Result of FASTA (omim) for
pFN21AB9611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9611, 589 aa
1>>>pF1KB9611 589 - 589 aa - 589 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6462+/-0.000439; mu= 16.9091+/- 0.027
mean_var=83.9646+/-17.074, 0's: 0 Z-trim(110.6): 385 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.139967
statistics sampled from 18490 (18930) to 18490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 9.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_001243505 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 516) 2742 564.4 3.3e-160
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 928 198.1 6.5e-50
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 928 198.1 6.8e-50
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 910 194.5 8.2e-49
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 910 194.5 8.7e-49
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 910 194.5 8.8e-49
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 897 191.8 5e-48
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 897 191.9 5.2e-48
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 897 191.9 5.3e-48
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 877 187.8 9.1e-47
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 822 176.7 1.7e-43
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 808 173.9 1.4e-42
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 794 171.0 9.3e-42
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 794 171.1 1.1e-41
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 794 171.1 1.2e-41
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 794 171.1 1.2e-41
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 794 171.1 1.2e-41
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 794 171.1 1.2e-41
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 794 171.1 1.2e-41
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 794 171.1 1.2e-41
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 793 170.9 1.4e-41
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 793 170.9 1.4e-41
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 793 170.9 1.4e-41
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 781 168.4 5.2e-41
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 781 168.4 5.2e-41
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 746 161.3 6.6e-39
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 746 161.3 7.2e-39
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 733 158.7 4.8e-38
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 733 158.7 4.8e-38
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 732 158.6 6.5e-38
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 731 158.4 7.5e-38
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 728 157.7 1e-37
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 728 157.7 1e-37
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 716 155.3 4.6e-37
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 716 155.3 4.6e-37
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 711 154.3 1.2e-36
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 702 152.5 3.8e-36
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 702 152.5 3.8e-36
>>NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro (589 aa)
initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3376.2 bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
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NP_001 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
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NP_001 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
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NP_001 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
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NP_001 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
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NP_001 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
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pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
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NP_001 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
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pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
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NP_001 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
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pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
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NP_001 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
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>>XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-neural (589 aa)
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pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
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XP_011 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
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pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
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XP_011 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
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pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
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pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
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pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
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>>XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-neural (589 aa)
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XP_011 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
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pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
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XP_011 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
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>>NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex protei (589 aa)
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Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
:::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
NP_003 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
:::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
NP_003 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
:::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
NP_003 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. : .:::::..:::::
NP_003 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
::. :.: :. : :. ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
NP_003 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
:::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_003 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
:::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.:::
NP_003 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::::: :::::. : :::
NP_003 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
:::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
NP_003 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
:::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
NP_003 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
550 560 570 580
>>NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro (589 aa)
initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3376.2 bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
:::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
NP_001 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
:::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
NP_001 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
:::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
NP_001 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. : .:::::..:::::
NP_001 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
::. :.: :. : :. ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
NP_001 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
:::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_001 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
:::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.:::
NP_001 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
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NP_001 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
:::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
NP_001 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
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NP_001 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
550 560 570 580
>>NP_001243505 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro (516 aa)
initn: 2904 init1: 2742 opt: 2742 Z-score: 2997.2 bits: 564.4 E(85289): 3.3e-160
Smith-Waterman score: 2742; 75.2% identity (91.5% similar) in 516 aa overlap (74-589:1-516)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 MFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLD
::: ::.::.:. :::....::::::::::
NP_001 MFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FAYSSRIAINEENAESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRR
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NP_001 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LYEFSWRMCLVHFETVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLE
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NP_001 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 PRKVHLPELLRSVRLALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVV
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NP_001 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 TSPCARPRKAGHTLLILGGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVY
:: ::::::.::.:..::::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::
NP_001 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 VTGGRGSENGVSKDVWVYDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVF
.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .
NP_001 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PASPSVSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQ
::::::::::::.::: ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::
NP_001 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 CYDPSENRWTIKAECPQPWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGD
::: :::::. : ::::::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::
NP_001 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
400 410 420 430 440 450
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pF1KB9 MTAKRMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVST
.:::::::::.:::::::::::::: :::::::::::: :.:: ::::::::::::::::
NP_001 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 WKHLPA
:::::.
NP_001 WKHLPS
>>NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein (555 aa)
initn: 815 init1: 446 opt: 928 Z-score: 1017.1 bits: 198.1 E(85289): 6.5e-50
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:8-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 HETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLA
.: ::.. .. :: . : : . ::.:::
NP_001 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
: : :: :::. . ::. ....: . ..: :.:. :...: ..:::.. :: :..
NP_001 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
.::. :::. .::...: :.::::. ..:.: : : . . . :: : .:.:
NP_001 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : : :. .:.. ::: ::: :
NP_001 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
: ..: :::. .. : .. ::.. . :.. .. .: ..:: ......::
NP_001 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
:. . . : . . :.::: : . .. .. .::..:: .. : . : ::
NP_001 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPGA
: :...:.. : : : :.: :.. ::.::: . .: : .:: :. .
NP_001 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
:.:..:::. :...: .. ::.. :: . :. .: :. :.:. :.: :.
NP_001 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
....::..:.. :: : .. :. .: :: : ...::. : . . : ..
NP_001 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KB9 LYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
:::::: :. ... :.:..: :. . :
NP_001 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
510 520 530 540 550
>>NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein 3 i (587 aa)
initn: 815 init1: 446 opt: 928 Z-score: 1016.7 bits: 198.1 E(85289): 6.8e-50
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:40-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 HETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLA
.: ::.. .. :: . : : . ::.:::
NP_059 SQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
: : :: :::. . ::. ....: . ..: :.:. :...: ..:::.. :: :..
NP_059 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
.::. :::. .::...: :.::::. ..:.: : : . . . :: : .:.:
NP_059 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : : :. .:.. ::: ::: :
NP_059 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
: ..: :::. .. : .. ::.. . :.. .. .: ..:: ......::
NP_059 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
:. . . : . . :.::: : . .. .. .::..:: .. : . : ::
NP_059 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPGA
: :...:.. : : : :.: :.. ::.::: . .: : .:: :. .
NP_059 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
:.:..:::. :...: .. ::.. :: . :. .: :. :.:. :.: :.
NP_059 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
....::..:.. :: : .. :. .: :: : ...::. : . . : ..
NP_059 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB9 LYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
:::::: :. ... :.:..: :. . :
NP_059 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
540 550 560 570 580
>>NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 isoform (568 aa)
initn: 961 init1: 401 opt: 910 Z-score: 997.3 bits: 194.5 E(85289): 8.2e-49
Smith-Waterman score: 910; 31.2% identity (63.2% similar) in 555 aa overlap (27-571:14-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
.: .: .:.::: . :::: . .. :: :
NP_067 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAH
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
: :::: : :: :::. : :. :..: .: ..:.::::.:. . .. ::.. :
NP_067 RIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQ-GLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQEL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
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