Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4277
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4277, 1280 aa
  1>>>pF1KE4277     1280 - 1280 aa - 1280 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0324+/-0.00118; mu= 0.8523+/- 0.070
 mean_var=248.4112+/-49.986, 0's: 0 Z-trim(108.8): 38  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.081375
 statistics sampled from 10588 (10618) to 10588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.318), width:  16
 Scan time:  2.660

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1          (1280) 8403 1001.1       0
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1          (1139) 7341 876.4       0
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9        (1132) 3357 408.7 4.6e-113
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9        (1065) 3110 379.7 2.3e-104
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6        (1343) 1705 214.8 1.3e-54
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19       (1011) 1471 187.2 1.9e-46
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5          ( 870)  649 90.7 1.9e-17
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5          (1047)  649 90.7 2.2e-17


>>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1               (1280 aa)
 initn: 8403 init1: 8403 opt: 8403  Z-score: 5344.3  bits: 1001.1 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 8403; 100.0% identity (100.0% similar) in 1280 aa overlap (1-1280:1-1280)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MELSPSSGGAAEALSWPEMFPALESDSPLPPEDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MELSPSSGGAAEALSWPEMFPALESDSPLPPEDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 QSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWERKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWERKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 TDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NTSPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NTSPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 LLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMEN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 LRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 GEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 TPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 CALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 ALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 FASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 GSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERES
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 SLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 PQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 DFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGLG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 ARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVRAIQRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVRAIQRQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 QTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKER
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 LRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 VEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGIS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280
pF1KE4 PTNPTKLSITENGEFKNSSC
       ::::::::::::::::::::
CCDS13 PTNPTKLSITENGEFKNSSC
             1270      1280

>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1               (1139 aa)
 initn: 3972 init1: 3916 opt: 7341  Z-score: 4671.3  bits: 876.4 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 7341; 99.4% identity (99.4% similar) in 1135 aa overlap (153-1280:5-1139)

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE4 STKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13                           MQTPEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
                                         10        20        30    

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE4 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLL
           40        50        60        70        80        90    

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE4 SPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLR
          100       110       120       130       140       150    

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE4 RTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGE
          160       170       180       190       200       210    

            370       380       390       400       410       420  
pF1KE4 HFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTP
          220       230       240       250       260       270    

            430       440       450       460       470       480  
pF1KE4 NKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACA
          280       290       300       310       320       330    

            490       500       510       520       530       540  
pF1KE4 LVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDAL
          340       350       360       370       380       390    

            550       560       570       580       590       600  
pF1KE4 GEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFA
          400       410       420       430       440       450    

            610       620       630       640       650       660  
pF1KE4 SWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVI
          460       470       480       490       500       510    

            670       680       690       700       710       720  
pF1KE4 QNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELS
          520       530       540       550       560       570    

            730              740       750       760       770     
pF1KE4 VLHSLLWEVVSQLDK-------ATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNS
       :::::::::::::::       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNS
          580       590       600       610       620       630    

         780       790       800       810       820       830     
pF1KE4 SPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEK
          640       650       660       670       680       690    

         840       850       860       870       880       890     
pF1KE4 DERESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DERESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQS
          700       710       720       730       740       750    

         900       910       920       930       940       950     
pF1KE4 TPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS
          760       770       780       790       800       810    

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KE4 QSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVD
          820       830       840       850       860       870    

        1020      1030      1040      1050      1060      1070     
pF1KE4 QGGLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QGGLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVR
          880       890       900       910       920       930    

        1080      1090      1100      1110      1120      1130     
pF1KE4 AIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNLDEAKHAEKYEQEIT
          940       950       960       970       980       990    

        1140      1150      1160      1170      1180      1190     
pF1KE4 KLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSII
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

        1200      1210      1220      1230      1240      1250     
pF1KE4 SRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQV
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

        1260      1270      1280
pF1KE4 RNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
         1120      1130         

>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9             (1132 aa)
 initn: 3707 init1: 2854 opt: 3357  Z-score: 2143.6  bits: 408.7 E(33420): 4.6e-113
Smith-Waterman score: 4028; 57.9% identity (79.3% similar) in 1141 aa overlap (153-1249:14-1129)

