Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0707
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0707, 426 aa
1>>>pF1KE0707 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3126+/-0.000831; mu= 17.2289+/- 0.050
mean_var=129.1864+/-48.325, 0's: 0 Z-trim(107.7): 336 B-trim: 1147 in 2/48
Lambda= 0.112841
statistics sampled from 9149 (9765) to 9149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 ( 426) 2912 486.1 2.8e-137
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 898 158.2 1.4e-38
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 ( 418) 621 113.1 5.3e-25
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 ( 398) 448 84.9 1.5e-16
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 289) 425 81.0 1.7e-15
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 425 81.1 2e-15
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 ( 412) 407 78.2 1.6e-14
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 ( 410) 391 75.6 9.7e-14
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 388 75.2 1.4e-13
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 388 75.2 1.4e-13
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 388 75.3 1.6e-13
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 341 67.5 2.8e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 331 65.9 8.9e-11
>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 (426 aa)
initn: 2912 init1: 2912 opt: 2912 Z-score: 2578.0 bits: 486.1 E(32554): 2.8e-137
Smith-Waterman score: 2912; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPLCLNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELF
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CCDS24 MTPLCLNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 CLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QETDPS
::::::
CCDS24 QETDPS
>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 (415 aa)
initn: 1199 init1: 885 opt: 898 Z-score: 806.1 bits: 158.2 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 1209; 50.7% identity (79.9% similar) in 353 aa overlap (36-387:20-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYL-GPQQTELFMPIC
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CCDS43 MSGMEKLQNASWIYQQKLEDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHN
..:. :::::..:: :.:::::.:.::.:::::::::::::::::::.:.:::.::::.:
CCDS43 VVYVPIFVVGVIGNVLVCLVILQHQAMKTPTNYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYEMWRN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGA
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CCDS43 YPFLFGPVGCYFKTALFETVCFASILSITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPM
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CCDS43 VWGFSVLFSLPNTSIHGIKFHYFPNGSLVPGSATCTVIKPMWIYNFIIQVTSFLFYLLPM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFVLVV
...:::: :..:::.... : .: :.: . :: ..:.:::::::.
CCDS43 TVISVLYYLMALRLKKDKSLEADE----GNANIQR--PCR--------KSVNKMLFVLVL
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFR
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CCDS43 VFAICWAPFHIDRLFFSFVEEWSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNPIIYNLLSRRFQ
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETD
.::... . :. ::.:
CCDS43 AAFQNVI---SSFHK--QWHSQHDPQLPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQFPCQSSMHN
340 350 360 370 380 390
>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 (418 aa)
initn: 431 init1: 162 opt: 621 Z-score: 562.4 bits: 113.1 E(32554): 5.3e-25
Smith-Waterman score: 621; 31.5% identity (67.6% similar) in 340 aa overlap (63-391:66-397)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMR
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CCDS13 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140
pF1KE0 T---PTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLAS
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CCDS13 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 VLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVP
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CCDS13 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG--EQNRS
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 CRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQE
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CCDS13 ADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKL---TVMVRQA
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 AKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQV----TKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVS
:. .. .... . . :: :. ...: ..:..: .:: :.:. :.:. .:
CCDS13 AEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYIS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 --QWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGAC-CHRLR
::: :. ... ..... .::..:. ::.::.:.:. ::. : .: :: : :
CCDS13 DEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATL---ACLCPVWR
340 350 360 370 380
390 400 410 420
pF1KE0 PRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETDPS
:.. ..::
CCDS13 RRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
390 400 410
>>CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 (398 aa)
initn: 367 init1: 150 opt: 448 Z-score: 410.4 bits: 84.9 E(32554): 1.5e-16
Smith-Waterman score: 449; 29.2% identity (57.6% similar) in 373 aa overlap (41-390:3-351)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 LPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLI
: : : : :. . . .: ::.
CCDS63 MENETVSELNQTQLQPRAVVALEYQVVTILLV
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE0 FVV---GAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLV-GLPLELYEMWHNYP
... : ::: .. ::..: : :::::: :: ::::.::.::.. ::: .. ..
CCDS63 LIICGLGIVGNIMVVLVVMRTKHMRTPTNCYLVSLAVADLMVLVAAGLPNITDSIYGSWV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
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CCDS63 Y--GYVGCLCITYLQYLGINASSCSITAFTIERYIAICHPIKAQFLCTFSRAKKIIIFVW
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GLAML-CSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAV--CMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLP
... : : : . .:.. . :. : : : :. . .:. .:
CCDS63 AFTSLYCML----WFFLLDLNI---STYKDAIVISCGYKISRNYYSPIYLMDFGVFYVVP
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KE0 MAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH--------DR-----
: . .::: .:. :.:... . . ... . .:. .:
CCDS63 MILATVLYGFIA------RILFLNPIPSDPKENSKTWKNDSTHQNTNLNVNTSNRCFNST
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340
pF1KE0 --GRRQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQ-WTDGLHLAFQHVHVISGIFFYL
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CCDS63 VSSRKQVTKMLAVVVILFALLWMPYRTLVVVNSFLSSPFQENWFLLFCRICI------YL
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSW
.:: :::.:.:::..:: .:.. :: : .. . ...:..
