Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0303
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0303, 596 aa
1>>>pF1KE0303 596 - 596 aa - 596 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5559+/-0.000439; mu= 17.2034+/- 0.027
mean_var=64.9684+/-12.909, 0's: 0 Z-trim(109.9): 18 B-trim: 14 in 1/50
Lambda= 0.159119
statistics sampled from 18177 (18188) to 18177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 8.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036385 (OMIM: 300044) transketolase-like protei ( 596) 3933 912.3 0
NP_001139405 (OMIM: 300044) transketolase-like pro ( 590) 3863 896.2 0
NP_001139406 (OMIM: 300044) transketolase-like pro ( 540) 3573 829.6 0
NP_001128527 (OMIM: 606781,617044) transketolase i ( 623) 2212 517.2 6.4e-146
NP_001055 (OMIM: 606781,617044) transketolase isof ( 623) 2212 517.2 6.4e-146
XP_011532356 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: tran ( 631) 2186 511.2 4.1e-144
NP_001244957 (OMIM: 606781,617044) transketolase i ( 631) 2186 511.2 4.1e-144
XP_011532357 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: tran ( 457) 1913 448.5 2.3e-125
NP_001166939 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydr ( 341) 210 57.5 8.4e-08
NP_001302465 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydr ( 341) 196 54.3 7.8e-07
NP_000916 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydroge ( 359) 196 54.3 8.2e-07
>>NP_036385 (OMIM: 300044) transketolase-like protein 1 (596 aa)
initn: 3933 init1: 3933 opt: 3933 Z-score: 4876.1 bits: 912.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3933; 99.7% identity (99.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE0 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
550 560 570 580 590
>>NP_001139405 (OMIM: 300044) transketolase-like protein (590 aa)
initn: 3608 init1: 3608 opt: 3863 Z-score: 4789.4 bits: 896.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3863; 98.7% identity (98.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_001 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSG------SSSEIMSVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE0 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
540 550 560 570 580 590
>>NP_001139406 (OMIM: 300044) transketolase-like protein (540 aa)
initn: 3573 init1: 3573 opt: 3573 Z-score: 4430.2 bits: 829.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3573; 99.8% identity (99.8% similar) in 540 aa overlap (57-596:1-540)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 MASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 SFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVK
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVK
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIED
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 SPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFN
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 KEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINI
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 IGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRT
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 TRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVI
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 DLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGV
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE0 PQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
520 530 540
>>NP_001128527 (OMIM: 606781,617044) transketolase isofo (623 aa)
initn: 2509 init1: 1638 opt: 2212 Z-score: 2740.7 bits: 517.2 E(85289): 6.4e-146
Smith-Waterman score: 2434; 59.4% identity (81.1% similar) in 618 aa overlap (15-594:6-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
NP_001 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:::::.::..::: :::::::::::::
NP_001 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
:.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..:: ::..: ::
NP_001 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::..... :
NP_001 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::::. ::::
NP_001 PQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFS
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
:::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.::.....::
NP_001 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
:::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: ::::.::.:
NP_001 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
::::.:::. .::. .: :..:::::. . .:.:::::::.:..::::::. :.:. :
NP_001 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
:::.: ::::::: :..::.::.:::.:::::: .::::::: .:: .: : : ::
NP_001 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
530 540 550 560 570 580
570 580 590
pF1KE0 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
:. ::.::: ::: :.::. : ::. ..
NP_001 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
590 600 610 620
>>NP_001055 (OMIM: 606781,617044) transketolase isoform (623 aa)
initn: 2509 init1: 1638 opt: 2212 Z-score: 2740.7 bits: 517.2 E(85289): 6.4e-146
Smith-Waterman score: 2434; 59.4% identity (81.1% similar) in 618 aa overlap (15-594:6-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
NP_001 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:::::.::..::: :::::::::::::
NP_001 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
:.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..:: ::..: ::
NP_001 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::..... :
NP_001 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::::. ::::
NP_001 PQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFS
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
:::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.::.....::
NP_001 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
:::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: ::::.::.:
NP_001 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
::::.:::. .::. .: :..:::::. . .:.:::::::.:..::::::. :.:. :
NP_001 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
:::.: ::::::: :..::.::.:::.:::::: .::::::: .:: .: : : ::
NP_001 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
530 540 550 560 570 580
570 580 590
pF1KE0 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
:. ::.::: ::: :.::. : ::. ..