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE4 STKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANT
                                     : : ::   :::. : : :::  ::. . .
CCDS68                  MEPDSLLDQDDSYESPQERPGSRRSLPG-SLSEKSPSMEPSAA
                                10        20         30        40  

            190       200       210         220             230    
pF1KE4 SPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFR--LPSLRST------DDRSRGLPKLKE
       .::.: ::.:.:::::::::::: ::::: :::  ::..::.      ..::. .:.:::
CCDS68 TPFRVTGFLSRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKE
             50        60        70        80        90       100  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE4 SRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASER
       :::::::::: :.:: :::.  : : .::.::::::::.:::::  :::::::: ::.::
CCDS68 SRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAER
            110       120       130       140       150       160  

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE4 DKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTK
       :::::::::.:.::::: ::.:..:.::.::::::  ::::.:::::::.:.::::.: :
CCDS68 DKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLK
            170       180       190       200       210       220  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE4 ADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKW
       .::.:::::::: .::::...:::.:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::
CCDS68 TDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKW
            230       240       250       260       270       280  

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE4 YPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVR
       ::: ::.:. ::  :: ::::.:.:::::::::.:::::: .:..:  ::..:::..:..
CCDS68 YPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAK
            290       300       310       320       330       340  

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE4 NKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVG
       .:::.: ::::::::::..:::::::.::::::::... :::::::.:::.:::::::::
CCDS68 TKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVG
            350       360       370       380       390       400  

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE4 QQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFP
       :.::.:::::::::::::::::::::::::...: .::.:::::::::::::::::::::
CCDS68 QKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFP
            410       420       430       440       450       460  

          600       610       620       630       640       650    
pF1KE4 RELKEVFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRT
       ::::::::::.:.: .::. ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::
CCDS68 RELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTART
            470       480       490       500       510       520  

          660       670       680       690       700       710    
pF1KE4 LTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGY
       ::::::: ::::::::::.:::::.:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.::
CCDS68 LTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGY
            530       540       550       560       570       580  

          720       730       740       750       760       770    
pF1KE4 IDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHN
       :::::::: :::::::.::::... :.:::::::.: :.  .:.  :: . ::   ..  
CCDS68 IDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLA
            590       600       610       620         630       640

           780        790         800       810       820       830
pF1KE4 SSPNV-SGSLSSGLQK-IFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSM
       :.:.  :.:.:.:::: ..:.  ..  :. .: ::. .: : .:  ..   :: . ..: 
CCDS68 STPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSS
              650       660       670       680       690          

              840        850       860        870        880       
pF1KE4 TYSEKDERESSLPNG-RSVSLMDLQDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASI
       .::: .: . .. :: .:.:..::::... . : .: .  :: :   : .: . .:... 
CCDS68 SYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAG
     700       710       720       730       740          750      

       890       900           910            920       930        
pF1KE4 KQLRETQSTPQSAPQVRR----PLHPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPK
          : :  .  .   :::    :  :. ..  ::    : :::::::::..   .:  :.
CCDS68 WPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPR
        760       770       780       790       800       810      

      940       950       960          970       980       990     
pF1KE4 ASIDSSLENLSTASSRSQSNSEDFKLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRH
       .  ::. :. :. ::  .::::..  .   :  ... :....:   .:   :. .. .. 
CCDS68 GLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARR--PGELARRQMSLTEKG
        820       830         840       850         860       870  

        1000      1010             1020      1030      1040        
pF1KE4 IPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL-------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAAL
          ..:::::.:    :..::          . :...::.:  . .    .: ...::. 
CCDS68 GQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS-
            880         890       900       910       920          

     1050      1060       1070      1080      1090      1100       
pF1KE4 VAEPVQNGSRSRQQSSSSR-ESPVPKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-
         . :  ..: :::::::. .::  : ::...:      :::.  ..   .:::::.:. 
CCDS68 -PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTM
      930       940       950       960           970          980 

       1110              1120      1130      1140      1150        
pF1KE4 NGQYEEDV--------EETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQ
       :.:  ::         ..  .. :: ..:::   ... :...::.:...:::::  .  :
CCDS68 NAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQ
             990      1000      1010         1020      1030        

     1160      1170      1180      1190      1200      1210        
pF1KE4 EQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDA
       :.  :::.:::.::::..:::::::::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.
CCDS68 EETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDS
     1040      1050      1060      1070      1080      1090        

