Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1799
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1799, 843 aa
  1>>>pF1KE1799 843 - 843 aa - 843 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9708+/-0.00104; mu= 19.0563+/- 0.062
 mean_var=150.3731+/-28.181, 0's: 0 Z-trim(109.1): 115  B-trim: 6 in 1/53
 Lambda= 0.104590
 statistics sampled from 10514 (10631) to 10514 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  3.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5              ( 843) 5979 915.1       0
CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5               ( 934) 1086 176.9 1.5e-43
CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1             ( 539)  785 131.1 4.9e-30
CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1             ( 591)  785 131.2 5.2e-30
CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1             ( 529)  719 121.2 4.8e-27
CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1               ( 584)  633 108.3 4.1e-23
CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5               ( 559)  423 76.5 1.4e-13


>>CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5                   (843 aa)
 initn: 5979 init1: 5979 opt: 5979  Z-score: 4886.2  bits: 915.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5979; 99.9% identity (100.0% similar) in 843 aa overlap (1-843:1-843)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCFSGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCFSGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRCE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 DSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 GNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSFFRSSSSSSRSYTSHTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSFFRSSSSSSRSYTSHTN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 EIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 THYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHFVVKFSSHGCKELENAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 THYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHFVVKFSSHGCKELENAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 KAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQK
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLSYLELDNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 LTPLYELVKEVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTPLYELVKEVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 TFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 ESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 EGYSLIGNPVARCGEDLRWLVGEMHCQKIACVLPVLMDGIQSHPQKPFYTVGEKVTVSCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGYSLIGNPVARCGEDLRWLVGEMHCQKIACVLPVLMDGIQSHPQKPFYTVGEKVTVSCS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 GGMSLEGPSAFLCGSSLKWSPEMKNARCVQKENPLTQAVPKCQRWEKLQNSRCVCKMPYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGMSLEGPSAFLCGSSLKWSPEMKNARCVQKENPLTQAVPKCQRWEKLQNSRCVCKMPYE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 CGPSLDVCAQDERSKRILPLTVCKMHVLHCQGRNYTLTGRDSCTLPASAEKACGACPLWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGPSLDVCAQDERSKRILPLTVCKMHVLHCQGRNYTLTGRDSCTLPASAEKACGACPLWG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 KCDAESSKCVCREASECEEEGFSICVEVNGKEQTMSECEAGALRCRGQSISVTSIRPCAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KCDAESSKCVCREASECEEEGFSICVEVNGKEQTMSECEAGALRCRGQSISVTSIRPCAA
              790       800       810       820       830       840

          
pF1KE1 ETQ
       :::
CCDS47 ETQ
          

>>CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5                    (934 aa)
 initn: 1082 init1: 392 opt: 1086  Z-score: 895.5  bits: 176.9 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1687; 32.5% identity (60.9% similar) in 872 aa overlap (25-840:79-934)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE1       MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAV
                                     :.::    ..:::.:. : . :.. :::  
CCDS39 QIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLR
       50        60        70        80        90       100        

           60        70        80         90       100       110   
pF1KE1 YGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEG-CGERFRCFSGQCISKSLVCNGDSDCDEDS
        .:.:::::..     : : :.. :  ::. : ..::: ::.::...: :::..::  :.
CCDS39 PSQFGGQPCTAPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCG-DN
      110       120       130       140       150       160        

           120       130        140       150       160       170  
pF1KE1 ADEDRCEDSERRPSCDID-KPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGD
       .::  :  .. .  :    .: :...: :::.. :.:. :..:....  :: :. : :. 
CCDS39 SDERDC--GRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKTVKSSR
       170         180       190       200       210       220     

            180       190        200       210       220           
pF1KE1 GKDFYRLSGNVLSYTFQVKI-NNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSFFRSS--S
        .. ::. .:. .  :.:.  ..:.. .::..  :  .. . . . ::.  : :      
CCDS39 TSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFY
         230       240       250       260       270       280     

     230       240              250       260       270       280  
pF1KE1 SSSRSYTSHTNEIHKG-------KSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSH
       ::.:: . . :   :        :. ... ......: .: ..  . :.:.. : : :.:
CCDS39 SSKRSENINHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKD-LHLSDVFLKALNH
         290       300       310       320       330        340    

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE1 LPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGW
       ::  :. . : :..:..::::. :::::: : .:.  .::.::.. ..  : :.:     
CCDS39 LPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIET
          350       360       370       380       390       400    

            350            360       370       380       390       
pF1KE1 HFVVKFSS-----HGCKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPA
       .  : :..     : :   . . :  ..  ... ..  .:::: . . ..:.. :  . .
CCDS39 KKRVLFAKKTKVEHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAW-EKGSSG
          410       420       430       440       450        460   

