Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0966
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0966, 512 aa
  1>>>pF1KE0966 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6010+/-0.00107; mu= -1.9954+/- 0.061
 mean_var=405.1443+/-94.905, 0's: 0 Z-trim(112.8): 82  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.063719
 statistics sampled from 13464 (13537) to 13464 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.416), width:  16
 Scan time:  2.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3            ( 512) 3588 344.6 1.6e-94
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2           ( 513) 2533 247.6 2.4e-65
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2           ( 405) 2038 202.0 1.1e-51
CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3          ( 567)  919 99.3 1.2e-20
CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3         ( 592)  919 99.3 1.2e-20
CCDS33361.1 BMPR2 gene_id:659|Hs108|chr2           (1038)  819 90.5   1e-17
CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2       ( 413)  764 84.9 1.9e-16
CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2       ( 443)  759 84.5 2.8e-16
CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2        ( 493)  759 84.5 2.9e-16
CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9         ( 426)  756 84.2 3.3e-16
CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9          ( 503)  756 84.3 3.6e-16
CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9         ( 507)  756 84.3 3.6e-16
CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4           ( 502)  743 83.1 8.3e-16
CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4          ( 532)  743 83.1 8.6e-16
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12          ( 453)  740 82.7 9.4e-16
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12           ( 505)  740 82.8   1e-15
CCDS2206.1 ACVR1 gene_id:90|Hs108|chr2             ( 509)  731 82.0 1.8e-15
CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10          ( 532)  717 80.7 4.5e-15
CCDS31804.1 ACVRL1 gene_id:94|Hs108|chr12          ( 503)  678 77.1 5.2e-14
CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2       ( 336)  570 66.9   4e-11


>>CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3                 (512 aa)
 initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588  Z-score: 1810.7  bits: 344.6 E(32554): 1.6e-94
Smith-Waterman score: 3588; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTAPWVALALLWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MTAPWVALALLWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 ASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GPEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYRHRKPPYGHVDIHEDPGPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 GPEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYRHRKPPYGHVDIHEDPGPPP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 PSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 HENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 LHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 TRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 HPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510  
pF1KE0 IRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 IRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
              490       500       510  

>>CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2                (513 aa)
 initn: 2337 init1: 1547 opt: 2533  Z-score: 1286.5  bits: 247.6 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 2533; 67.3% identity (87.9% similar) in 511 aa overlap (3-512:4-513)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MTAPWVALALLWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHC
          :  .:.:..  :  .:.  :..::.::...::::: .::::.:.: : :..::: ::
CCDS33 MGAAAKLAFAVFLISCSSGAILGRSETQECLFFNANWEKDRTNQTGVEPCYGDKDKRRHC
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 YASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEA
       .:.:.: ::.::.::.::::::.::::: .::  ...:.:::::::::.:::.:...:: 
CCDS33 FATWKNISGSIEIVKQGCWLDDINCYDRTDCVEKKDSPEVYFCCCEGNMCNEKFSYFPEM
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 GGPEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYRHRKPPYGHVDIH-EDPGP
          . : .:    :   ..: :::.:.  .. ::. :::.:::.:  :  : .  .::::
CCDS33 EVTQPTSNPVTPKPPYYNILLYSLVPLMLIAGIVICAFWVYRHHKMAYPPVLVPTQDPGP
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 PPPSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPG
       ::::::.:::::::::.::::::::::::::.:..:::::::.:::::::.: :..: ::
CCDS33 PPPSPLLGLKPLQLLEVKARGRFGCVWKAQLLNEYVAVKIFPIQDKQSWQNEYEVYSLPG
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 MKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGL
       :::::.::::.:::::....:.::::::::.::::.:.::.:...::::::.::::.:::
CCDS33 MKHENILQFIGAEKRGTSVDVDLWLITAFHEKGSLSDFLKANVVSWNELCHIAETMARGL
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE0 SYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQ
       .:::::.:  . .::::.:.:::.::::::::..::: .::::::..:: ::  ::::::
CCDS33 AYLHEDIPGLK-DGHKPAISHRDIKSKNVLLKNNLTACIADFGLALKFEAGKSAGDTHGQ
              310        320       330       340       350         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 VGTRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS33 VGTRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELASRCTAADGPVDEYMLPFEEEI
     360       370       380       390       400       410         

