Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9642
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9642, 593 aa
  1>>>pF1KB9642 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3386+/-0.000964; mu= 14.5620+/- 0.057
 mean_var=171.1545+/-34.683, 0's: 0 Z-trim(111.0): 215  B-trim: 5 in 2/52
 Lambda= 0.098035
 statistics sampled from 11746 (12030) to 11746 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time:  3.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1       ( 593) 4009 579.9 3.1e-165
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19      ( 592) 1524 228.5 1.9e-59
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15       ( 614) 1491 223.8   5e-58
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15       ( 620) 1491 223.8 5.1e-58
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9        ( 606) 1463 219.8 7.8e-57
CCDS46071.1 LRFN1 gene_id:57622|Hs108|chr19        ( 771)  520 86.6 1.3e-16
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  468 79.1 1.7e-14
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  468 79.1 1.8e-14
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 605)  467 79.0   2e-14
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 643)  467 79.0   2e-14
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7          ( 653)  451 76.7 9.9e-14
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3             ( 560)  438 74.8 3.2e-13
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22       ( 762)  439 75.1 3.5e-13
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19       ( 713)  438 75.0 3.8e-13
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11       ( 640)  435 74.5 4.7e-13
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1          ( 967)  427 73.6 1.3e-12
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11         ( 951)  416 72.0 3.9e-12
CCDS34969.1 LRRC24 gene_id:441381|Hs108|chr8       ( 513)  407 70.4 6.4e-12
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12        (1119)  407 70.8   1e-11
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1         ( 642)  383 67.1 7.7e-11
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1           ( 661)  383 67.1 7.9e-11


>>CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1            (593 aa)
 initn: 4009 init1: 4009 opt: 4009  Z-score: 3080.1  bits: 579.9 E(32554): 3.1e-165
Smith-Waterman score: 4009; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRDRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRDRG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 AYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDPNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDPNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590   
pF1KB9 LPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRVTAKLF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRVTAKLF
              550       560       570       580       590   

>>CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19           (592 aa)
 initn: 1855 init1: 1276 opt: 1524  Z-score: 1180.6  bits: 228.5 E(32554): 1.9e-59
Smith-Waterman score: 1524; 44.8% identity (70.1% similar) in 581 aa overlap (16-587:11-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
                      :::.:   :  .:: ::: :.:: : .:: : .:.: ::: :.: 
CCDS45      MTCWLCVLSLPLLLLPAAPPPAGG-CPARCECTVQTRAVACTRRRLTAVPDGIPA
                    10        20         30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
       .:.::.:: ::.  :. : :. :  :.::::: : .. .::::: .:  : .:::.::.:
CCDS45 ETRLLELSRNRIRCLNPGDLAALPALEELDLSENAIAHVEPGAFANLPRLRVLRLRGNQL
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
       ... ::::. :. ::::::  :..:..:: .: .: ::..:::::: ::::.  ::::: 
CCDS45 KLIPPGVFTRLDNLTLLDLSENKLVILLDYTFQDLHSLRRLEVGDNDLVFVSRRAFAGLL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
        :  ::::::::... : .:..: .: :::::.: :. :    .: :  : .:::  :: 
CCDS45 ALEELTLERCNLTALSGESLGHLRSLGALRLRHLAIASLEDQNFRRLPGLLHLEIDNWPL
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
       :: .  ::: ::::.::..:. :...::  :: : . :  :.::.::::..:   .  ::
CCDS45 LEEVAAGSLRGLNLTSLSVTHTNITAVPAAALRHQAHLTCLNLSHNPISTVPRGSFRDLV
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
       ::.::.:.:: :. .  .:: ::  ..::....: :.::::..: : . : :::..::::
CCDS45 RLRELHLAGALLAVVEPQAFLGLRQIRLLNLSNNLLSTLEESTFHSVNTLETLRVDGNPL
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
       .:::::::... :. :.:    :::: : .:.: .:... : .   .:.:.   ::.   
CCDS45 ACDCRLLWIVQRRKTLNFDGRLPACATPAEVRGDALRNLPDSVLFEYFVCRKPKIRERRL
          360       370       380       390       400       410    

