FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1799, 843 aa 1>>>pF1KE1799 843 - 843 aa - 843 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9708+/-0.00104; mu= 19.0563+/- 0.062 mean_var=150.3731+/-28.181, 0's: 0 Z-trim(109.1): 115 B-trim: 6 in 1/53 Lambda= 0.104590 statistics sampled from 10514 (10631) to 10514 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16 Scan time: 3.780 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 ( 843) 5979 915.1 0 CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 ( 934) 1086 176.9 1.5e-43 CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 539) 785 131.1 4.9e-30 CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 591) 785 131.2 5.2e-30 CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 529) 719 121.2 4.8e-27 CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 ( 584) 633 108.3 4.1e-23 CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5 ( 559) 423 76.5 1.4e-13 >>CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 (843 aa) initn: 5979 init1: 5979 opt: 5979 Z-score: 4886.2 bits: 915.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5979; 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CCDS39 PSQFGGQPCTAPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCG-DN 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ADEDRCEDSERRPSCDID-KPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGD .:: : .. . : .: :...: :::.. :.:. :..:.... :: :. : :. 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CCDS39 KKRVLFAKKTKVEHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAW-EKGSSG 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 GNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHC ... .: : ::: . : :: .:.:. .::...::: .:. :. ::.:: .::::.: CCDS39 LEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQC 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 RPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPC-VQGK :: :.: :. ::.::: :. :.: ::. ....::: :.:::::: : . : CCDS39 APCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQS-PDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYK 530 540 550 560 570 580 520 530 540 550 560 pF1KE1 KTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQC--------------EDEELEHLRLLEPHCFP ..:.:::::: :. ::. : :: . .: .:::.... : : CCDS39 RSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPE----- 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 LSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGYSLIGNPVARCGEDLRWLVG . ::.: ..::...: .. ::..: .: :. .: :: : : : CCDS39 --IEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQG 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 pF1KE1 EMHCQKIACVLPVLMDGIQSHPQKPFYTVGEKVTVSCSGGMSLEGPSAFLC-GSSLKWSP ...::. :. ::... . : . .: .::.. ..: :. . ::: . : :.: :.: CCDS39 DVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQRLYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNS--WTP 700 710 720 730 740 750 690 700 710 720 730 pF1KE1 EMKNARCVQKENPLTQAVPKCQRWEKLQNSRCVCKMPYE-CGP-SLDVCAQDERSKRILP ..:. .:.. ::. .:: .: ..:.:.: : : :. : :.:. : :. . CCDS39 PISNSLTCEKDT-LTKLKGHCQLGQKQSGSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYFT 760 770 780 790 800 810 740 750 760 770 780 pF1KE1 LTVCK-----------MHVLH---CQGRNYTLTGRDSCTLPASAEK--ACG--ACPLWGK .:: .: :: :: : . : ... : .:: .: : : CCDS39 SPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDGRQLEWGLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDWEK 820 830 840 850 860 870 790 800 810 820 830 pF1KE1 CDAESSKCVCREASECEEEGFSI-CVEVNGK--EQTMSECEAGALRCRGQSISVTSIRPC :.: .::::: .: . : .. ::..... :.:.. ::.:..:: .... . : CCDS39 CSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKMGSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPGKC 880 890 900 910 920 930 840 pF1KE1 AAETQ : CCDS39 LA >>CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (539 aa) initn: 699 init1: 230 opt: 785 Z-score: 652.7 bits: 131.1 E(32554): 4.9e-30 Smith-Waterman score: 928; 30.3% identity (61.9% similar) in 544 aa overlap (25-545:10-538) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGG :..:. . .. :. :. : : . : . .:. : CCDS60 MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQPSQFHG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE1 QPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRC .:: . :...: .: : .. : : : : .:.:... :.::::.:: :..:: : CCDS60 EPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQSDEANC 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 EDSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRL . .. . ..:. .: ..: : .:..:.. :.. . ..: : . . . .: CCDS60 RRIYKKCQHEMDQYW-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR--FRK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE1 SGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR----------SS :: ::: :.. . .: . :.: .: ... ::. .:. :: :. :. CCDS60 PYNVESYTPQTQGKYEFILKEYES-YSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQ 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 SSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYD :. .. : .:... . :: .: ... .:::.. . .:. :.: : .....:: :. CCDS60 SDRGKHYIRRTKRFSHTKSV-FLHARSDLEVAHY-KLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYS 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 YSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHF--VV :. :: :. ..::::. . ::: :. . ...: ....:.. . . : .. ... .. CCDS60 YGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAI 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KE1 K--FSSHG-----CKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGN . . : : :. . : .: . .. : ..:::.. :. :.: :: :... CCDS60 EEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL--PTAD 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 KRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCA--SVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHC .. :...: : .:: :. :::::: . : :. . .: ::::. : . ::: CCDS60 --LMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHC 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 RPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKK :::..:. ...:..: : : . : ::: . . .:: :.:::.:: : .: CCDS60 APCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACE---VSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRK 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 TRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPAL ::.:.::::::..:: : : ..:. .: CCDS60 TRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS 520 530 >>CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (591 aa) initn: 699 init1: 230 opt: 785 Z-score: 652.3 bits: 131.2 E(32554): 5.2e-30 Smith-Waterman score: 928; 30.3% identity (61.9% similar) in 544 aa overlap (25-545:62-590) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAV :..:. . .. :. :. : : . : . CCDS30 GERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQ 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 YGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDS .:. :.:: . :...: .: : .. : : : : .:.:... :.::::.:: :. CCDS30 PSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQ 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ADEDRCEDSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDG .:: :. .. . ..:. .: ..: : .:..:.. :.. . ..: : . . CCDS30 SDEANCRRIYKKCQHEMDQYW-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 pF1KE1 KDFYRLSGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR------ . .: :: ::: :.. . .: . :.: .: ... ::. .:. :: :. CCDS30 R--FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYES-YSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFE 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 ----SSSSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSH :.:. .. : .:... . :: .: ... .:::.. . .:. :.: : ..... CCDS30 LGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSV-FLHARSDLEVAHY-KLKPRSLMLHYEFLQRVKR 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 LPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGW :: :.:. :: :. ..::::. . ::: :. . ...: ....:.. . . : .. . CCDS30 LPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDF 330 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 pF1KE1 HF--VVK--FSSHG-----CKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLEL .. ... . : : :. . : .: . .. : ..:::.. :. :.: :: CCDS30 KIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 DNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCA--SVKKLYLKWALEEYLDE :... .. :...: : .:: :. :::::: . : :. . .: ::::. : CCDS30 --PTAD--LMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKE 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 FDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSP . ::: :::..:. ...:..: : : . : ::: . . .:: :.:::.:: CCDS30 VSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACE---VSYRKNTPIDGKWNCWSNWSS 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 CVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFC : .:::.:.::::::..:: : : ..:. .: CCDS30 CSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE1 PSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGYSLIGNPVARCGEDLRWLVGEMHCQKIAC >>CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (529 aa) initn: 738 init1: 230 opt: 719 Z-score: 599.0 bits: 121.2 E(32554): 4.8e-27 Smith-Waterman score: 862; 30.5% identity (61.8% similar) in 524 aa overlap (45-545:20-528) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 EFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGGQPCVGNAFETQSCE .: : . .:. :.:: . :...: CCDS60 MDTCMTLAFTLSGRFFMLLSQYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCV 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 PTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRCEDSERRPSCDIDKP .: : .. : : : : .:.:... :.::::.:: :..:: :. .. . ..:. CCDS60 TNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQSDEANCRRIYKKCQHEMDQY 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 PPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRLSGNVLSYTFQVKIN .: ..: : .:..:.. :.. . ..: : . . . .: :: ::: :.. . CCDS60 W-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR--FRKPYNVESYTPQTQGK 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 pF1KE1 NDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR----------SSSSSSRSYTSHTNEI .: . :.: .: ... ::. .:. :: :. :.:. .. : .:... 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CCDS39 GDNDCG-DFSDEDDCE-SEPRPPCR-DRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFY 130 140 150 160 170 170 180 190 200 pF1KE1 GGQCRKVFSGDGKDFYRLSGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYN------------STWSY-- .: : . .:. .:: :: : ...: ...: : :. .: .. CCDS39 NGLCNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNA 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 pF1KE1 ---VKHTSTE---------HTSSS---RKRSFFRSSSSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLV .: : :: .:.:: . .. :: : :....: . : : ..: CCDS39 AISLKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSK-KEKMFLH 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 VENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGE :.. .....:. : . . :. : ... ::. :. . : ... ::::: .:::::: CCDS39 VKGEIHLGRFVMRNRDVV-LTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 pF1KE1 YRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHFVVK--FS--SHGCK-ELENALKAASGTQ :.... .:. ..:.. . . :.: :.:. :. :: : : . . .. .: . : CCDS39 YELIYVLDKASMKRKGVELKDIKRCL--GYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRGEGRA 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 NNVLRGE------PFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKL :. . .:::: . : : . . . . :: :... : .:.::: CCDS39 VNITSENLIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKL 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 TPLYELVK-EVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPY .:.:.:: .. : .:: :. :.:.:..::. .:. ::::: . . .::: : :. 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