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE0 GQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERV
       :::::::..:::::::: ::...:.: :: :.:.:: ::::::::::::::::::: ::.
CCDS33 GQHPSLEDMQEVVVHKKKRPVLRDYWQKHAGMAMLCETIEECWDHDAEARLSAGCVGERI
     420       430       440       450       460       470         

      480       490       500       510  
pF1KE0 SLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
       . ..: .:  :.. .:..:: :::::.::::::.
CCDS33 TQMQRLTNIITTEDIVTVVTMVTNVDFPPKESSL
     480       490       500       510   

>>CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2                (405 aa)
 initn: 1885 init1: 1095 opt: 2038  Z-score: 1041.7  bits: 202.0 E(32554): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 2038; 70.1% identity (88.6% similar) in 405 aa overlap (109-512:2-405)

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE0 LDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEAGGPEVTYEPPPTAPTLLTV
                                     :::.:...::    . : .:    :   ..
CCDS63                              MCNEKFSYFPEMEVTQPTSNPVTPKPPYYNI
                                            10        20        30 

      140       150       160       170        180       190       
pF1KE0 LAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYRHRKPPYGHVDIH-EDPGPPPPSPLVGLKPLQLLEIKA
       : :::.:.  .. ::. :::.:::.:  :  : .  .::::::::::.:::::::::.::
CCDS63 LLYSLVPLMLIAGIVICAFWVYRHHKMAYPPVLVPTQDPGPPPPSPLLGLKPLQLLEVKA
              40        50        60        70        80        90 

       200       210       220       230       240       250       
pF1KE0 RGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNL
       ::::::::::::.:..:::::::.:::::::.: :..: :::::::.::::.:::::...
CCDS63 RGRFGCVWKAQLLNEYVAVKIFPIQDKQSWQNEYEVYSLPGMKHENILQFIGAEKRGTSV
             100       110       120       130       140       150 

       260       270       280       290       300       310       
pF1KE0 EVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSI
       .:.::::::::.::::.:.::.:...::::::.::::.:::.:::::.:  . .::::.:
CCDS63 DVDLWLITAFHEKGSLSDFLKANVVSWNELCHIAETMARGLAYLHEDIPGLK-DGHKPAI
             160       170       180       190       200        210

       320       330       340       350       360       370       
pF1KE0 AHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQ
       .:::.::::::::..::: .::::::..:: ::  :::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHRDIKSKNVLLKNNLTACIADFGLALKFEAGKSAGDTHGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQ
              220       230       240       250       260       270

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE0 RDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMR
       :::::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::..:::::::: :
CCDS63 RDAFLRIDMYAMGLVLWELASRCTAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEDMQEVVVHKKKR
              280       290       300       310       320       330

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE0 PTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLV
       :...:.: :: :.:.:: ::::::::::::::::::: ::.. ..: .:  :.. .:..:
CCDS63 PVLRDYWQKHAGMAMLCETIEECWDHDAEARLSAGCVGERITQMQRLTNIITTEDIVTVV
              340       350       360       370       380       390

       500       510  
pF1KE0 TSVTNVDLPPKESSI
       : :::::.::::::.
CCDS63 TMVTNVDFPPKESSL
              400     

>>CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3               (567 aa)
 initn: 837 init1: 584 opt: 919  Z-score: 484.2  bits: 99.3 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 973; 37.6% identity (62.7% similar) in 482 aa overlap (41-479:69-539)

               20        30        40        50        60          
pF1KE0 LWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSG--
                                     .: :    ::  :.    : : ::...   
CCDS26 TDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEV---CVAVWRKNDENI
       40        50        60        70        80           90     