              430       440       450         460       470        
pF1KB9 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLG--RAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRD
       . : :  :  . : : ..:.:::::.:. :.   .    :::.:::  :::::.... .:
CCDS45 QRVTATAGEDVRFLCRAEGEPAPTVAWVTPQHRPVTATSAGRARVLPGGTLEIQDARPQD
          420       430       440       450       460       470    

      480       490       500       510           520       530    
pF1KB9 RGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDP----NITVPGIPGPFFLDSRGVAM
        :.:.::.::..:::   :.. .. :.:  ..   :    : :. .. .:  ::   . .
CCDS45 SGTYTCVASNAGGND---TYFATLTVRPEPAANRTPGEAHNETLAALRAP--LDLTTILV
          480          490       500       510       520           

          540       550       560       570          580       590 
pF1KB9 VLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPR---PSGDKNSGGNRVTAK
         :.: . ::  : .:: :. .::.:.:. :.... ..   .   :..  ..:: :    
CCDS45 STAMGCITFLGVVLFCFVLLFVWSRGRGQHKNNFSVEYSFRKVDGPAAAAGQGGARKFNM
     530       540       550       560       570       580         

          
pF1KB9 LF 
          
CCDS45 KMI
     590  

>>CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15            (614 aa)
 initn: 1608 init1: 1326 opt: 1491  Z-score: 1155.2  bits: 223.8 E(32554): 5e-58
Smith-Waterman score: 1621; 43.8% identity (72.1% similar) in 592 aa overlap (5-578:8-596)

                  10        20          30        40        50     
pF1KB9    MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLL--LPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVP
              . :.     : :.:.:.:  . .::. .::  :.:..: .:::: .... :::
CCDS73 MLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRKRFVAVP
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB9 GGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRL
        :.: .:.::::. ::.  :.:  .. .  :.::.:. : .:..:::::..: .: :: :
CCDS73 EGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFNLRTLGL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB9 QGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGA
       ..:::...  :::.::: :: ::.  :.::..::  : .: .:..:::::: ::...  :
CCDS73 RSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLVYISHRA
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB9 FAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEI
       :.:: .:  ::::.:::...:  ::..: .:..::::.:.:. .   ... : .:: :::
CCDS73 FSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYRLKVLEI
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB9 HLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARR
         :: :... :. : ::::.::.::.:::..::. :. :: .:: :.:: ::::.: .  
CCDS73 SHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPISTIEGSM
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB9 LSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRL
       :  :.::::..: :. :. .  .::.::. ...:.:. : : ::::..: :  .: :: :
CCDS73 LHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGNLETLIL
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB9 SGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALI
       ..:::.:::::::..: : .:.:. . :.:: :. :::: .:.: :.: :..:::. : :
CCDS73 DSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFTCRRARI
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450         460       470   
pF1KB9 RKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRP--HGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRS
       :    . :...::  . : : .:::: :.. :. :  : .     ::. :. :::::.: 
CCDS73 RDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDGTLEVRY
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500            510                  
pF1KB9 VQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEP-----PNGTLS---------DPNITVP
       .:..: :.:.:...:..::::. . :.: .  :     :: :..         . : :  
CCDS73 AQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGEANSTRA
              490       500       510       520       530       540

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB9 GIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSG
        .: ::  : . . .. ..::. ::  : .:. :. :::.::: .::.. ...: :: : 
CCDS73 TVPFPF--DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV-PRKSD
                550       560       570       580       590        

     580       590      
pF1KB9 DKNSGGNRVTAKLF   
                        
CCDS73 AGISSADAPRKFNMKMI
       600       610    

>>CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15            (620 aa)
 initn: 1608 init1: 1326 opt: 1491  Z-score: 1155.2  bits: 223.8 E(32554): 5.1e-58
Smith-Waterman score: 1621; 43.8% identity (72.1% similar) in 592 aa overlap (5-578:14-602)

