Result of FASTA (omim) for pFN21AB8477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8477, 914 aa
  1>>>pF1KB8477 914 - 914 aa - 914 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4533+/-0.000452; mu= -8.2308+/- 0.028
 mean_var=323.0531+/-67.172, 0's: 0 Z-trim(119.2): 45  B-trim: 268 in 1/55
 Lambda= 0.071357
 statistics sampled from 32937 (32983) to 32937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.387), width:  16
 Scan time: 15.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055864 (OMIM: 607334) trafficking kinesin-bindi ( 914) 5923 624.4 7.6e-178
XP_011509992 (OMIM: 607334) PREDICTED: trafficking ( 914) 5923 624.4 7.6e-178
XP_016860261 (OMIM: 607334) PREDICTED: trafficking ( 703) 4567 484.8 6.4e-136
NP_001036111 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bi ( 953) 1815 201.5 1.6e-50
XP_005265015 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 879) 1594 178.8   1e-43
XP_005265017 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 712) 1521 171.2 1.6e-41
XP_006713094 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 643) 1406 159.3 5.4e-38
XP_005265020 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 645) 1406 159.3 5.5e-38
XP_006713093 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 645) 1406 159.3 5.5e-38
XP_011531791 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 664) 1406 159.3 5.6e-38
XP_006713092 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 666) 1406 159.3 5.6e-38
XP_005265019 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 666) 1406 159.3 5.6e-38
XP_016861402 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 691) 1406 159.4 5.8e-38
NP_001252537 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bi ( 744) 1406 159.4 6.1e-38
XP_016861401 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 758) 1406 159.4 6.2e-38
XP_005265013 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 932) 1406 159.4 7.4e-38
XP_016861395 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking (1022) 1406 159.5 7.9e-38
NP_001252539 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bi ( 556) 1185 136.5 3.4e-31
NP_001252538 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bi ( 670) 1185 136.6   4e-31
NP_055780 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bindi ( 686) 1185 136.6   4e-31
XP_016861399 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 858) 1185 136.7 4.9e-31
XP_016861397 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 925) 1185 136.7 5.2e-31
XP_016861396 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 941) 1185 136.7 5.2e-31
XP_016861400 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 828) 1161 134.2 2.6e-30
XP_016861398 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking ( 895) 1161 134.2 2.8e-30


>>NP_055864 (OMIM: 607334) trafficking kinesin-binding p  (914 aa)
 initn: 5923 init1: 5923 opt: 5923  Z-score: 3313.9  bits: 624.4 E(85289): 7.6e-178
Smith-Waterman score: 5923; 99.9% identity (99.9% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIESLASLCTTQSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_055 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPTESLASLCTTQSE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
              850       860       870       880       890       900

              910    
pF1KB8 VCTSSPKMGVLKED
       ::::::::::::::
NP_055 VCTSSPKMGVLKED
              910    

>>XP_011509992 (OMIM: 607334) PREDICTED: trafficking kin  (914 aa)
 initn: 5923 init1: 5923 opt: 5923  Z-score: 3313.9  bits: 624.4 E(85289): 7.6e-178
Smith-Waterman score: 5923; 99.9% identity (99.9% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIESLASLCTTQSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
XP_011 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPTESLASLCTTQSE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
              850       860       870       880       890       900

              910    
pF1KB8 VCTSSPKMGVLKED
       ::::::::::::::
XP_011 VCTSSPKMGVLKED
              910    

>>XP_016860261 (OMIM: 607334) PREDICTED: trafficking kin  (703 aa)
 initn: 4567 init1: 4567 opt: 4567  Z-score: 2561.2  bits: 484.8 E(85289): 6.4e-136
Smith-Waterman score: 4567; 99.9% identity (99.9% similar) in 703 aa overlap (212-914:1-703)

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB8 SEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTY
                                             10        20        30

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB8 EEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEH
               40        50        60        70        80        90

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB8 VIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLY
              100       110       120       130       140       150

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB8 FSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSISF
              160       170       180       190       200       210

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB8 PALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDSD
              220       230       240       250       260       270

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB8 LATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIESLASLCTTQSEI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
XP_016 LATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPTESLASLCTTQSEI
              280       290       300       310       320       330

             550       560       570       580       590       600 
pF1KB8 TDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLPG
              340       350       360       370       380       390

             610       620       630       640       650       660 
pF1KB8 DAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANPG
              400       410       420       430       440       450

             670       680       690       700       710       720 
pF1KB8 KCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLSI
              460       470       480       490       500       510

             730       740       750       760       770       780 
pF1KB8 GESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNSP
              520       530       540       550       560       570

             790       800       810       820       830       840 
pF1KB8 SHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRL
              580       590       600       610       620       630

             850       860       870       880       890       900 
pF1KB8 GIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAPV
              640       650       660       670       680       690

