPSPMETSGCAPAEEDLCQAFSDVILA-VNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQLE
         ::.: ..:     ::.:::::::..:  ..:.: ::  .:.:::.:::::: ::::::
CCDS10 GPSPTPEDVS---MKEENLCQAFSDALLCKIEDIDNEDWENPQLCSDYVKDIYQYLRQLE
      90          100       110       120       130       140      

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE2 EEQAVRPKYLLGREVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKK
         :.. :..: ::...: :::::.::::::. ::::::::.:: :.:.:::.: . : .:
CCDS10 VLQSINPHFLDGRDINGRMRAILVDWLVQVHSKFRLLQETLYMCVGIMDRFLQVQPVSRK
        150       160       170       180       190       200      

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE2 MLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRPLP
        :::::.::...:::::::. :.: ::...:::.::. :::.::  ::. :.: ::::::
CCDS10 KLQLVGITALLLASKYEEMFSPNIEDFVYITDNAYTSSQIREMETLILKELKFELGRPLP
        210       220       230       240       250       260      

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE2 LHFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWT
       ::::::::: ::::::::::::::::::..::::::. ::..::.: ::. :.: .:.:.
CCDS10 LHFLRRASKAGEVDVEQHTLAKYLMELTLIDYDMVHYHPSKVAAAASCLSQKVLGQGKWN
        270       280       290       300       310       320      

            370       380       390       400       410       420  
pF1KE2 PTLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNSAL
          :.: .:::. .: ::::.::::: ::..::: ...:::::.::  ::: .:::::  
CCDS10 LKQQYYTGYTENEVLEVMQHMAKNVVKVNENLTKFIAIKNKYASSKLLKISMIPQLNSKA
        330       340       350       360       370       380      

            430    
pF1KE2 VQDLAKAVAKV 
       :.:::       
CCDS10 VKDLASPLIGRS
        390        

>>CCDS3723.1 CCNA2 gene_id:890|Hs108|chr4                 (432 aa)
 initn: 538 init1: 380 opt: 617  Z-score: 463.5  bits: 94.9 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 617; 31.6% identity (62.2% similar) in 399 aa overlap (28-415:35-424)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MALRVTRNSKINAENKAKINMAGAKRVPTAPAATSKPGLRPRTALGDIGNKVSEQLQ
                                     :   : ...:  :   :.   ::  .   :
CCDS37 SAPGPATREAGSALLALQQTALQEDQENINPEKAAPVQQPRTRAALAVLKSGNPRGLAQQ
           10        20        30        40        50        60    

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 AKMPMKKEAKPSATGKVIDKKLPKPLEKVPMLVPVPVSEPVPEPEPEPEPEPVKEEKLSP
        . :  ... :     : :...  :  :.    :.  .  : : : : . .:.. .:.  
CCDS37 QR-PKTRRVAPLKDLPVNDEHVTVPPWKANSKQPA-FTIHVDEAEKEAQKKPAESQKIER
            70        80        90        100       110       120  

       120        130       140            150       160       170 
pF1KE2 EPILV-DTASPSPMETSGCAPAEEDLCQAFS-----DVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYV
       :  :. ..:   :   .  .: .  .  .:      :. . ..:   :  .. :   .: 
CCDS37 EDALAFNSAISLPGPRKPLVPLDYPMDGSFESPHTMDMSIILED---EKPVSVNEVPDYH
            130       140       150       160          170         

             180       190        200       210       220       230
pF1KE2 KDIYAYLRQLEEEQAVRPKYLLGR-EVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSII
       .::..:::..: .   .  :.  . ..:..:::::.::::.:  ...: .::....:. :
CCDS37 EDIHTYLREMEVKCKPKVGYMKKQPDITNSMRAILVDWLVEVGEEYKLQNETLHLAVNYI
     180       190       200       210       220       230         