       70        80            90         100        110       120 
pF1KE0 TIELVKKGCWLD--DFNCYD--RQECVATEEN-P-QVYF-CCCEGNFCNERFTHLPEAGG
       :.: : .   :   ::   :    .:.  :.. : ...: : : .. ::. .       .
CCDS26 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIF-----S
         100       110       120       130       140            150

             130       140       150       160                     
pF1KE0 PEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYR-HRKPPYG------------
        : .   :    ... : . ::::  :... :.. :. :: .:.   .            
CCDS26 EEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLM
              160       170       180       190       200       210

          170        180              190       200       210      
pF1KE0 ----HVDI-HEDPGPPPPSPLVG-------LKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDF---
           :  :  ::      :  ..       : :..:  . ..:::. :.::.: ..    
CCDS26 EFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQ
              220       230       240       250       260       270

              220       230       240       250       260       270
pF1KE0 ---VAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDK
          ::::::: ..  ::..:..:::  ..::::.:::..::.: ..:  . ::::::: :
CCDS26 FETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAK
              280       290       300       310       320       330

              280       290       300       310       320       330
pF1KE0 GSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLK
       :.: .::  ..:.:..: ... ...::...:: :   : :. . : :.:::.::.:.:.:
CCDS26 GNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC-GRPKMP-IVHRDLKSSNILVK
              340       350       360        370        380        

              340       350         360       370        380       
pF1KE0 SDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGD--THGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMY
       .:::  : ::::..:..:     :  . ::::: :::::::::. .:..  ..: . :.:
CCDS26 NDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVY
      390       400       410       420       430       440        

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE0 AMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKH
       .:.:::::..:::.:. : : .:  ::  .. .:: .: ... :.. . :: : . ::.:
CCDS26 SMALVLWEMTSRCNAV-GEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNH
      450       460        470       480       490       500       

       450       460       470       480       490       500       
pF1KE0 PGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPP
        :. ..: :. :::::: ::::.: :: :: :                            
CCDS26 QGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
       510       520       530       540       550       560       

       510  
pF1KE0 KESSI

>>CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3              (592 aa)
 initn: 806 init1: 584 opt: 919  Z-score: 484.0  bits: 99.3 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 973; 37.6% identity (62.7% similar) in 482 aa overlap (41-479:94-564)

               20        30        40        50        60          
pF1KE0 LWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSG--
                                     .: :    ::  :.    : : ::...   
CCDS33 TDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEV---CVAVWRKNDENI
            70        80        90       100          110       120

       70        80            90         100        110       120 
pF1KE0 TIELVKKGCWLD--DFNCYD--RQECVATEEN-P-QVYF-CCCEGNFCNERFTHLPEAGG
       :.: : .   :   ::   :    .:.  :.. : ...: : : .. ::. .       .
CCDS33 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIF-----S
              130       140       150       160       170          

             130       140       150       160                     
pF1KE0 PEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYR-HRKPPYG------------
        : .   :    ... : . ::::  :... :.. :. :: .:.   .            
CCDS33 EEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLM
         180       190       200       210       220       230     

          170        180              190       200       210      
pF1KE0 ----HVDI-HEDPGPPPPSPLVG-------LKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDF---
           :  :  ::      :  ..       : :..:  . ..:::. :.::.: ..    
CCDS33 EFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQ
         240       250       260       270       280       290     

              220       230       240       250       260       270
pF1KE0 ---VAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDK
          ::::::: ..  ::..:..:::  ..::::.:::..::.: ..:  . ::::::: :
CCDS33 FETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAK
         300       310       320       330       340       350     

              280       290       300       310       320       330
pF1KE0 GSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLK
       :.: .::  ..:.:..: ... ...::...:: :   : :. . : :.:::.::.:.:.:
CCDS33 GNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC-GRPKMP-IVHRDLKSSNILVK
         360       370       380       390         400       410   

              340       350         360       370        380       
pF1KE0 SDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGD--THGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMY
       .:::  : ::::..:..:     :  . ::::: :::::::::. .:..  ..: . :.:
CCDS33 NDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVY
           420       430       440       450       460       470   