NP_001 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
590 600 610 620
>>XP_011532356 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: transket (631 aa)
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Smith-Waterman score: 2408; 58.6% identity (80.0% similar) in 626 aa overlap (15-594:6-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
XP_011 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
XP_011 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
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90 100 110 120 130
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRAS--------YRVFCLMSDGESSEGSV
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:: :::.::..::: :::::
XP_011 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSV
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140 150 160 170 180 190
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:::::::: :.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..::
XP_011 WEAMAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEE
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200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQT
::..: :: ::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::.
XP_011 LCKAFGQA---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQS
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260 270 280 290 300 310
pF1KE0 SRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDG
.... :: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::
XP_011 KKKILATPPQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDG
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 DTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHI
::. :::::::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.:
XP_011 DTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQI
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 RIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVAL
:.....:::::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: :
XP_011 RMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVEL
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440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAAD
:::.::.:::::.:::. .::. .: :..:::::. . .:.:::::::.:..::::::.
XP_011 AANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAE
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pF1KE0 ELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDP
:.:. : :::.: ::::::: :..::.::.:::.:::::: .::::::: .:: .:
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560 570 580 590
pF1KE0 DIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
: : :::. ::.::: ::: :.::. : ::. ..
XP_011 GITVTHLAVNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
590 600 610 620 630
>>NP_001244957 (OMIM: 606781,617044) transketolase isofo (631 aa)
initn: 2334 init1: 1638 opt: 2186 Z-score: 2708.3 bits: 511.2 E(85289): 4.1e-144
Smith-Waterman score: 2408; 58.6% identity (80.0% similar) in 626 aa overlap (15-594:6-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
NP_001 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
NP_001 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRAS--------YRVFCLMSDGESSEGSV
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:: :::.::..::: :::::
NP_001 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSV
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 WEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEA
:::::::: :.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..::
NP_001 WEAMAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEE
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQT
::..: :: ::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::.
NP_001 LCKAFGQA---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQS
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260 270 280 290 300 310
pF1KE0 SRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDG
.... :: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::
NP_001 KKKILATPPQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDG
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 DTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHI
::. :::::::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.:
NP_001 DTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQI
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:.....:::::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: :
NP_001 RMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVEL
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAAD
:::.::.:::::.:::. .::. .: :..:::::. . .:.:::::::.:..::::::.
NP_001 AANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAE
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 ELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDP
:.:. : :::.: ::::::: :..::.::.:::.:::::: .::::::: .:: .:
NP_001 LLKKEKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEP
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KE0 DIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
: : :::. ::.::: ::: :.::. : ::. ..
NP_001 GITVTHLAVNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
590 600 610 620 630
>>XP_011532357 (OMIM: 606781,617044) PREDICTED: transket (457 aa)
initn: 1916 init1: 1638 opt: 1913 Z-score: 2371.8 bits: 448.5 E(85289): 2.3e-125
Smith-Waterman score: 1913; 61.5% identity (85.1% similar) in 457 aa overlap (138-594:1-454)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 YTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAE
::::: :.:::::: .:.::::.: : .
XP_011 MAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQ
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 HCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIED
: ..:::.:::::::.. .:::..:: ::..: :: ::.:::..:::::::: ..::
XP_011 HQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVED
40 50 60 70 80
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pF1KE0 AESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGD
::::.::.:.. :. ::. : ::::..... :: ::.: :.:...:: : :.:.:::
XP_011 KESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGD
90 100 110 120 130 140
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pF1KE0 KIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVA
::::::: : ::::::.:..:...:::::. :::::::.::.:.:::::..:::::::.:
XP_011 KIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIA
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pF1KE0 LGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALED
.:::.:.::. : ::::::.:::::.::.....:::::. :::::::.:.:: :::::::
XP_011 VGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALED
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 IAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAK
.::::..: :.:::.:.:.::.:: ::::.::.:::::.:::. .::. .: :..::::
XP_011 LAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAK
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 VLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATE
:. . .:.:::::::.:..::::::. :.:. : :::.: ::::::: :..::.::.