              240       250       260       270       280       290
pF1KE2 DRFMQNNCVPKKMLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKIL
       :::...  : .  :::::..::..:::.::.::::...:...::.::::.:. .::  .:
CCDS37 DRFLSSMSVLRGKLQLVGTAAMLLASKFEEIYPPEVAEFVYITDDTYTKKQVLRMEHLVL
     240       250       260       270       280       290         

              300          310       320       330        340      
pF1KE2 RALNFGLGRPLPLHFLRRA---SKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYD-MVHFPPSQIAA
       ..:.: :. :   .:: .    .. ..  ::  .:: .: ::...: : .... :: ::.
CCDS37 KVLTFDLAAPTVNQFLTQYFLHQQPANCKVE--SLAMFLGELSLIDADPYLKYLPSVIAG
     300       310       320       330         340       350       

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE2 GAFCLALKILDNGEWTPTLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYAT
       .:: :::  . .  :  .: .  .:: ::: : .. : .. . . :    ......:: .
CCDS37 AAFHLALYTVTGQSWPESLIRKTGYTLESLKPCLMDLHQTYLKAPQH--AQQSIREKYKN
       360       370       380       390       400         410     

        410       420       430   
pF1KE2 SKHAKISTLPQLNSALVQDLAKAVAKV
       ::.  .: :                  
CCDS37 SKYHGVSLLNPPETLNL          
         420       430            

>>CCDS14331.1 CCNB3 gene_id:85417|Hs108|chrX              (1395 aa)
 initn: 580 init1: 542 opt: 603  Z-score: 445.7  bits: 93.3 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 640; 30.7% identity (62.4% similar) in 404 aa overlap (29-419:980-1376)

                 10        20        30         40        50       
pF1KE2   MALRVTRNSKINAENKAKINMAGAKRVPTAPAA-TSKPGLRPRTALGDIGNKVSEQLQ
                                     ::: . ::: ..   :..:  :. ..: . 
CCDS14 ALQESPTYKEDTFLKTLLVPQVGTSPNVSSTAPESITSKSSIATMTSVGKSGT-INEAFL
     950       960       970       980       990      1000         

        60        70        80        90         100            110
pF1KE2 AKMPMKKEAKPSATGKVIDKKLPKPLEKVPMLVPVPVSEP--VPEPEPEP-----EPEPV
        .  .  . ::. ::: .. : :  :.. :        :   .:.    :      :: .
CCDS14 FEDMITLNEKPT-TGKELSFKEPLALQESPTCKEDTFLETFLIPQIGTSPYVFSTTPESI
     1010      1020       1030      1040      1050      1060       

              120       130       140           150       160      
pF1KE2 KEEKLSPEPILVDTASPSPMETSGCAPAEED----LCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNL
        : : :   .     : .  :.:.:  : .       ..    :   .:.: ::..::..
CCDS14 TE-KSSIATMTSVGKSRTTTESSACESASDKPVSPQAKGTPKEITPREDID-EDSSDPSF
       1070      1080      1090      1100      1110       1120     

        170       180       190        200       210       220     
pF1KE2 CSEYVKDIYAYLRQLEEEQAVRPKYLLGR-EVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYM
          :.:.:..:... .::: .   :.  . :.:..:::::.::::.::..:.. .::.:.
CCDS14 NPMYAKEIFSYMKE-REEQFILTDYMNRQIEITSDMRAILVDWLVEVQVSFEMTHETLYL
        1130       1140      1150      1160      1170      1180    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE2 TVSIIDRFMQNNCVPKKMLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQM
       .:...: ....    :  :::.:.::..::.:.::   :.. ::... :..: . .. .:
CCDS14 AVKLVDLYLMKAVCKKDKLQLLGATAFMIAAKFEEHNSPRVDDFVYICDDNYQRSEVLSM
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 EMKILRALNFGLGRPLPLHFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIA
       :..:: .:.  .. :.  ::::: ..  .....  ::..:. :.:. .: .:.   :..:
CCDS14 EINILNVLKCDINIPIAYHFLRRYARCIHTNMKTLTLSRYICEMTLQEYHYVQEKASKLA
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 AGAFCLALKILDNGEWTPTLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYA
       :... ::: .   : :.: :.:: .:.   : :....: : ... .    :  .:  ::.
CCDS14 AASLLLALYMKKLGYWVPFLEHYSGYSISELHPLVRQLNKLLTFSSYDSLK--AVYYKYS
         1310      1320      1330      1340      1350        1360  

