Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1897
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1897, 803 aa
  1>>>pF1KE1897 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8033+/-0.00122; mu= 10.1452+/- 0.074
 mean_var=153.4675+/-29.740, 0's: 0 Z-trim(106.8): 24  B-trim: 11 in 1/51
 Lambda= 0.103530
 statistics sampled from 9168 (9177) to 9168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.282), width:  16
 Scan time:  3.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12        ( 803) 5172 785.1       0
CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6        ( 724) 1823 284.9 3.2e-76
CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14       ( 732) 1463 231.1   5e-60
CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14      ( 854) 1463 231.2 5.7e-60
CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16        ( 704)  561 96.4 1.8e-19
CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16        ( 651)  559 96.1   2e-19


>>CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12             (803 aa)
 initn: 5172 init1: 5172 opt: 5172  Z-score: 4184.5  bits: 785.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5172; 100.0% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRALWVLGLCCVLLTFGSVRADDEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MRALWVLGLCCVLLTFGSVRADDEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 LNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 TDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 AQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 EEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 SFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 DFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 NDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 MAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 SEKTKESREAVEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SEKTKESREAVEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMER
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 IMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 IMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFET
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 ATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDE
              730       740       750       760       770       780

              790       800   
pF1KE1 EMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
       :::::::::::::::::::::::
CCDS90 EMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
              790       800   

>>CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6             (724 aa)
 initn: 1677 init1: 447 opt: 1823  Z-score: 1481.8  bits: 284.9 E(32554): 3.2e-76
Smith-Waterman score: 2207; 47.8% identity (75.7% similar) in 737 aa overlap (65-783:4-724)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE1 LGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLY
                                     .... .:. : ::::::. ..:.::::..:
CCDS49                            MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFY
                                          10        20        30   

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE1 KNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGM
       .:::::::::::::::::::::  :::: . :....:: . :  . ..  : ..:::.::
CCDS49 SNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGM
            40        50        60        70        80        90   

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE1 TREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSK
       :. .:..::::::::::. :.    :: . : . : .:::::::::::.:::.::.: .:
CCDS49 TKADLINNLGTIAKSGTKAFM----EALQAGADIS-MIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITK
           100       110           120        130       140        

          220        230       240       250       260       270   
pF1KE1 HNNDTQHIWESDSN-EFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQ
       ::.: :. :::...  :.: :: .:. .:::: . : :::. ..:::   .:..:::.::
CCDS49 HNDDEQYAWESSAGGSFTVRAD-HGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQ
      150       160       170        180       190       200       

             280       290       300              310          320 
pF1KE1 FINFPI--YVWSSKTETVEEPMEEEEAAKEEKEESDDE-------AAVEEEEE---EKKP
       ::..::  :. . . . . .   ::: ...:.:..:::       .. .::..   .:: 
CCDS49 FIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEEDKDDEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKK
       210       220       230       240       250       260       

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE1 KTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEV
       ::::...   : : .:  :::: :   .. ..::  ::::.... .: .:  ::..::..
CCDS49 KTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQL
       270       280       290       300       310       320       

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE1 TFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDD
        :...::.:  ::  ::..  .::.. :::::::::: :.  ...:.::::..:::::.:
CCDS49 EFRALLFIPRRAPFDLFEN--KKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSED
       330       340         350       360       370       380     

             450       460       470       480        490       500
pF1KE1 LPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDH
       ::::.::: ::: :.::::::..:.: :......:.:: :   :.. :. :.:::. :: 
CCDS49 LPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDS
         390       400       410       420       430       440     

              510       520       530       540       550       560
pF1KE1 SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLK
       .:: ::..:::...:.   ..:::..:: :::: : .::...: :.... .: ::::. :
CCDS49 TNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRK
         450       460       470       480       490       500     

              570       580       590       600       610       620
pF1KE1 KGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLN
       .:.::.:.:::.::::.: : ::::: . .:.:::... :.:. :.. :  . .:: : .
CCDS49 RGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCK
         510       520       530       540       550       560     

              630       640       650       660       670       680
pF1KE1 WMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYAS
        ::.  :  :.::...:.::. ::: .:.: :::..::::::::::    .: ::  :  
CCDS49 LMKE-ILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMM
          570       580       590       600       610          620 