     1220      1230      1240      1250      1260      1270        
pF1KE4 KQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNS
       ::::::::::::.:::.::.::::::::.::                             
CCDS68 KQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH                          
     1100      1110      1120      1130                            

     1280
pF1KE4 SC

>>CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9             (1065 aa)
 initn: 3683 init1: 2842 opt: 3110  Z-score: 1987.2  bits: 379.7 E(33420): 2.3e-104
Smith-Waterman score: 3961; 58.9% identity (80.3% similar) in 1087 aa overlap (229-1280:1-1065)

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE4 IKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEP
                                     .:.::::::::::::: :.:: :::.  : 
CCDS68                               MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
                                             10        20        30

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE4 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV
       : .::.::::::::.:::::  :::::::: ::.:::::::::::.:.::::: ::.:..
CCDS68 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
               40        50        60        70        80        90

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE4 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH
       :.::.::::::  ::::.:::::::.:.::::.: :.::.:::::::: .::::...:::
CCDS68 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
              100       110       120       130       140       150

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE4 IYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRF
       .:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::::: ::.:. ::  :: ::::.:.
CCDS68 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
              160       170       180       190       200       210

      440       450       460       470       480       490        
pF1KE4 QTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLT
       :::::::::.:::::: .:..:  ::..:::..:...:::.: ::::::::::..:::::
CCDS68 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
              220       230       240       250       260       270

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE4 DLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEV
       ::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS68 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
              280       290       300       310       320       330

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE4 DPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISE
       ::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. ::::
CCDS68 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
              340       350       360       370       380       390

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE4 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYM
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::::::.:::::
CCDS68 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
              400       410       420       430       440       450

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE4 AFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKA
       .:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.:::::::::: :::::::.::::...
CCDS68 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS
              460       470       480       490       500       510

      740       750       760       770        780        790      
pF1KE4 TVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV-SGSLSSGLQK-IFEDPTD
        :.:::::::.: :.  .:.  :: . ::   ..  :.:.  :.:.:.:::: ..:.  .
CCDS68 IVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS
              520       530         540       550       560        

          800       810       820       830       840        850   
pF1KE4 S--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNG-RSVSLMDL
       .  :. .: ::. .: : .:  ..   :: . ..: .::: .: . .. :: .:.:..::
CCDS68 GLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDL
      570       580       590        600       610       620       

           860       870       880       890       900             
pF1KE4 QDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVRR----PLHP
       ::... . : .:      .  : .: . .:...    : :  .  .   :::    :  :
CCDS68 QDARTLDGEAGSPA-GPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTP
       630       640        650       660       670       680      

     910            920       930       940       950       960    
pF1KE4 ALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSEDFKL
       . ..  ::    : :::::::::..   .:  :..  ::. :. :. ::  .::::..  
CCDS68 GTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEELAA
        690       700       710       720       730         740    

             970       980       990      1000      1010           
pF1KE4 S---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL--
       .   :  ... :....:   .:   :. .. ..    ..:::::.:    :..::     
CCDS68 AAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPPPP
          750       760         770       780       790         800

         1020      1030      1040      1050      1060       1070   
pF1KE4 -----GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSR-ESPVPK
            . :...::.:  . .    .: ...::.   . :  ..: :::::::. .::  :
CCDS68 PPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELK
              810       820       830         840       850        

          1080      1090      1100       1110              1120    
pF1KE4 VRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------EETEQNLDEA
        ::...:      :::.  ..   .:::::.:. :.:  ::         ..  .. :: 
CCDS68 PRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDEL
      860           870          880       890       900       910 

         1130      1140      1150      1160      1170      1180    
pF1KE4 KHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQ
       ..:::   ... :...::.:...:::::  .  ::.  :::.:::.::::..::::::::
CCDS68 SQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQ
                920       930       940       950       960        

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KE4 EEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSAL
       :.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::.::.::::::
CCDS68 EDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSAL
      970       980       990      1000      1010      1020        

         1250      1260      1270       1280
pF1KE4 TQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSS-C
       ::.:::::::.::::::::::::.:::::::.::: :
CCDS68 TQLKERYSMQARNGISPTNPTKLQITENGEFRNSSNC
     1030      1040      1050      1060     

