Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0827
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0827, 220 aa
1>>>pF1KE0827 220 - 220 aa - 220 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7634+/-0.00118; mu= 10.9207+/- 0.069
mean_var=92.1053+/-24.762, 0's: 0 Z-trim(102.2): 354 B-trim: 804 in 2/44
Lambda= 0.133639
statistics sampled from 6446 (6850) to 6446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 1.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1131 228.7 3.2e-60
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1090 220.8 7.8e-58
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1038 210.8 7.8e-55
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 957 195.2 4.3e-50
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 904 184.9 4.7e-47
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 894 183.1 2e-46
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 878 179.9 1.5e-45
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 873 179.0 3e-45
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 859 176.3 1.9e-44
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 853 175.1 4.5e-44
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 844 173.4 1.4e-43
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 843 173.2 1.6e-43
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 836 171.8 4.1e-43
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 833 171.3 6.2e-43
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 821 168.9 3.1e-42
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 783 161.6 5e-40
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 782 161.4 5.8e-40
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 779 160.9 8.5e-40
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 772 159.5 2.3e-39
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 767 158.5 4.2e-39
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 766 158.3 4.8e-39
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 761 157.4 9.4e-39
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 757 156.6 1.6e-38
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 749 155.1 4.7e-38
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 748 154.9 5.3e-38
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 731 151.6 5.2e-37
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 724 150.2 1.3e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 720 149.5 2.2e-36
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 719 149.3 2.5e-36
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 717 148.9 3.4e-36
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 715 148.5 4.4e-36
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 715 148.5 4.4e-36
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 715 148.5 4.4e-36
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 713 148.2 6.2e-36
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 712 147.9 6.6e-36
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 712 147.9 6.6e-36
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 711 147.7 7.5e-36
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 711 147.7 7.5e-36
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 705 146.6 1.7e-35
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 704 146.4 1.9e-35
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 701 145.8 2.8e-35
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 696 144.8 5.6e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 693 144.3 8.5e-35
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 685 142.7 2.4e-34
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 665 138.9 3.5e-33
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 653 136.6 1.7e-32
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 645 135.0 5.1e-32
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 636 133.3 1.7e-31
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 634 132.9 2.2e-31
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 614 129.0 3.3e-30
>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 778 init1: 778 opt: 1131 Z-score: 1194.7 bits: 228.7 E(32554): 3.2e-60
Smith-Waterman score: 1131; 80.5% identity (90.0% similar) in 221 aa overlap (1-220:96-315)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
::::: ::.:::.:.::::::: :::::::
CCDS73 FIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDRYVAIC
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
::::::::::::: .::::::: :::.::.::::: ::::::::::: :: :::.:::::
CCDS73 KPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVV-YSLPFCGPNVIVHFSCDMHPLLEL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
::::::::::.:: ..::.::::: :::::::: :.:::::::: : :::::::: :::
CCDS73 ACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSGSTVV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
:::::::::.::::::::: :::.:::::.:: ::.:..:::::::: :::..:: ::::
CCDS73 VLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLGKKLT
250 260 270 280 290 300
220
pF1KE0 IVRIR-VSLLM
: : ::.::
CCDS73 IFIIGGVSVLM
310
>>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1090 init1: 1090 opt: 1090 Z-score: 1151.7 bits: 220.8 E(32554): 7.8e-58
Smith-Waterman score: 1090; 76.0% identity (88.5% similar) in 217 aa overlap (1-217:96-312)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
::::: .::.::.:.::::::::::::::
CCDS31 LMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDRYVAIS
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
::::::.:::: : :::::::: :::.::: ::: :::::.:::::::: :::::::::
CCDS31 KPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMYPLLEL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
: :::::::.:: .:: .:::::..:::: :: :: ::::::: :.::: :: ::: ::
CCDS31 LCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
.: ::::::::::::::::.::..::::..:: ::::..:.::.::: ::.:.: :.::.
