Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0396
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0396, 1040 aa
  1>>>pF1KE0396 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3211+/-0.00096; mu= 22.1581+/- 0.058
 mean_var=83.2420+/-16.890, 0's: 0 Z-trim(106.0): 70  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.140573
 statistics sampled from 8656 (8727) to 8656 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.268), width:  16
 Scan time:  4.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10746.1 NOD2 gene_id:64127|Hs108|chr16         (1040) 7022 1434.9       0
CCDS5427.1 NOD1 gene_id:10392|Hs108|chr7           ( 953) 1366 287.8 7.5e-77
CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1004)  455 103.0 3.2e-21
CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1061)  455 103.1 3.4e-21
CCDS62785.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1062)  455 103.1 3.4e-21
CCDS73817.1 NLRC3 gene_id:197358|Hs108|chr16       (1065)  378 87.5 1.7e-16
CCDS60680.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11       ( 891)  364 84.6 1.1e-15
CCDS7693.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11        ( 892)  364 84.6 1.1e-15
CCDS10544.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16         (1130)  341 80.0 3.2e-14
CCDS73826.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16         (1131)  341 80.0 3.2e-14
CCDS7784.1 NLRP10 gene_id:338322|Hs108|chr11       ( 655)  338 79.2 3.3e-14
CCDS12934.1 NLRP9 gene_id:338321|Hs108|chr19       ( 991)  306 72.8   4e-12
CCDS32537.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1375)  299 71.5 1.4e-11
CCDS58508.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1399)  299 71.5 1.4e-11
CCDS42245.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1429)  299 71.5 1.4e-11
CCDS42244.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1443)  299 71.5 1.4e-11
CCDS42246.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1473)  299 71.6 1.4e-11
CCDS54318.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1039)  297 71.0 1.5e-11
CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1040)  297 71.0 1.5e-11
CCDS12913.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1062)  297 71.0 1.5e-11
CCDS77654.1 LRRC74B gene_id:400891|Hs108|chr22     ( 392)  291 69.4 1.6e-11
CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19       (1029)  285 68.6 7.9e-11
CCDS12937.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19       (1048)  285 68.6   8e-11
CCDS7697.1 RNH1 gene_id:6050|Hs108|chr11           ( 461)  280 67.3 8.7e-11


>>CCDS10746.1 NOD2 gene_id:64127|Hs108|chr16              (1040 aa)
 initn: 7022 init1: 7022 opt: 7022  Z-score: 7691.9  bits: 1434.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7022; 100.0% identity (100.0% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MGEEGGSASHDEEERASVLLGHSPGCEMCSQEAFQAQRSQLVELLVSGSLEGFESVLDWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGEEGGSASHDEEERASVLLGHSPGCEMCSQEAFQAQRSQLVELLVSGSLEGFESVLDWL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LSWEVLSWEDYEGFHLLGQPLSHLARRLLDTVWNKGTWACQKLIAAAQEAQADSQSPKLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSWEVLSWEDYEGFHLLGQPLSHLARRLLDTVWNKGTWACQKLIAAAQEAQADSQSPKLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GCWDPHSLHPARDLQSHRPAIVRRLHSHVENMLDLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GCWDPHSLHPARDLQSHRPAIVRRLHSHVENMLDLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ARRLLDLATVKANGLAAFLLQHVQELPVPLALPLEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARRLLDLATVKANGLAAFLLQHVQELPVPLALPLEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 DGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 AGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDVGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDVGQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 EDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHCSPTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHCSPTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNAR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 KVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 GLCHLPVFSWMVSKCHQELLLQEGGSPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLCHLPVFSWMVSKCHQELLLQEGGSPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 RGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPGSTAPLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPGSTAPLE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 FLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSVA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 ALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACARWCLARSLRKHFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACARWCLARSLRKHFH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 SIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGHLKLTFCSVGPTECA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGHLKLTFCSVGPTECA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 ALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECAL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 HCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGNTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGNTS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 LQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKNVMLEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKNVMLEEL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 CLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTILEVWLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTILEVWLRG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040
pF1KE0 NTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
       ::::::::::::::::::::
CCDS10 NTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
             1030      1040

>>CCDS5427.1 NOD1 gene_id:10392|Hs108|chr7                (953 aa)
 initn: 1236 init1: 760 opt: 1366  Z-score: 1493.2  bits: 287.8 E(32554): 7.5e-77
Smith-Waterman score: 1583; 35.0% identity (62.9% similar) in 946 aa overlap (125-1027:13-940)

          100       110       120       130        140       150   
pF1KE0 KGTWACQKLIAAAQEAQADSQSPKLHGCWDPHSLHP-ARDLQSHRPAIVRRLHSHVENML
                                     :   ::  . :.:.:  .: .... .. ..
CCDS54                   MEEQGHSEMEIIPSESHPHIQLLKSNRELLVTHIRN-TQCLV
                                 10        20        30         40 

           160       170       180       190       200             
pF1KE0 DLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQRARRLLDLATVKANGLAAFLLQHVQEL-------
       :   .  . :  :  ::     :  ...:..:::.  :.. .. :.:  .:.:       
CCDS54 DNLLKNDYFSA-EDAEIVCACPTQPDKVRKILDLVQSKGEEVSEFFLYLLQQLADAYVDL
              50         60        70        80        90       100

         210                   220       230       240       250   
pF1KE0 -PVPLAL---P---------LEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTYDGAETLCLEDIYT
        :  : .   :         ...   ..:  .::  .. .:.:.  :   : : ::.:: 
CCDS54 RPWLLEIGFSPSLLTQSKVVVNTDPVSRYTQQLRHHLGRDSKFVLCYAQKEELLLEEIYM
              110       120       130       140       150       160

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 ENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGEAGSGKSTLLQRLH
       ....:.   ::...    :  .:.   :  : : ::....:....:.:: ::: :::::.
CCDS54 DTIMEL---VGFSNESLGSLNSLACL-LDHTTGILNEQGETIFILGDAGVGKSMLLQRLQ
                 170       180        190       200       210      

           320       330       340         350       360       370 
pF1KE0 LLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKP--LSVRTLLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHP
        :::.:.      : : : ::...:. .   : .. :::.: :.:.   :..: .::  :
CCDS54 SLWATGRLDAGVKFFFHFRCRMFSCFKESDRLCLQDLLFKHYCYPERDPEEVFAFLLRFP
        220       230       240       250       260       270      

             380       390           400       410       420       
pF1KE0 DRVLLTFDGFDEFKFRFTDRER----HCSPTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRP
         .:.::::.::..  . :  :     : : .:.   .:: :::.:.:::.: :..:.: 
CCDS54 HVALFTFDGLDELHSDL-DLSRVPDSSC-PWEPAHPLVLLANLLSGKLLKGASKLLTART
        280       290        300        310       320       330    