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE1 GNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHC
        ... .: : ::: . : ::  .:.:. .::...::: .:.  :. ::.::  .::::.:
CCDS39 LEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQC
           470       480       490       500       510       520   

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE1 RPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPC-VQGK
        :: :.:  :. ::.::: :.  :.:  ::.      ....::: :.:::::: : .  :
CCDS39 APCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQS-PDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYK
           530       540       550        560       570       580  

        520       530       540                     550       560  
pF1KE1 KTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQC--------------EDEELEHLRLLEPHCFP
       ..:.:::::: :. ::. : ::  .  .:              .:::.... : :     
CCDS39 RSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPE-----
            590       600       610       620       630            

            570       580       590       600       610       620  
pF1KE1 LSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGYSLIGNPVARCGEDLRWLVG
         .     ::.:   ..::...:  .. ::..:  .:  :.  .:    ::  :  :  :
CCDS39 --IEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQG
         640       650       660       670       680       690     

            630       640       650       660       670        680 
pF1KE1 EMHCQKIACVLPVLMDGIQSHPQKPFYTVGEKVTVSCSGGMSLEGPSAFLC-GSSLKWSP
       ...::.  :. ::... .   : . .: .::.. ..:  :. . ::: . : :.:  :.:
CCDS39 DVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQRLYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNS--WTP
         700       710       720       730       740       750     

             690       700       710       720         730         
pF1KE1 EMKNARCVQKENPLTQAVPKCQRWEKLQNSRCVCKMPYE-CGP-SLDVCAQDERSKRILP
        ..:.   .:.. ::.   .::  .: ..:.:.:  : : :.  : :.:. :  :.  . 
CCDS39 PISNSLTCEKDT-LTKLKGHCQLGQKQSGSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYFT
           760        770       780       790       800       810  

     740                     750       760       770           780 
pF1KE1 LTVCK-----------MHVLH---CQGRNYTLTGRDSCTLPASAEK--ACG--ACPLWGK
         .::           .: ::   ::       : .   : ... :  .::  .:  : :
CCDS39 SPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDGRQLEWGLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDWEK
            820       830       840       850       860       870  

             790       800        810         820       830        
pF1KE1 CDAESSKCVCREASECEEEGFSI-CVEVNGK--EQTMSECEAGALRCRGQSISVTSIRPC
       :.: .:::::    .: . : .. ::.....  :.:.. ::.:..:: .... .     :
CCDS39 CSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKMGSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPGKC
            880       890       900       910       920       930  

      840   
pF1KE1 AAETQ
        :   
CCDS39 LA   
            

>>CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1                  (539 aa)
 initn: 699 init1: 230 opt: 785  Z-score: 652.7  bits: 131.1 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 928; 30.3% identity (61.9% similar) in 544 aa overlap (25-545:10-538)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGG
                               :..:. . .. :. :. : : . :   .   .:. :
CCDS60                MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQPSQFHG
                              10        20        30        40     

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pF1KE1 QPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRC
       .::  .  :...:  .: : ..  : : : :  .:.:... :.::::.::  :..::  :
CCDS60 EPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQSDEANC
          50        60        70         80        90        100   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 EDSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRL
       .   .. . ..:.   .:   ..: : .:..:.. :.. . ..: :   .  . .  .: 
CCDS60 RRIYKKCQHEMDQYW-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR--FRK
           110        120       130       140       150         160

     180       190       200       210       220                   
pF1KE1 SGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR----------SS
         :: ::: :.. . .:  . :.: .:  ... ::. .:.   :: :.          :.
CCDS60 PYNVESYTPQTQGKYEFILKEYES-YSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQ
              170       180        190       200       210         

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE1 SSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYD
       :. .. :  .:... . ::  .: ... .:::.. . .:. :.:   : .....::  :.
CCDS60 SDRGKHYIRRTKRFSHTKSV-FLHARSDLEVAHY-KLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYS
     220       230        240       250        260       270       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE1 YSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHF--VV
       :. :: :. ..::::.  . ::: :.  . ...: ....:..  . . : .. ...  ..
CCDS60 YGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAI
       280       290       300       310       320       330       

          350            360       370       380       390         
pF1KE1 K--FSSHG-----CKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGN
       .  . : :     :. . : .:  .  .. :     ..:::..  :. :.: ::  :...
CCDS60 EEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL--PTAD
       340       350       360       370       380       390       