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE0 AMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKH
       .:.:::::..:::.:. : : .:  ::  .. .:: .: ... :.. . :: : . ::.:
CCDS33 SMALVLWEMTSRCNAV-GEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNH
           480        490       500       510       520       530  

       450       460       470       480       490       500       
pF1KE0 PGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPP
        :. ..: :. :::::: ::::.: :: :: :                            
CCDS33 QGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
            540       550       560       570       580       590  

       510  
pF1KE0 KESSI

>>CCDS33361.1 BMPR2 gene_id:659|Hs108|chr2                (1038 aa)
 initn: 996 init1: 190 opt: 819  Z-score: 431.6  bits: 90.5 E(32554): 1e-17
Smith-Waterman score: 1040; 35.3% identity (64.9% similar) in 530 aa overlap (4-502:12-527)

                       10        20        30        40        50  
pF1KE0         MTAPWVALALLWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGE
                  ::.  ..:  :  :.:   . . : : . .   .    ..: . . .: 
CCDS33 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAAS---QNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGT
               10        20           30        40        50       

               60        70           80        90       100       
pF1KE0 Q--DKRLHCYASWRNSSGTIELVKKGCWL---DDFNCYDRQECVATEENPQVY-----FC
          .:   ::. :..:.: :.:::.:::    :  .:.  .:::.:   :..      ::
CCDS33 ILCSKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECH-YEECVVTTTPPSIQNGTYRFC
        60        70        80        90        100       110      

            110        120       130       140       150       160 
pF1KE0 CCEGNFCNERFT-HLPEAGGPEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYR
       ::  ..::  :: ..:    :..:   :: . .   ..  .:  .. :.....   . ::
CCDS33 CCSTDLCNVNFTENFPP---PDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYR
        120       130          140       150       160       170   

                 170       180       190       200       210       
pF1KE0 H----RKPPYGHVDIHEDPGPPPPSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVK
            ::     ... :  .  :    . :  :.:::. .:::.: :.:..: .  ::::
CCDS33 MLTGDRKQGLHSMNMMEAAASEPS---LDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVK
           180       190          200       210       220       230

       220       230       240       250        260       270      
pF1KE0 IFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKR-GSNLEVELWLITAFHDKGSLTDY
       .: . ..:.. .:..:. .: :.:.:. .::....:  .. ..:  :.  .. .:::  :
CCDS33 VFSFANRQNFINEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKY
              240       250       260       270       280       290

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE0 LKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAV
       :. .   :   :..:....:::.::: ..:  ::. .::.:.:::..:.:::.:.: : :
CCDS33 LSLHTSDWVSSCRLAHSVTRGLAYLHTELP--RGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCV
              300       310       320         330       340        

        340             350       360       370          380       
pF1KE0 LADFGLAVRF------EPGKPPGDTHGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQRD---AFLRIDMY
       ..::::..:.      .::.  . . ..::: :::::::::::.:. ::   :. ..:::
CCDS33 ISDFGLSMRLTGNRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNL-RDCESALKQVDMY
      350       360       370       380       390        400       

       390       400         410       420       430       440     
pF1KE0 AMGLVLWELVSRCKAA-DGP-VDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWL
       :.::. ::.  ::     :  : ::.. :. :.:.::..:..: .: ..:.:: . . : 
CCDS33 ALGLIYWEIFMRCTDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAW-
       410       420       430       440       450       460       

         450         460       470         480       490       500 
pF1KE0 KHPGLA--QLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVS--LIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVT
       :. .::  .:  :::.:::.::::::.: :.:::..  ..    : ..:  .  . :.. 
CCDS33 KENSLAVRSLKETIEDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQ
        470       480       490       500       510       520      

             510                                                   
pF1KE0 NVDLPPKESSI                                                 
       :                                                           
CCDS33 NERNLSHNRRVPKIGPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNS
        530       540       550       560       570       580      

>>CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2            (413 aa)
 initn: 723 init1: 333 opt: 764  Z-score: 408.7  bits: 84.9 E(32554): 1.9e-16
Smith-Waterman score: 764; 38.5% identity (70.4% similar) in 314 aa overlap (169-479:94-403)