       430       440       450       460       470       480       
pF1KE0 AAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALHGLCHLPV
       .      :...: .  :.::: . .. : :.   : .. :::.  :. .  : .:: .:.
CCDS54 GI--EVPRQFLRKKVLLRGFSPSHLRAYARRMFPERALQDRLLSQLEANPNLCSLCSVPL
            340       350       360       370       380       390  

       490       500             510       520       530           
pF1KE0 FSWMVSKCHQELLLQEGGSPK------TTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGL-GP--S
       : :.. .: :..     :::.      : ::..::. .  : .  : . ....  .:  .
CCDS54 FCWIIFRCFQHFRAAFEGSPQLPDCTMTLTDVFLLVTEVHLNRMQPSSLVQRNTRSPVET
            400       410       420       430       440       450  

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE0 LLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPGSTAP
       :  ::  ::  ::..:  :.    .::. ...::. ..  :..::::     . ::.   
CCDS54 LHAGR-DTLCSLGQVAHRGMEKSLFVFTQEEVQASGLQERDMQLGFLRALPELGPGGDQQ
             460       470       480       490       500       510 

       600       610       620       630            640       650  
pF1KE0 -LEFLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFN-----CGRPGNSPMARLLPTMCIQAS
         ::.:.:.: ::.::.:.:.  :    : ..:.      :   .: .  .:: .:.:.:
CCDS54 SYEFFHLTLQAFFTAFFLVLDDRVGTQELLRFFQEWMPPAGAATTSCYPPFLPFQCLQGS
             520       530       540       550       560       570 

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE0 EGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACARWC-L
           . .   : : . : .:.:  :: ::::. .  ::   .    : :::.  : :  :
CCDS54 ----GPAREDLFKNKDH-FQFTNLFLCGLLSKAKQKLLR--HLVPAAALRRKRKALWAHL
                 580        590       600         610       620    

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE0 ARSLRKHFHSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGHLKLTF
         ::: ...:.: .     ..:.::: :::..: .:: : ..... ::::. ...::::.
CCDS54 FSSLRGYLKSLPRVQVESFNQVQAMPTFIWMLRCIYETQSQKVGQLAARGICANYLKLTY
          630       640       650       660       670       680    

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE0 CSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRG
       :..  ..:.::.:::.:. . .::.:: :...: ::..: ::..   .: :  :.:.: :
CCDS54 CNACSADCSALSFVLHHFPKRLALDLDNNNLNDYGVRELQPCFSRLTVLRLSVNQITDGG
          690       700       710       720       730       740    

             840       850       860       870       880       890 
pF1KE0 ICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVL
       .  : :   . . .  :.:.::..::  :. ..:.:   ...  :.::.: ::. :.. :
CCDS54 VKVLSEELTKYKIVTYLGLYNNQITDVGARYVTKILDECKGLTHLKLGKNKITSEGGKYL
          750       760       770       780       790       800    

             900       910       920       930       940       950 
pF1KE0 AEGLRGNTSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALML
       : ..... :.. .:.:::.::::::.:.:::: .: ::  :::..:.:.. :...::  :
CCDS54 ALAVKNSKSISEVGMWGNQVGDEGAKAFAEALRNHPSLTTLSLASNGISTEGGKSLARAL
          810       820       830       840       850       860    

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KE0 AKNVMLEELCLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERND
        .:. :: : : .:.:.:: . :::: :: :..:: : : .: ::  :.  : .::. : 
CCDS54 QQNTSLEILWLTQNELNDEVAESLAEMLKVNQTLKHLWLIQNQITAKGTAQLADALQSNT
          870       880       890       900       910       920    

            1020      1030      1040
pF1KE0 TILEVWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
        : :. : :: .. ::             
CCDS54 GITEICLNGNLIKPEEAKVYEDEKRIICF
          930       940       950   

>>CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19            (1004 aa)
 initn: 323 init1:  98 opt: 455  Z-score: 494.4  bits: 103.0 E(32554): 3.2e-21
Smith-Waterman score: 606; 26.3% identity (52.6% similar) in 779 aa overlap (270-1031:190-876)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 YDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVG
                                     : ::  . .: ::    .  .   ::.. :
CCDS62 LLLVKEHSNPMQVQQQLLDTGRGHARTVGHQASP--IKIETLFEPDEERPEPPRTVVMQG
     160       170       180       190         200       210       

     300       310       320        330       340       350        
pF1KE0 EAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQ-EFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDV
        :: ::: : ... : :: :. :: .: ..: ..::...  :   :.. :.:   :::. 
CCDS62 AAGIGKSMLAHKVMLDWADGKLFQGRFDYLFYINCREMNQSATECSMQDLIF--SCWPEP
       220       230       240       250       260         270     

      360       370       380       390        400        410      
pF1KE0 GQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERH-CSPTDPTSVQTLLFN-LLQGNLL
       .    .: :.  :.:.:. .:::::.:  : : .   :   .      ::.: :.. .::
CCDS62 SAP--LQELIRVPERLLFIIDGFDELKPSFHDPQGPWCLCWEEKRPTELLLNSLIRKKLL
           280       290       300       310       320       330   

        420       430         440       450       460       470    
pF1KE0 KNARKVVTSRPAAVSAFLR--KYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQ
        .   ..:.::.:.  . :  .. : . .. ::::   . :. :  :.   : ...  ..
CCDS62 PELSLLITTRPTALEKLHRLLEHPR-HVEILGFSEAERKEYFYKYFHNAEQAGQVFNYVR
           340       350        360       370       380       390  

          480       490       500            510       520         
pF1KE0 ETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELLLQEGG-----SPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPD
       ..  :  .: .:.  :.:  : :. :  :::     . .::: .:.: :  ..    :  
CCDS62 DNEPLFTMCFVPLVCWVVCTCLQQQL--EGGGLLRQTSRTTTAVYMLYLLSLM---QPKP
            400       410         420       430       440          

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE0 SASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDIS--LGFLVR
       .: .   :   ::    :  :.  .::.  .   .:  :.:.   .. .:.:  :.. . 
CCDS62 GAPRLQPPPNQRG----LCSLAADGLWNQKI---LFEEQDLRKHGLDGEDVSAFLNMNIF
       450       460           470          480       490       500

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE0 AKGVVPGSTAPLEFLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTM
        : .  .      :.:..:: ::::.:             .... :. : .:        
CCDS62 QKDI--NCERYYSFIHLSFQEFFAAMY-------------YILDEGEGGAGP--------
                510       520                    530               

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE0 CIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACA
               :..:. :: .    .     .::: : ::  .::: :   :.   :... : 
CCDS62 --------DQDVTRLLTEYAFSE----RSFLA-LTSRFLFGLLNEETRSH---LEKSLC-
               540       550            560       570          580 