>>CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6             (1343 aa)
 initn: 3347 init1: 1691 opt: 1705  Z-score: 1094.3  bits: 214.8 E(33420): 1.3e-54
Smith-Waterman score: 3382; 46.6% identity (70.1% similar) in 1285 aa overlap (62-1212:17-1280)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE4 EDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQQSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWE
                                     :..   ::.::  :: .  .::: .   :.
CCDS34               MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPY-DRPGWN
                             10        20        30         40     

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE4 RKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQTDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATK
        ..::.. .::..:....  :.   ......:.... :::::::: ::.     :.:  .
CCDS34 PRFCIISGNQLLMLDEDEIHPLLI-RDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGR-----PHG--E
          50        60         70        80        90              

             160       170       180        190       200       210
pF1KE4 LEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDR
        :    :: ::.:. :     :  ::. : ..::.   ::.:.:::.:::::::: ::::
CCDS34 HEYHLGRS-RRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDR
       100        110           120       130       140       150  

                220        230       240       250       260       
pF1KE4 NTSFR--LPSLRSTD-DRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSS
       ..:::  :: .::.: ::.: . ..:::.:::::::: :..: :.:.  :   .::.:::
CCDS34 TSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSS
            160       170       180       190       200       210  

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE4 ILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAK
       ::::.::::::  ::.:::.: ::.:::::.:::.:.:.::::: ::..:::.::::::.
CCDS34 ILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEAR
            220       230       240       250       260       270  

       330       340       350          360       370       380    
pF1KE4 DLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVE
       .: :::.:.::::::: :.:::::: ..   :..:::::::: .:: .... .:.:.: .
CCDS34 ELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSD
            280       290       300       310       320       330  

          390       400       410       420                        
pF1KE4 KKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN--------------------K
       ::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: .                    :
CCDS34 KKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGK
            340       350       360       370       380       390  

          430       440       450       460       470       480    
pF1KE4 GKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALV
       :: : :..:.:.:.::..::::: ::::::.::..: :::.::::...:..:::.: :::
CCDS34 GKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALV
            400       410       420       430       440       450  

          490       500       510       520       530       540    
pF1KE4 HILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGE
       :::::::.:::::.:..::::::  :.. :::::::.:::.::::..:.::.::.::.::
CCDS34 HILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGE
            460       470       480       490       500       510  

          550       560       570       580       590       600    
pF1KE4 FIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASW
       ::.:::::.::::::: ::..: : .::.::.::::::.::..::.::::::::::::::
CCDS34 FIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASW
            520       530       540       550       560       570  

          610       620       630       640       650       660    
pF1KE4 KQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQN
       . .: .::..::..::::::::::::::::::::::.:::::::..::::::::::::::
CCDS34 RLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQN
            580       590       600       610       620       630  

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE4 LANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVL
       ::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: ::..:. .:.::::::::::.:
CCDS34 LANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTL
            640       650       660       670       680       690  

          730       740       750       760       770              
pF1KE4 HSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEH---------NS
       :.:::::. ::.: .. :::::::.: ::. .: ::. ::.:  : .:.         . 
CCDS34 HALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGP
            700       710       720        730       740       750 

         780             790         800       810         820     
pF1KE4 SPNVSGSL------SSGLQKIFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRG--KTLLLVQQA
       : ...: .      :  ::...    .:  :. .: ::....      :  : :. :.. 
CCDS34 SAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRP
             760       770       780       790       800       810 

             830       840          850        860         870     
pF1KE4 ----SSQSMTYSEKDERESS---LPNGRSVSLMDLQ-DTHAAQVEHASV--MLDVPIRLT
           :: ..  : .:  :     :  ..:::..::: :  ..... .::  .  :   : 
CCDS34 PLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLH
             820       830       840       850       860       870 

         880       890          900       910             920      
pF1KE4 GSQLSITQVASIKQL---RETQSTPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQ------PLSFQNPV
       .:: :.: . ...     : .:.. .:   .   :        :.       :::::::.
CCDS34 SSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPL
             880       890       900       910       920       930 

        930              940                     950       960     
pF1KE4 YHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL--------------STASSRSQSNSEDFKLS
       .:.    :. : .       .  :: ..               . :  .. :.:::.. .
CCDS34 FHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSG
             940       950       960       970       980       990 

