Result of FASTA (ccds) for pFN21AB8477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8477, 914 aa
  1>>>pF1KB8477 914 - 914 aa - 914 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5681+/-0.00107; mu= -3.2659+/- 0.064
 mean_var=251.5285+/-51.576, 0's: 0 Z-trim(111.4): 37  B-trim: 105 in 1/52
 Lambda= 0.080869
 statistics sampled from 12336 (12361) to 12336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.38), width:  16
 Scan time:  4.830

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2347.1 TRAK2 gene_id:66008|Hs108|chr2          ( 914) 5923 704.9 1.7e-202
CCDS43072.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3         ( 953) 1815 225.6 3.4e-58
CCDS58826.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3         ( 556) 1185 152.0 2.8e-36
CCDS74922.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3         ( 670) 1185 152.1 3.3e-36
CCDS2695.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3          ( 686) 1185 152.1 3.4e-36


>>CCDS2347.1 TRAK2 gene_id:66008|Hs108|chr2               (914 aa)
 initn: 5923 init1: 5923 opt: 5923  Z-score: 3748.8  bits: 704.9 E(32554): 1.7e-202
Smith-Waterman score: 5923; 99.9% identity (99.9% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDTRGRSIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 FPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSSEEVAGSSQKMGQPGPSGDS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIESLASLCTTQSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS23 DLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPTESLASLCTTQSE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPITSAGGPVTVATANP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLS
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB8 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 IGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHSPISENPLQPLPKSLAIPSTPPNS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PSHSPCPSPLPFEPRVHLSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LGIARVVKNPGAQENGRCQEAEIGPQKPDSAVYLNSGSSLLGGLRRNQSLPVIMGSFAAP
              850       860       870       880       890       900

              910    
pF1KB8 VCTSSPKMGVLKED
       ::::::::::::::
CCDS23 VCTSSPKMGVLKED
              910    

>>CCDS43072.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3              (953 aa)
 initn: 2293 init1: 1319 opt: 1815  Z-score: 1158.3  bits: 225.6 E(32554): 3.4e-58
Smith-Waterman score: 2478; 48.9% identity (71.5% similar) in 940 aa overlap (31-911:31-941)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
                                     :::.. ::::::..::::::::.:.:..::
CCDS43 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
       .. :...:: ..:     :.  :.    :::..:..: ..:: :::::::::: ::.:: 
CCDS43 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
       :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . 
CCDS43 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVT
       :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.:
CCDS43 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
       :::::::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: : 
CCDS43 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 HVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHL
        ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..  
CCDS43 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KB8 YFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSI
          .: : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.
CCDS43 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSL
              370       380       390         400       410        

     420       430             440       450       460             
pF1KB8 SFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS
       . :. . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.
CCDS43 T-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGN
       420       430       440       450       460       470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB8 ---SQKMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGC
          :.: : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: 
CCDS43 DERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGS
       480       490       500       510       520       530       

          530         540        550       560       570       580 
pF1KB8 VTPIESLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNL
       .:: ::. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:
CCDS43 LTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHL
       540       550       560       570       580       590       

             590       600         610       620       630         
pF1KB8 GTILDPRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVT
       : ::::::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: :: 
CCDS43 GGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQ
       600       610       620       630          640              

     640       650       660       670       680        690        
pF1KB8 GIFLPPITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSD-ITQVTPS-SGFPSLS
            : :::         .::::.: ::::::::::::::::: .:.:::: .. :. .
CCDS43 H----PETSAH--------HPGKCMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPA
     650                   660       670       680       690       

       700       710       720       730       740       750       
pF1KB8 CGSSGSSSSNTAVNSPALSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTMSLAKLLQERGISAKVYHS
       :::. :  ..: : .:    :::..::.:: :.::::.:....:. ::.:::::: :: .
CCDS43 CGST-SHLKSTPVATPCTPRRLSLAESFTNTRESTTTMSTSLGLVWLLKERGISAAVY-D
       700        710       720       730       740       750      