       710       720        730       740       750       760      
pF1KE0 RWCLARSLRKHFHS-IPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGH
        : ..  ..  . . :   : .......   : . ..  :::.:::.. ..:     ..:
CCDS62 -WKVSPHIKMDLLQWIQSKAQSDGSTLQQ--GSLEFFSCLYEIQEEEFIQQA-----LSH
               590       600         610       620            630  

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE0 LKLTFCSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNN
       ...   :        .:  ..:.     :.   ..       :.:   :   : :  :..
CCDS62 FQVIVVS-------NIASKMEHMVSSFCLKRCRSA-------QVLHLYG---ATYSADGE
                   640       650       660                 670     

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE0 ISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAA
         ::. :.    .:  .  .. .:.     :. .. .:  :    :.. : :  : . . 
CCDS62 --DRARCSAGAHTLLVQLPERTVLL-----DAYSEHLAAALCTNPNLIELSLYRNALGSR
           680       690            700       710       720        

        890        900       910       920       930       940     
pF1KE0 GAQVLAEGLRG-NTSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQ
       :...: .:::  : .:: : .   :... . . :. ::  ...:  ..: ::..:  : .
CCDS62 GVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKRCRISSSACEDLSAALIANKNLTRMDLSGNGVGFPGMM
      730       740       750       760       770       780        

         950        960       970        980       990      1000   
pF1KE0 ALALMLAK-NVMLEELCLEENHLQDEGVCS-LAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEAL
        :   : . .  :. . :.. .:.. :.:. .:  :  :  :  : :..: .  :: . :
CCDS62 LLCEGLRHPQCRLQMIQLRKCQLES-GACQEMASVLGTNPHLVELDLTGNALEDLGLRLL
      790       800       810        820       830       840       

          1010       1020      1030      1040                      
pF1KE0 LQALERNDTILE-VWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL                      
        :.:..    :. .::.   ..    :.:                               
CCDS62 CQGLRHPVCRLRTLWLKICRLTAAACDELASTLSVNQSLRELDLSLNELGDLGVLLLCEG
       850       860       870       880       890       900       

>>CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19            (1061 aa)
 initn: 292 init1:  98 opt: 455  Z-score: 494.0  bits: 103.1 E(32554): 3.4e-21
Smith-Waterman score: 606; 26.3% identity (52.6% similar) in 779 aa overlap (270-1031:190-876)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 YDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVG
                                     : ::  . .: ::    .  .   ::.. :
CCDS12 LLLVKEHSNPMQVQQQLLDTGRGHARTVGHQASP--IKIETLFEPDEERPEPPRTVVMQG
     160       170       180       190         200       210       

     300       310       320        330       340       350        
pF1KE0 EAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQ-EFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDV
        :: ::: : ... : :: :. :: .: ..: ..::...  :   :.. :.:   :::. 
CCDS12 AAGIGKSMLAHKVMLDWADGKLFQGRFDYLFYINCREMNQSATECSMQDLIF--SCWPEP
       220       230       240       250       260         270     

      360       370       380       390        400        410      
pF1KE0 GQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERH-CSPTDPTSVQTLLFN-LLQGNLL
       .    .: :.  :.:.:. .:::::.:  : : .   :   .      ::.: :.. .::
CCDS12 SAP--LQELIRVPERLLFIIDGFDELKPSFHDPQGPWCLCWEEKRPTELLLNSLIRKKLL
           280       290       300       310       320       330   

        420       430         440       450       460       470    
pF1KE0 KNARKVVTSRPAAVSAFLR--KYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQ
        .   ..:.::.:.  . :  .. : . .. ::::   . :. :  :.   : ...  ..
CCDS12 PELSLLITTRPTALEKLHRLLEHPR-HVEILGFSEAERKEYFYKYFHNAEQAGQVFNYVR
           340       350        360       370       380       390  

          480       490       500            510       520         
pF1KE0 ETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELLLQEGG-----SPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPD
       ..  :  .: .:.  :.:  : :. :  :::     . .::: .:.: :  ..    :  
CCDS12 DNEPLFTMCFVPLVCWVVCTCLQQQL--EGGGLLRQTSRTTTAVYMLYLLSLM---QPKP
            400       410         420       430       440          

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE0 SASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDIS--LGFLVR
       .: .   :   ::    :  :.  .::.  .   .:  :.:.   .. .:.:  :.. . 
CCDS12 GAPRLQPPPNQRG----LCSLAADGLWNQKI---LFEEQDLRKHGLDGEDVSAFLNMNIF
       450       460           470          480       490       500

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE0 AKGVVPGSTAPLEFLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTM
        : .  .      :.:..:: ::::.:             .... :. : .:        
CCDS12 QKDI--NCERYYSFIHLSFQEFFAAMY-------------YILDEGEGGAGP--------
                510       520                    530               

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE0 CIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACA
               :..:. :: .    .     .::: : ::  .::: :   :.   :... : 
CCDS12 --------DQDVTRLLTEYAFSE----RSFLA-LTSRFLFGLLNEETRSH---LEKSLC-
               540       550            560       570          580 

       710       720        730       740       750       760      
pF1KE0 RWCLARSLRKHFHS-IPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGH
        : ..  ..  . . :   : .......   : . ..  :::.:::.. ..:     ..:
CCDS12 -WKVSPHIKMDLLQWIQSKAQSDGSTLQQ--GSLEFFSCLYEIQEEEFIQQA-----LSH
               590       600         610       620            630  

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE0 LKLTFCSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNN
       ...   :        .:  ..:.     :.   ..       :.:   :   : :  :..
CCDS12 FQVIVVS-------NIASKMEHMVSSFCLKRCRSA-------QVLHLYG---ATYSADGE
                   640       650       660                 670     

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE0 ISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAA
         ::. :.    .:  .  .. .:.     :. .. .:  :    :.. : :  : . . 
CCDS12 --DRARCSAGAHTLLVQLPERTVLL-----DAYSEHLAAALCTNPNLIELSLYRNALGSR
           680       690            700       710       720        

        890        900       910       920       930       940     
pF1KE0 GAQVLAEGLRG-NTSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQ
       :...: .:::  : .:: : .   :... . . :. ::  ...:  ..: ::..:  : .
CCDS12 GVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKRCRISSSACEDLSAALIANKNLTRMDLSGNGVGFPGMM
      730       740       750       760       770       780        

         950        960       970        980       990      1000   
pF1KE0 ALALMLAK-NVMLEELCLEENHLQDEGVCS-LAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEAL
        :   : . .  :. . :.. .:.. :.:. .:  :  :  :  : :..: .  :: . :
CCDS12 LLCEGLRHPQCRLQMIQLRKCQLES-GACQEMASVLGTNPHLVELDLTGNALEDLGLRLL
      790       800       810        820       830       840       