         970       980              990      1000      1010        
pF1KE4 GPSNSSMEDFTKRSTQSE------DFSRRH-TVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGG
        :.  .   . ..: ..:      ::.::. .. :    .  : : . :  .      ::
CCDS34 VPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGG
            1000      1010      1020      1030      1040      1050 

           1020      1030      1040          1050        1060      
pF1KE4 L------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSV----VSAALVA--EPVQNGSRSRQQSSSS
              :. .  :: : .. : . : : .      :. :.   ::  . .: :::: : 
CCDS34 GSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLS-
            1060      1070      1080      1090      1100      1110 

       1070                     1080      1090      1100      1110 
pF1KE4 RESPV---------------PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYE
       .:. .               :..   :..:: .. .:    ::   :::.::: :  .  
CCDS34 KEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK-QHSQTPSTLNP----TMPASERTVAWVSNMPHLS
             1120      1130       1140          1150      1160     

                        1120        1130      1140      1150       
pF1KE4 EDVE------------ETEQNLDEAK--HAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLV
        :.:            :  ...::..  ....::.:: .:::::..:.:.::::::::: 
CCDS34 ADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLS
        1170      1180      1190      1200      1210      1220     

      1160      1170      1180      1190      1200      1210       
pF1KE4 QEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVID
       ::.: .:.:..:.::::.::.:::.:: :::::.::::.::: :::::..::  :     
CCDS34 QEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLP
        1230      1240      1250      1260      1270      1280     

      1220      1230      1240      1250      1260      1270       
pF1KE4 AKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKN
                                                                   
CCDS34 EPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAPPAPPPPPRLQITENGEFRNTADH  
        1290      1300      1310      1320      1330      1340     

>>CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19            (1011 aa)
 initn: 1511 init1: 1030 opt: 1471  Z-score: 947.7  bits: 187.2 E(33420): 1.9e-46
Smith-Waterman score: 1538; 35.9% identity (62.6% similar) in 898 aa overlap (157-1031:154-999)

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE4 RCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATKLEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTAN-TSPF
                                     :..:::  . :...::    .  .:  .: 
CCDS46 IPEAPTPNVPVWDIGGFTLLDGKLVLLGGEEEGPRRPRV-GSASSEGSIHVAMGNFRDPD
           130       140       150       160        170       180  

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE4 KVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPC
       ..::    .  :  .  . .. : :    .   :.  :    : :.   ::  :::    
CCDS46 RMPGKTEPETAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARLEPRD----GPPSALGSR--ESL----
            190       200       210       220             230      

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE4 STVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTV
       .:.  ::::  . : . ::: :.::.  ::.::. .::.:::: ::.:::.:.:.:::  
CCDS46 ATLSELDLGAERDVRIWPLHPSLLGEPHCFQVTWTGGSRCFSCRSAAERDRWIEDLRRQF
            240       250       260       270       280       290  

         310       320           330       340       350       360 
pF1KE4 QPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDL----APKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWG
       ::..:: .: :. : .:. ::: :    :       :: :: .:.:::. ..   ..::.
CCDS46 QPTQDNVEREETWLSVWVHEAKGLPRAAAGAPGVRAELWLDGALLARTAPRAGPGQLFWA
            300       310       320       330       340       350  

             370       380       390         400       410         
pF1KE4 EHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGL--VNIPTASVTGRQFVEKWYPVST
       :.:.: .::: . ..... . .   .       ..:  .. : : ..:   .:.:.:.  
CCDS46 ERFHFEALPPARRLSLRL-RGLGPGSAVLGRVALALEELDAPRAPAAG---LERWFPLL-
            360       370        380       390          400        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 PTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEEL
            :  .: ..: . : . . .:: :.:::.:::.: .:. ::..:::.. .. ::::
CCDS46 -----GAPAGAALRARIRARRLRVLPSERYKELAEFLTFHYARLCGALEPALPAQAKEEL
            410       420       430       440       450       460  

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 ACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLH
       : :.:..:..::::. ..:::  .:. ::: ...:.:::::.:::.:.::.:::.:.::.
CCDS46 AAAMVRVLRATGRAQALVTDLGTAELARCGGREALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQ
            470       480       490       500       510       520  