       760              770       780       790         800        
pF1KB8 PISENP------LQPL-PKSLAIPSTPPNSPSHSPCPSPLPFEPRVHLS--ENFLASRPA
       : : .       :.   ::  .::::::::: ..:  ::  :: .      .:::::.::
CCDS43 PQSWDRAGRGSLLHSYTPKMAVIPSTPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDNFLASKPA
         760       770       780       790       800       810     

      810         820       830       840       850       860      
pF1KB8 ETFLQEMY--GLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKNPGAQENGRCQEAE----
        ..:.:.   ..: :..  ::.  ..::::...:.:.:.:: : :  .     : .    
CCDS43 SSILREVREKNVRSSESQTDVSVSNLNLVDKVRRFGVAKVV-NSGRAHVPTLTEEQGPLL
         820       830       840       850        860       870    

            870                   880             890          900 
pF1KB8 IGPQKPDSAVY----LNSG--------SSLLGGL------RRNQSLPVIMGS---FAAPV
        ::  :  :.     .  :        .: .:::      :::.:.:...::   . :::
CCDS43 CGPPGPAPALVPRGLVPEGLPLRCPTVTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPV
          880       890       900       910       920       930    

             910             
pF1KB8 CTSSPKMGVLKED         
         .:   :.:            
CCDS43 TLTS---GILMGAKLSKQTSLR
             940       950   

>>CCDS58826.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3              (556 aa)
 initn: 1483 init1: 1098 opt: 1185  Z-score: 764.7  bits: 152.0 E(32554): 2.8e-36
Smith-Waterman score: 1480; 53.3% identity (77.2% similar) in 492 aa overlap (96-568:22-510)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 NQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRD
                                     .: ..:: :::::::::: ::.:: :..::
CCDS58          MQKFIEADYYELDWYYEECSDVLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
                        10        20        30        40        50 

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pF1KB8 LELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSIASEES
       :::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . :.:::
CCDS58 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
              60        70        80        90       100       110 

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB8 ETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTYEEKE
       : .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.::::::
CCDS58 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KB8 QQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEHVIEK
       ::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: :  ..:.
CCDS58 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
             180       190       200       210       220       230 

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB8 EELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLYFSQS
       :::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..     .:
CCDS58 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
             240       250       260       270       280       290 

         370       380       390       400       410        420    
pF1KB8 YGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSISFPAL
        : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.. :. 
CCDS58 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLT-PSP
             300       310         320       330       340         

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pF1KB8 LPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS---SQ
       . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.   :.
CCDS58 MNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSK
      350       360       370       380       390       400        

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pF1KB8 KMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIE
       : : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: .:: :
CCDS58 KPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTE
      410       420       430       440       450       460        

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pF1KB8 SLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILD
       :. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::..                  
CCDS58 SIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGDHAGPRPLSVLLGDSLWSLI
      470       480       490       500       510       520        

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pF1KB8 PRPGVITKGFTQLPGDAIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLPPI
                                                                   
CCDS58 HLRKAGHLCHAYSFFFRDSHPRCWFEFL                                
      530       540       550                                      

>>CCDS74922.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3              (670 aa)
 initn: 1668 init1: 1098 opt: 1185  Z-score: 763.4  bits: 152.1 E(32554): 3.3e-36
Smith-Waterman score: 1701; 53.2% identity (76.1% similar) in 564 aa overlap (96-638:22-574)

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pF1KB8 NQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRD
                                     .: ..:: :::::::::: ::.:: :..::
CCDS74          MQKFIEADYYELDWYYEECSDVLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
                        10        20        30        40        50 

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pF1KB8 LELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSIASEES
       :::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. .  ..:.::.:::  :::::.. . :.:::
CCDS74 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
              60        70        80        90       100       110 

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pF1KB8 ETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLEMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTYEEKE
       : .: :::::. ::: :  :. ..:. ::.:::.:::::..:::.: ..::::.::::::
CCDS74 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
             120       130       140       150       160       170 

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB8 QQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEHVIEK
       ::::.:::::::..:.:.. ..:::. :...  : :::.. :::::::::.: :  ..:.
CCDS74 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
             180       190       200       210       220       230 

