FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3246, 1042 aa 1>>>pF1KB3246 1042 - 1042 aa - 1042 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3051+/-0.00107; mu= 21.3663+/- 0.065 mean_var=64.1497+/-12.756, 0's: 0 Z-trim(102.3): 67 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.160132 statistics sampled from 6810 (6878) to 6810 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16 Scan time: 4.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 (1042) 6865 1595.6 0 CCDS9143.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 ( 997) 6510 1513.6 0 CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 994) 5599 1303.1 0 CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (1001) 5599 1303.2 0 CCDS42234.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1029) 5191 1208.9 0 CCDS11041.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1043) 5191 1208.9 0 CCDS11042.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1052) 5191 1208.9 0 CCDS45580.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 998) 5183 1207.0 0 CCDS45579.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 999) 5183 1207.0 0 CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 869) 4930 1148.6 0 CCDS56281.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 903) 723 176.7 2e-43 CCDS46914.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 919) 723 176.7 2e-43 CCDS56280.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 923) 723 176.7 2e-43 CCDS46912.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 939) 723 176.7 2.1e-43 CCDS56279.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 944) 723 176.7 2.1e-43 CCDS33856.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 949) 723 176.7 2.1e-43 CCDS75006.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 953) 723 176.7 2.1e-43 CCDS56278.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 973) 723 176.7 2.1e-43 CCDS46913.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 888) 717 175.3 5.2e-43 CCDS42207.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 946) 687 168.4 6.7e-41 CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035) 563 139.7 3e-32 CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 (1029) 559 138.8 5.7e-32 CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020) 511 127.7 1.2e-28 CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1039) 499 125.0 8.6e-28 CCDS53858.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1045) 499 125.0 8.6e-28 CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 ( 992) 493 123.6 2.2e-27 CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 493 123.6 2.2e-27 CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 493 123.6 2.2e-27 CCDS30977.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1170) 452 114.1 1.8e-24 CCDS1440.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1205) 452 114.1 1.8e-24 CCDS82733.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1154) 430 109.0 5.9e-23 CCDS2601.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1198) 430 109.0 6.1e-23 CCDS33701.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1243) 430 109.1 6.3e-23 CCDS41817.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1176) 416 105.8 5.6e-22 CCDS9035.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1220) 416 105.8 5.8e-22 CCDS14722.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1173) 411 104.6 1.3e-21 CCDS35440.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1220) 411 104.7 1.3e-21 CCDS67088.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 975) 325 84.7 1e-15 CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1013) 306 80.4 2.2e-14 CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024) 306 80.4 2.2e-14 CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026) 306 80.4 2.2e-14 >>CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 (1042 aa) initn: 6865 init1: 6865 opt: 6865 Z-score: 8560.6 bits: 1595.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6865; 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