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE4 DALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKE
       ..::. .. :  : :.:::::::: .::: .::. :.  :: .:  ::.::  :: ::  
CCDS46 ETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCPASELPEHQARLRNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGI
            530       540       550       560       570       580  

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE4 VFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIA
       ::.::.. : .::.. .. ::. ::::::.:::::..::::.:  ..:    .:::::::
CCDS46 VFSSWREACKERGSEVLGPRLVCASLFLRLLCPAILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIA
            590       600       610       620       630       640  

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE4 KVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGR
       :::::::: : ::.:: ::.:::.:::..  .:. :: ...  :. .   :..:  ::. 
CCDS46 KVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEEHGPAMQCFLDQVAMVDVDAAPSGYQGSGDLAL
            650       660       670       680       690       700  

     720       730       740       750       760       770         
pF1KE4 ELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV
       .:.:::. :  . ..::..:   : ::: .:  : ..  .:. ..  .:         .:
CCDS46 QLAVLHAQLCTIFAELDQTTRDTLEPLPTILRAIEEG--QPVLVSVPMRLPL---PPAQV
            710       720       730         740       750          

     780       790       800        810       820       830        
pF1KE4 SGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHK-LKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDER
        .:::.: .  :  : :   :  : : :: .  :  :...    .    . .   .  .:
CCDS46 HSSLSAGEKPGFLAPRDLPKHTPLISKSQ-SLRSVRRSESWARPRPDEERPLRRPRPVQR
       760       770       780        790       800       810      

      840       850       860       870       880        890       
pF1KE4 ESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQ-LRETQSTP
        .:.:  :           : . . :.     : :  :: ::.  .   .   :.. : :
CCDS46 TQSVPVRRP----------ARRRQSAGPW---P-RPKGS-LSMGPAPRARPWTRDSASLP
        820                 830           840        850       860 

       900       910        920       930           940        950 
pF1KE4 QSAPQVRRPLHPALNQPGGL-QPLSFQNPVYHLNN---PIPAM-PKASIDSSL-ENLSTA
       .. :.:  : .  ..::    : :. . :: .: .    . :.  . .. : : :.::: 
CCDS46 RK-PSV--PWQRQMDQPQDRNQALGTHRPVNKLAELQCEVAALREEQKVLSRLVESLST-
                870       880       890       900       910        

             960       970        980       990            1000    
pF1KE4 SSRSQSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKR-STQSEDFSRRHTVPD------RHIPLALPRQN
       . :. ..... .: :    ...:. .:  . : .:. .:.. .      ...   : ...
CCDS46 QIRALTEQQE-QLRG----QLQDLDSRLRAGSSEFDSEHNLTSNEGHSLKNLEHRLNEME
       920        930           940       950       960       970  

         1010       1020      1030      1040      1050      1060   
pF1KE4 STGQAQIRKVDQG-GLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQS
        : :::.: . :.  :. :...  : :.                                
CCDS46 RT-QAQLRDAVQSLQLSPRTRGSWSQPQPLKAPCLNGDTT                    
             980       990      1000      1010                     

>>CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5               (870 aa)
 initn: 366 init1: 239 opt: 649  Z-score: 427.1  bits: 90.7 E(33420): 1.9e-17
Smith-Waterman score: 669; 27.9% identity (60.5% similar) in 534 aa overlap (260-774:349-867)

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 PKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKC----
                                     ::  .:.:..:.  ::...    :.     
CCDS47 ILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIF
      320       330       340       350       360       370        

          290       300            310        320       330        
pF1KE4 -FSCNSASERDKWMENLR-----RTVQPNKDNCR-RAENVLRLWIIEAKDLAPKKKY---
        :. ..  . . ::..:.     :  .:. .: : :  . : : : ::. : : :..   
CCDS47 YFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL-PVKHFTNP
      380       390       400       410       420        430       

         340       350       360       370        380       390    
pF1KE4 FCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPP-LHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNY
       .:.. :...  :.: .. ...:  :.:.: : .::: .. . . .     .: ::.:.  
CCDS47 YCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITL----SNKTKKSKDPD
       440       450        460       470       480           490  

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE4 VGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAE
       . ..    . .   . ...:. .:.  : ::   : :.:...:..   :.: :.:.:: :
CCDS47 ILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPG-SLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKE
            500       510       520        530       540       550 