          1010       1020      1030      1040                      
pF1KE0 LQALERNDTILE-VWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL                      
        :.:..    :. .::.   ..    :.:                               
CCDS12 CQGLRHPVCRLRTLWLKICRLTAAACDELASTLSVNQSLRELDLSLNELGDLGVLLLCEG
       850       860       870       880       890       900       

>>CCDS62785.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19            (1062 aa)
 initn: 292 init1:  98 opt: 455  Z-score: 494.0  bits: 103.1 E(32554): 3.4e-21
Smith-Waterman score: 606; 26.6% identity (52.5% similar) in 779 aa overlap (270-1031:190-877)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 YDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVG
                                     : ::  . .: ::    .  .   ::.. :
CCDS62 LLLVKEHSNPMQVQQQLLDTGRGHARTVGHQASP--IKIETLFEPDEERPEPPRTVVMQG
     160       170       180       190         200       210       

     300       310       320        330       340       350        
pF1KE0 EAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQ-EFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDV
        :: ::: : ... : :: :. :: .: ..: ..::...  :   :.. :.:   :::. 
CCDS62 AAGIGKSMLAHKVMLDWADGKLFQGRFDYLFYINCREMNQSATECSMQDLIF--SCWPEP
       220       230       240       250       260         270     

      360       370       380       390        400        410      
pF1KE0 GQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERH-CSPTDPTSVQTLLFN-LLQGNLL
       .    .: :.  :.:.:. .:::::.:  : : .   :   .      ::.: :.. .::
CCDS62 SAP--LQELIRVPERLLFIIDGFDELKPSFHDPQGPWCLCWEEKRPTELLLNSLIRKKLL
           280       290       300       310       320       330   

        420       430         440       450       460       470    
pF1KE0 KNARKVVTSRPAAVSAFLR--KYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQ
        .   ..:.::.:.  . :  .. : . .. ::::   . :. :  :.   : ...  ..
CCDS62 PELSLLITTRPTALEKLHRLLEHPR-HVEILGFSEAERKEYFYKYFHNAEQAGQVFNYVR
           340       350        360       370       380       390  

          480       490       500            510       520         
pF1KE0 ETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELLLQEGG-----SPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPD
       ..  :  .: .:.  :.:  : :. :  :::     . .::: .:.: :  ..    :  
CCDS62 DNEPLFTMCFVPLVCWVVCTCLQQQL--EGGGLLRQTSRTTTAVYMLYLLSLM---QPKP
            400       410         420       430       440          

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE0 SASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDIS--LGFLVR
       .: .   :   ::    :  :.  .::.  .   .:  :.:.   .. .:.:  :.. . 
CCDS62 GAPRLQPPPNQRG----LCSLAADGLWNQKI---LFEEQDLRKHGLDGEDVSAFLNMNIF
       450       460           470          480       490       500

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE0 AKGVVPGSTAPLEFLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTM
        : .  .      :.:..:: ::::.:             .... :. : .:        
CCDS62 QKDI--NCERYYSFIHLSFQEFFAAMY-------------YILDEGEGGAGP--------
                510       520                    530               

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE0 CIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACA
               :..:. :: .    .     .::: : ::  .::: :   :.   :... : 
CCDS62 --------DQDVTRLLTEYAFSE----RSFLA-LTSRFLFGLLNEETRSH---LEKSLC-
               540       550            560       570          580 

       710       720        730       740       750       760      
pF1KE0 RWCLARSLRKHFHS-IPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGH
        : ..  ..  . . :   : .......   : . ..  :::.:::.. ..:     ..:
CCDS62 -WKVSPHIKMDLLQWIQSKAQSDGSTLQQ--GSLEFFSCLYEIQEEEFIQQA-----LSH
               590       600         610       620            630  

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE0 LKLTFCSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNN
       ...   :        .:  ..:.     :.   ..       :.:   :   : :  :..
CCDS62 FQVIVVS-------NIASKMEHMVSSFCLKRCRSA-------QVLHLYG---ATYSADGE
                   640       650       660                 670     

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE0 ISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAA
         ::. :.    . :   .: :    . : :. .. .:  :    :.. : :  : . . 
CCDS62 --DRARCS---AGAHTLLVQ-LRPERTVLLDAYSEHLAAALCTNPNLIELSLYRNALGSR
           680          690        700       710       720         

        890        900       910       920       930       940     
pF1KE0 GAQVLAEGLRG-NTSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQ
       :...: .:::  : .:: : .   :... . . :. ::  ...:  ..: ::..:  : .
CCDS62 GVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKRCRISSSACEDLSAALIANKNLTRMDLSGNGVGFPGMM
     730       740       750       760       770       780         

         950        960       970        980       990      1000   
pF1KE0 ALALMLAK-NVMLEELCLEENHLQDEGVCS-LAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEAL
        :   : . .  :. . :.. .:.. :.:. .:  :  :  :  : :..: .  :: . :
CCDS62 LLCEGLRHPQCRLQMIQLRKCQLES-GACQEMASVLGTNPHLVELDLTGNALEDLGLRLL
     790       800       810        820       830       840        

          1010       1020      1030      1040                      
pF1KE0 LQALERNDTILE-VWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL                      
        :.:..    :. .::.   ..    :.:                               
CCDS62 CQGLRHPVCRLRTLWLKICRLTAAACDELASTLSVNQSLRELDLSLNELGDLGVLLLCEG
      850       860       870       880       890       900        

>>CCDS73817.1 NLRC3 gene_id:197358|Hs108|chr16            (1065 aa)
 initn: 343 init1: 343 opt: 378  Z-score: 409.6  bits: 87.5 E(32554): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 811; 28.1% identity (56.6% similar) in 897 aa overlap (176-1038:20-864)

         150       160       170       180       190        200    
pF1KE0 HSHVENMLDLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQRARRLLDLATVKAN-GLAAFLLQHVQ
                                     .:..... :.:: . :.. :  :   : ..
CCDS73            MRKQEVRTGREAGQGHGTGSPAEQVKALMDLLAGKGSQGSQA--PQALD
                          10        20        30        40         

           210       220       230       240       250             
pF1KE0 ELP-VPLALPLEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTYDGAETLCLEDIYTE------NVL
       . : .::.   . .  ...   : . :..  .. . .    .: : .  :.      .  
CCDS73 RTPDAPLGPCSNDSRIQRHRKALLSKVGGGPELGGPWHRLASLLLVEGLTDLQLREHDFT
        50        60        70        80        90       100       

       260       270       280       290       300       310       
pF1KE0 EVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGEAGSGKSTLLQRLHLLWA
       .: :  : .: : .   :..:..::   ....    . ...: :: ::.::....  :::
CCDS73 QVEATRG-GGHPAR---TVALDRLFLPLSRVSVPPRVSITIGVAGMGKTTLVRHFVRLWA
       110        120          130       140       150       160   