                        10        20          30        40         
pF1KB9          MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLL--LPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHR
                    . :.     : :.:.:.:  . .::. .::  :.:..: .:::: ..
CCDS45 MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB9 QLEAVPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQS
       .. ::: :.: .:.::::. ::.  :.:  .. .  :.::.:. : .:..:::::..: .
CCDS45 RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB9 LLTLRLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLV
       : :: :..:::...  :::.::: :: ::.  :.::..::  : .: .:..:::::: ::
CCDS45 LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 FVAPGAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQ
       ...  ::.:: .:  ::::.:::...:  ::..: .:..::::.:.:. .   ... : .
CCDS45 YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
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     230       240       250       260       270       280         
pF1KB9 LKELEIHLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPIS
       :: :::  :: :... :. : ::::.::.::.:::..::. :. :: .:: :.:: ::::
CCDS45 LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB9 AIPARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDK
       .: .  :  :.::::..: :. :. .  .::.::. ...:.:. : : ::::..: :  .
CCDS45 TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
              310       320       330       340       350       360

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB9 LVTLRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFT
       : :: :..:::.:::::::..: : .:.:. . :.:: :. :::: .:.: :.: :..::
CCDS45 LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450         460       
pF1KB9 CKPALIRKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRP--HGAWLGRAGRVRVLEDG
       :. : ::    . :...::  . : : .:::: :.. :. :  : .     ::. :. ::
CCDS45 CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
              430       440       450       460       470       480

       470       480       490       500            510            
pF1KB9 TLEIRSVQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEP-----PNGTLS---------D
       :::.: .:..: :.:.:...:..::::. . :.: .  :     :: :..         .
CCDS45 TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
              490       500       510       520       530       540

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB9 PNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFV
        : :   .: ::  : . . .. ..::. ::  : .:. :. :::.::: .::.. ...:
CCDS45 ANSTRATVPFPF--DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV
              550         560       570       580       590        

           580       590      
pF1KB9 APRPSGDKNSGGNRVTAKLF   
        :: :                  
CCDS45 -PRKSDAGISSADAPRKFNMKMI
       600       610       620

>>CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9             (606 aa)
 initn: 1623 init1: 1304 opt: 1463  Z-score: 1133.9  bits: 219.8 E(32554): 7.8e-57
Smith-Waterman score: 1568; 43.7% identity (71.0% similar) in 586 aa overlap (11-584:9-588)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
                 : :.  :  .:.. :.. : ::: :.:..: ..: : .:.: :.: :.:.
CCDS65   MLHTAISCWQPFLGLAVVLIFMGSTIG-CPARCECSAQNKSVSCHRRRLIAIPEGIPI
                 10        20         30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
       .:..:::: ::: ...   .    ::.:.::: : ....:::::..: .: .:::.::::
CCDS65 ETKILDLSKNRLKSVNPEEFISYPLLEEIDLSDNIIANVEPGAFNNLFNLRSLRLKGNRL
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
       ...  :::.::: :: ::.  :.::..::  : .: .:..:::::: ::...  ::.:: 
CCDS65 KLVPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLHNLKSLEVGDNDLVYISHRAFSGLL
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
       .:  ::::.:::..::  ::..: .:..:.:..:.:. .:. :.. : .::.:::  :: 
CCDS65 SLEQLTLEKCNLTAVPTEALSHLRSLISLHLKHLNINNMPVYAFKRLFHLKHLEIDYWPL
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
       :. .  .:: ::::.::..:  :::.::: :. :: .:  :.:: ::::.: :  .: :.
CCDS65 LDMMPANSLYGLNLTSLSVTNTNLSTVPFLAFKHLVYLTHLNLSYNPISTIEAGMFSDLI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
       :::::.. :: : .:  :.:.::  ...:.:..: :.::::..: ::  : .: ...:::
CCDS65 RLQELHIVGAQLRTIEPHSFQGLRFLRVLNVSQNLLETLEENVFSSPRALEVLSINNNPL
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
       .:::::::.:. .  :.:: . : ::::  .. .:.:.: .     .::::   ::..  
CCDS65 ACDCRLLWILQRQPTLQFGGQQPMCAGPDTIRERSFKDFHSTALSFYFTCKKPKIREKKL
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450         460       470        
pF1KB9 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRA--GRVRVLEDGTLEIRSVQLRD
       . ....::  . . ::.:::: :..::. :.  ..     ::. :: ::::::: .: .:
CCDS65 QHLLVDEGQTVQLECSADGDPQPVISWVTPRRRFITTKSNGRATVLGDGTLEIRFAQDQD
       420       430       440       450       460       470       