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE0 LAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYRHRKPPYGHVDIHEDPGPPPPSPLVGLKPLQLLEIKAR
                                     .. .:   : :     .  . . : :: ..
CCDS46 VSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGK
            70        80        90       100       110       120   

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE0 GRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLE
       :::: ::...  .. ::::::  .:..::  : ::..:  ..:::.: ::::... ..  
CCDS46 GRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTW
           130       140       150       160       170       180   

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE0 VELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIA
       ..:::.. .:..::: :::. ::.:   . ..: ... ::..:: ..   .:   ::.::
CCDS46 TQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQG---KPAIA
           190       200       210       220       230          240

      320       330       340       350         360       370      
pF1KE0 HRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDT--HGQVGTRRYMAPEVLEGAINF
       :::.::::.:.:.  : ..::.::::. .      :   . .:::.::::::.:. ..: 
CCDS46 HRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNV
              250       260       270       280       290       300

         380       390       400       410       420       430     
pF1KE0 Q-RDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKK
       .  ..: : :.:..::: ::.. :: .. : :.::.::. . . . ::.::...::  .:
CCDS46 NIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRC-SVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQK
              310       320        330       340       350         

         440       450       460       470       480       490     
pF1KE0 MRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVS
       .::.: ..: .  .:  .   ..:::  .. :::.:  ... .:                
CCDS46 FRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA      
     360       370       380       390       400       410         

         500       510  
pF1KE0 LVTSVTNVDLPPKESSI

>>CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2            (443 aa)
 initn: 727 init1: 333 opt: 759  Z-score: 405.8  bits: 84.5 E(32554): 2.8e-16
Smith-Waterman score: 821; 35.4% identity (62.8% similar) in 435 aa overlap (88-479:11-433)

        60        70        80        90        100                
pF1KE0 HCYASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEE-NPQVYFC----------CCEG
                                     . ::.  : : :: ::          ::  
CCDS46                     MLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQV-FCHSSNNVTKTECCFT
                                   10        20         30         

        110       120       130       140       150                
pF1KE0 NFCNERFTHLPEAGGPEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWM-------
       .:::.   ::: :. :..    :  .:  :...    .:.  ::. ..:. :        
CCDS46 DFCNNITLHLPTAS-PNA----PKLGPMELAIII--TVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCS
      40        50             60          70        80        90  

     160                    170            180       190           
pF1KE0 YRHRKPPY-------------GHV--DIHED---PGPPPPSPLVGLKPLQ----LLEIKA
       ::..: :              :..  :.  :    :     ::.  . .     : :: .
CCDS46 YRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVG
            100       110       120       130       140       150  

       200       210       220       230       240       250       
pF1KE0 RGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNL
       .:::: ::...  .. ::::::  .:..::  : ::..:  ..:::.: ::::... .. 
CCDS46 KGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGT
            160       170       180       190       200       210  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KE0 EVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSI
        ..:::.. .:..::: :::. ::.:   . ..: ... ::..:: ..   .:   ::.:
CCDS46 WTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQG---KPAI
            220       230       240       250       260            

       320       330       340       350         360       370     
pF1KE0 AHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDT--HGQVGTRRYMAPEVLEGAIN
       ::::.::::.:.:.  : ..::.::::. .      :   . .:::.::::::.:. ..:
CCDS46 AHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMN
     270       280       290       300       310       320         

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE0 FQ-RDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHK
        .  ..: : :.:..::: ::.. :: .. : :.::.::. . . . ::.::...::  .
CCDS46 VNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRC-SVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQ
     330       340       350        360       370       380        

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE0 KMRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLV
       :.::.: ..: .  .:  .   ..:::  .. :::.:  ... .:               
CCDS46 KFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA     
      390       400       410       420       430       440        

          500       510  
pF1KE0 SLVTSVTNVDLPPKESSI

>>CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2             (493 aa)
 initn: 727 init1: 333 opt: 759  Z-score: 405.3  bits: 84.5 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 833; 34.0% identity (61.5% similar) in 470 aa overlap (57-479:26-483)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KE0 RECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYD
                                     :.:     .::.    .. .:: . .    
CCDS22      MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNG
                    10        20        30        40        50     

