Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9480, 832 aa
  1>>>pF1KB9480 832 - 832 aa - 832 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8633+/-0.000873; mu= 18.3021+/- 0.053
 mean_var=76.4493+/-15.576, 0's: 0 Z-trim(106.8): 17  B-trim: 42 in 1/49
 Lambda= 0.146686
 statistics sampled from 9202 (9207) to 9202 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  4.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6       ( 832) 5630 1201.3       0
CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1        ( 807) 2896 622.7 7.8e-178
CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14      ( 806) 2156 466.1 1.1e-130


>>CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6            (832 aa)
 initn: 5630 init1: 5630 opt: 5630  Z-score: 6432.9  bits: 1201.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5630; 100.0% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSVGIVLPVNFSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSVGIVLPVNFSG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 DLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKMRYKEDDLVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKMRYKEDDLVKR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKKAERGKLYFTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKKAERGKLYFTN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKREKEKVNEKPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKREKEKVNEKPLG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 MAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVSYAPDPQNIYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVSYAPDPQNIYW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYLNNPIITQFFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYLNNPIITQFFP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 TLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLPSLGLSSLDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLPSLGLSSLDLF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 FRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPGLLMYMIRLCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPGLLMYMIRLCL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 ARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLMYMLLKHLVDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLMYMLLKHLVDR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 YNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTSMFTFVVLVIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTSMFTFVVLVIT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 IVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDTVDPRSNGRPPTAAAVPKSAKYIAQVLQDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDTVDPRSNGRPPTAAAVPKSAKYIAQVLQDSE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830  
pF1KB9 VDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENEIHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENEIHQ
              790       800       810       820       830  

>>CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1             (807 aa)
 initn: 2150 init1: 1866 opt: 2896  Z-score: 3306.2  bits: 622.7 E(32554): 7.8e-178
Smith-Waterman score: 3089; 59.0% identity (83.8% similar) in 752 aa overlap (19-767:27-755)

                       10        20         30        40        50 
pF1KB9         MLPFLLATLGTTALNNSNPKD-YCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMC
                                 :.: :::..   ::::::. :::.:::: .:  :
CCDS31 MMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSC
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 FLALLFLFSILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTS
       :: :...:::.:.  :::::.:::..::                      :..:..::.:
CCDS31 FLFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEAD----------------------SESRFQRLSS
               70        80                              90        

              120       130       140       150       160       170
pF1KB9 VSSSVDFD-QRDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSV
       .::: . : . . : : :::::::..::.: . :: ::.:::::::::: :::::. ::.
CCDS31 TSSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLSL
      100       110       120       130       140       150        

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 GIVLPVNFSGDLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKM
        ..::::.:::::... :::::::::::.. :.:::::: :: .::.:::  ::.::...
CCDS31 CVILPVNLSGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFLTVGFMRHHTQSI
      160       170       180       190       200       210        

              240       250       260       270       280       290
pF1KB9 RYKEDDLVKRTLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKK
       .:::..::.:::::.:. . :..: ...::..:::.: :.... :::::.:..:  :.::
CCDS31 KYKEENLVRRTLFITGLPRDARKETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKKK
      220       230       240       250       260       270        

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 AERGKLYFTNLQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKRE
       .:..  :.:::: : .  :.:::::::..::: : :::  .:: :::.....: :   .:
CCDS31 TEKSLTYYTNLQVKTGQRTLINPKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRLLERITEE
      280       290       300       310       320       330        

              360       370       380       390       400       410
pF1KB9 KEKVNEKPLGMAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVS
       ...:...:::::::::....... ::::::.::::.  :.:::.::: :. :. :.:::.
CCDS31 ERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTVT
      340       350       360       370       380       390        

              420       430       440       450       460       470
pF1KB9 YAPDPQNIYWEHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYL
       .: ::..: :..:::.:. :::. : :: .::. :::::::.::..::::::::::.. :
CCDS31 FAADPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHAL
      400       410       420       430       440       450        

              480       490       500       510       520       530
pF1KB9 NNPIITQFFPTLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLP
       :::::.::::::::: ::::::.:::::...:.:::.::::.  : : : :::::::.::
CCDS31 NNPIISQFFPTLLLWSFSALLPSIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILP
      460       470       480       490       500       510        

              540       550       560       570       580       590
pF1KB9 SLGLSSLDLFFRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPG
       ::::.:::.::::::::   .::.::.:::::::.::::::::::::::::.:.:::.::
CCDS31 SLGLTSLDFFFRWLFDKTS-SEASIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLPG
      520       530        540       550       560       570       

              600       610       620       630       640       650
pF1KB9 LLMYMIRLCLARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLM
       :..: .:. .:..::.:::::..::....::: ::::.:::::...::::::::.::::.
CCDS31 LILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLI
       580       590       600       610       620       630       

              660       670       680       690       700       710
pF1KB9 YMLLKHLVDRYNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTS
       :.::::.:::.:::..::::::.: :: .::::..:::::::::: ::: .: :. ::..
CCDS31 YILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLEKGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPAT
       640       650       660       670       680       690       

              720       730       740       750        760         
pF1KB9 MFTFVVLVITIVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDT-VDPRSNGRPPTAAAVPKSA
       .:::.::..::..:: :.::: ::.::  ::: :.  .:   . ...  :: .  ::.  
CCDS31 LFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCFKHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTPYVPRIL
       700       710       720       730       740       750       

     770       780       790       800       810       820         
pF1KB9 KYIAQVLQDSEVDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENE
                                                                   
CCDS31 NGLASERTALSPQQQQQQTYGAIHNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA          
       760       770       780       790       800                 

>>CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14           (806 aa)
 initn: 2050 init1: 1428 opt: 2156  Z-score: 2459.9  bits: 466.1 E(32554): 1.1e-130
Smith-Waterman score: 2337; 43.0% identity (74.4% similar) in 817 aa overlap (21-831:20-806)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
                           : :...:  .::::: ::::::::: :..  .. .: ..:
CCDS45  MSASPDDLSTGGRLQNMTVDECFQSR--NTVLQGQPFGGVPTVLCLNIALWVLVLVVYS
                10        20          30        40        50       

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pF1KB9 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
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