FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1897, 803 aa 1>>>pF1KE1897 803 - 803 aa - 803 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8033+/-0.00122; mu= 10.1452+/- 0.074 mean_var=153.4675+/-29.740, 0's: 0 Z-trim(106.8): 24 B-trim: 11 in 1/51 Lambda= 0.103530 statistics sampled from 9168 (9177) to 9168 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 3.390 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 ( 803) 5172 785.1 0 CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 ( 724) 1823 284.9 3.2e-76 CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 732) 1463 231.1 5e-60 CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 854) 1463 231.2 5.7e-60 CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 704) 561 96.4 1.8e-19 CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 651) 559 96.1 2e-19 >>CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 (803 aa) initn: 5172 init1: 5172 opt: 5172 Z-score: 4184.5 bits: 785.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5172; 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CCDS49 KTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQL 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 TFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDD :...::.: :: ::.. .::.. :::::::::: :. ...:.::::..:::::.: CCDS49 EFRALLFIPRRAPFDLFEN--KKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSED 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 LPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDH ::::.::: ::: :.::::::..:.: :......:.:: : :.. :. :.:::. :: CCDS49 LPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLK .:: ::..:::...:. ..:::..:: :::: : .::...: :.... .: ::::. : CCDS49 TNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRK 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLN .:.::.:.:::.::::.: : ::::: . .:.:::... :.:. :.. : . .:: : . 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CCDS99 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL ..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.:::: CCDS99 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .:: CCDS99 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY .:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: CCDS99 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . :: CCDS99 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK : :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . :: CCDS99 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::. CCDS99 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL .:.:.:: : . .. : : . .. ::.: CCDS99 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD 700 710 720 730 >>CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 (854 aa) initn: 1709 init1: 448 opt: 1463 Z-score: 1190.1 bits: 231.2 E(32554): 5.7e-60 Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (71-783:137-854) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF :. : ::::::. ..:.::::..:.::::: CCDS32 QHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV :::::::.:::::::: :::: . :....:: ... .:. : ..:::.:::. .:. CCDS32 LRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLI 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQ .::::::::::. :. :: . : . : .:::::::::::.:::.:: : .:::.: : CCDS32 NNLGTIAKSGTKAFM----EALQAGADIS-MIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQ 230 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 pF1KE1 HIWESDSN-EFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPI . :::... :.: .: :. .:::: . : :::. ..::: ::..:::.::::..:: CCDS32 YAWESSAGGSFTVRTDT-GEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPI 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 pF1KE1 YVWSSKT---ETVEEPMEEEEAAKEEKE----ESDDEAAVEE----EEEEKKP----KTK .. : :. .. ::.: .:::: ::.:. .:. :::::: : : CCDS32 TLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKK 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 KVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFK :... : : .: :::: : .. ..:: ::::.... .: .: ::..::.. :. CCDS32 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL ..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.:::: CCDS32 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .:: CCDS32 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY .:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: CCDS32 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . :: CCDS32 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK : :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . :: CCDS32 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK 700 710 720 730 740 750 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::. CCDS32 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI 760 770 780 790 800 810 750 760 770 780 790 800 pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL .:.:.:: : . .. : : . .. ::.: CCDS32 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD 820 830 840 850 >>CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 (704 aa) initn: 1048 init1: 194 opt: 561 Z-score: 463.2 bits: 96.4 E(32554): 1.8e-19 Smith-Waterman score: 1105; 32.0% identity (61.3% similar) in 697 aa overlap (64-743:76-697) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 DLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSL :. . .. .. : ::::..... .. :: CCDS10 RRNPAWSLQAGRLFSTQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSL 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 YKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVG :..::.:.:::::::::::.:.: ..: .:: :. .... . ::. . . :::.: CCDS10 YSEKEVFIRELISNASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIG 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 MTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTS ::.::::.::::::.::.. ::. . :......:..::::::::::::.:::.: : : CCDS10 MTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDAL---QNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYS 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 KHN--NDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKY . .. . : ::.. ::. : . :: : . :: . ... ....: :: CCDS10 RSAAPGSLGYQWLSDGSGVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKY 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 SQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAKEEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVW :.:..::.:. . . CCDS10 SNFVSFPLYLNGRR---------------------------------------------- 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 DWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPT :: .. ::. :.:.: ... ::. .. : : .:. ... ....::..:: CCDS10 ----MNTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPD 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 pF1KE1 SAPRGLFD---EYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSR : ..:: : ::. . :: :.:.: :..::.: :..:::::.:.:::.:: CCDS10 MKP-SMFDVSRELGSS----VALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSR 350 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 ETLQQHKLLK----VIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYNDTFWKEFGTNIKLGVIE--DHSN : ::. :.. :....:.. .:. :: :. :: :....: .. :.. .. CCDS10 ELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAE-KYAK-FFEDYGLFMREGIVTATEQEV 410 420 430 440 450 460 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 RTRLAKLLRFQSSHHPT-DITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKK . .:::::..:: :. ..:::..:. ::. .::.. . .:. :: ::. : . :: CCDS10 KEDIAKLLRYESSALPSGQLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKK 470 480 490 500 510 520 570 580 590 600 610 pF1KE1 GYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAV-----EKEFE ::.. : :: . : ::: :.. .: . : .:. :.: . ::: : CCDS10 DTEVLFCFEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETE 530 540 550 560 570 580 620 630 640 650 660 670 pF1KE1 PLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTN :. ::.. .: ... .. :. :: : ... ..: . .. :... : . CCDS10 ELMAWMRN-VLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERA---- 590 600 610 620 630 680 690 700 710 720 730 pF1KE1 YYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYG . :.:::::: ::. : ... .: . : :. ..:.: . .: :. : .:. CCDS10 --QLLQPTLEINPRHALIKK-LNQLRASEPGLAQL-LVDQIYENAMIAAG-LVDDPRAMV 640 650 660 670 680 690 740 750 760 770 780 790 pF1KE1 DRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKES :....: CCDS10 GRLNELLVKALERH 700 >>CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 (651 aa) initn: 1046 init1: 194 opt: 559 Z-score: 462.1 bits: 96.1 E(32554): 2e-19 Smith-Waterman score: 1103; 32.3% identity (61.2% similar) in 688 aa overlap (73-743:32-644) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 RTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLR . : ::::..... .. :::..::.:.: CCDS61 ARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIR 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKN ::::::::::.:.: ..: .:: :. .... . ::. . . :::.:::.::::.: CCDS61 ELISNASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSN 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 LGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHN--NDTQ :::::.::.. ::. . :......:..::::::::::::.:::.: : :. .. CCDS61 LGTIARSGSKAFLDAL---QNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLG 120 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 HIWESDSNEFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIY . : ::.. ::. : . :: : . :: . ... ....: :::.:..::.: CCDS61 YQWLSDGSGVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLY 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 VWSSKTETVEEPMEEEEAAKEEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIK . . . :: .. CCDS61 LNGRR--------------------------------------------------MNTLQ 240 350 360 370 380 390 pF1KE1 PIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFD- ::. :.:.: ... ::. .. : : .:. ... ....::..:: : ..:: CCDS61 AIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKP-SMFDV 250 260 270 280 290 300 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 --EYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLL : ::. . :: :.:.: :..::.: :..:::::.:.:::.::: ::. :. CCDS61 SRELGSS----VALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALI 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 K----VIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYNDTFWKEFGTNIKLGVIE--DHSNRTRLAKLLR . :....:.. .:. :: :. :: :....: .. :.. .. . .::::: CCDS61 RKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAE-KYAK-FFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLR 360 370 380 390 400 410 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 FQSSHHPT-DITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTE ..:: :. ..:::..:. ::. .::.. . .:. :: ::. : . :: ::.. : CCDS61 YESSALPSGQLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFE 420 430 440 450 460 470 580 590 600 610 620 pF1KE1 PVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAV-----EKEFEPLLNWMKDK :: . : ::: :.. .: . : .:. :.: . ::: : :. ::.. CCDS61 QFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRN- 480 490 500 510 520 530 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 ALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTF .: ... .. :. :: : ... ..: . .. :... : . . :. CCDS61 VLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERA------QLLQPTL 540 550 560 570 580 690 700 710 720 730 740 pF1KE1 EINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRL :::::: ::. : ... .: . : :. ..:.: . .: :. : .:. :....: CCDS61 EINPRHALIKK-LNQLRASEPGLAQL-LVDQIYENAMIAAG-LVDDPRAMVGRLNELLVK 590 600 610 620 630 640 750 760 770 780 790 800 pF1KE1 SLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL CCDS61 ALERH 650 803 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 20:28:57 2016 done: Sun Nov 6 20:28:57 2016 Total Scan time: 3.390 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]