Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0246, 418 aa
1>>>pF1KE0246 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4627+/-0.000941; mu= 16.9023+/- 0.058
mean_var=169.1166+/-73.545, 0's: 0 Z-trim(106.6): 227 B-trim: 1147 in 2/48
Lambda= 0.098624
statistics sampled from 8532 (9064) to 8532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 ( 418) 2743 403.3 2.3e-112
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 ( 426) 621 101.4 1.8e-21
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 ( 410) 609 99.6 5.7e-21
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 289) 443 75.8 6.1e-14
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 440 75.5 9.2e-14
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 433 74.6 2e-13
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 ( 412) 419 72.6 7.8e-13
CCDS2170.1 GPR39 gene_id:2863|Hs108|chr2 ( 453) 408 71.1 2.4e-12
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 ( 398) 393 68.9 1e-11
>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 (418 aa)
initn: 2743 init1: 2743 opt: 2743 Z-score: 2130.9 bits: 403.3 E(32554): 2.3e-112
Smith-Waterman score: 2743; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRLNSSAPGTPGTPAADPFQRAQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDI
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CCDS13 MRLNSSAPGTPGTPAADPFQRAQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQNRSADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQNRSADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 GVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 PILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
370 380 390 400 410
>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 (426 aa)
initn: 431 init1: 162 opt: 621 Z-score: 499.1 bits: 101.4 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 621; 31.5% identity (67.6% similar) in 340 aa overlap (66-397:63-391)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
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CCDS24 GHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMR
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
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CCDS24 T---PTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLAS
100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG--EQNRS
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CCDS24 VLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVP
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLT---VMVRQA
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CCDS24 CRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQE
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 AEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYIS
:. .. .... . . :: :. ...: ..:..: .:: :.:. :.:. .:
CCDS24 AKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGR----RQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVS
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380
pF1KE0 DEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATL---ACLCPVWR
::: :. ... ..... .::..:. ::.::.:.:. ::. : .: :: : :
CCDS24 --QWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGAC-CHRLR
330 340 350 360 370 380
390 400 410
pF1KE0 RRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
:.. ..::
CCDS24 PRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETDPS
390 400 410 420
>>CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 (410 aa)
initn: 1019 init1: 431 opt: 609 Z-score: 490.0 bits: 99.6 E(32554): 5.7e-21
Smith-Waterman score: 986; 39.6% identity (72.4% similar) in 384 aa overlap (52-403:21-400)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 AQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGN
..: :.: ...::: ::.: ....:..::
CCDS16 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGN
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 TVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGC
...: .. . .. .. . ...:. ::::. :: ::...:::::.:.: :.::.::: ::
CCDS16 ALSAHVVLKARAGRA--GRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGC
60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 RGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAV
:::::... :.:::.:.::.::.:: ::.:.:..:..:.. ::. ... : :: ::.
CCDS16 RGYYFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAL
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250
pF1KE0 PMLFTMGEQNR--SADGQ-HAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTI
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CCDS16 PMAVIMGQKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGV
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290
pF1KE0 IANKLTVMVRQA-----------------AEQGQVCTV--------GGEHSTFSMAIEPG
...: .. :. .:.: . . ::. : .
CCDS16 TVSHLLALCSQVPSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHK-DVR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALF
:...:...:.::::.:. .:.::::::.::::.::. :. :: ::.::::::::::.::
CCDS16 RIRSLQRSVQVLRAIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE0 YVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLC----PVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLS
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CCDS16 YVSSAVTPLLYNAVSSSFRKLFLEAVSSLCGEHHPM-KRLPPKPQSPTLMDTASGFGDPP
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE0 SNATRETLY
CCDS16 ETRT
410
>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (289 aa)
initn: 412 init1: 252 opt: 443 Z-score: 363.8 bits: 75.8 E(32554): 6.1e-14
Smith-Waterman score: 443; 33.9% identity (68.1% similar) in 257 aa overlap (66-318:46-287)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
:::. .:::::: .:: .: ....: ..
CCDS46 LADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVGIAGNLLTMLVVSR---FR
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
:..:.. .:.:.:.:::: ..: ::..: .: ..:: ::: :. . :. ..:::::
CCDS46 ELRTTTNLYLSSMAFSDLL-IFLCMPLDLVR-LWQYRPWNFGDLLCKLFQFVSESCTYAT
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQNRSA
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CCDS46 VLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGPIFVLVGVEHENGT
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 DGQHAGGLVCTPT---IHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAA
: .. : :: .... . :.. :.... :..:. ..:: ..:. :: : :
CCDS46 DPWDTN--ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIF-FFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDA
200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISD
: ....: .: : .::: . : . .... : ::
CCDS46 VVGASLRDQNHKQTVKML--GGSQRALRLS---LAGPILSL--CLLPSL
250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 EQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRK
>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 521 init1: 252 opt: 440 Z-score: 360.5 bits: 75.5 E(32554): 9.2e-14
Smith-Waterman score: 604; 36.0% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (66-372:46-331)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
:::. .:::::: .:: .: ....: ..
