Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0303
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0303, 596 aa
1>>>pF1KE0303 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5439+/-0.00107; mu= 17.3529+/- 0.064
mean_var=64.2923+/-13.185, 0's: 0 Z-trim(103.0): 17 B-trim: 385 in 1/48
Lambda= 0.159954
statistics sampled from 7181 (7190) to 7181 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35448.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX ( 596) 3933 916.9 0
CCDS55541.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX ( 540) 3573 833.8 0
CCDS3805.1 TKTL2 gene_id:84076|Hs108|chr4 ( 626) 2679 627.5 1.5e-179
CCDS2871.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 ( 623) 2212 519.7 4.3e-147
CCDS58834.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 ( 631) 2186 513.7 2.8e-145
>>CCDS35448.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX (596 aa)
initn: 3933 init1: 3933 opt: 3933 Z-score: 4901.0 bits: 916.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3933; 99.7% identity (99.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVLQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSLDNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 STFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE0 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
550 560 570 580 590
>>CCDS55541.1 TKTL1 gene_id:8277|Hs108|chrX (540 aa)
initn: 3573 init1: 3573 opt: 3573 Z-score: 4452.7 bits: 833.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3573; 99.8% identity (99.8% similar) in 540 aa overlap (57-596:1-540)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 MASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSVLFFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAKRL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 SFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFASYYSL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVK
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DNLVAIFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQASQVK
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 HKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQPPIED
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 SPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFSEIFN
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 KEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAESNINI
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 IGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMCFIRT
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 TRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIFIRVI
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 DLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLAVSGV
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE0 PQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
520 530 540
>>CCDS3805.1 TKTL2 gene_id:84076|Hs108|chr4 (626 aa)
initn: 3032 init1: 2679 opt: 2679 Z-score: 3336.7 bits: 627.5 E(32554): 1.5e-179
Smith-Waterman score: 2927; 70.4% identity (87.3% similar) in 621 aa overlap (13-595:5-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.:.:: :.::..: :.:::::::::::...::. ::: :..:..:::
CCDS38 MMANDAKPDVKTVQVLRDTANRLRIHSIRATCASGSGQLTSCCSAAEVVSVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. :.:::.:::.::::::.:..
CCDS38 FFHTMKYKQTDPEHPDNDRFILSRGHAAPILYAAWVEVGDISESDLLNLRKLHSDLERHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
:: ::::::: ::::::.::::::::::.:.:::::::::.::::::::::::.::::
CCDS38 TPRLPFVDVATGSLGQGLGTACGMAYTGKYLDKASYRVFCLMGDGESSEGSVWEAFAFAS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
.:.::::::.:::::::.:: : :: .::: :::::::::.:::.:::::::.::::
CCDS38 HYNLDNLVAVFDVNRLGQSGPAPLEHGADIYQNCCEAFGWNTYLVDGHDVEALCQAFWQA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
::::.::::.::::::::: :.:::::.::.::.:.::::::.:::::::::..:: :.
CCDS38 SQVKNKPTAIVAKTFKGRGIPNIEDAENWHGKPVPKERADAIVKLIESQIQTNENLIPKS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
:.::::...:::..::::: :.:::::::.:. :::::::: ::.::.::.::: ::::
CCDS38 PVEDSPQISITDIKMTSPPAYKVGDKIATQKTYGLALAKLGRANERVIVLSGDTMNSTFS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
::: ::.:::::::..:::::::::::::.::::::::..::::.:::::..:.:.....
CCDS38 EIFRKEHPERFIECIIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFAGAFAAFFTRAFDQLRMGAISQA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
:::.::::::::.:.::.:::::::.::::.::.::.:::.::.:::::. ::::.::::
CCDS38 NINLIGSHCGVSTGEDGVSQMALEDLAMFRSIPNCTVFYPSDAISTEHAIYLAANTKGMC
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
::::..::: ::::::: ::::::::.:: :.:::::::::.:..::: :::.::.: :
CCDS38 FIRTSQPETAVIYTPQENFEIGQAKVVRHGVNDKVTVIGAGVTLHEALEAADHLSQQGIS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
.:::: :::::::.:::.:::::: ::.::::::: .:::::::::::: .::: ::.::
CCDS38 VRVIDPFTIKPLDAATIISSAKATGGRVITVEDHYREGGIGEAVCAAVSREPDILVHQLA
540 550 560 570 580 590
570 580 590
pF1KE0 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
:::::: ::. :::::.:::.::::.:: :.
