FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1958, 514 aa 1>>>pF1KE1958 514 - 514 aa - 514 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4767+/-0.000771; mu= 17.5071+/- 0.046 mean_var=70.9713+/-14.389, 0's: 0 Z-trim(108.8): 19 B-trim: 5 in 1/50 Lambda= 0.152241 statistics sampled from 10423 (10430) to 10423 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16 Scan time: 3.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 ( 514) 3439 764.5 0 CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 ( 492) 624 146.2 8.2e-35 CCDS8262.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 496) 410 99.2 1.2e-20 CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 517) 391 95.0 2.2e-19 >>CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 (514 aa) initn: 3439 init1: 3439 opt: 3439 Z-score: 4079.7 bits: 764.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3439; 100.0% identity (100.0% similar) in 514 aa overlap (1-514:1-514) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAVWLAQWLGPLLLVSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MAVWLAQWLGPLLLVSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 WLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 WLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AWGALVISLEHRFYGLSIPAGGLEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AWGALVISLEHRFYGLSIPAGGLEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 CFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 CFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLEC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALVGGVVQYDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 RAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALVGGVVQYDG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 QTGAPLSVRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQKCLSFSRAETVAQLRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QTGAPLSVRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQKCLSFSRAETVAQLRS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 TEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPER 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 PSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV 490 500 510 >>CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 (492 aa) initn: 499 init1: 184 opt: 624 Z-score: 738.5 bits: 146.2 E(32554): 8.2e-35 Smith-Waterman score: 624; 30.5% identity (57.3% similar) in 485 aa overlap (45-509:14-480) 20 30 40 50 60 pF1KE1 VSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGL-SLGPGAAALPKVGWLE----QLLDPF ::: .: :: : :. : : :: : CCDS70 MGSAPWAPVLLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHF 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NVS--DRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVI : ..: ::. :.:. :: .::::.. :.::.. . . : :: :::.. 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CCDS82 TLVAVTISEGAHHLDLRTKNALDPMSVLLARSLEVRHMKNWIRDFYDSAGKQH 450 460 470 480 490 >>CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 (517 aa) initn: 416 init1: 191 opt: 391 Z-score: 461.6 bits: 95.0 E(32554): 2.2e-19 Smith-Waterman score: 502; 27.7% identity (54.3% similar) in 455 aa overlap (65-503:77-507) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 QQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVGWLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGP :.: :. . ..: ::: : :..: . : CCDS41 NYSVLYFQQKALAAGQLHICIIQLNHYKTPLVDHFGFNTVKTFNQRYLVADKYWKKNGGS 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 IFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVISLEHRFYGLSIPAGG---LEMAQLRFL :... :.::.. : .: :... :::.:: :.: : . .: :: CCDS41 ILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGDNSFKDSRHLNFL 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 SSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWICFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAP .:. :::: . :.: . . ..: : .::::.: :::: :.:.::.. ...:.::: CCDS41 TSEQALADFAELIKHLKRTIPGAENQPVIAIGGSYGGMLAAWFRMKYPHMVVGALAASAP 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 VRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSL-ECRAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELS . :. . : ....: . : .: .. .. ..: : . :.. : : CCDS41 IWQFEDLVPCG--VFMKIVTTDFRKSGPHCSESIHRSWDAINR-LSNTGSGLQWLTGALH 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE1 ACGPLGRAENQAELLGALQALVG-GVVQYDGQTG--APLS---VRQLCGLLLGGGGNRSH :.:: . : .. :. ..:.: .. :: .. .: : . : : CCDS41 LCSPLTSQDIQHLKDWISETWVNLAMVDYPYASNFLQPLPAWPIKVVCQYL--KNPNVSD 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 STPYCGLRRAVQIVLHSLGQ-KCLSFSRAETVAQLRSTEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGF : .. .:... . :: :::..:.. : :..: : ::.::: CCDS41 SLLLQNIFQALNVYYNYSGQVKCLNISETAT-----------SSLGTLGWSYQACTEV-V 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 YVTCENPR----CPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQAVAQTNSYYGGQTPGAN-K . : : : : : : : : .: : . ...:::.. ... . CCDS41 MPFCTNGVDDMFEPHSW--NLKELSDDCFQQWG-----VRPRPSWITTMYGGKNISSHTN 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 VLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQL ..: ::. ::: .::. . .. .. : :.: ::. . : :. :.:. ... CCDS41 IVFSNGELDPWSGGGVTKDITDTLVAVTISEGAHHLDLRTKNALDPMSVLLARSLEVRHM 450 460 470 480 490 500 500 510 pF1KE1 QTWLKLAKESQIKGEV ..:.. CCDS41 KNWIRDFYDSAGKQH 510 514 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:19:30 2016 done: Sun Nov 6 21:19:31 2016 Total Scan time: 3.600 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]