      480       490       500                 510       520        
pF1KB9 RGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEV----------IQVEPPNGTLSDPNITVPGIPGPFFLD
        : :::..::.::::.. . : :           .  :   : :. .:.     . : ::
CCDS65 SGMYVCIASNAAGNDTFTASLTVKGFASDRFLYANRTPMYMTDSNDTISNGTNANTFSLD
       480       490       500       510       520       530       

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB9 SRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRV
        . . .  :.: . ::  : .:: :. .::.:::. :. . ...: ::    ::.:    
CCDS65 LKTILVSTAMGCFTFLGVVLFCFLLLFVWSRGKGKHKNSIDLEYV-PR----KNNGAVVE
       540       550       560       570       580            590  

      590            
pF1KB9 TAKLF         
                     
CCDS65 GEVAGPRRFNMKMI
            600      

>>CCDS46071.1 LRFN1 gene_id:57622|Hs108|chr19             (771 aa)
 initn: 527 init1: 249 opt: 520  Z-score: 411.9  bits: 86.6 E(32554): 1.3e-16
Smith-Waterman score: 549; 33.7% identity (59.5% similar) in 383 aa overlap (160-523:69-418)

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB9 GLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLAKLSTLTLER
                                     .:.. :: .. :    ::....:  ::: :
CCDS46 ICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVPPAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSR
       40        50        60        70        80        90        

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB9 CNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPSLEALDPGSL
        ... : . :.: : :: ::.:    .... .  :::::.:..:               .
CCDS46 NTIGQVAAGAFADLRALRALHLDSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHL---------------I
      100       110       120       130       140                  

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB9 VGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLVRLQELRLSG
       .: :     : :  . :. :.:.  :: .. :::: : . :.: . .. .: :. : :. 
CCDS46 LGNN----QIRR--VESAAFDAF--LSTVEDLDLSYNNLEALPWEAVGQMVNLNTLTLDH
               150         160         170       180       190     

     310       320       330       340               350       360 
pF1KB9 ACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAF--------PSPDKLVTLRLSGNPLT
         .  ::  .:  :  .  ::...: :. :   ..        :.:   .:. ..:::: 
CCDS46 NLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPKPPTPLTVSFGGNPLH
         200       210       220       230       240       250     

             370       380       390       400       410        420
pF1KB9 CDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALI-RKSGP
       :.:.:::: :: :. :.     .:: :.:.  .    : .: :  .: :.: :: :..: 
CCDS46 CNCELLWLRRLTREDDL----ETCATPEHLTDR---YFWSI-PEEEFLCEPPLITRQAGG
         260       270           280           290       300       

              430        440       450       460       470         
pF1KB9 RWVIAEEGGHAV-FSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRDR
       : ...:  :.:: . : . ::: :.: :. : :  :: ..:.::  ::::..  . ::: 
CCDS46 RALVVE--GQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTITTLRDS
       310         320       330       340       350       360     

     480       490       500          510             520       530
pF1KB9 GAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVE---PPNGT---LSDP---NITVPGIPGPFFLDSR
       :...:..::.::. .  . . :. .    :: ..   :..:   .:..:: ::       
CCDS46 GTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGANDSAAE
         370       380       390       400       410       420     

              540       550       560       570       580       590
pF1KB9 GVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRVTA
                                                                   
CCDS46 RRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAA
         430       440       450       460       470       480     

>>CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3             (581 aa)
 initn: 709 init1: 371 opt: 468  Z-score: 373.5  bits: 79.1 E(32554): 1.7e-14
Smith-Waterman score: 468; 29.7% identity (60.3% similar) in 350 aa overlap (19-360:6-353)

