FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3655, 1012 aa 1>>>pF1KE3655 1012 - 1012 aa - 1012 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1780+/-0.000376; mu= 23.0803+/- 0.024 mean_var=82.1827+/-17.172, 0's: 0 Z-trim(113.6): 65 B-trim: 31 in 1/52 Lambda= 0.141476 statistics sampled from 22913 (22978) to 22913 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16 Scan time: 13.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003326 (OMIM: 191325) ubiquitin-like modifier-a (1012) 6817 1402.1 0 XP_006713384 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l (1005) 6419 1320.8 0 XP_011532374 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 796) 5415 1115.8 0 XP_005265487 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 987) 4671 964.0 0 XP_011532372 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 960) 3582 741.8 4.2e-213 XP_011532373 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 910) 3210 665.8 2.9e-190 NP_695012 (OMIM: 301830,314370) ubiquitin-like mod (1058) 2975 617.9 9e-176 XP_016885269 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1058) 2975 617.9 9e-176 NP_003325 (OMIM: 301830,314370) ubiquitin-like mod (1058) 2975 617.9 9e-176 XP_016885270 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1058) 2975 617.9 9e-176 XP_005272706 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1064) 2975 617.9 9e-176 XP_016885268 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1064) 2975 617.9 9e-176 XP_011542256 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1072) 2975 617.9 9.1e-176 XP_016885267 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1086) 2975 617.9 9.2e-176 XP_016885266 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1109) 2975 617.9 9.3e-176 XP_016863848 (OMIM: 611361) PREDICTED: ubiquitin-l (1009) 1692 356.0 5.9e-97 NP_060697 (OMIM: 611361) ubiquitin-like modifier-a (1052) 1692 356.0 6.1e-97 NP_001139186 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme ( 266) 362 84.0 1.2e-15 XP_006723028 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 281) 362 84.1 1.2e-15 NP_001139185 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme ( 299) 362 84.1 1.3e-15 NP_005491 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme su ( 346) 362 84.1 1.4e-15 XP_016881624 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 349) 362 84.1 1.4e-15 XP_006723026 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 378) 362 84.2 1.5e-15 NP_937838 (OMIM: 603172) NEDD8-activating enzyme E ( 449) 354 82.6 5.3e-15 NP_003959 (OMIM: 603172) NEDD8-activating enzyme E ( 463) 354 82.6 5.4e-15 XP_011532513 (OMIM: 603172) PREDICTED: NEDD8-activ ( 422) 287 68.9 6.6e-11 XP_011532512 (OMIM: 603172) PREDICTED: NEDD8-activ ( 436) 287 68.9 6.7e-11 NP_055299 (OMIM: 609277) adenylyltransferase and s ( 460) 247 60.8 2e-08 NP_003896 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzyme E ( 534) 223 55.9 6.7e-07 XP_016881625 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 282) 200 51.0 1.1e-05 NP_001273429 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzym ( 537) 189 49.0 8.2e-05 XP_011524606 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 700) 180 47.3 0.00036 NP_001018169 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzym ( 528) 178 46.7 0.00039 XP_016881623 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 608) 178 46.8 0.00043 XP_006723025 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 612) 178 46.8 0.00043 NP_005490 (OMIM: 613295) SUMO-activating enzyme su ( 640) 178 46.8 0.00044 XP_005258461 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 752) 178 46.9 0.0005 >>NP_003326 (OMIM: 191325) ubiquitin-like modifier-activ (1012 aa) initn: 6817 init1: 6817 opt: 6817 Z-score: 7515.0 bits: 1402.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6817; 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