             910    
pF1KB8 CTSSPKMGVLKED
       :::::::::::::
XP_016 CTSSPKMGVLKED
              700   

>>NP_001036111 (OMIM: 608112) trafficking kinesin-bindin  (953 aa)
 initn: 2293 init1: 1319 opt: 1815  Z-score: 1028.1  bits: 201.5 E(85289): 1.6e-50
Smith-Waterman score: 2478; 48.9% identity (71.5% similar) in 940 aa overlap (31-911:31-941)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
NP_001 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
NP_001 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
NP_001 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
NP_001 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
NP_001 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
NP_001 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
NP_001 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
NP_001 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
NP_001 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
NP_001 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: :: 
NP_001 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQ
       600       610       620       630          640              

     640       650       660       670       680        690        
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSD-ITQVTPS-SGFPSLS
            : :::         .::::.: ::::::::::::::::: .:.:::: .. :. .
NP_001 H----PETSAH--------HPGKCMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPA
     650                   660       670       680       690       

       700       710       720       730       740       750       
pF1KB8 CGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHS
       :::. :  ..: : .:    :::..::.:: :.::::.:....:. ::.:::::: :: .
NP_001 CGST-SHLKSTPVATPCTPRRLSLAESFTNTRESTTTMSTSLGLVWLLKERGISAAVY-D
       700        710       720       730       740       750      

       760              770       780       790         800        
pF1KB8 PISENP------LQPL-PKSLAIPSTPPNSPSHSPCPSPLPFEPRVHLS--ENFLASRPA
       : : .       :.   ::  .::::::::: ..:  ::  :: .      .:::::.::
NP_001 PQSWDRAGRGSLLHSYTPKMAVIPSTPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDNFLASKPA
         760       770       780       790       800       810     

      810         820       830       840       850       860      
pF1KB8 ETFLQEMY--GLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKNPGAQENGRCQEAE----
        ..:.:.   ..: :..  ::.  ..::::...:.:.:.:: : :  .     : .    
NP_001 SSILREVREKNVRSSESQTDVSVSNLNLVDKVRRFGVAKVV-NSGRAHVPTLTEEQGPLL
         820       830       840       850        860       870    

            870                   880             890          900 
pF1KB8 IGPQKPDSAVY----LNSG--------SSLLGGL------RRNQSLPVIMGS---FAAPV
        ::  :  :.     .  :        .: .:::      :::.:.:...::   . :::
NP_001 CGPPGPAPALVPRGLVPEGLPLRCPTVTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPV
          880       890       900       910       920       930    

             910             
pF1KB8 CTSSPKMGVLKED         
         .:   :.:            
NP_001 TLTS---GILMGAKLSKQTSLR
             940       950   

>>XP_005265015 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (879 aa)
 initn: 2072 init1: 1098 opt: 1594  Z-score: 905.6  bits: 178.8 E(85289): 1e-43
Smith-Waterman score: 2257; 48.9% identity (70.9% similar) in 875 aa overlap (96-911:22-867)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 NQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRD
                                     .: ..:: :::::::::: ::.:: :..::
XP_005          MQKFIEADYYELDWYYEECSDVLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
                        10        20        30        40        50 

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB8 LELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSIASEES
       :::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . :.:::
XP_005 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
              60        70        80        90       100       110 

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB8 ETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTYEEKE
       : .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.::::::
XP_005 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
             120       130       140       150       160       170 

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB8 QQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEHVIEK
       ::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: :  ..:.
XP_005 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
             180       190       200       210       220       230 

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB8 EELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLYFSQS
       :::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..     .:
XP_005 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
             240       250       260       270       280       290 

         370       380       390       400       410        420    
pF1KB8 YGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSISFPAL
        : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.. :. 
XP_005 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLT-PSP
             300       310         320       330       340         

          430             440       450       460                  
pF1KB8 LPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS---SQ
       . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.   :.
XP_005 MNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSK
      350       360       370       380       390       400        

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 KMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIE
       : : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: .:: :
XP_005 KPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTE
      410       420       430       440       450       460        

     530         540        550       560       570       580      
pF1KB8 SLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILD
       :. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:: :::
XP_005 SIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILD
      470       480       490       500       510       520        

        590       600         610       620       630       640    
pF1KB8 PRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLP
       :::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: ::      
XP_005 PRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQH----
      530       540       550       560               570          

          650       660       670       680        690        700  
pF1KB8 PITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSD-ITQVTPS-SGFPSLSCGSSG
       : :::         .::::.: ::::::::::::::::: .:.:::: .. :. .:::. 
XP_005 PETSAH--------HPGKCMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPACGST-
        580               590       600       610       620        

            710       720       730       740       750       760  
pF1KB8 SSSSNTAVNSPALSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISEN
       :  ..: : .:    :::..::.:: :.::::.:....:. ::.:::::: :: .: : .
XP_005 SHLKSTPVATPCTPRRLSLAESFTNTRESTTTMSTSLGLVWLLKERGISAAVY-DPQSWD
       630       640       650       660       670       680       