       320       330       340       350        360       370      
pF1KE0 AGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCC-WPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLL
        ::  ..: .:.:.. :.:.   :  . : .    :  .: ::. .   : .  : :.::
CCDS73 HGQVGKDFSLVLPLTFRDLNTHEKLCADRLI----CSVFPHVGEPS---LAVAVPARALL
           170       180       190           200          210      

        380         390       400       410       420       430    
pF1KE0 TFDGFDEFK--FRFTDRERHCSPTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFL
        .::.:: .  . :..     .:     :. :. :...:::. ..   .::::.: . . 
CCDS73 ILDGLDECRTPLDFSNTVACTDPKKEIPVDHLITNIIRGNLFPEVSIWITSRPSASGQIP
        220       230       240       250       260       270      

          440       450       460        470       480       490   
pF1KE0 RKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEP-GVADRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVS
          .    ...::.:. :.. :..   :  ..   ..  .:   ::. .: .:.:  ...
CCDS73 GGLVDRMTEIRGFNEEEIKVCLEQMFPEDQALLGWMLSQVQADRALYLMCTVPAFCRLTG
        280       290       300       310       320       330      

           500              510       520       530       540      
pF1KE0 KCHQELLLQEGGS-------PKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPT
           .:  .. :        :.:  ..:   ..  :       . ..    .. .:    
CCDS73 MALGHLWRSRTGPQDAELWPPRTLCELYSWYFRMALSGEGQEKGKASPRIEQVAHGGRKM
        340       350       360       370       380       390      

        550       560       570       580              590         
pF1KE0 LLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISL--G-----FLVRAKGVVPGSTAPL
       .  :::::. ::    :::  :...:  :   :..:  :     :: : . ..  :..  
CCDS73 VGTLGRLAFHGLLKKKYVFYEQDMKAFGV---DLALLQGAPCSCFLQREETLA--SSVAY
        400       410       420          430       440         450 

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE0 EFLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSV
        : :...: : :: :         :  : .:.    ..    ::     ..       :.
CCDS73 CFTHLSLQEFVAAAYYY------GASRRAIFDLFTESGVSWPRLGFLTHFR-------SA
             460             470       480       490               

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE0 AALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKALLRRQACARWCLARSLRKHF
       :   ..::   :..   ::.:::: .  .:::    :  :  ..::  :  .:. :.  .
CCDS73 AQRAMQAEDGRLDVFLRFLSGLLSPRVNALLA---GSLLAQGEHQA-YRTQVAELLQGCL
      500       510       520       530          540        550    

     720       730       740       750       760        770        
pF1KE0 HSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQEERLARKAARGLNVGHL-KLTFCSVGPTE
       .   : :   :....       ... :.:.:. .:::.. .... : : .::    ::..
CCDS73 R---PDAAVCARAIN-------VLHCLHELQHTELARSVEEAMESGALARLT----GPAH
             560              570       580       590           600

      780       790       800        810       820       830       
pF1KE0 CAALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGVEQ-LLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIE
        ::::..:: .    : . . .   . :: : ::: :  :. : :  :...:  . .:. 
CCDS73 RAALAYLLQ-VSDACAQEANLSLSLSQGVLQSLLPQLLYCRKLRLDTNQFQD-PVMELLG
               610       620       630       640       650         

       840          850       860       870       880       890    
pF1KE0 CALH---CEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEG
        .:    : ..::..: .:....  :...:. :   ... .: : .: :   ::..::..
CCDS73 SVLSGKDC-RIQKISLAENQISNKGAKALARSLLVNRSLTSLDLRGNSIGPQGAKALADA
      660        670       680       690       700       710       

          900       910       920       930       940       950    
pF1KE0 LRGNTSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKN
       :. : .:  :.. :: : :.::...::::.....:  : :  :.:: .::: .:  : .:
CCDS73 LKINRTLTSLSLQGNTVRDDGARSMAEALASNRTLSMLHLQKNSIGPMGAQRMADALKQN
       720       730       740       750       760       770       

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KE0 VMLEELCLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTIL
         :.:: .  : . : :. .:::.:: :..:. : :..: :.  :. ::. ::  :.:.:
CCDS73 RSLKELMFSSNSIGDGGAKALAEALKVNQGLESLDLQSNSISDAGVAALMGALCTNQTLL
       780       790       800       810       820       830       

         1020      1030         1040                               
pF1KE0 EVWLRGNTFSLEEVDKLG---CRDTRLLL                               
        . :: :..: : .. ..   : .. :                                 
CCDS73 SLSLRENSISPEGAQAIAHALCANSTLKNLDLTANLLHDQGARAIAVAVRENRTLTSLHL
       840       850       860       870       880       890       

>>CCDS60680.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11            (891 aa)
 initn: 141 init1:  78 opt: 364  Z-score: 395.3  bits: 84.6 E(32554): 1.1e-15
Smith-Waterman score: 457; 25.8% identity (51.6% similar) in 741 aa overlap (294-1009:197-865)

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE0 GMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGEAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQ
                                     ::.. : :: ::.   ...   ::::. .:
CCDS60 EEPEPGRARRSDTHTFNRLFRRDEEGRRPLTVVLQGPAGIGKTMAAKKILYDWAAGKLYQ
        170       180       190       200       210       220      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE0 -EFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFD
        .  :.: . : .:       :.  :....:  :: :   . :.:  .:.:.:. .:: :
CCDS60 GQVDFAFFMPCGELLERPGTRSLADLILDQC--PDRGAP-VPQMLA-QPQRLLFILDGAD
        230       240       250         260         270       280  

            390        400       410       420       430       440 
pF1KE0 EFKFRFTDRERHCS-PTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTE
       :.      .   :. : . .:   .: .::.  :: .:  .::.: :: . .  .    .
CCDS60 ELPALGGPEAAPCTDPFEAASGARVLGGLLSKALLPTALLLVTTRAAAPGRLQGRLCSPQ
            290       300       310       320       330       340  

              450       460       470       480       490          
pF1KE0 F-NLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKC-HQEL
         ...:::..  . :. :  ..   :.:  :...:. .: .:: .:   :.:    .:.:
CCDS60 CAEVRGFSDKDKKKYFYKYFRDERRAERAYRFVKENETLFALCFVPFVCWIVCTVLRQQL
            350       360       370       380       390       400  

     500         510       520       530       540       550       
pF1KE0 LLQEGGS--PKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWG
        : .  :   ::::..:::..   :  :   :      :: : .: : .: .:.: .. :
CCDS60 ELGRDLSRTSKTTTSVYLLFITSVLSSAPVAD------GPRL-QGDLRNLCRLAREGVLG
            410       420       430              440       450     