CCDS32 LADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVGIAGNLLTMLVVSR---FR
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
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CCDS32 ELRTTTNLYLSSMAFSDLL-IFLCMPLDLVR-LWQYRPWNFGDLLCKLFQFVSESCTYAT
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQNRSA
.:....::::::.::: :..::......:.: : .:: .. : :.. .: :.. ..
CCDS32 VLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGPIFVLVGVEHENGT
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 DGQHAGGLVCTPT---IHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAA
: .. : :: .... . :.. :.... :..:. ..:: ..:. :: : :
CCDS32 DPWDTN--ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIF-FFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDA
200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISD
.::. :. : : .. :..: .::.::..::::.:: : .: :
CCDS32 ------VVGA-----SL-----RDQNHKQTVKMLAVVVFAFILCWLPFHVGRYLFSK-SF
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 EQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRK
: . . .. .: .:. .:::.:..:::::::..: ..:
CCDS32 EPGSLEIAQISQYCNLVSFVLFYLSAAINPILYNIMSKKYRVAVFRLLGFEPFSQRKLST
300 310 320 330 340 350
400 410
pF1KE0 RPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
CCDS32 LKDESSRAWTESSINT
360
>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 (415 aa)
initn: 573 init1: 157 opt: 433 Z-score: 354.6 bits: 74.6 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 613; 31.9% identity (66.6% similar) in 323 aa overlap (66-386:48-349)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
:..::. .::::..::... ... .. :
CCDS43 LEDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVSVVYVPIFVVGVIGNVLVCLVILQH---Q
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
.... ..:.: :::.::::.:::.::.:.:. .: ..:. :: .:: : .. .:.
CCDS43 AMKTPTNYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYE-MWRNYPFLFGPVGCYFKTALFETVCFAS
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQ-NRSA
:.....:::::.:: :::.:: .: :. .... .: :.:...: : . .
CCDS43 ILSITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGIVWGFSVLFSLPNTSIHGIKFHYFP
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 DGQHA-GGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQ
.:. . :. .:: . .:::..:. ...::.::::: ..: .: :..
CCDS43 NGSLVPGSATCTVIKPMWIYNFIIQVTSFLFYLLPMTVISVLYYLMALRLKKDKSLEADE
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQ
:. . .: : . ..: ..:..:..:: :.:. ::.: .. :.
CCDS43 GN-----------ANIQRPCR----KSVNKMLFVLVLVFAICWAPFHIDRLFFSFV--EE
260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 WTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRP
:. : .. ..:....::.::..:::.:::.: :. : ... . :
CCDS43 WSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNPIIYNLLSRRFQAAFQNVISSFHKQWHSQHDPQ
300 310 320 330 340 350
400 410
pF1KE0 AFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
CCDS43 LPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQFPCQSSMHNSHLPAALSSEQMSRTNYQSFHFNKT
360 370 380 390 400 410
>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 (412 aa)
initn: 576 init1: 257 opt: 419 Z-score: 343.9 bits: 72.6 E(32554): 7.8e-13
Smith-Waterman score: 598; 34.6% identity (62.2% similar) in 381 aa overlap (64-401:39-386)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKS
: :::: : :::::. ::.::.. ..: ..
CCDS94 DGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYRD
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTY
... :.. .:::.:.:::: .::..: .:: .: .::.:: :: .. ..:::
CCDS94 MRT---TTNLYLGSMAVSDLL-ILLGLPFDLYR-LWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTY
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQN-
:: :....::::::::::.:..:..:..: :.. .:...: .. : : :.:: .: ::.
CCDS94 ATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDP
130 140 150 160 170 180
220 230
pF1KE0 ------------RSADGQ------------------------HAGGLV---CTPT-IHTA
: :.. .:..: : :. . .
CCDS94 GISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPAQLG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIE
...:.. :.: :..:.. .:.: .:. .: : .: . .
CCDS94 ALRVMLWVTT-AYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPL--RGPAAS-------------
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNA
:: .. :. :::: .::.::..::::.:: :.. ::. :. . ..: : .:: .:.
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