                   770       780       790         800       810   
pF1KB8 PL-------QPLPKSLAIPSTPPNSPSHSPCPSPLPFEPRVHLS--ENFLASRPAETFLQ
                .  ::  .::::::::: ..:  ::  :: .      .:::::.:: ..:.
XP_005 RAGRGSLLHSYTPKMAVIPSTPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDNFLASKPASSILR
        690       700       710       720       730       740      

             820       830       840       850       860           
pF1KB8 EMY--GLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKNPGAQENGRCQEAE----IGPQK
       :.   ..: :..  ::.  ..::::...:.:.:.:: : :  .     : .     ::  
XP_005 EVREKNVRSSESQTDVSVSNLNLVDKVRRFGVAKVV-NSGRAHVPTLTEEQGPLLCGPPG
        750       760       770       780        790       800     

       870                   880             890          900      
pF1KB8 PDSAVY----LNSG--------SSLLGGL------RRNQSLPVIMGS---FAAPVCTSSP
       :  :.     .  :        .: .:::      :::.:.:...::   . :::  .: 
XP_005 PAPALVPRGLVPEGLPLRCPTVTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPVTLTS-
         810       820       830       840       850       860     

        910             
pF1KB8 KMGVLKED         
         :.:            
XP_005 --GILMGAKLSKQTSLR
            870         

>>XP_005265017 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (712 aa)
 initn: 2017 init1: 1319 opt: 1521  Z-score: 866.4  bits: 171.2 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 2073; 53.0% identity (75.4% similar) in 683 aa overlap (31-691:31-690)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
XP_005 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
XP_005 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
XP_005 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
XP_005 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
XP_005 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
XP_005 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
XP_005 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
XP_005 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
XP_005 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
XP_005 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: :: 
XP_005 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQ
       600       610       620       630          640              

     640       650       660       670       680        690        
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSD-ITQVTPSSGFPSLSC
            : :::         .::::.: ::::::::::::::::: .:.::: :       
XP_005 H----PETSAH--------HPGKCMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPRSCEEDDEA
     650                   660       670       680       690       

      700       710       720       730       740       750        
pF1KB8 GSSGSSSSNTAVNSPALSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSP
                                                                   
XP_005 AICPVELRGDIGQRV                                             
       700       710                                               

>>XP_006713094 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (643 aa)
 initn: 1872 init1: 1319 opt: 1406  Z-score: 803.0  bits: 159.3 E(85289): 5.4e-38
Smith-Waterman score: 1924; 53.5% identity (77.1% similar) in 611 aa overlap (31-620:31-638)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
XP_006 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
XP_006 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
XP_006 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
XP_006 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
XP_006 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
XP_006 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
XP_006 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
XP_006 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
XP_006 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
XP_006 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::. :   :                   
XP_006 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTELALFLHPGL              
       600       610       620       630       640                 

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCG

>>XP_005265020 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (645 aa)
 initn: 1872 init1: 1319 opt: 1406  Z-score: 803.0  bits: 159.3 E(85289): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 1919; 53.4% identity (76.9% similar) in 616 aa overlap (31-625:31-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
XP_005 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
XP_005 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
XP_005 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
XP_005 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
XP_005 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
XP_005 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
XP_005 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
XP_005 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
XP_005 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
XP_005 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.  :   : :.:              
XP_005 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDT-GREVQ-QHPGSQW          
       600       610       620       630         640               

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCG

>>XP_006713093 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (645 aa)
 initn: 1872 init1: 1319 opt: 1406  Z-score: 803.0  bits: 159.3 E(85289): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 1919; 53.4% identity (76.9% similar) in 616 aa overlap (31-625:31-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
XP_006 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
XP_006 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
XP_006 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
XP_006 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
XP_006 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
XP_006 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
XP_006 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
XP_006 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
XP_006 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
XP_006 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.  :   : :.:              
XP_006 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDT-GREVQ-QHPGSQW          
       600       610       620       630         640               

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCG

>>XP_011531791 (OMIM: 608112) PREDICTED: trafficking kin  (664 aa)
 initn: 1872 init1: 1319 opt: 1406  Z-score: 802.8  bits: 159.3 E(85289): 5.6e-38
Smith-Waterman score: 1922; 52.6% identity (76.3% similar) in 629 aa overlap (31-638:31-648)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
XP_011 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
XP_011 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
XP_011 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
XP_011 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
XP_011 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
XP_011 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
XP_011 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
XP_011 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
XP_011 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
XP_011 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: :: 
XP_011 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQ
       600       610       620       630          640              

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCG
                                                                   
XP_011 HPETSELALFLHPGL                                             
     650       660                                                 




914 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 20:57:41 2016 done: Sun Nov  6 20:57:43 2016
 Total Scan time: 15.380 Total Display time:  0.250

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com