       560       570       580       590          600       610    
pF1KE0 LGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPG---STAPLEFLHITFQCFFAAF-
              :. ..:.  ..  . ..  ::  .:  .::   . .  .:.  .:: :.::. 
CCDS60 RRAQ---FAEKELEQLELRGSKVQTLFL--SKKELPGVLETEVTYQFIDQSFQEFLAALS
            460       470       480         490       500       510

           620       630       640       650       660        670  
pF1KE0 YLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSVAALLQ-KAEPHN-L
       ::  .. ::                           ... :   .:..::.  :.::. :
CCDS60 YLLEDGGVP---------------------------RTAAG---GVGTLLRGDAQPHSHL
                                         520          530       540

             680              690       700       710         720  
pF1KE0 QITAAFLAGLLSRE-------HWGLLAECQTSEKALLRRQACARWC--LARSLRKHFHSI
        .:. :: :::: :       :.: ..  .....::   :. .. :  .:  . .  ...
CCDS60 VLTTRFLFGLLSAERMRDIERHFGCMVSERVKQEALRWVQGQGQGCPGVAPEVTEGAKGL
              550       560       570       580       590       600

            730        740       750        760       770       780
pF1KE0 PPAAPGEAKSVHAMPGF-IWLIRSLYEMQEERLARKA-ARGLNVGHLKLTFCSVGPTECA
         .   : .     :.. . :.  ::: ::. ..:.:  :  ...  .. :: .   . :
CCDS60 EDTEEPEEEEEGEEPNYPLELLYCLYETQEDAFVRQALCRFPELALQRVRFCRM---DVA
              610       620       630       640       650          

              790       800        810       820       830         
pF1KE0 ALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGV-EQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECA
       .:.. ..    :..  :   :   ... :.    ::  : :    .. :..:  : .  .
CCDS60 VLSYCVRCC--PAGQALRLISCRLVAAQEKKKKSLG--KRLQASLGGGSSQGTTKQLPAS
       660         670       680       690         700       710   

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE0 LHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGNT
       :    .: .       ::   :           . .: :..  .  :  . :.:.::.  
CCDS60 LLHPLFQAM-------TDPLCH-----------LSSLTLSHCKLPDAVCRDLSEALRAAP
           720                         730       740       750     

     900       910       920       930       940       950         
pF1KE0 SLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKNVMLEE
       .:  ::.  ::... : . :.:.:.  :       :     . : : :. :: ..  :  
CCDS60 ALTELGLLHNRLSEAGLRMLSEGLAWPQCRVQTVRVQLPDPQRGLQYLVGMLRQSPALTT
         760       770       780       790       800       810     

     960       970       980        990      1000      1010        
pF1KE0 LCLEENHLQDEGVCSLAEGLK-KNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTILEVWL
       : :   .:    :  :   :. .. .:. :.:..  ..  . . : ::..:         
CCDS60 LDLSGCQLPAPMVTYLCAVLQHQGCGLQTLSLASVELSEQSLQEL-QAVKRAKPDLVITH
         820       830       840       850       860        870    

     1020      1030      1040
pF1KE0 RGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
                             
CCDS60 PALDGHPQPPKELISTF     
          880       890      

>>CCDS7693.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11             (892 aa)
 initn: 141 init1:  78 opt: 364  Z-score: 395.3  bits: 84.6 E(32554): 1.1e-15
Smith-Waterman score: 449; 25.7% identity (51.5% similar) in 742 aa overlap (294-1009:197-866)

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE0 GMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGEAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQ
                                     ::.. : :: ::.   ...   ::::. .:
CCDS76 EEPEPGRARRSDTHTFNRLFRRDEEGRRPLTVVLQGPAGIGKTMAAKKILYDWAAGKLYQ
        170       180       190       200       210       220      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE0 -EFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFD
        .  :.: . : .:       :.  :....:  :: :   . :.:  .:.:.:. .:: :
CCDS76 GQVDFAFFMPCGELLERPGTRSLADLILDQC--PDRGAP-VPQMLA-QPQRLLFILDGAD
        230       240       250         260         270       280  

            390        400       410       420       430       440 
pF1KE0 EFKFRFTDRERHCS-PTDPTSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTE
       :.      .   :. : . .:   .: .::.  :: .:  .::.: :: . .  .    .
CCDS76 ELPALGGPEAAPCTDPFEAASGARVLGGLLSKALLPTALLLVTTRAAAPGRLQGRLCSPQ
            290       300       310       320       330       340  

              450       460       470       480       490          
pF1KE0 F-NLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKC-HQEL
         ...:::..  . :. :  ..   :.:  :...:. .: .:: .:   :.:    .:.:
CCDS76 CAEVRGFSDKDKKKYFYKYFRDERRAERAYRFVKENETLFALCFVPFVCWIVCTVLRQQL
            350       360       370       380       390       400  

     500         510       520       530       540       550       
pF1KE0 LLQEGGS--PKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWG
        : .  :   ::::..:::..   :  :   :      :: : .: : .: .:.: .. :
CCDS76 ELGRDLSRTSKTTTSVYLLFITSVLSSAPVAD------GPRL-QGDLRNLCRLAREGVLG
            410       420       430              440       450     

       560       570       580       590          600       610    
pF1KE0 LGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPG---STAPLEFLHITFQCFFAAF-
              :. ..:.  ..  . ..  ::  .:  .::   . .  .:.  .:: :.::. 
CCDS76 RRAQ---FAEKELEQLELRGSKVQTLFL--SKKELPGVLETEVTYQFIDQSFQEFLAALS
            460       470       480         490       500       510

           620       630       640       650       660        670  
pF1KE0 YLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQASEGKDSSVAALLQ-KAEPHN-L
       ::  .. ::                           ... :   .:..::.  :.::. :
CCDS76 YLLEDGGVP---------------------------RTAAG---GVGTLLRGDAQPHSHL
                                         520          530       540

             680              690       700       710         720  
pF1KE0 QITAAFLAGLLSRE-------HWGLLAECQTSEKALLRRQACARWC--LARSLRKHFHSI
        .:. :: :::: :       :.: ..  .....::   :. .. :  .:  . .  ...
CCDS76 VLTTRFLFGLLSAERMRDIERHFGCMVSERVKQEALRWVQGQGQGCPGVAPEVTEGAKGL
              550       560       570       580       590       600

            730        740       750        760       770       780
pF1KE0 PPAAPGEAKSVHAMPGF-IWLIRSLYEMQEERLARKA-ARGLNVGHLKLTFCSVGPTECA
         .   : .     :.. . :.  ::: ::. ..:.:  :  ...  .. :: .   . :
CCDS76 EDTEEPEEEEEGEEPNYPLELLYCLYETQEDAFVRQALCRFPELALQRVRFCRM---DVA
              610       620       630       640       650          