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB8 EELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQDRNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLYFSQS
       :::  :: :.:::::::: ::.::.:.  ::. ::::.:::.:.::... :..     .:
CCDS74 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
             240       250       260       270       280       290 

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pF1KB8 YGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSISFPAL
        : :  .::::::::::::.:.:.:  :   . ..:::::.:::  :.. . ::.. :. 
CCDS74 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLT-PSP
             300       310         320       330       340         

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pF1KB8 LPIPGSNRSSVIMT------AKPFESGLQQTEDKSLLNQGSSS----EEVA--GS---SQ
       . :::::.::.. .      . :  :   .   . .:.. ..:     :.:  :.   :.
CCDS74 MNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSK
      350       360       370       380       390       400        

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 KMGQPGPSGDSDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAEEWQRKIQVLADQKEGVSGCVTPIE
       : : ::  :. :: :::.::::::.:::::..:: :: .::.: ::.. :  :: .:: :
CCDS74 KPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTE
      410       420       430       440       450       460        

     530         540        550       560       570       580      
pF1KB8 SLASLCTTQ--SEITDLSSAS-CLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLYHWQQLAQPNLGTILD
       :. :: : .  ::.: .:. :   :...::::::::::::: ::.::::::::.:: :::
CCDS74 SIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILD
      470       480       490       500       510       520        

        590       600         610       620       630       640    
pF1KB8 PRPGVITKGFTQLPGD--AIYHISDLEEDEEEGITFQVQQPLEVEEKLSTSKPVTGIFLP
       :::::.::::  :  :   .: ..:.:::.      ... :     .:.:: ::      
CCDS74 PRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGD---HISLP-----RLATSTPVQHPETS
      530       540       550       560               570       580

          650       660       670       680       690       700    
pF1KB8 PITSAGGPVTVATANPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSS
                                                                   
CCDS74 GERSQARVTVSGSRSYPSRPQASPEEMQEPPAATEEEEEEEEEEGSGEGTTISPVNLAPF
              590       600       610       620       630       640

>>CCDS2695.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3               (686 aa)
 initn: 1702 init1: 1098 opt: 1185  Z-score: 763.3  bits: 152.1 E(32554): 3.4e-36
Smith-Waterman score: 1734; 52.0% identity (74.6% similar) in 598 aa overlap (62-638:13-590)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB8 VCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDTLFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEET
                                     : :. ::  ..: .::: .. :     :: 
CCDS26                   MSLRDKGGEEECFEYDCQDEERKPTHRQHDTQDL----LEE-
                                 10        20        30            

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB8 FRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLE
           .: ..:: :::::::::: ::.:: :..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::
CCDS26 ----VLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLE
            40        50        60        70        80        90   

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB8 EQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSIASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLE
       ::. .  ..:.::.:::  :::::.. . :.:::: .: :::::. ::: :  :. ..:.
CCDS26 EQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLD
           100       110       120       130       140       150   

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB8 MLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETVTYEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELS
        ::.:::.:::::..:::.: ..::::.::::::::::.:::::::..:.:.. ..:::.
CCDS26 SLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELA
           160       170       180       190       200       210   

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB8 GKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELKLHLQASKDAQRQLTMELHELQD
        :...  : :::.. :::::::::.: :  ..:.:::  :: :.:::::::: ::.::.:
CCDS26 KKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELED
           220       230       240       250       260       270   

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB8 RNMECLGMLHESQEEIKELRSRSGPTAHLYFSQSYGAFTGESLAAEIEGTMRKKLSLDEE
       .  ::. ::::.:::.:.::... :..     .: : :  .::::::::::::.:.:.: 
CCDS26 KYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEA
           280       290       300       310       320       330   

             400       410        420       430             440    
pF1KB8 SSLFKQKAQQKRVFDTVRIANDT-RGRSISFPALLPIPGSNRSSVIMT------AKPFES
        :   . ..:::::.:::  :.. . ::.. :. . :::::.::.. .      . :  :
CCDS26 ES--PDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLT-PSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSS
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