               10        20               30        40        50   
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPG----GSG---GSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEA
                         .:::: :    :.:    .::. : :.   : : :   .. :
CCDS33              MPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYHGCPSECTCSRASQ-VECTGARIVA
                            10        20        30         40      

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB9 VPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTL
       ::  :: ..  :.. ....  :... .  .: :  : .  :.:: . ::::..: ::  :
CCDS33 VPTPLPWNAMSLQILNTHITELNESPFLNISALIALRIEKNELSRITPGAFRNLGSLRYL
         50        60        70        80        90       100      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 RLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAP
        : .:.:...  :.:.::..:  : :  ::.. .  . :.. ..:..:..  ::: ..  
CCDS33 SLANNKLQVLPIGLFQGLDSLESLLLSSNQLLQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNHLEYIPD
        110       120       130       140       150       160      

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB9 GAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKEL
       :::  :. :. :.: . .:. .   .. .:  : .::: :  .  .: :.. :: .:.::
CCDS33 GAFDHLVGLTKLNLGKNSLTHISPRVFQHLGNLQVLRLYENRLTDIPMGTFDGLVNLQEL
        170       180       190       200       210       220      

           240        250       260       270       280       290  
pF1KB9 EIHLWPSLEALDPGSL-VGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIP
        ..   ..  :.:: .  . ::. : ..  ..:..: .....:  :  : :  : .. . 
CCDS33 ALQ-QNQIGLLSPGLFHNNHNLQRLYLSNNHISQLPPSVFMQLPQLNRLTLFGNSLKELS
         230       240       250       260       270       280     

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 ARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVT
          ..:.  :.:: :    ..:.  ..: .:  ...: .. : .. .   :: .  .:  
CCDS33 PGIFGPMPNLRELWLYDNHISSLPDNVFSNLRQLQVLILSRNQISFISPGAFNGLTELRE
         290       300       310       320       330       340     

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB9 LRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKP
       : :  : :                                                    
CCDS33 LSLHTNALQDLDGNVFRMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQLENLP
         350       360       370       380       390       400     

>>CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3            (587 aa)
 initn: 709 init1: 371 opt: 468  Z-score: 373.5  bits: 79.1 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 468; 29.7% identity (60.3% similar) in 350 aa overlap (19-360:12-359)

               10        20               30        40        50   
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPG----GSG---GSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEA
                         .:::: :    :.:    .::. : :.   : : :   .. :
CCDS46        MPLDKAMPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYHGCPSECTCSRASQ-VECTGARIVA
                      10        20        30        40         50  

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB9 VPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTL
       ::  :: ..  :.. ....  :... .  .: :  : .  :.:: . ::::..: ::  :
CCDS46 VPTPLPWNAMSLQILNTHITELNESPFLNISALIALRIEKNELSRITPGAFRNLGSLRYL
             60        70        80        90       100       110  

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 RLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAP
        : .:.:...  :.:.::..:  : :  ::.. .  . :.. ..:..:..  ::: ..  
CCDS46 SLANNKLQVLPIGLFQGLDSLESLLLSSNQLLQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNHLEYIPD
            120       130       140       150       160       170  

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB9 GAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKEL
       :::  :. :. :.: . .:. .   .. .:  : .::: :  .  .: :.. :: .:.::
CCDS46 GAFDHLVGLTKLNLGKNSLTHISPRVFQHLGNLQVLRLYENRLTDIPMGTFDGLVNLQEL
            180       190       200       210       220       230  

           240        250       260       270       280       290  
pF1KB9 EIHLWPSLEALDPGSL-VGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIP
        ..   ..  :.:: .  . ::. : ..  ..:..: .....:  :  : :  : .. . 
CCDS46 ALQ-QNQIGLLSPGLFHNNHNLQRLYLSNNHISQLPPSVFMQLPQLNRLTLFGNSLKELS
             240       250       260       270       280       290 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 ARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVT
          ..:.  :.:: :    ..:.  ..: .:  ...: .. : .. .   :: .  .:  
CCDS46 PGIFGPMPNLRELWLYDNHISSLPDNVFSNLRQLQVLILSRNQISFISPGAFNGLTELRE
             300       310       320       330       340       350 