CCDS31 ALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEKLS
250 260 270 280 290 300
220
pF1KE0 IVRIRVSLLM
::: :::
CCDS31 IVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
310 320
>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1070 init1: 1030 opt: 1038 Z-score: 1097.9 bits: 210.8 E(32554): 7.8e-55
Smith-Waterman score: 1038; 71.3% identity (89.5% similar) in 209 aa overlap (1-209:96-304)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
:.::: .:.:::.:.:::.::::: :::::
CCDS31 FIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDCYVAIC
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
::::::.:: . : ..::::. .:::::::::. ..:.::::::::::::::::::::.:
CCDS31 KPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLKL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
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CCDS31 VCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSSHMTVV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
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CCDS31 VFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLWRRDLI
250 260 270 280 290 300
220
pF1KE0 IVRIRVSLLM
CCDS31 SSST
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 950 init1: 950 opt: 957 Z-score: 1012.9 bits: 195.2 E(32554): 4.3e-50
Smith-Waterman score: 957; 63.5% identity (86.7% similar) in 211 aa overlap (1-211:126-336)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
:.::: ::::.:.:..::::::::::.:::
CCDS31 FIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTISFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAIC
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
:::: : :::.: .:.:..: ::::::. :.. .:.::::::::::.:.::.::::.:
CCDS31 KPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGFLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKL
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
:::.:: ::... .:::.: : : .:.:::: :.:::: : ::.:::. ::.::.:::
CCDS31 ACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFFTILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
.::::::::.:.:: :.::::: .:: : :::::::..:::.:.:: .:...: ::..
CCDS31 ILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVS
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE0 IVRIRVSLLM
.
CCDS31 LAGKWLYHS
340
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 872 init1: 872 opt: 904 Z-score: 958.3 bits: 184.9 E(32554): 4.7e-47
Smith-Waterman score: 904; 62.0% identity (88.0% similar) in 208 aa overlap (1-208:96-303)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
: :.: .:.:::.: .::.:::::.:::::
CCDS73 FIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAIC
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
:::::.::::. : ::. :. :::::...::. ...::::::::::::.::. :::.:
CCDS73 KPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
:::::... : .. ..: .:.. :::::.:: : : ::.:.: :.:.:::::: ::::::
CCDS73 ACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
.::::::::.:.::....:::: :..:::.:::::::..:::.:..: :::..: .:
CCDS73 ILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDI
250 260 270 280 290 300
220
pF1KE0 IVRIRVSLLM
CCDS73 SGDK
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 890 init1: 890 opt: 894 Z-score: 946.8 bits: 183.1 E(32554): 2e-46
Smith-Waterman score: 894; 57.8% identity (89.6% similar) in 211 aa overlap (1-211:151-361)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
: :::..:.:.:.:...:..::::::::::
CCDS31 FLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKTISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAIC
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
::::: .::::.. .:. :: :::.:::..::. ..:::::::::.::.::.::::::
CCDS31 KPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTGGLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLEL
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ACTDTYFIGLAVVFSGGAMCMVIFALLLISYGVSLNSLKTYSQEGRRKALSTCSSHITVV
:::::...:: ::...: .:.. :.:::.::.: : ::.:.:.::: ::::::.:::.::
CCDS31 ACTDTHIFGLMVVINSGFICIINFSLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVV
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VLFFVPCIFMYVRPVSNFPIDKFVTVFYTVITPMLNPFLYTLRNSEMINAIKHLLCKKLT
.::::::::.:.:: : : .::....:: ...:.:::..::.::.:. .:.... . ..
CCDS31 ILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMAAIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMV
310 320 330 340 350 360
220
pF1KE0 IVRIRVSLLM
.
CCDS31 VSDEKENIKL
370
>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 933 init1: 877 opt: 878 Z-score: 931.2 bits: 179.9 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 878; 59.9% identity (86.5% similar) in 207 aa overlap (1-207:96-302)
10 20 30
pF1KE0 MGQLFTDHLFGGTEIFLLVVMAYDRYVAIC
. :::..:.:::. :.::.:::::::::::
CCDS31 LLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDRYVAIC
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 KPLHYLTIMNRQVSILLLVVAMTGGFLHSVFQIVVLYSLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLEL
::::: ::. .: :.. : .:::.:...:.. .:..::::::.::::.::.. :: :
CCDS31 KPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLFQLLTL
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]