FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4233, 850 aa 1>>>pF1KE4233 850 - 850 aa - 850 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6053+/-0.00105; mu= 20.0789+/- 0.063 mean_var=92.7142+/-18.905, 0's: 0 Z-trim(105.4): 101 B-trim: 184 in 1/49 Lambda= 0.133199 statistics sampled from 8297 (8411) to 8297 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16 Scan time: 2.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3117.1 RASA2 gene_id:5922|Hs108|chr3 ( 849) 5624 1091.9 0 CCDS32016.1 RASA3 gene_id:22821|Hs108|chr13 ( 834) 3522 687.9 1.9e-197 CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 803) 829 170.4 1.1e-41 CCDS9165.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 804) 711 147.7 7.5e-35 CCDS73529.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 805) 674 140.6 1e-32 CCDS55889.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 806) 672 140.2 1.4e-32 CCDS59506.1 RASA4B gene_id:100271927|Hs108|chr7 ( 757) 611 128.5 4.4e-29 CCDS47674.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 757) 608 127.9 6.5e-29 CCDS55888.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 776) 482 103.7 1.3e-21 CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1065) 398 87.7 1.2e-16 CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1132) 398 87.7 1.2e-16 CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1139) 379 84.1 1.6e-15 CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 ( 870) 377 83.6 1.7e-15 CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1280) 379 84.1 1.7e-15 CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 (1047) 377 83.6 1.9e-15 CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6 (1343) 364 81.2 1.3e-14 CCDS11264.1 NF1 gene_id:4763|Hs108|chr17 (2818) 344 77.7 3.3e-13 CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19 (1011) 328 74.2 1.3e-12 >>CCDS3117.1 RASA2 gene_id:5922|Hs108|chr3 (849 aa) initn: 4271 init1: 4271 opt: 5624 Z-score: 5841.2 bits: 1091.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5624; 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CCDS32 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK ::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: : CCDS32 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL :::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:.. CCDS32 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL :::::.::. ..::: .:.: ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.::: CCDS32 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF :: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..:::::::::: CCDS32 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS .:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: ::::::: CCDS32 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS ::.:::: ::::::: ::::..: :...:.:. : :::.::: :::. .. ... CCDS32 KTVQTLG---SLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAV .:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::. :.. .:.::..::::: CCDS32 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQP-LYSIPIENILAV 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 EKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYL ::::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.:: CCDS32 EKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYL 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 NGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACG .:.::::. .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.:::: CCDS32 SGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACG 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 TIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSK . .::.::..: .::.:::.: :.::..:. . . :.. : .:.. . ...::::. CCDS32 SKSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQ 760 770 780 790 800 810 850 pF1KE4 ENPIVGKAS :.:: :. CCDS32 EHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI 820 830 >>CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 (803 aa) initn: 936 init1: 207 opt: 829 Z-score: 861.7 bits: 170.4 E(32554): 1.1e-41 Smith-Waterman score: 1190; 31.1% identity (61.0% similar) in 798 aa overlap (39-795:6-767) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL :: .: :.::: : : .: ... CCDS57 MAKRSSLYIRIVEGKNL-PAKDITGSSDPYCIVKV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDL :.: . :: .: :.: ::..::. ..: ::. ..:::.:...:.:: :::: . .. . CCDS57 DNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVHLPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 CNH-SGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLIN .: .: : : :: . ::::..::.:. . .. .:. ..: : CCDS57 ASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEIHLRLE----VWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDR 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEED . . ::.. : : .: .:.. ::. :..:: : ::. .: CCDS57 NGTSDPFVRVRYKGRTR----ETSIVKKSCYPRWNETFEFEL--------------QEGA 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 IEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLG .: : . . :. . .. :::.. . :. ::. .....:. ::: .. .. .:: CCDS57 MEALCV--EAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLG 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLL-------LKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA ::.:.. .. :::: :: :: :: ...: : : .: ::. :. CCDS57 SLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPG-QLIPLIEETTSTE-CRQ--DV 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 VLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKV . :..:.: . : . .:.:. :...::.::.::::.. .. ..:..: .::. CCDS57 ATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAGMQYLHG 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 pF1KE4 TLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLK--------------EGDNVENNKENLRYYVDKLFNT .: ::.... . .: :.:: :.. :.. .:.. ..:: .. :... CCDS57 VLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHLGALLSA 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 IVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH--VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFH . .: .::.:. : .: . . .:::. : : . ::.::. ::::. :..::. :: CCDS57 LSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIMSPKLFH 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 LRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKK :: .: ::.: ::: :..:..:.. :... : ::..: : .. ..: . .: CCDS57 LRERHADARTSRTLLLLAKAVQNV---GNMDTPASRAKEAWM-EPLQPTVRQG-VAQLKD 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE4 FLDEISSTETKESSGTSEPVHL-----KEGEMY-KRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSREL :. .. . : :. .. . : ::: .. .:..:. . ...::: .: ::.. : CCDS57 FITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEAL 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 TYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTE---KPL--YVQANNCV- .. : :.:: . : . :: :.::.::.::. ....:::.:. .: :.: . :: CCDS57 SFAKTPSSKKSAL-IKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCK-CVN 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 EANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQID : :.:...: .:: : . :. :::.:. . .: ::.. .. :: . : . : CCDS57 ELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWND 660 670 680 690 700 710 760 770 780 790 800 pF1KE4 -IDEDRETERIYS-LFTLSLLKLQKMEEACGTI---AVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTT .:.: :.. :: :. . . .. .: : .: .: : :.: CCDS57 PLDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDL 720 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 pF1KE4 FKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS CCDS57 REAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT 780 790 800 >>CCDS9165.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 (804 aa) initn: 819 init1: 191 opt: 711 Z-score: 739.2 bits: 147.7 E(32554): 7.5e-35 Smith-Waterman score: 1083; 28.1% identity (60.6% similar) in 840 aa overlap (39-839:6-800) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL :: .. :.. : : : .: ... CCDS91 MAKSSSLNVRVVEGRAL-PAKDVSGSSDPYCLVKV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDL :.: : :: .: .::.::..::. ..: :. :.::: :.... .: :::.....: . CCDS91 DDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVHLPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 C-NHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL-PL- . : ..:..:. :: ..::::.. : ... : .. : : :. . : : CCDS91 TADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEICLSVQMLE---DGQGRC--LRCHVLQARDLAPRD 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 INGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEE :.: : ::.: : . : ... .:.. ::: :...:.. ...: CCDS91 ISGTS-DPFARV-FWG---SQSLETSTIKKTRFPHWDEVL----------------ELRE 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDD .:..::. . .. ::: .. ..:. .. ..:. : : ....: . 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CCDS91 EVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGLLTGYLGPIVD 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 TIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH--VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTF .:: : :: .: : .:.. . .:::. : :.: :.:.:.:::::: :...:. : CCDS91 AIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFFAPAILTPKLF 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 HLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVK :: .: : :: :.: :..:..:..:. : .. .. :: .: . .. . . :. CCDS91 DLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLG---QQLGQGKELWMAPLHPFLLQC--VSRVR 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 pF1KE4 KFLDEISSTETKESSGTSEPVH-----LKEGEMYKRAQGRTRIGKK-NFKKRWFCLTSRE :::.. ... :.. .. . ..:: . :: . . .. . ::::. :... 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CCDS91 PLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQLRLKLLEDSNMDTTLEADTGACPE----VLARQRAATAR 720 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 pF1KE4 TIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS .. .. ::. ::...... ..: : CCDS91 LLE----VLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>CCDS73529.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 (805 aa) initn: 865 init1: 184 opt: 674 Z-score: 700.7 bits: 140.6 E(32554): 1e-32 Smith-Waterman score: 1088; 28.3% identity (60.4% similar) in 841 aa overlap (39-839:6-801) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL :: .. :.. : : : .: ... CCDS73 MAKSSSLNVRVVEGRAL-PAKDVSGSSDPYCLVKV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 DQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDL :.: : :: .: .::.::..::. ..: :. :.::: :.... .: :::.....: . CCDS73 DDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVHLPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 C-NHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL-PL- . : ..:..:. :: ..::::.. : ... : .. : : :. . : : CCDS73 TADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEICLSVQMLE---DGQGRC--LRCHVLQARDLAPRD 