FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1897, 803 aa 1>>>pF1KE1897 803 - 803 aa - 803 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6823+/-0.000496; mu= 10.7433+/- 0.031 mean_var=168.5392+/-32.911, 0's: 0 Z-trim(114.3): 27 B-trim: 199 in 1/54 Lambda= 0.098792 statistics sampled from 24035 (24057) to 24035 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 7.200 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003290 (OMIM: 191175) endoplasmin precursor [Ho ( 803) 5172 750.3 7.8e-216 NP_001258898 (OMIM: 140572) heat shock protein HSP ( 724) 1823 272.9 3.5e-72 NP_031381 (OMIM: 140572) heat shock protein HSP 90 ( 724) 1823 272.9 3.5e-72 NP_001258899 (OMIM: 140572) heat shock protein HSP ( 724) 1823 272.9 3.5e-72 NP_001258901 (OMIM: 140572) heat shock protein HSP ( 714) 1813 271.5 9.3e-72 NP_001258900 (OMIM: 140572) heat shock protein HSP ( 676) 1509 228.1 9.9e-59 NP_005339 (OMIM: 140571) heat shock protein HSP 90 ( 732) 1463 221.6 9.9e-57 XP_011535020 (OMIM: 140571) PREDICTED: heat shock ( 853) 1463 221.6 1.1e-56 NP_001017963 (OMIM: 140571) heat shock protein HSP ( 854) 1463 221.6 1.1e-56 XP_016878340 (OMIM: 606219) PREDICTED: heat shock ( 405) 573 94.5 9.7e-19 NP_057376 (OMIM: 606219) heat shock protein 75 kDa ( 704) 561 93.0 4.8e-18 NP_001258978 (OMIM: 606219) heat shock protein 75 ( 651) 559 92.7 5.5e-18 XP_011520647 (OMIM: 606219) PREDICTED: heat shock ( 564) 394 69.1 6e-11 >>NP_003290 (OMIM: 191175) endoplasmin precursor [Homo s (803 aa) initn: 5172 init1: 5172 opt: 5172 Z-score: 3995.9 bits: 750.3 E(85289): 7.8e-216 Smith-Waterman score: 5172; 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NP_001 KTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQL 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 TFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDD :...::.: :: ::.. .::.. :::::::::: :. ...:.::::..:::::.: NP_001 EFRALLFIPRRAPFDLFEN--KKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSED 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 LPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDH ::::.::: ::: :.::::::..:.: :......:.:: : :.. :. :.:::. :: NP_001 LPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLK .:: ::..:::...:. ..:::..:: :::: : .::...: :.... .: ::::. : NP_001 TNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRK 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLN .:.::.:.:::.::::.: : ::::: . .:.:::... :.:. :.. : . .:: : . 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NP_001 KTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQL 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 TFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDD :...::.: :: ::.. .::.. :::::::::: :. ...:.::::..:::::.: NP_001 EFRALLFIPRRAPFDLFEN--KKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSED 280 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 LPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDH ::::.::: ::: :.::::::..:.: :......:.:: : :.. :. :.:::. :: NP_001 LPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDS 340 350 360 370 380 390 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLK .:: ::..:::...:. ..:::..:: :::: : .::...: :.... .: ::::. : NP_001 TNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRK 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLN .:.::.:.:::.::::.: : ::::: . .:.:::... :.:. :.. : . .:: : . NP_001 RGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCK 460 470 480 490 500 510 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 WMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYAS ::. : :.::...:.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : NP_001 LMKE-ILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMM 520 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 QKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIE :: .:::: ::... . .. . :..::.: ::.:.::::: : ::. : : .....:: NP_001 AKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIY 580 590 600 610 620 630 750 760 770 780 790 pF1KE1 RMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDED----EEMDVGTDEEEETAKES ::..:.:.:: : : :::. .. : : ::: ::.: NP_001 RMIKLGLGIDED----EVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD 640 650 660 670 800 pF1KE1 TAEKDEL >>NP_005339 (OMIM: 140571) heat shock protein HSP 90-alp (732 aa) initn: 1709 init1: 448 opt: 1463 Z-score: 1139.5 bits: 221.6 E(85289): 9.9e-57 Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (71-783:15-732) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF :. : ::::::. ..:.::::..:.::::: NP_005 MPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV :::::::.:::::::: :::: . :....:: ... .:. : ..:::.:::. .:. 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NP_005 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL ..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.:::: NP_005 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .:: NP_005 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY .:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: NP_005 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . :: NP_005 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK : :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . :: NP_005 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::. NP_005 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL .:.:.:: : . .. : : . .. ::.: NP_005 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD 700 710 720 730 >>XP_011535020 (OMIM: 140571) PREDICTED: heat shock prot (853 aa) initn: 1709 init1: 448 opt: 1463 Z-score: 1138.6 bits: 221.6 E(85289): 1.1e-56 Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (71-783:136-853) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF :. : ::::::. ..:.::::..:.::::: XP_011 QHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV :::::::.:::::::: :::: . :....:: ... .:. : ..:::.:::. .:. 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XP_011 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL ..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.:::: XP_011 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .:: XP_011 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY .:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: XP_011 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . :: XP_011 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK : :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . :: XP_011 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK 700 710 720 730 740 750 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::. 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NP_001 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL ..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.:::: NP_001 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .:: NP_001 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY .:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: NP_001 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . :: NP_001 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK : :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . :: NP_001 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK 700 710 720 730 740 750 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::. NP_001 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI 760 770 780 790 800 810 750 760 770 780 790 800 pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL .:.:.:: : . .. : : . .. ::.: NP_001 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD 820 830 840 850 >>XP_016878340 (OMIM: 606219) PREDICTED: heat shock prot (405 aa) initn: 428 init1: 188 opt: 573 Z-score: 457.4 bits: 94.5 E(85289): 9.7e-19 Smith-Waterman score: 641; 31.4% identity (62.5% similar) in 411 aa overlap (348-743:5-398) 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 EKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTA :.:.: ... ::. .. : : .:. . XP_016 MMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKT 10 20 30 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 EGEVTFKSILFVPTSAPRGLFD---EYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVK .. ....::..:: : ..:: : ::. . :: :.:.: :..::.: :.. 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