CCDS38 VSGVPQRGKTSELLDMFGISTRHIIAAVTLTLMK
600 610 620
>>CCDS2871.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 (623 aa)
initn: 2509 init1: 1638 opt: 2212 Z-score: 2754.4 bits: 519.7 E(32554): 4.3e-147
Smith-Waterman score: 2434; 59.4% identity (81.1% similar) in 618 aa overlap (15-594:6-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
CCDS28 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
CCDS28 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRASYRVFCLMSDGESSEGSVWEAMAFAS
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:::::.::..::: :::::::::::::
CCDS28 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFAS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEALCQVFWQA
:.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..:: ::..: ::
CCDS28 IYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQTSRNLDPQP
::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::..... :
CCDS28 ---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATP
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDGDTRYSTFS
: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::::. ::::
CCDS28 PQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFS
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 EIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHIRIGGLAES
:::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.::.....::
CCDS28 EIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQIRMAAISES
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVALAANAKGMC
:::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: ::::.::.:
CCDS28 NINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGIC
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 FIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAADELSKQDIF
::::.:::. .::. .: :..:::::. . .:.:::::::.:..::::::. :.:. :
CCDS28 FIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKIN
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 IRVIDLFTIKPLDVATIVSSAKATEGRIITVEDHYPQGGIGEAVCAAVSMDPDIQVHSLA
:::.: ::::::: :..::.::.:::.:::::: .::::::: .:: .: : : ::
CCDS28 IRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLA
530 540 550 560 570 580
570 580 590
pF1KE0 VSGVPQSGKSEELLDMYGISARHIIVAVKCMLLN
:. ::.::: ::: :.::. : ::. ..
CCDS28 VNRVPRSGKPAELLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA
590 600 610 620
>>CCDS58834.1 TKT gene_id:7086|Hs108|chr3 (631 aa)
initn: 2334 init1: 1638 opt: 2186 Z-score: 2721.8 bits: 513.7 E(32554): 2.8e-145
Smith-Waterman score: 2408; 58.6% identity (80.0% similar) in 626 aa overlap (15-594:6-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADAEARAEFPEEARPDRGTLQVFQDMASRLRIHSIRATCSTSSGHPTSCSSSSEIMSVL
.::. ::...: :.:::: ::.:: ...::::::: :..:::.::
CCDS58 MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVL
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE0 FFYIMRYKQSDPENPDNDRFVLAK------------------------------------
::. ::::..::.:: ::::::.:
CCDS58 FFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNLRKISSDLDGHP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KE0 --RLSFVDVATGWLGQGLGVACGMAYTGKYFDRAS--------YRVFCLMSDGESSEGSV
. .:.::::: ::::::.::::::::::::.:: :::.::..::: :::::
CCDS58 VPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASLPSSWDYSYRVYCLLGDGELSEGSV
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 WEAMAFASYYSLDNLVATFDVNRLGHSGALPAEHCINIYQRRCEAFGWNTYVVDGRDVEA
:::::::: :.:::::: .:.::::.: : .: ..:::.:::::::.. .:::..::
CCDS58 WEAMAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMDIYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEE
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LCQVFWQASQVKHKPTAVVAKTFKGRGTPSIEDAESWHAKPMPRERADAIIKLIESQIQT
::..: :: ::.:::..:::::::: ..:: ::::.::.:.. :. ::. : ::::.
CCDS58 LCKAFGQA---KHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQS
240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 SRNLDPQPPIEDSPEVNITDVRMTSPPDYRVGDKIATRKACGLALAKLGYANNRVVVLDG
.... :: ::.: :.:...:: : :.:.:::::::::: : ::::::.:..:...:::
CCDS58 KKKILATPPQEDAPSVDIANIRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDG
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 DTRYSTFSEIFNKEYPERFIECFMAEQNMVSVALGCASRGRTIAFASTFAAFLTRAFDHI
::. :::::::.::.:.:::::..:::::::.:.:::.:.::. : ::::::.:::::.:
CCDS58 DTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQI
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 RIGGLAESNINIIGSHCGVSVGDDGASQMALEDIAMFRTIPKCTIFYPTDAVSTEHAVAL
:.....:::::. :::::::.:.:: :::::::.::::..: :.:::.:.:.::.:: :
CCDS58 RMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVEL
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 AANAKGMCFIRTTRPETMVIYTPQERFEIGQAKVLRHCVSDKVTVIGAGITVYEALAAAD
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