             90        100                 110       120       130 
pF1KE0 RQE----CVATEE-NPQVYFC----------CCEGNFCNERFTHLPEAGGPEVTYEPPPT
       ...    ::.  : : :: ::          ::  .:::.   ::: :. :..    :  
CCDS22 KEQVIKSCVSLPELNAQV-FCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTAS-PNA----PKL
          60        70         80        90       100              

             140       150              160                    170 
pF1KE0 APTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWM-------YRHRKPPY-------------GHV-
       .:  :...    .:.  ::. ..:. :        ::..: :              :.. 
CCDS22 GPMELAIII--TVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTL
     110         120       130       140       150       160       

                  180       190           200       210       220  
pF1KE0 -DIHED---PGPPPPSPLVGLKPLQ----LLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIFPLQ
        :.  :    :     ::.  . .     : :: ..:::: ::...  .. ::::::  .
CCDS22 KDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSR
       170       180       190       200       210       220       

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE0 DKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNII
       :..::  : ::..:  ..:::.: ::::... ..  ..:::.. .:..::: :::. ::.
CCDS22 DERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIV
       230       240       250       260       270       280       

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE0 TWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGL
       :   . ..: ... ::..:: ..   .:   ::.:::::.::::.:.:.  : ..::.::
CCDS22 TVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQG---KPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGL
       290       300       310          320       330       340    

            350         360       370        380       390         
pF1KE0 AVRFEPGKPPGDT--HGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQ-RDAFLRIDMYAMGLVLWELVSR
       ::. .      :   . .:::.::::::.:. ..: .  ..: : :.:..::: ::.. :
CCDS22 AVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARR
          350       360       370       380       390       400    

     400       410       420       430       440       450         
pF1KE0 CKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKHPGLAQLCVTIEE
       : .. : :.::.::. . . . ::.::...::  .:.::.: ..: .  .:  .   ..:
CCDS22 C-SVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRE
           410       420       430       440       450       460   

     460       470       480       490       500       510  
pF1KE0 CWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
       ::  .. :::.:  ... .:                                 
CCDS22 CWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA                       
           470       480       490                          

>>CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9              (426 aa)
 initn: 567 init1: 315 opt: 756  Z-score: 404.5  bits: 84.2 E(32554): 3.3e-16
Smith-Waterman score: 756; 39.7% identity (72.5% similar) in 295 aa overlap (188-479:126-416)

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE0 WMYRHRKPPYGHVDIHEDPGPPPPSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVK
                                     . . : :  ..:::: ::...  .. ::::
CCDS47 TTTYCCNQDHCNKIELPTTGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVK
         100       110       120       130       140       150     

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 IFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYL
       ::  ....::  : ::..:  ..:::.: ::::... ..  ..:::.. .:..::: :::
CCDS47 IFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYL
         160       170       180       190       200       210     

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 KGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVL
       .   .: . . ..: . . ::..:: ..   .:   ::.:::::.::::.:.:.. :  .
CCDS47 NRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQG---KPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCI
         220       230       240          250       260       270  

       340       350         360       370        380       390    
pF1KE0 ADFGLAVRFEPGKPPGDT--HGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMYAMGLVLW
       ::.::::: . .    :   . .:::.::::::::. .::... ..: : :.::::::.:
CCDS47 ADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFW
            280       290       300       310       320       330  

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE0 ELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKHPGLAQLC
       :.. :: .  :  ..:.::. . . . ::.::...:: ..:.::.: ..: .  .:  . 
CCDS47 EIARRC-SIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMA
             340       350       360       370       380       390 

          460       470       480       490       500       510  
pF1KE0 VTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
         ..:::  .. :::.:  ... .:                                 
CCDS47 KIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM                       
             400       410       420                             




512 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 15:18:59 2016 done: Mon Nov  7 15:19:00 2016
 Total Scan time:  2.590 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com