FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2060, 705 aa 1>>>pF1KE2060 705 - 705 aa - 705 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1115+/-0.000481; mu= 15.6320+/- 0.029 mean_var=162.7832+/-33.068, 0's: 0 Z-trim(112.9): 432 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.100524 statistics sampled from 21532 (22076) to 21532 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16 Scan time: 9.340 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016875404 (OMIM: 216950,613785) PREDICTED: comp ( 719) 4991 737.5 4.4e-212 NP_001724 (OMIM: 216950,613785) complement C1r sub ( 705) 4990 737.3 4.8e-212 XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 1430 221.0 1.2e-56 NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 699) 1430 221.0 1.2e-56 XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 706) 1430 221.0 1.2e-56 NP_057630 (OMIM: 608974) complement C1r subcompone ( 487) 1320 204.9 6.3e-52 XP_016874886 (OMIM: 608974) PREDICTED: complement ( 504) 1320 204.9 6.4e-52 XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615) 1298 201.8 6.6e-51 XP_016862358 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 702) 1298 201.9 7.2e-51 NP_624302 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 728) 1298 201.9 7.4e-51 XP_011511291 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 735) 1298 201.9 7.4e-51 NP_001284569 (OMIM: 608974) complement C1r subcomp ( 445) 1287 200.0 1.6e-50 XP_016874887 (OMIM: 608974) PREDICTED: complement ( 462) 1287 200.0 1.7e-50 NP_006601 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 686) 1028 162.7 4.4e-39 XP_016862360 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 660) 994 157.7 1.3e-37 XP_006713764 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 354) 757 123.0 2e-27 NP_001027019 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding ( 380) 757 123.1 2.1e-27 XP_011511293 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 387) 757 123.1 2.1e-27 XP_016855586 (OMIM: 605102,613791) PREDICTED: mann ( 332) 598 99.9 1.7e-20 NP_001275930 (OMIM: 206200,609862) transmembrane p ( 802) 502 86.5 4.4e-16 NP_705837 (OMIM: 206200,609862) transmembrane prot ( 811) 502 86.5 4.4e-16 XP_005262454 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) P ( 418) 473 81.9 5.4e-15 NP_001300842 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) c ( 423) 473 81.9 5.5e-15 NP_000124 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) coag ( 461) 473 82.0 5.8e-15 NP_114154 (OMIM: 608018) serine protease 27 isofor ( 290) 466 80.7 8.8e-15 NP_690851 (OMIM: 613797) serine protease 33 precur ( 280) 462 80.1 1.3e-14 XP_011520754 (OMIM: 613797) PREDICTED: serine prot ( 280) 462 80.1 1.3e-14 XP_011520753 (OMIM: 613797) PREDICTED: serine prot ( 280) 462 80.1 1.3e-14 XP_005262880 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 536) 454 79.3 4.3e-14 XP_006714200 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 610) 454 79.4 4.6e-14 NP_000119 (OMIM: 264900,612416) coagulation factor ( 625) 454 79.4 4.7e-14 XP_005262878 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 626) 454 79.4 4.7e-14 XP_016882221 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 393) 450 78.6 5.3e-14 XP_005258895 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14 NP_892028 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 450 78.6 5.5e-14 NP_002142 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 450 78.6 5.5e-14 XP_006723244 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14 XP_016882220 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14 NP_036599 (OMIM: 609341) tryptase gamma preproprot ( 321) 447 78.0 6.3e-14 NP_001119574 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 447 78.1 6.6e-14 NP_003285 (OMIM: 191080) tryptase alpha/beta-1 pre ( 275) 445 77.6 7e-14 NP_005134 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin isofor ( 406) 447 78.1 7.3e-14 NP_001305067 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 446 77.9 7.3e-14 NP_002764 (OMIM: 600823) prostasin preproprotein [ ( 343) 444 77.6 8.9e-14 XP_016859994 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 542) 446 78.2 9.6e-14 XP_011535778 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 364) 443 77.5 1e-13 NP_001254483 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulat ( 382) 443 77.5 1.1e-13 XP_006720026 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 412) 443 77.6 1.1e-13 XP_011535777 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 433) 443 77.6 1.1e-13 NP_062562 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 444) 443 77.6 1.2e-13 >>XP_016875404 (OMIM: 216950,613785) PREDICTED: compleme (719 aa) initn: 4991 init1: 4991 opt: 4991 Z-score: 3928.6 bits: 737.5 E(85289): 4.4e-212 Smith-Waterman score: 4991; 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XP_016 SRTPHRARAHRQVKLGGPRPGSREHPRQENEVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVL 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 SQGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCH : :. : .::..:::::: . :: :.:.:::.::: : :: . .:.: :: XP_016 SPGSFMSITFRSDFSNEER-----FTGFDAHYMAVDVDECKER-----EDEELSCDHYCH 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 NYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRV ::.:::.:::: :: :. : ..:..:::..:.:. .: :.: ..: :: . .: :.:.. XP_016 NYIGGYYCSCRFGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIEL 130 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 ERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLL :.:. ..:.: . :::.:: .: :::: ..: .. : .: :::.. : ..:.:..: .: XP_016 EEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLIL 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 FFTDESGDSRGWKLRYTTEIIKCP--QPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQL : .:.::..:::.: : . .:: :: . . :. : .: :.: ...: ::.. 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