FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1916, 453 aa 1>>>pF1KE1916 453 - 453 aa - 453 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7353+/-0.000841; mu= 15.2837+/- 0.051 mean_var=67.1294+/-13.593, 0's: 0 Z-trim(106.0): 26 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.156537 statistics sampled from 8734 (8755) to 8734 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16 Scan time: 2.840 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 ( 453) 3066 701.4 4.8e-202 CCDS34867.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 447) 2739 627.6 8e-180 CCDS55213.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 457) 2728 625.1 4.6e-179 CCDS64282.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 449) 2646 606.6 1.7e-173 CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 446) 2573 590.1 1.5e-168 CCDS64281.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 501) 2573 590.1 1.7e-168 CCDS4284.2 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 509) 2573 590.1 1.7e-168 CCDS43380.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 432) 2569 589.2 2.8e-168 CCDS3387.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2515 577.0 1.4e-164 CCDS56304.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 430) 2504 574.5 7.3e-164 CCDS56305.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 440) 2504 574.5 7.5e-164 CCDS3388.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2504 574.5 7.6e-164 >>CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 (453 aa) initn: 3066 init1: 3066 opt: 3066 Z-score: 3740.9 bits: 701.4 E(32554): 4.8e-202 Smith-Waterman score: 3066; 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87.0% identity (97.3% similar) in 439 aa overlap (15-453:11-449) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI : ::::::::.:. ..:::::::::::..:.::::::::::::: CCDS64 MIPGIGTLTQDTLWCFSQVKGTIEIGTTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST ::::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: CCDS64 FQREQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLST 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN ::::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.::: CCDS64 NDKTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFAN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF ::::::::::::::.:::.::::::::::..:::..:::::::::::::::::::::::: CCDS64 AHTYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS :::.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::: CCDS64 HPHHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD :::::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::: CCDS64 HSGRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSD 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD :.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::: CCDS64 SVIMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLD 360 370 380 390 400 410 430 440 450 pF1KE1 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN :.:::::::::: .:.:::::::::::::::.: CCDS64 FSKKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN 420 430 440 >>CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (446 aa) initn: 2600 init1: 2573 opt: 2573 Z-score: 3139.3 bits: 590.1 E(32554): 1.5e-168 Smith-Waterman score: 2573; 88.4% identity (98.1% similar) in 421 aa overlap (33-453:26-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 GAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVIFQ :::::::::::..:.::::::::::::::: CCDS42 MKCFSRYLPYIFRPPNTILSSSCHTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 REQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLSTND ::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: CCDS42 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 KTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFANAH ::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.::::: CCDS42 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 TYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP ::::::::::::.:::.::::::::::..:::..:::::::::::::::::::::::::: CCDS42 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 HQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFSHS :.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::::: CCDS42 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 GRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSA :::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::. 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