              790       800        810       820        830        
pF1KE0 ALAFVLQHLRRPVALQLDYNSVGDIGV-EQLLPCLGVCKALYLR-DNNISDRGICKLIEC
       .:.. ..    :..  :   :   ... :.    ::  : :     .. :..:  : .  
CCDS76 VLSYCVRCC--PAGQALRLISCRLVAAQEKKKKSLG--KRLQASLGGGSSSQGTTKQLPA
       660         670       680       690         700       710   

      840       850       860       870       880       890        
pF1KE0 ALHCEQLQKLALFNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGN
       .:    .: .       ::   :           . .: :..  .  :  . :.:.::. 
CCDS76 SLLHPLFQAM-------TDPLCH-----------LSSLTLSHCKLPDAVCRDLSEALRAA
           720                         730       740       750     

      900       910       920       930       940       950        
pF1KE0 TSLQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAKNVMLE
        .:  ::.  ::... : . :.:.:.  :       :     . : : :. :: ..  : 
CCDS76 PALTELGLLHNRLSEAGLRMLSEGLAWPQCRVQTVRVQLPDPQRGLQYLVGMLRQSPALT
         760       770       780       790       800       810     

      960       970       980        990      1000      1010       
pF1KE0 ELCLEENHLQDEGVCSLAEGLK-KNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTILEVW
        : :   .:    :  :   :. .. .:. :.:..  ..  . . : ::..:        
CCDS76 TLDLSGCQLPAPMVTYLCAVLQHQGCGLQTLSLASVELSEQSLQEL-QAVKRAKPDLVIT
         820       830       840       850       860        870    

      1020      1030      1040
pF1KE0 LRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
                              
CCDS76 HPALDGHPQPPKELISTF     
          880       890       

>>CCDS10544.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16              (1130 aa)
 initn: 376 init1: 133 opt: 341  Z-score: 368.7  bits: 80.0 E(32554): 3.2e-14
Smith-Waterman score: 517; 26.5% identity (50.7% similar) in 818 aa overlap (265-1040:382-1129)

          240       250       260         270       280        290 
pF1KE0 RFLSTYDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPP--QKSPATLGLEE-LFSTPGHLNDD
                                     .: :   ... :  :: : :...  :    
CCDS10 EPAGPDGILVEVDLVQARLERSSSKSLERELATPDWAERQLAQGGLAEVLLAAKEHRRPR
             360       370       380       390       400       410 

              300       310       320       330       340          
pF1KE0 ADTVL-VVGEAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKP---LSVRT
          :. :.:.::.:::     .   :: :. . .. :::   :   .:. .:    ... 
CCDS10 ETRVIAVLGKAGQGKSYWAGAVSRAWACGR-LPQYDFVFSVPC---HCLNRPGDAYGLQD
             420       430       440        450          460       

       350       360       370       380       390         400     
pF1KE0 LLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHC--SPTDPTSVQT
       :::     : :. ...:. .: .:::::: .:::.:.. .    .  :  .:..: :.. 
CCDS10 LLFSLGPQPLVAADEVFSHILKRPDRVLLILDGFEELEAQDGFLHSTCGPAPAEPCSLRG
       470       480       490       500       510       520       

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE0 LLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGV
       :: .:.: .::..   ..:.:: .  .   .   . :.:.::: .  . :. .  .  :.
CCDS10 LLAGLFQKKLLRGCTLLLTARPRGRLVQSLSKADALFELSGFSMEQAQAYVMRYFESSGM
       530       540       550       560       570       580       

            470       480       490       500         510       520
pF1KE0 A---DRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELL-LQEGGS-PKTTTDMYLLILQH
       .   :: . ::..   : .  : :..   : .  . :: : : .. :.: : .:. .: .
CCDS10 TEHQDRALTLLRDRPLLLSHSHSPTLCRAVCQLSEALLELGEDAKLPSTLTGLYVGLLGR
       590       600       610       620       630       640       

              530       540       550       560       570       580
pF1KE0 FLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDI
         :  .:: .                : .:..:: : ::        . ::  :    :.
CCDS10 AALD-SPPGA----------------LAELAKLA-WELGR----RHQSTLQEDQFPSADV
       650                        660            670       680     

              590         600         610       620           630  
pF1KE0 SLGFLVRAKGVV--PGSTAPLEFLHITF--QCFFAAFYLALSADVP----PALLRHLFNC
           .  :::.:  :  .:  :.   .:  :::..:..::::...     :  :      
CCDS10 RTWAM--AKGLVQHPPRAAESELAFPSFLLQCFLGALWLALSGEIKDKELPQYLALTPRK
         690         700       710       720       730       740   

            640          650       660       670       680         
pF1KE0 GRPGNSPMA---RLLPTMCIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGL
        :: .. .    :.:  . .:        ..:::  .   ...     ::  :.: . : 
CCDS10 KRPYDNWLEGVPRFLAGLIFQPPA---RCLGALLGPSAAASVDRKQKVLARYLKRLQPGT
           750       760          770       780       790       800

     690       700       710       720       730       740         
pF1KE0 LAECQTSEKALLRRQACARWCLARSLRKHFHSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEM
       :   :     ::.   ::.     .. .:              :. .:: . .. .    
CCDS10 LRARQ-----LLELLHCAHEAEEAGIWQHV-------------VQELPGRLSFLGTRLTP
                   810       820                    830       840  

     750         760        770        780          790       800  
pF1KE0 QEERLARKA--ARGLNVG-HLKLT-FCSVGPTECAALAFVLQH---LRRPVALQLDYNSV
        . ..  ::  : : . .  :. : .:  :    ..:. : .    :   :::  . .. 
CCDS10 PDAHVLGKALEAAGQDFSLDLRSTGICPSGLGSLVGLSCVTRFRAALSDTVALWESLQQH
            850       860       870       880       890       900  

            810          820       830       840       850         
pF1KE0 GDIGVEQLLP---CLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGC
       :.  . :       .   ::  :.:  . : :  ::.       : :.        : . 
CCDS10 GETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKD--VEDLG--KLV-------QTQR--------TRSS
            910       920         930                        940   

     860       870       880        890       900          910     
pF1KE0 AHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGA-QVLAEGLRGNTSLQFLGFWG---NRVGDEG
       ... :  :   ...  :... . ...  :   :.. : . .::: : . .   :..::::
CCDS10 SEDTAGELPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVRILTAFSSLQHLDLDALSENKIGDEG
           950       960       970       980       990      1000   

         920       930       940       950        960       970    
pF1KE0 AQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAK-NVMLEELCLEENHLQDEGVCS
       .. :. .. . .::. :.:  ::: ..::  ::  : .  . : .: : .: . : :. :
CCDS10 VSQLSATFPQLKSLETLNLSQNNITDLGAYKLAEALPSLAASLLRLSLYNNCICDVGAES
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