              690       700       710       720       730       740
pF1KE1 QKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIE
        :: .:::: ::... . .. . :..::.: ::.:.::::: : ::. : : .....:: 
CCDS49 AKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIY
             630       640       650       660       670       680 

              750       760       770           780       790      
pF1KE1 RMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDED----EEMDVGTDEEEETAKES
       ::..:.:.:: :    :   :::. .. :     : :::    ::.:             
CCDS49 RMIKLGLGIDED----EVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD             
             690           700       710       720                 

        800   
pF1KE1 TAEKDEL

>>CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14            (732 aa)
 initn: 1709 init1: 448 opt: 1463  Z-score: 1191.1  bits: 231.1 E(32554): 5e-60
Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (71-783:15-732)

               50        60        70        80        90       100
pF1KE1 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF
                                     :. : ::::::. ..:.::::..:.:::::
CCDS99                 MPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF
                               10        20        30        40    

              110       120       130       140       150       160
pF1KE1 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV
       :::::::.::::::::  :::: . :....:: ...  .:.   : ..:::.:::. .:.
CCDS99 LRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLI
           50        60        70        80        90       100    

              170       180       190       200       210       220
pF1KE1 KNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQ
       .::::::::::. :.    :: . : . : .:::::::::::.:::.:: : .:::.: :
CCDS99 NNLGTIAKSGTKAFM----EALQAGADIS-MIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQ
          110           120        130       140       150         

               230       240       250       260       270         
pF1KE1 HIWESDSN-EFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPI
       . :::...  :.: .:  :. .:::: . : :::. ..:::   ::..:::.::::..::
CCDS99 YAWESSAGGSFTVRTDT-GEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPI
     160       170        180       190       200       210        

     280          290       300           310           320        
pF1KE1 YVWSSKT---ETVEEPMEEEEAAKEEKE----ESDDEAAVEE----EEEEKKP----KTK
        ..  :    :. ..  ::.:  .::::    ::.:.  .:.    ::::::     : :
CCDS99 TLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKK
      220       230       240       250       260       270        

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE1 KVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFK
       :...   : : .:  :::: :   .. ..::  ::::.... .: .:  ::..::.. :.
CCDS99 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR
      280       290       300       310       320       330        

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL
       ..::::  ::  ::..   ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.::::
CCDS99 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL
      340       350         360       370       380       390      

          450       460       470       480        490       500   
pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR
       :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: :   :...:. :::::. :: .::
CCDS99 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR
        400       410       420       430       440       450      

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY
        .:..:::. .:    ...:: .:  ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: 
CCDS99 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL
        460       470       480       490       500       510      

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK
       ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...:  . .:: : . ::
CCDS99 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK
        520       530       540       550       560       570      

           630       640       650       660       670       680   
pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK
       :  :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..::::::::::    .: ::  : . ::
CCDS99 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK
         580       590       600       610          620       630  

           690       700       710       720       730       740   
pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML
        .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::.
CCDS99 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI
            640       650       660       670       680       690  

           750       760       770       780       790       800   
pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
       .:.:.:: :  . ..      :       : . .. ::.:                    
CCDS99 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD                    
            700       710       720       730                      

>>CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14           (854 aa)
 initn: 1709 init1: 448 opt: 1463  Z-score: 1190.1  bits: 231.2 E(32554): 5.7e-60
Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (71-783:137-854)

               50        60        70        80        90       100
pF1KE1 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF
                                     :. : ::::::. ..:.::::..:.:::::
CCDS32 QHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF
        110       120       130       140       150       160      

              110       120       130       140       150       160
pF1KE1 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV
       :::::::.::::::::  :::: . :....:: ...  .:.   : ..:::.:::. .:.
CCDS32 LRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLI
        170       180       190       200       210       220      

              170       180       190       200       210       220
pF1KE1 KNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQ
       .::::::::::. :.    :: . : . : .:::::::::::.:::.:: : .:::.: :
CCDS32 NNLGTIAKSGTKAFM----EALQAGADIS-MIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQ
        230       240           250        260       270       280 

               230       240       250       260       270         
pF1KE1 HIWESDSN-EFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPI
       . :::...  :.: .:  :. .:::: . : :::. ..:::   ::..:::.::::..::
CCDS32 YAWESSAGGSFTVRTDT-GEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPI
             290        300       310       320       330       340