     400       410       420       430         440       450       
pF1KE1 KRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCA--SVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHC
          .. :...:   : .:: :. ::::::  .  :  :. .  .: ::::.  : . :::
CCDS60 --LMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHC
           400       410       420       430       440       450   

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE1 RPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKK
        :::..:. ...:..: : :   . : :::   .   .   .:: :.:::.:: :   .:
CCDS60 APCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACE---VSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRK
           460       470       480          490       500       510

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE1 TRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPAL
       ::.:.::::::..::  : : ..:. .:                                
CCDS60 TRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS                               
              520       530                                        

>>CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1                  (591 aa)
 initn: 699 init1: 230 opt: 785  Z-score: 652.3  bits: 131.2 E(32554): 5.2e-30
Smith-Waterman score: 928; 30.3% identity (61.9% similar) in 544 aa overlap (25-545:62-590)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE1       MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAV
                                     :..:. . .. :. :. : : . :   .  
CCDS30 GERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQ
              40        50        60        70        80        90 

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pF1KE1 YGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDS
        .:. :.::  .  :...:  .: : ..  : : : :  .:.:... :.::::.::  :.
CCDS30 PSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQ
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pF1KE1 ADEDRCEDSERRPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDG
       .::  :.   .. . ..:.   .:   ..: : .:..:.. :.. . ..: :   .  . 
CCDS30 SDEANCRRIYKKCQHEMDQYW-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT
     150       160       170        180       190       200        

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pF1KE1 KDFYRLSGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR------
       .  .:   :: ::: :.. . .:  . :.: .:  ... ::. .:.   :: :.      
CCDS30 R--FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYES-YSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFE
        210       220       230        240       250       260     

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pF1KE1 ----SSSSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSH
           :.:. .. :  .:... . ::  .: ... .:::.. . .:. :.:   : .....
CCDS30 LGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSV-FLHARSDLEVAHY-KLKPRSLMLHYEFLQRVKR
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            290       300       310       320       330       340  
pF1KE1 LPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGW
       ::  :.:. :: :. ..::::.  . ::: :.  . ...: ....:..  . . : .. .
CCDS30 LPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDF
           330       340       350       360       370       380   

                350            360       370       380       390   
pF1KE1 HF--VVK--FSSHG-----CKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLEL
       ..  ...  . : :     :. . : .:  .  .. :     ..:::..  :. :.: ::
CCDS30 KIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL
           390       400       410       420       430       440   

           400       410       420       430         440       450 
pF1KE1 DNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCA--SVKKLYLKWALEEYLDE
         :...   .. :...:   : .:: :. ::::::  .  :  :. .  .: ::::.  :
CCDS30 --PTAD--LMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKE
               450       460       470       480       490         

             460       470       480       490       500       510 
pF1KE1 FDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSP
        . ::: :::..:. ...:..: : :   . : :::   .   .   .:: :.:::.:: 
CCDS30 VSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACE---VSYRKNTPIDGKWNCWSNWSS
     500       510       520       530          540       550      

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE1 CVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFC
       :   .:::.:.::::::..::  : : ..:. .:                          
CCDS30 CSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS                         
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             580       590       600       610       620       630 
pF1KE1 PSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGYSLIGNPVARCGEDLRWLVGEMHCQKIAC

>>CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1                  (529 aa)
 initn: 738 init1: 230 opt: 719  Z-score: 599.0  bits: 121.2 E(32554): 4.8e-27
Smith-Waterman score: 862; 30.5% identity (61.8% similar) in 524 aa overlap (45-545:20-528)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE1 EFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAVYGQYGGQPCVGNAFETQSCE
                                     .: :   .   .:. :.::  .  :...: 
CCDS60            MDTCMTLAFTLSGRFFMLLSQYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCV
                          10        20        30        40         

           80        90        100       110       120       130   
pF1KE1 PTRGCPTEEGCGERFRCF-SGQCISKSLVCNGDSDCDEDSADEDRCEDSERRPSCDIDKP
        .: : ..  : : : :  .:.:... :.::::.::  :..::  :.   .. . ..:. 
CCDS60 TNRPCGSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCG-DQSDEANCRRIYKKCQHEMDQY
      50        60         70        80         90       100       

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pF1KE1 PPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGDGKDFYRLSGNVLSYTFQVKIN
         .:   ..: : .:..:.. :.. . ..: :   .  . .  .:   :: ::: :.. .
CCDS60 W-GIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR--FRKPYNVESYTPQTQGK
        110       120       130       140         150       160    

           200       210       220                  230       240  
pF1KE1 NDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRSF-FR----------SSSSSSRSYTSHTNEI
        .:  . :.: .:  ... ::. .:.   :: :.          :.:. .. :  .:...
CCDS60 YEFILKEYES-YSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRF
          170        180       190       200       210       220   