         410       420       430        
pF1KE2 TSKHAKISTLPQLNSALVQDLAKAVAKV     
            ... .: :.                   
CCDS14 HPVFFEVAKIPALDMLKLEEILNCDCEAQGLVL
           1370      1380      1390     

>>CCDS45031.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13              (421 aa)
 initn: 520 init1: 405 opt: 584  Z-score: 439.9  bits: 90.5 E(32554): 3.5e-18
Smith-Waterman score: 584; 36.8% identity (69.5% similar) in 266 aa overlap (161-424:158-421)

              140       150       160       170       180       190
pF1KE2 ETSGCAPAEEDLCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQLEEEQAVRPK
                                     :.:    .::...:: :::. : ..  . .
CCDS45 DLHFLLDFNTVSPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAH
       130       140       150       160       170       180       

               200       210       220       230       240         
pF1KE2 YLLGR-EVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKKMLQLVGV
       :.  . ..: .::.::.::::.:  ...:  ::.:..:...:::..   : .  :::::.
CCDS45 YMKKQPDITEGMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGT
       190       200       210       220       230       240       

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 TAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRPLPLHFLRRA
       .::..::::::.::::. .:...::.::::.:. .::  .:..: : :  :   .:: . 
CCDS45 AAMLLASKYEEIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQY
       250       260       270       280       290       300       

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pF1KE2 SKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYD-MVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWTPTLQHY
        .   : :. ..::::. ::..:. : .... :: :::.:::::   ...  :  ::  .
CCDS45 LRRQGVCVRTENLAKYVAELSLLEADPFLKYLPSLIAAAAFCLANYTVNKHFWPETLAAF
       310       320       330       340       350       360       

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE2 LSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNSALVQDLAK
        .:.   ..: ...: :  . . .    ......:: .::.  .: .      :.:    
CCDS45 TGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPH--RPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ    
       370       380       390         400       410       420     

      430   
pF1KE2 AVAKV

>>CCDS45030.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13              (464 aa)
 initn: 520 init1: 405 opt: 584  Z-score: 439.3  bits: 90.5 E(32554): 3.8e-18
Smith-Waterman score: 584; 36.8% identity (69.5% similar) in 266 aa overlap (161-424:201-464)

              140       150       160       170       180       190
pF1KE2 ETSGCAPAEEDLCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQLEEEQAVRPK
                                     :.:    .::...:: :::. : ..  . .
CCDS45 DLHFLLDFNTVSPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAH
              180       190       200       210       220       230

               200       210       220       230       240         
pF1KE2 YLLGR-EVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKKMLQLVGV
       :.  . ..: .::.::.::::.:  ...:  ::.:..:...:::..   : .  :::::.
CCDS45 YMKKQPDITEGMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGT
              240       250       260       270       280       290

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 TAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRPLPLHFLRRA
       .::..::::::.::::. .:...::.::::.:. .::  .:..: : :  :   .:: . 
CCDS45 AAMLLASKYEEIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQY
              300       310       320       330       340       350

     310       320       330        340       350       360        
pF1KE2 SKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYD-MVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWTPTLQHY
        .   : :. ..::::. ::..:. : .... :: :::.:::::   ...  :  ::  .
CCDS45 LRRQGVCVRTENLAKYVAELSLLEADPFLKYLPSLIAAAAFCLANYTVNKHFWPETLAAF
              360       370       380       390       400       410