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE4 FVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVL
       .. ..   .  .:  : . ...  ::  :..:.      . .:  :   :..   :  .:
CCDS47 LILQKELHVVYALSHVCG-QDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTL
             560        570       580       590       600       610

          520       530       540       550       560       570    
pF1KE4 IFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSN
        :: .:.:.  .:.:.: .. :..: :: . :  ..:: ..::..:::  ..: .. . .
CCDS47 -FRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLT
               620       630       640       650       660         

            580       590       600       610         620       630
pF1KE4 --LKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDIS--ERLISASLFLRFL
         :..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ...  ..   . .   :..:. .:::..
CCDS47 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
     670       680        690       700       710       720        

              640       650       660       670       680       690
pF1KE4 CPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWG
       ::::..: .::.... :.  ..::: :.:: .:::::...:: :: ::  .: :.. .  
CCDS47 CPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKH
      730       740       750       760       770       780        

              700       710       720       730       740       750
pF1KE4 GMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVL
        :  :: :..:   . .:   .   ::.:.:..:: .     ..: ..   . :   .::
CCDS47 RMIMFLDELGNVPELPDTTEHS-RTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNERGAQQHVL
      790       800       810        820       830        840      

              760       770       780       790       800       810
pF1KE4 ADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNT
           : :.    .::.  ..:. :                                    
CCDS47 ---KKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                                 
           850       860       870                                 

>>CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5               (1047 aa)
 initn: 366 init1: 239 opt: 649  Z-score: 425.9  bits: 90.7 E(33420): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 669; 27.9% identity (60.5% similar) in 534 aa overlap (260-774:526-1044)

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 PKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKC----
                                     ::  .:.:..:.  ::...    :.     
CCDS34 ILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIF
         500       510       520       530       540       550     

          290       300            310        320       330        
pF1KE4 -FSCNSASERDKWMENLR-----RTVQPNKDNCR-RAENVLRLWIIEAKDLAPKKKY---
        :. ..  . . ::..:.     :  .:. .: : :  . : : : ::. : : :..   
CCDS34 YFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL-PVKHFTNP
         560       570       580       590       600        610    

         340       350       360       370        380       390    
pF1KE4 FCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPP-LHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNY
       .:.. :...  :.: .. ...:  :.:.: : .::: .. . . .     .: ::.:.  
CCDS34 YCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITL----SNKTKKSKDPD
          620       630        640       650           660         

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE4 VGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAE
       . ..    . .   . ...:. .:.  : ::   : :.:...:..   :.: :.:.:: :
CCDS34 ILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPG-SLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKE
     670       680       690       700        710       720        

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE4 FVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVL
       .. ..   .  .:  : . ...  ::  :..:.      . .:  :   :..   :  .:
CCDS34 LILQKELHVVYALSHVCG-QDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTL
      730       740        750       760       770       780       

          520       530       540       550       560       570    
pF1KE4 IFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSN
        :: .:.:.  .:.:.: .. :..: :: . :  ..:: ..::..:::  ..: .. . .
CCDS34 -FRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLT
        790       800       810       820       830       840      

            580       590       600       610         620       630
pF1KE4 --LKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDIS--ERLISASLFLRFL
         :..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ...  ..   . .   :..:. .:::..
CCDS34 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
        850        860       870       880       890       900     

              640       650       660       670       680       690
pF1KE4 CPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWG
       ::::..: .::.... :.  ..::: :.:: .:::::...:: :: ::  .: :.. .  
CCDS34 CPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKH
         910       920       930       940       950       960     

              700       710       720       730       740       750
pF1KE4 GMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVL
        :  :: :..:   . .:   .   ::.:.:..:: .     ..: ..   . :   .::
CCDS34 RMIMFLDELGNVPELPDTTEHS-RTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNERGAQQHVL
         970       980        990      1000       1010      1020   

              760       770       780       790       800       810
pF1KE4 ADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNT
           : :.    .::.  ..:. :                                    
CCDS34 ---KKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                                 
             1030      1040                                        




1280 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Jul 16 15:46:51 2019 done: Tue Jul 16 15:46:51 2019
 Total Scan time:  2.660 Total Display time:  0.280

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com