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pF1KE1 HKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYGTH
        . ::  .: ... .:::.. . .:. :.:   : .....::  :.:. :: :. ..:::
CCDS60 SHTKSV-FLHARSDLEVAHY-KLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTH
            230       240        250       260       270       280 

            310       320       330       340           350        
pF1KE1 YLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHF--VVK--FSSHG-----C
       :.  . ::: :.  . ...: ....:..  . . : .. ...  ...  . : :     :
CCDS60 YITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKC
             290       300       310       320       330       340 

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE1 KELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGNKRRYSAWAESVTNL
       . . : .:  .  .. :     ..:::..  :. :.: ::  :...   .. :...:   
CCDS60 RGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL--PTAD--LMQEWGDAVQYN
             350       360       370       380           390       

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pF1KE1 PQVIKQKLTPLYELVKEVPCA--SVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGT
       : .:: :. ::::::  .  :  :. .  .: ::::.  : . ::: :::..:. ...:.
CCDS60 PAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGS
       400       410       420       430       440       450       

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pF1KE1 HCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKKTRSRECNNPPPSGG
       .: : :   . : ::: .     .   .:: :.:::.:: :   .:::.:.::::::..:
CCDS60 RCDCICPVGSQGLACEVSY---RKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNG
       460       470          480       490       500       510    

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE1 GRSCVGETTESTQCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPV
       :  : : ..:. .:                                              
CCDS60 GSPCSGPASETLDCS                                             
          520                                                      

>>CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1                    (584 aa)
 initn: 954 init1: 244 opt: 633  Z-score: 528.4  bits: 108.3 E(32554): 4.1e-23
Smith-Waterman score: 1006; 31.7% identity (59.4% similar) in 577 aa overlap (17-545:26-584)

                        10        20          30        40         
pF1KE1          MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSP--VNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRR
                                :    :..:  :.:: . .. :..:  :   . :.
CCDS60 MFAVVFFILSLMTCQPGVTAQEKVNQRVRRAATPAAVTCQLSNWSEWTDCFPCQDKKYRH
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90        100        
pF1KE1 RSVAVYGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEGCGERFRC-FSGQCISKSLVCNGDSD
       ::.   ...::  : :. ..  ::  .  :  .  ::. :.:  .:.:... ::::::.:
CCDS60 RSLLQPNKFGGTICSGDIWDQASCSSSTTCVRQAQCGQDFQCKETGRCLKRHLVCNGDQD
               70        80        90       100       110       120

      110       120        130       140       150       160       
pF1KE1 CDEDSADEDRCEDSER-RPSCDIDKPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRK
       :  :..::: ::: .    .:.  .: :. . .. ::: :: .  . : ... .::::. 
CCDS60 C-LDGSDEDDCEDVRAIDEDCSQYEPIPGSQKAALGYNILTQEDAQSVYDASYYGGQCET
               130       140       150       160       170         

       170                        180       190       200          
pF1KE1 VFSGD---------------GKD--FYRLSGNVLSYTFQVKINNDFNYEFY---NSTWSY
       :..:.               : :  ..:   : :.: :..  .. .. :::   :.  : 
CCDS60 VYNGEWRELRYDSTCERLYYGDDEKYFRKPYNFLKYHFEALADTGISSEFYDNANDLLSK
     180       190       200       210       220       230         

       210            220       230       240         250       260
pF1KE1 VKHTSTEHTSSS-----RKRSFFRSSSSSSRSYTSHTNEIHKG--KSYQLLVVENTVEVA
       ::. ...  . .         .. . . :  . ::  ::..:   :.. .  . . :..:
CCDS60 VKKDKSDSFGVTIGIGPAGSPLLVGVGVSHSQDTSFLNELNKYNEKKFIFTRIFTKVQTA
     240       250       260       270       280       290         

              270       280       290       300       310       320
pF1KE1 QFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVD
       .:   . ... : : . . : .::. :.:. : ..:..:::::. :::.:: :. .. .:
CCDS60 HFKMRKDDIM-LDEGMLQSLMELPDQYNYGMYAKFINDYGTHYITSGSMGGIYEYILVID
     300        310       320       330       340       350        

              330         340       350                  360       
pF1KE1 SEKLKQNDFNSVEEKKC--KSSGWHFVVKFSSHG------CKEL-----ENALKAASGTQ
       . :...  ..: .   :   : : ..  :..  :      ::..     : : :: . ..
CCDS60 KAKMESLGITSRDITTCFGGSLGIQYEDKINVGGGLSGDHCKKFGGGKTERARKAMA-VE
      360       370       380       390       400       410        