          980       990      1000      1010        1020      1030  
pF1KE0 LAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTI--LEVWLRGNTFSLEEVDKLG
       ::. :    ::... .. : .:  ::. :  .:.:   .  : .:     ::..:  .: 
CCDS10 LARVLPDMVSLRVMDVQYNKFTAAGAQQLAASLRRCPHVETLAMWTPTIPFSVQE--HLQ
          1070      1080      1090      1100      1110        1120 

           1040 
pF1KE0 CRDTRLLL 
        .:.:. : 
CCDS10 QQDSRISLR
            1130

>>CCDS73826.1 CIITA gene_id:4261|Hs108|chr16              (1131 aa)
 initn: 376 init1: 133 opt: 341  Z-score: 368.7  bits: 80.0 E(32554): 3.2e-14
Smith-Waterman score: 517; 26.5% identity (50.7% similar) in 818 aa overlap (265-1040:383-1130)

          240       250       260         270       280        290 
pF1KE0 RFLSTYDGAETLCLEDIYTENVLEVWADVGMAGPP--QKSPATLGLEE-LFSTPGHLNDD
                                     .: :   ... :  :: : :...  :    
CCDS73 EPAGPDGILVEVDLVQARLERSSSKSLERELATPDWAERQLAQGGLAEVLLAAKEHRRPR
            360       370       380       390       400       410  

              300       310       320       330       340          
pF1KE0 ADTVL-VVGEAGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKP---LSVRT
          :. :.:.::.:::     .   :: :. . .. :::   :   .:. .:    ... 
CCDS73 ETRVIAVLGKAGQGKSYWAGAVSRAWACGR-LPQYDFVFSVPC---HCLNRPGDAYGLQD
            420       430       440        450          460        

       350       360       370       380       390         400     
pF1KE0 LLFEHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHC--SPTDPTSVQT
       :::     : :. ...:. .: .:::::: .:::.:.. .    .  :  .:..: :.. 
CCDS73 LLFSLGPQPLVAADEVFSHILKRPDRVLLILDGFEELEAQDGFLHSTCGPAPAEPCSLRG
      470       480       490       500       510       520        

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE0 LLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQGIELYLRKRHHEPGV
       :: .:.: .::..   ..:.:: .  .   .   . :.:.::: .  . :. .  .  :.
CCDS73 LLAGLFQKKLLRGCTLLLTARPRGRLVQSLSKADALFELSGFSMEQAQAYVMRYFESSGM
      530       540       550       560       570       580        

            470       480       490       500         510       520
pF1KE0 A---DRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELL-LQEGGS-PKTTTDMYLLILQH
       .   :: . ::..   : .  : :..   : .  . :: : : .. :.: : .:. .: .
CCDS73 TEHQDRALTLLRDRPLLLSHSHSPTLCRAVCQLSEALLELGEDAKLPSTLTGLYVGLLGR
      590       600       610       620       630       640        

              530       540       550       560       570       580
pF1KE0 FLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHLGRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDI
         :  .:: .                : .:..:: : ::        . ::  :    :.
CCDS73 AALD-SPPGA----------------LAELAKLA-WELGR----RHQSTLQEDQFPSADV
      650                        660        670           680      

              590         600         610       620           630  
pF1KE0 SLGFLVRAKGVV--PGSTAPLEFLHITF--QCFFAAFYLALSADVP----PALLRHLFNC
           .  :::.:  :  .:  :.   .:  :::..:..::::...     :  :      
CCDS73 RTWAM--AKGLVQHPPRAAESELAFPSFLLQCFLGALWLALSGEIKDKELPQYLALTPRK
        690         700       710       720       730       740    

            640          650       660       670       680         
pF1KE0 GRPGNSPMA---RLLPTMCIQASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGL
        :: .. .    :.:  . .:        ..:::  .   ...     ::  :.: . : 
CCDS73 KRPYDNWLEGVPRFLAGLIFQPPA---RCLGALLGPSAAASVDRKQKVLARYLKRLQPGT
          750       760          770       780       790       800 

     690       700       710       720       730       740         
pF1KE0 LAECQTSEKALLRRQACARWCLARSLRKHFHSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEM
       :   :     ::.   ::.     .. .:              :. .:: . .. .    
CCDS73 LRARQ-----LLELLHCAHEAEEAGIWQHV-------------VQELPGRLSFLGTRLTP
                  810       820                    830       840   

     750         760        770        780          790       800  
pF1KE0 QEERLARKA--ARGLNVG-HLKLT-FCSVGPTECAALAFVLQH---LRRPVALQLDYNSV
        . ..  ::  : : . .  :. : .:  :    ..:. : .    :   :::  . .. 
CCDS73 PDAHVLGKALEAAGQDFSLDLRSTGICPSGLGSLVGLSCVTRFRAALSDTVALWESLQQH
           850       860       870       880       890       900   

            810          820       830       840       850         
pF1KE0 GDIGVEQLLP---CLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECALHCEQLQKLALFNNKLTDGC
       :.  . :       .   ::  :.:  . : :  ::.       : :.        : . 
CCDS73 GETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKD--VEDLG--KLV-------QTQR--------TRSS
           910       920         930                940            

     860       870       880        890       900          910     
pF1KE0 AHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGA-QVLAEGLRGNTSLQFLGFWG---NRVGDEG
       ... :  :   ...  :... . ...  :   :.. : . .::: : . .   :..::::
CCDS73 SEDTAGELPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVRILTAFSSLQHLDLDALSENKIGDEG
          950       960       970       980       990      1000    

         920       930       940       950        960       970    
pF1KE0 AQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALMLAK-NVMLEELCLEENHLQDEGVCS
       .. :. .. . .::. :.:  ::: ..::  ::  : .  . : .: : .: . : :. :
CCDS73 VSQLSATFPQLKSLETLNLSQNNITDLGAYKLAEALPSLAASLLRLSLYNNCICDVGAES
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

          980       990      1000      1010        1020      1030  
pF1KE0 LAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGAEALLQALERNDTI--LEVWLRGNTFSLEEVDKLG
       ::. :    ::... .. : .:  ::. :  .:.:   .  : .:     ::..:  .: 
CCDS73 LARVLPDMVSLRVMDVQYNKFTAAGAQQLAASLRRCPHVETLAMWTPTIPFSVQE--HLQ
         1070      1080      1090      1100      1110        1120  

           1040 
pF1KE0 CRDTRLLL 
        .:.:. : 
CCDS73 QQDSRISLR
           1130 




1040 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 12:23:50 2016 done: Thu Nov  3 12:23:51 2016
 Total Scan time:  4.700 Total Display time:  0.360

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com