     280          290       300           310           320        
pF1KE1 YVWSSKT---ETVEEPMEEEEAAKEEKE----ESDDEAAVEE----EEEEKKP----KTK
        ..  :    :. ..  ::.:  .::::    ::.:.  .:.    ::::::     : :
CCDS32 TLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKK
              350       360       370       380       390       400

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE1 KVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFK
       :...   : : .:  :::: :   .. ..::  ::::.... .: .:  ::..::.. :.
CCDS32 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR
              410       420       430       440       450       460

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE1 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL
       ..::::  ::  ::..   ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.::::
CCDS32 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL
              470         480       490       500       510        

          450       460       470       480        490       500   
pF1KE1 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR
       :.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: :   :...:. :::::. :: .::
CCDS32 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR
      520       530       540       550       560       570        

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE1 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY
        .:..:::. .:    ...:: .:  ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.: 
CCDS32 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL
      580       590       600       610       620       630        

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE1 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK
       ::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...:  . .:: : . ::
CCDS32 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK
      640       650       660       670       680       690        

           630       640       650       660       670       680   
pF1KE1 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK
       :  :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..::::::::::    .: ::  : . ::
CCDS32 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK
       700       710       720       730       740          750    

           690       700       710       720       730       740   
pF1KE1 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML
        .:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::.
CCDS32 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI
          760       770       780       790       800       810    

           750       760       770       780       790       800   
pF1KE1 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
       .:.:.:: :  . ..      :       : . .. ::.:                    
CCDS32 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD                    
          820       830       840       850                        

>>CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16             (704 aa)
 initn: 1048 init1: 194 opt: 561  Z-score: 463.2  bits: 96.4 E(32554): 1.8e-19
Smith-Waterman score: 1105; 32.0% identity (61.3% similar) in 697 aa overlap (64-743:76-697)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE1 DLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSL
                                     :. . .. .. :  ::::..... ..  ::
CCDS10 RRNPAWSLQAGRLFSTQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSL
          50        60        70        80        90       100     

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE1 YKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVG
       :..::.:.:::::::::::.:.:   ..: .::    :. .... . ::. . . :::.:
CCDS10 YSEKEVFIRELISNASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIG
         110       120       130          140       150       160  

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE1 MTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTS
       ::.::::.::::::.::.. ::. .   :......:..::::::::::::.:::.: : :
CCDS10 MTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDAL---QNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYS
            170       180          190       200       210         

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE1 KHN--NDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKY
       .    ..  . : ::..    ::.  :  .  :: : . :: . ...     ....: ::
CCDS10 RSAAPGSLGYQWLSDGSGVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKY
     220       230       240         250       260       270       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE1 SQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAKEEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVW
       :.:..::.:. . .                                              
CCDS10 SNFVSFPLYLNGRR----------------------------------------------
       280       290                                               

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE1 DWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPT
           :: .. ::.   :.:.: ... ::.  ..  : :   .:. ... ....::..:: 
CCDS10 ----MNTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPD
                 300       310       320       330       340       

                400       410       420       430       440        
pF1KE1 SAPRGLFD---EYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSR
         : ..::   : ::.    . :: :.:.:     :..::.: :..:::::.:.:::.::
CCDS10 MKP-SMFDVSRELGSS----VALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSR
       350        360           370       380       390       400  

      450           460       470       480       490         500  
pF1KE1 ETLQQHKLLK----VIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYNDTFWKEFGTNIKLGVIE--DHSN
       : ::.  :..    :....:..  .:. :: :. ::   :....:  .. :..   ..  
CCDS10 ELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAE-KYAK-FFEDYGLFMREGIVTATEQEV
            410       420       430         440       450       460

            510        520       530       540       550       560 
pF1KE1 RTRLAKLLRFQSSHHPT-DITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKK
       .  .:::::..::  :. ..:::..:. ::.    .::.. . .:. :: ::. : . ::
CCDS10 KEDIAKLLRYESSALPSGQLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKK
              470       480       490       500       510       520

             570       580       590       600       610           
pF1KE1 GYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAV-----EKEFE
         ::..  :  ::  .  : ::: :.. .:  . :    .:.  :.:  .     ::: :
CCDS10 DTEVLFCFEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETE
              530       540       550       560       570       580