XP_011 VVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATK
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 GRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHII
:::.:::::: .::::::: .:: .: : : :::. ::.::: ::: :.::. :
XP_011 GRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIA
390 400 410 420 430 440
590
pF1KE0 VAVKCMLLN
::. ..
XP_011 QAVRGLITKA
450
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pF1KE0 VGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMV
: :.. ...: .:.:. ..:....
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pF1KE0 SVALGCASRG-RTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAE----SNINIIGSHC-----GVS
..:.: : : : : :: : .:.:.. :.. :. :.. :.: :
NP_001 GIAVGAAMAGLRPICEFMTFN-FSMQAIDQV-INSAAKTYYMSGVAAQHSQCFAAWYGHC
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pF1KE0 VGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVI
: .: :: . . : .: . .: :. . :. : . .. .
NP_001 PGLKVVSPWNSEDA---KGLIKSAIRDNNPVVVLENELMY-----GVPFEFPPEAQSKDF
160 170 180 190 200
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pF1KE0 YTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPL
: ::.::. :. . ..::.. . : . : :: :::. . .::.. ::.:.
NP_001 LIP-----IGKAKIERQ--GTHITVVSHSRPVGHCLEAAAVLSKEGVECEVINMRTIRPM
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pF1KE0 DVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPD---IQVHSLAVSGVPQSGK
:. :: .:. :. ...::: .:: :.: .:: . : ... .. :.:.
NP_001 DMETIEASVMKTN-HLVTVEGGWPQFGVGAEICARIMEGPAFNFLDAPAVRVTGADVPMP
260 270 280 290 300 310
580 590
pF1KE0 SEELLDMYGI-SARHIIVAVKCMLLN
..:. .: ... :: :.: :
NP_001 YAKILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI
320 330 340
>>NP_001302465 (OMIM: 179060,614111) pyruvate dehydrogen (341 aa)
initn: 180 init1: 98 opt: 196 Z-score: 243.7 bits: 54.3 E(85289): 7.8e-07
Smith-Waterman score: 226; 27.2% identity (53.4% similar) in 309 aa overlap (315-594:46-339)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 VGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMV
: :.. ...: .:.:. ..:....
NP_001 TVRDAINQGMDEELERDEKVFLLGEEVAQYDGAYKVSRGLWKKYGDKRIIDTPISEMGFA
20 30 40 50 60 70
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pF1KE0 SVALGCASRG-RTIAFASTFAAFLTRAFDHI---------RIGGLAESNINIIGSHCGVS
..:.: : : : : :: : .:.:.. ::: : . : . :.:
NP_001 GIAVGAAMAGLRPICEFMTFN-FSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGLQPVPIVFRGPN-GAS
80 90 100 110 120 130
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 VGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRP----E
.: :.: . : . : . : . .: : .: .: :: . : :
NP_001 AG--VAAQHSQCFAAWYGHCPGLKVVSPWN---SEDAKGLIKSA-----IRDNNPVVVLE
140 150 160 170 180
460 470 480 490
pF1KE0 TMVIYT-----PQER------FEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQ
. ..: : : . ::.::. :. . ..::.. . : . : :: :::.
NP_001 NELMYGVPFEFPPEAQSKDFLIPIGKAKIERQ--GTHITVVSHSRPVGHCLEAAAVLSKE
190 200 210 220 230 240
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 DIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPD---I
. .::.. ::.:.:. :: .:. :. ...::: .:: :.: .:: . : .
NP_001 GVECEVINMRTIRPMDMETIEASVMKTN-HLVTVEGGWPQFGVGAEICARIMEGPAFNFL
250 260 270 280 290 300
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pF1KE0 QVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGI-SARHIIVAVKCMLLN
.. .. :.:. ..:. .: ... :: :.: :
NP_001 DAPAVRVTGADVPMPYAKILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI
310 320 330 340
596 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:17:18 2016 done: Thu Nov 3 17:17:19 2016
Total Scan time: 8.540 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]