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB9 LRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKP
       : :  : :                                                    
CCDS46 LSLHTNALQDLDGNVFRMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQLENLP
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16             (605 aa)
 initn: 429 init1: 429 opt: 467  Z-score: 372.6  bits: 79.0 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 471; 34.4% identity (58.4% similar) in 375 aa overlap (4-361:87-447)

                                          10        20        30   
pF1KB9                            MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPA
                                     ...:  :.     : :: :  ::. ::   
CCDS10 SVFCSSRNLTRLPDGVPGGTQALWLDGNNLSSVPPAAFQNLSSLGFLNL-QGGQLGSL--
         60        70        80        90       100        110     

            40                 50        60           70        80 
pF1KB9 VCDCTSQPQAVL-----CG-H---RQLEAVPGGLPLDTELL---DLSGNRLWGLQQGMLS
             .:::.:     :  :    ::...  :    :  :    ::.:::  :..:.. 
CCDS10 ------EPQALLGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALASLGLSNNRLSRLEDGLFE
                 120       130       140       150       160       

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB9 RLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRL
        :. : .:.:..:.:..:  .::.:: ::  : : ::::  . :..::::. :  :::  
CCDS10 GLGSLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSR
       170       180       190       200       210       220       

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 NQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALA
       : .  .  ..: .:  :::: .  : .. :::::: ::  :  : : .   . : ::   
CCDS10 NALRAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSH---NRVAGLLED
       230       240       250       260       270          280    

             210          220       230        240       250       
pF1KB9 RLPALVALRLRELD---IGRLPAGALRGLGQLKELEI-HLWPSLEALDPGSLVGLN-LSS
        .:.:..::. .:.   :. :   ... :  :.::.. :    .. :   :. ::. :  
CCDS10 TFPGLLGLRVLRLSHNAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGH--NRIRQLAERSFEGLGQLEV
          290       300       310       320         330       340  

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB9 LAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIA
       :.. . .:. :   :.  :. . :..:: : .  .: . .  : .:. :.: :.::  : 
CCDS10 LTLDHNQLQEVKAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIR
            350       360       370       380       390       400  

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB9 AHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHL
        :.: ::.... : . ::.:  .:: .. .  .:. : :..: ::               
CCDS10 PHTFTGLSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEY
            410       420       430       440       450       460  

        380       390       400       410       420       430      
pF1KB9 DFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGPRWVIAEEGGHAVFSCS
                                                                   
CCDS10 LLLSRNRLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFT
            470       480       490       500       510       520  

>>CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16             (643 aa)
 initn: 429 init1: 429 opt: 467  Z-score: 372.3  bits: 79.0 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 471; 34.4% identity (58.4% similar) in 375 aa overlap (4-361:125-485)

                                          10        20        30   
pF1KB9                            MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPA
                                     ...:  :.     : :: :  ::. ::   
CCDS53 SVFCSSRNLTRLPDGVPGGTQALWLDGNNLSSVPPAAFQNLSSLGFLNL-QGGQLGSL--
          100       110       120       130       140        150   

            40                 50        60           70        80 
pF1KB9 VCDCTSQPQAVL-----CG-H---RQLEAVPGGLPLDTELL---DLSGNRLWGLQQGMLS
             .:::.:     :  :    ::...  :    :  :    ::.:::  :..:.. 
CCDS53 ------EPQALLGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALASLGLSNNRLSRLEDGLFE
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        :. : .:.:..:.:..:  .::.:: ::  : : ::::  . :..::::. :  :::  
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       : .  .  ..: .:  :::: .  : .. :::::: ::  :  : : .   . : ::   
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        .:.:..::. .:.   :. :   ... :  :.::.. :    .. :   :. ::. :  
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       :.. . .:. :   :.  :. . :..:: : .  .: . .  : .:. :.: :.::  : 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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