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE2 LSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNSALVQDLAK
        .:.   ..: ...: :  . . .    ......:: .::.  .: .      :.:    
CCDS45 TGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPH--RPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ    
              420       430         440       450       460        

      430   
pF1KE2 AVAKV

>>CCDS9357.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13               (465 aa)
 initn: 520 init1: 405 opt: 584  Z-score: 439.3  bits: 90.5 E(32554): 3.8e-18
Smith-Waterman score: 584; 36.8% identity (69.5% similar) in 266 aa overlap (161-424:202-465)

              140       150       160       170       180       190
pF1KE2 ETSGCAPAEEDLCQAFSDVILAVNDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRQLEEEQAVRPK
                                     :.:    .::...:: :::. : ..  . .
CCDS93 DLHFLLDFNTVSPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAH
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               200       210       220       230       240         
pF1KE2 YLLGR-EVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKKMLQLVGV
       :.  . ..: .::.::.::::.:  ...:  ::.:..:...:::..   : .  :::::.
CCDS93 YMKKQPDITEGMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGT
             240       250       260       270       280       290 

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 TAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRPLPLHFLRRA
       .::..::::::.::::. .:...::.::::.:. .::  .:..: : :  :   .:: . 
CCDS93 AAMLLASKYEEIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQY
             300       310       320       330       340       350 

     310       320       330        340       350       360        
pF1KE2 SKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYD-MVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWTPTLQHY
        .   : :. ..::::. ::..:. : .... :: :::.:::::   ...  :  ::  .
CCDS93 LRRQGVCVRTENLAKYVAELSLLEADPFLKYLPSLIAAAAFCLANYTVNKHFWPETLAAF
             360       370       380       390       400       410 

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE2 LSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNSALVQDLAK
        .:.   ..: ...: :  . . .    ......:: .::.  .: .      :.:    
CCDS93 TGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPH--RPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ    
             420       430         440       450       460         

      430   
pF1KE2 AVAKV

>>CCDS14332.1 CCNB3 gene_id:85417|Hs108|chrX              (291 aa)
 initn: 371 init1: 371 opt: 414  Z-score: 319.8  bits: 67.7 E(32554): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 414; 31.1% identity (69.4% similar) in 206 aa overlap (214-419:69-272)

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE2 EQAVRPKYLLGREVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKKM
                                     ..:.. .::.:..:...: ....    :  
CCDS14 TKISPSSLQESPSSLQGALKKRSAFEDLTNVSFEMTHETLYLAVKLVDLYLMKAVCKKDK
       40        50        60        70        80        90        

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE2 LQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDNTYTKHQIRQMEMKILRALNFGLGRPLPL
       :::.:.::..::.:.::   :.. ::... :..: . .. .::..:: .:.  .. :.  
CCDS14 LQLLGATAFMIAAKFEEHNSPRVDDFVYICDDNYQRSEVLSMEINILNVLKCDINIPIAY
      100       110       120       130       140       150        

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE2 HFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWTP
       ::::: ..  .....  ::..:. :.:. .: .:.   :..::... ::: .   : :.:
CCDS14 HFLRRYARCIHTNMKTLTLSRYICEMTLQEYHYVQEKASKLAAASLLLALYMKKLGYWVP
      160       170       180       190       200       210        

           370       380       390       400       410       420   
pF1KE2 TLQHYLSYTEESLLPVMQHLAKNVVMVNQGLTKHMTVKNKYATSKHAKISTLPQLNSALV
        :.:: .:.   : :....: : ... .    :  .:  ::.     ... .: :.    
CCDS14 FLEHYSGYSISELHPLVRQLNKLLTFSSYDSLK--AVYYKYSHPVFFEVAKIPALDMLKL
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           430        
pF1KE2 QDLAKAVAKV     
                      
CCDS14 EEILNCDCEAQGLVL
        280       290 




433 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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