       370       380       390       400         410       420     
pF1KE1 NNVLRGEPFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGNKRR--YSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLY
       . . :    .:::..:. .::        : :.    : .:..:.   : ::  .. :..
CCDS60 DIISR----VRGGSSGWSGGL--------AQNRSTITYRSWGRSLKYNPVVIDFEMQPIH
       420           430               440       450       460     

         430         440       450       460       470       480   
pF1KE1 ELVKEVPCASV--KKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFG
       :.....  . .  :.  :. ::..:: ::. :.: :: :.:.  .::: : :.:.  ..:
CCDS60 EVLRHTSLGPLEAKRQNLRRALDQYLMEFNACRCGPCFNNGVPILEGTSCRCQCRLGSLG
         470       480       490       500       510       520     

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pF1KE1 AACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTEST
       :::::    : .:   ::.:::::::: :  : . : :::.:: :..:: :: :. ... 
CCDS60 AACEQTQTEGAKA---DGSWSCWSSWSVCRAGIQERRRECDNPAPQNGGASCPGRKVQTQ
         530          540       550       560       570       580  

           550       560       570       580       590       600   
pF1KE1 QCEDEELEHLRLLEPHCFPLSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGY
        :                                                          
CCDS60 AC                                                          
                                                                   

>>CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5                    (559 aa)
 initn: 706 init1: 192 opt: 423  Z-score: 357.3  bits: 76.5 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 780; 30.6% identity (58.8% similar) in 519 aa overlap (15-487:30-540)

                              10        20        30        40     
pF1KE1                MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKT
                                    :.   :...: ..:. . .. ::.:. : . 
CCDS39 MSACRSFAVAICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQ
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80         90       100    
pF1KE1 QTRRRSVAVYGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCP-TEEGCGERFRCFSGQCISKSLVCN
       . : ::. :.::..:. :.  . . ..: ::. :  .:. ::. :.: .:.::.  : ::
CCDS39 MFRSRSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCSTGRCIKMRLRCN
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140          150       160 
pF1KE1 GDSDCDEDSADEDRCEDSERRPSCDIDKPPPNIELT---GNGYNELTGQFRNRVINTKSF
       ::.::  : .::: :: :: :: :  :.   . ::.   : : : :  .  .  .... .
CCDS39 GDNDCG-DFSDEDDCE-SEPRPPCR-DRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFY
               130        140        150       160       170       

             170       180       190       200                     
pF1KE1 GGQCRKVFSGDGKDFYRLSGNVLSYTFQVKINNDFNYEFYN------------STWSY--
       .: : .  .:.   .::   :: :  ...: ...:  : :.            .: ..  
CCDS39 NGLCNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNA
       180       190       200       210       220       230       

          210                   220       230       240       250  
pF1KE1 ---VKHTSTE---------HTSSS---RKRSFFRSSSSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLV
          .: : ::         .:.::   . .. :: : :....:    .   : :  ..: 
CCDS39 AISLKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSK-KEKMFLH
       240       250       260       270       280        290      

            260       270       280       290       300       310  
pF1KE1 VENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELSHLPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGE
       :.. .....:.  : . . :.  :  ... ::. :. . :  ... ::::: .:::::: 
CCDS39 VKGEIHLGRFVMRNRDVV-LTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGL
        300       310        320       330       340       350     

            320       330       340           350        360       
pF1KE1 YRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSGWHFVVK--FS--SHGCK-ELENALKAASGTQ
       :.... .:. ..:..  .  . :.:   :.:. :.  ::  : : . . .. .: . :  
CCDS39 YELIYVLDKASMKRKGVELKDIKRCL--GYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRGEGRA
         360       370       380         390       400       410   

       370             380       390       400       410       420 
pF1KE1 NNVLRGE------PFIRGGGAGFISGLTYLELDNPAGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKL
        :.   .       .::::   .   :    : . . .   .  :: :... : .:.:::
CCDS39 VNITSENLIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKL
           420       430       440       450       460       470   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 TPLYELVK-EVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCHCRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPY
       .:.:.::  ..  : .::  :. :.:.:..::.  .:. ::::: . .   .::: : :.
CCDS39 SPIYNLVPVKMKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGGTVILMDGKCLCAC-PF
           480       490       500       510       520       530   

               490       500       510       520       530         
pF1KE1 TF-GAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPCVQGKKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGET
        : : :::                                                    
CCDS39 KFEGIACEISKQKISEGLPALEFPNEK                                 
            540       550                                          




843 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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