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE1 PLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTN
        :. ::.. .: ... .. :. ::   :  ... ..: . .. :...    :  .     
CCDS10 ELMAWMRN-VLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERA----
               590       600       610       620       630         

        680       690       700       710       720       730      
pF1KE1 YYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYG
            . :.:::::: ::.  : ... .:   . : :.  ..:.: . .: :. : .:. 
CCDS10 --QLLQPTLEINPRHALIKK-LNQLRASEPGLAQL-LVDQIYENAMIAAG-LVDDPRAMV
           640       650        660        670       680        690

        740       750       760       770       780       790      
pF1KE1 DRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKES
        :....:                                                     
CCDS10 GRLNELLVKALERH                                              
              700                                                  

>>CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16             (651 aa)
 initn: 1046 init1: 194 opt: 559  Z-score: 462.1  bits: 96.1 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 1103; 32.3% identity (61.2% similar) in 688 aa overlap (73-743:32-644)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE1 RTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLR
                                     . :  ::::..... ..  :::..::.:.:
CCDS61 ARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIR
              10        20        30        40        50        60 

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE1 ELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKN
       ::::::::::.:.:   ..: .::    :. .... . ::. . . :::.:::.::::.:
CCDS61 ELISNASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSN
              70        80           90       100       110        

            170       180       190       200       210         220
pF1KE1 LGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHN--NDTQ
       :::::.::.. ::. .   :......:..::::::::::::.:::.: : :.    ..  
CCDS61 LGTIARSGSKAFLDAL---QNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLG
      120       130          140       150       160       170     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE1 HIWESDSNEFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIY
       . : ::..    ::.  :  .  :: : . :: . ...     ....: :::.:..::.:
CCDS61 YQWLSDGSGVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLY
         180       190         200       210       220       230   

              290       300       310       320       330       340
pF1KE1 VWSSKTETVEEPMEEEEAAKEEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIK
       . . .                                                  :: ..
CCDS61 LNGRR--------------------------------------------------MNTLQ
                                                             240   

              350       360       370       380       390          
pF1KE1 PIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFD-
        ::.   :.:.: ... ::.  ..  : :   .:. ... ....::..::   : ..:: 
CCDS61 AIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKP-SMFDV
           250       260       270       280       290        300  

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE1 --EYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLL
         : ::.    . :: :.:.:     :..::.: :..:::::.:.:::.::: ::.  :.
CCDS61 SRELGSS----VALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALI
                310       320       330       340       350        

           460       470       480       490         500       510 
pF1KE1 K----VIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYNDTFWKEFGTNIKLGVIE--DHSNRTRLAKLLR
       .    :....:..  .:. :: :. ::   :....:  .. :..   ..  .  .:::::
CCDS61 RKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAE-KYAK-FFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLR
      360       370       380         390       400       410      

              520       530       540       550       560       570
pF1KE1 FQSSHHPT-DITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTE
       ..::  :. ..:::..:. ::.    .::.. . .:. :: ::. : . ::  ::..  :
CCDS61 YESSALPSGQLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFE
        420       430       440       450       460       470      

              580       590       600       610            620     
pF1KE1 PVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAV-----EKEFEPLLNWMKDK
         ::  .  : ::: :.. .:  . :    .:.  :.:  .     ::: : :. ::.. 
CCDS61 QFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRN-
        480       490       500       510       520       530      

         630       640       650       660       670       680     
pF1KE1 ALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTF
       .: ... .. :. ::   :  ... ..: . .. :...    :  .          . :.
CCDS61 VLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERA------QLLQPTL
         540       550       560       570       580               

         690       700       710       720       730       740     
pF1KE1 EINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRL
       :::::: ::.  : ... .:   . : :.  ..:.: . .: :. : .:.  :....:  
CCDS61 EINPRHALIKK-LNQLRASEPGLAQL-LVDQIYENAMIAAG-LVDDPRAMVGRLNELLVK
     590       600        610        620        630       640      

         750       760       770       780       790       800   
pF1KE1 SLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
                                                                 
CCDS61 ALERH                                                     
        650                                                      




803 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 20:28:57 2016 done: Sun Nov  6 20:28:57 2016
 Total Scan time:  3.390 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com