FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1914, 451 aa 1>>>pF1KE1914 451 - 451 aa - 451 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2584+/-0.000381; mu= 18.3512+/- 0.024 mean_var=69.9218+/-14.092, 0's: 0 Z-trim(112.2): 67 B-trim: 68 in 1/52 Lambda= 0.153380 statistics sampled from 21010 (21077) to 21010 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 8.870 The best scores are: opt bits E(85289) NP_110400 (OMIM: 612901,613112) tubulin beta-1 cha ( 451) 3020 677.6 1.9e-194 XP_016883574 (OMIM: 612901,613112) PREDICTED: tubu ( 429) 2860 642.2 8.1e-184 NP_006077 (OMIM: 600638,602661,614039) tubulin bet ( 450) 2437 548.6 1.3e-155 NP_006079 (OMIM: 602660) tubulin beta-4B chain [Ho ( 445) 2434 547.9 2e-155 NP_821133 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin bet ( 444) 2433 547.7 2.3e-155 NP_821080 (OMIM: 610031,612850) tubulin beta-2B ch ( 445) 2430 547.0 3.7e-155 NP_001276058 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain ( 444) 2424 545.7 9.2e-155 NP_006078 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain iso ( 444) 2424 545.7 9.2e-155 NP_001276056 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain ( 489) 2424 545.7 9.9e-155 NP_001276052 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain ( 495) 2424 545.7 1e-154 NP_001060 (OMIM: 615101,615763) tubulin beta-2A ch ( 445) 2416 543.9 3.1e-154 NP_115914 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain isof ( 446) 2414 543.5 4.3e-154 NP_001290453 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 446) 2414 543.5 4.3e-154 NP_817124 (OMIM: 616768,616780) tubulin beta-8 cha ( 444) 2388 537.7 2.3e-152 NP_001280141 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin ( 464) 2314 521.4 2e-147 NP_001280143 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin ( 400) 2144 483.7 3.8e-136 NP_001184110 (OMIM: 600638,602661,614039) tubulin ( 378) 2055 464.0 3.1e-130 NP_001280145 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin ( 372) 2047 462.2 1e-129 NP_001280144 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin ( 372) 2047 462.2 1e-129 NP_001276059 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain ( 372) 2046 462.0 1.2e-129 NP_001276060 (OMIM: 602662) tubulin beta-4A chain ( 372) 2046 462.0 1.2e-129 NP_001290456 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 374) 2038 460.2 4.1e-129 XP_011517761 (OMIM: 616768,616780) PREDICTED: tubu ( 372) 2019 456.0 7.6e-128 NP_001290457 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 381) 1951 441.0 2.6e-123 NP_001290455 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 409) 1943 439.2 9.4e-123 NP_001297244 (OMIM: 615101,615763) tubulin beta-2A ( 360) 1940 438.5 1.3e-122 XP_016871682 (OMIM: 616768,616780) PREDICTED: tubu ( 332) 1807 409.1 9.1e-114 XP_016871681 (OMIM: 616768,616780) PREDICTED: tubu ( 332) 1807 409.1 9.1e-114 NP_001290459 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 300) 1634 370.8 2.8e-102 NP_001290458 (OMIM: 615103) tubulin beta-6 chain i ( 300) 1634 370.8 2.8e-102 XP_011517762 (OMIM: 616768,616780) PREDICTED: tubu ( 291) 1455 331.2 2.3e-90 NP_006073 (OMIM: 602530) tubulin alpha-1B chain [H ( 451) 1198 274.4 4.3e-73 NP_005991 (OMIM: 191110,616208) tubulin alpha-4A c ( 448) 1191 272.9 1.3e-72 NP_006000 (OMIM: 602529,611603) tubulin alpha-1A c ( 451) 1190 272.6 1.5e-72 NP_001257328 (OMIM: 602529,611603) tubulin alpha-1 ( 451) 1190 272.6 1.5e-72 NP_061816 (OMIM: 605742,613180) tubulin alpha-8 ch ( 449) 1186 271.7 2.7e-72 NP_005992 (OMIM: 602528) tubulin alpha-3C/D chain ( 450) 1179 270.2 7.9e-72 NP_001265481 (OMIM: 191110,616208) tubulin alpha-4 ( 433) 1135 260.5 6.6e-69 NP_001257329 (OMIM: 602529,611603) tubulin alpha-1 ( 416) 1095 251.6 2.9e-66 NP_001180343 (OMIM: 605742,613180) tubulin alpha-8 ( 383) 1029 237.0 6.8e-62 NP_001061 (OMIM: 191135,615412) tubulin gamma-1 ch ( 451) 980 226.2 1.4e-58 NP_057521 (OMIM: 605785) tubulin gamma-2 chain iso ( 451) 973 224.6 4.2e-58 XP_016860313 (OMIM: 191110,616208) PREDICTED: tubu ( 295) 753 175.8 1.3e-43 NP_001280142 (OMIM: 156610,191130,615771) tubulin ( 242) 648 152.5 1.1e-36 NP_001307438 (OMIM: 605785) tubulin gamma-2 chain ( 460) 629 148.5 3.5e-35 XP_016879942 (OMIM: 605785) PREDICTED: tubulin gam ( 298) 525 125.4 2.1e-28 XP_011522916 (OMIM: 605785) PREDICTED: tubulin gam ( 298) 525 125.4 2.1e-28 NP_057346 (OMIM: 607345) tubulin epsilon chain [Ho ( 475) 514 123.1 1.6e-27 XP_016879945 (OMIM: 605785) PREDICTED: tubulin gam ( 274) 488 117.2 5.7e-26 XP_016879946 (OMIM: 605785) PREDICTED: tubulin gam ( 274) 488 117.2 5.7e-26 >>NP_110400 (OMIM: 612901,613112) tubulin beta-1 chain [ (451 aa) initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 3612.1 bits: 677.6 E(85289): 1.9e-194 Smith-Waterman score: 3020; 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