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 INGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEE :.: : ::.: : . : ... .:.. ::: :...:.. ...: CCDS73 ISGTS-DPFARV-FWG---SQSLETSTIKKTRFPHWDEVL----------------ELRE 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDD .:..::. . .. ::: .. ..:. .. ..:. : : ....: . CCDS73 MPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQ-QKPPKGWFRLLPFPRAEEDSG-GN 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 pF1KE4 LGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPD--VQPISASAAYILSEI----CRDKND ::.::... :: ::::. : :: ::..: . .. .:: .: :. ::. : CCDS73 LGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESVQGPAEEDTASPLALLEELTLGDCRQ--D 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 AVLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLK . ::.:.: . : ... .. :.: ::.::.::::.. ....::.:: ::. CCDS73 LATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQFMKLVGMPYLH 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 pF1KE4 VTLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGD----------NVENNKEN----LRYYVDKLFN .:::..... . .: :.:: :. : . :. .:. : :. . . CCDS73 EVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGLLTGYLGPIVD 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 TIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH--VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTF .:: : :: .: : .:.. . .:::. : :.: :.:.:.:::::: :...:. : CCDS73 AIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFFAPAILTPKLF 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 HLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVK :: .: : :: :.: :..:..:..:. : .. .. :: .: . .. . . :. CCDS73 DLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLG---QQLGQGKELWMAPLHPFLLQC--VSRVR 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 pF1KE4 KFLDEISSTETKESSGTSE-----PVHL-KEGEMYKRAQGRTRIGKK-NFKKRWFCLTSR :::.. ... : .:. : . .:: . :: . . .. . ::::. :... CCDS73 DFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYVWLSGE 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 ELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTE-----KPLYVQANNC :.. :.: . ..:::..: :::...:..:. ...::. . . :.: .: CCDS73 TLSFSKSP-EWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQCKNV 600 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 VEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVP-ADIQ : :.:...: ..: : :.:. ::... .. : :: .. ... ::. ..: .: . 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CCDS55 DDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVHLPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 C-NHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL-PL- . : ..:..:. :: ..::::.. : ... : .. : : :. . : : CCDS55 TADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEICLSVQMLE---DGQGRC--LRCHVLQARDLAPRD 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 INGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEE :.: : ::.: : . : ... .:.. ::: :...:.. ...: CCDS55 ISGTS-DPFARV-FWG---SQSLETSTIKKTRFPHWDEVL----------------ELRE 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDD .:..::. . .. ::: .. ..:. .. ..:. : : ....: . CCDS55 MPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQ-QKPPKGWFRLLPFPRAEEDSG-GN 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 pF1KE4 LGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPD--VQPISASAAYILSEI----CRDKND ::.::... :: ::::. : :: ::..: . .. .:: .: :. ::. : CCDS55 LGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESVQGPAEEDTASPLALLEELTLGDCRQ--D 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 AVLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLK . ::.:.: . : ... .. :.: ::.::.::::.. ....::.:: ::. CCDS55 LATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQFMKLVGMPYLH 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 pF1KE4 VTLKPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGD----------NVENNKEN----LRYYVDKLFN .:::..... . .: :.:: :. : . :. .:. : :. . . CCDS55 EVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGLLTGYLGPIVD 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 TIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH---VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHT .:: : :: .: : .:.. . .:::. : :.: :.:.:.:::::: :...:. CCDS55 AIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQQDVKYLAISGFLFLRFFAPAILTPKL 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 FHLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAV : :: .: : :: :.: :..:..:..:. : .. .. :: .: . .. . . : CCDS55 FDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLG---QQLGQGKELWMAPLHPFLLQC--VSRV 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 pF1KE4 KKFLDEISSTETKESSGTSE-----PVHL-KEGEMYKRAQGRTRIGKK-NFKKRWFCLTS . :::.. ... : .:. : . .:: . :: . . .. . ::::. :.. CCDS55 RDFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYVWLSG 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 RELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTE-----KPLYVQANN . :.. :.: . ..:::..: :::...:..:. ...::. . . :.: .: CCDS55 ETLSFSKSP-EWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQCKN 600 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 pF1KE4 CVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVP-ADI : :.:...: ..: : :.:. ::... .. : :: .. ... ::. ..: .: CCDS55 VNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTLGDW 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 800 pF1KE4 QIDIDEDRETERIYSLFTLS--LLKLQKMEEACGTIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTT . .: : :.. .: . :. :.:. .:.. .. :. . .. ..: CCDS55 SDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQLRLKLLEDSNMDTTLEADTGACPE----VLARQRAAT 720 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 pF1KE4 FKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS . .. .. ::. ::...... ..: : CCDS55 ARLLE----VLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>CCDS59506.1 RASA4B gene_id:100271927|Hs108|chr7 (757 aa) initn: 825 init1: 207 opt: 611 Z-score: 635.7 bits: 128.5 E(32554): 4.4e-29 Smith-Waterman score: 1040; 29.1% identity (57.4% similar) in 793 aa overlap (39-795:6-721) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL :: .: :.::: : : .: ... 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CCDS59 DNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVHLPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 CNH-SGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLIN .: .: : : :: . ::::..::.:. . .. .:. ..: : CCDS59 ASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEIHLRLE----VWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDR 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEED . . ::.. : : .: .:.. ::. :..:: : ::. .: CCDS59 NGTSDPFVRVRYKGRTR----ETSIVKKSCYPRWNETFEFEL--------------QEGA 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 IEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLG .: : . . :. . .. :::.. . :. ::. .....:. ::: .. .. .:: CCDS59 MEALCV--EAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLG 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLL-------LKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA ::.:.. .. :::: :: :: :: ...: : : .: ::. :. 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CCDS47 DNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVHLPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 CNH-SGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLIN .: .: : : :: . ::::..::.:. . .. .:. ..: : CCDS47 ASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEIHLRLE----VWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDR 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEED . . ::.. : : .: .:.. ::. :..:: : ::. .: CCDS47 NGTSDPFVRVRYKGRTR----ETSIVKKSCYPRWNETFEFEL--------------QEGA 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 IEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLG .: : . . :. . .. :::.. . :. ::. .....:. ::: .. .. .:: CCDS47 MEALCV--EAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLG 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLL-------LKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDA ::.:.. .. :::: :: :: :: ...: : : .: ::. :. 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CCDS47 VLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHLGALLSA 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 IVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPH--VQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFH . .: .::.:. : .: . . .:::. : : . ::.::. ::::. :..::. :: CCDS47 LSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIMSPKLFH 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 LRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKK :: .: ::.: ::: :..:..:.. :... : ::..: : .. ..: . .: CCDS47 LRERHADARTSRTLLLLAKAVQNV---GNMDTPASRAKEAWM-EPLQPTVRQG-VAQLKD 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE4 FLDEISSTETKESSGTSEPVHL-----KEGEMY-KRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSREL :. .. . : :. .. . : ::: .. .:..:. . ...::: .: ::.. : CCDS47 FITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEAL 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 TYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCV-EANEW .. : :.:: :: : :.: CCDS47 SFAKTPSSK-------------------------------------------CVNELNQW 610 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 IDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQID-IDED ...: .:: : . :. :::.:. . .: ::.. .. :: . : . : .:.: CCDS47 LSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDPLDHD 620 630 640 650 660 670 760 770 780 790 800 810 pF1KE4 RETERIYS-LFTLSLLKLQKMEEACGTI---AVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQ :.. :: :. . . .. .: : .: .: : :.: CCDS47 LEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLREAHS 680 690 700 710 720 730 820 830 840 850 pF1KE4 QIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS CCDS47 SSPAGSPPSEPNCLLELQT 740 750 >>CCDS55888.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 (776 aa) initn: 823 init1: 195 opt: 482 Z-score: 501.5 bits: 103.7 E(32554): 1.3e-21 Smith-Waterman score: 989; 27.3% identity (58.6% similar) in 835 aa overlap (39-839:6-772) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINL :: .. :.. : : : .: ... 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CCDS68 DRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGS-----KEEYMS-FMNQFLEHEWT-NMQRFLLEISN 430 440 450 460 470 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 TETKESSGTSEPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIY :: CCDS68 PETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPG 480 490 500 510 520 530 850 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 9 12:20:11 2016 done: Wed Nov 9 12:20:12 2016 Total Scan time: 2.600 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]