CCDS63 NSAINPVIYNLMSQKFRAAFRK-LC--NCKQKPTEKPANYSVALNYSVIKESDHFSTELD
320 330 340 350 360
410 420
pF1KE0 VHPLAGNDGPEAQQETDPS
CCDS63 DITVTDTYLSATKVSFDDTCLASEVSFSQS
370 380 390
>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (289 aa)
initn: 361 init1: 157 opt: 425 Z-score: 391.7 bits: 81.0 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 431; 36.2% identity (63.4% similar) in 268 aa overlap (37-299:25-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICAT
: . .: :: :.: . .: :. . ::
CCDS46 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQL-FPAP----LLAGVTAT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYP
. .:::: .:: :: ::. : . .:: :: :: :.: ::::..: .::.: ..:. :
CCDS46 CVALFVVGIAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRLWQYRP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
. .: : . .. : :.::..:::::::: :. ::.:. .::...:. :. ..:
CCDS46 WNFGDLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVP-DSAVC----MLVRPRALYNMVVQTTALLFFC
..:. . : : :... . : : :. : . :: .: ...: .....::
CCDS46 AVAFCSAGPIFVLVGVEHEN----GTDPWDTNECRPTEFAVRS-GLLTVMVWVSSIFFF-
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFV
::. ..::: ::: .: :.: ::.:.. . . : :.: .:..:::
CCDS46 LPVFCLTVLYSLIGRKLWRRR---------RGDAVVGA--SLRDQNH----KQTVKMLGG
230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSS
CCDS46 SQRALRLSLAGPILSLCLLPSL
270 280
>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 540 init1: 157 opt: 425 Z-score: 390.6 bits: 81.1 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 597; 36.6% identity (65.8% similar) in 336 aa overlap (37-364:25-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICAT
: . .: :: :.: . .: :. . ::
CCDS32 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQL-FPAP----LLAGVTAT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYP
. .:::: .:: :: ::. : . .:: :: :: :.: ::::..: .::.: ..:. :
CCDS32 CVALFVVGIAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRLWQYRP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
. .: : . .. : :.::..:::::::: :. ::.:. .::...:. :. ..:
CCDS32 WNFGDLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVP-DSAVC----MLVRPRALYNMVVQTTALLFFC
..:. . : : :... . : : :. : . :: .: ...: .....::
CCDS32 AVAFCSAGPIFVLVGVEHEN----GTDPWDTNECRPTEFAVRS-GLLTVMVWVSSIFFF-
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFV
::. ..::: ::: .: :.: ::.:.. . . : :.: .:..::: :
CCDS32 LPVFCLTVLYSLIGRKLWRRR---------RGDAVVGA--SLRDQNH----KQTVKMLAV
230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE0 LVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDG-LHLA--FQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSL
.: .: .:: :::. : ..: ... : :..: :. ...: ..:::..: ::.::..
CCDS32 VVFAFILCWLPFHVGRYLFS--KSFEPGSLEIAQISQYCNLVSFVLFYLSAAINPILYNI
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MSSRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPE
::...:
CCDS32 MSKKYRVAVFRLLGFEPFSQRKLSTLKDESSRAWTESSINT
330 340 350 360
>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 (412 aa)
initn: 496 init1: 263 opt: 407 Z-score: 374.2 bits: 78.2 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 592; 34.3% identity (60.8% similar) in 385 aa overlap (60-402:38-395)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 AARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHK
..:. :. : .::::. :: .: ..: :..
CCDS94 SDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYR
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 AMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASV
::: :: :: :.::::::.:: :::..::..:.. :...: : . . : :..
CCDS94 DMRTTTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTYATL
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQ---LH
:..::::::::.:. .::.:: .::: .:: .....:..:.: . : : :..: .
CCDS94 LHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDPGIS
130 140 150 160 170 180
210 220
pF1KE0 V------------------------------PCRGPVPDSAVCML---VRPR-----ALY
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230 240 250 260 270 280
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410 420
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CCDS94 YTETSANVKTMG
410
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. .. :.... ..: ::. : : .:. .. . : : .: ..
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CCDS35 STFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
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CCDS47 -ISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNII
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CCDS47 AGWPF--GNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFV--II
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pF1KE0 GAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQ---LHVPCRGPVPDSAV--CMLVRPRALYNMVVQTTAL
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CCDS47 MIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIY-TTVL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]