FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1719, 225 aa 1>>>pF1KE1719 225 - 225 aa - 225 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0540+/-0.000565; mu= 16.1271+/- 0.035 mean_var=65.6482+/-12.897, 0's: 0 Z-trim(113.1): 37 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.158293 statistics sampled from 13736 (13773) to 13736 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16 Scan time: 2.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 ( 225) 1520 354.9 2.4e-98 CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 247) 911 215.8 1.9e-56 CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 243) 901 213.5 9.2e-56 CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 245) 823 195.7 2.1e-50 CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 252) 780 185.9 2e-47 CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 181) 716 171.2 3.8e-43 CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 199) 713 170.6 6.6e-43 CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 192) 705 168.7 2.3e-42 CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 226) 705 168.8 2.6e-42 CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 255) 705 168.8 2.9e-42 CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 ( 208) 380 94.5 5.3e-20 CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 ( 211) 373 92.9 1.6e-19 CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX ( 207) 350 87.7 6.1e-18 CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 ( 268) 334 84.1 9.5e-17 CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 170) 319 80.5 7.1e-16 CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 305 77.4 7.2e-15 CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 ( 206) 293 74.7 5.1e-14 CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 ( 208) 270 69.4 2e-12 CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 ( 208) 268 68.9 2.7e-12 CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5 ( 155) 251 65.0 3.1e-11 >>CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 (225 aa) initn: 1520 init1: 1520 opt: 1520 Z-score: 1879.0 bits: 354.9 E(32554): 2.4e-98 Smith-Waterman score: 1520; 100.0% identity (100.0% similar) in 225 aa overlap (1-225:1-225) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP 190 200 210 220 >>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (247 aa) initn: 912 init1: 763 opt: 911 Z-score: 1126.8 bits: 215.8 E(32554): 1.9e-56 Smith-Waterman score: 911; 61.6% identity (83.0% similar) in 224 aa overlap (2-225:3-225) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPAR ::.::.::::::..:: .:: ...:: : ...::. .:. ..::::. : . : CCDS95 MAAAIASGLIRQKRQAREQHWDRPSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 PDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSA : .::::::::.:.::::.::: .:::...:: .:... : :::::::::::.::.. CCDS95 LRR-QDPQLKGIVTRLYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEG : : :.:::.:: :: : :: ::.::: :::::::.:.: ::::..:::::.:::.::: CCDS95 KTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 QVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP :.:::::::::: ::::::: ::::::.:::::.: :. :. .: CCDS95 QAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGK 180 190 200 210 220 230 CCDS95 PVNKSKTT 240 >>CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 (243 aa) initn: 916 init1: 804 opt: 901 Z-score: 1114.6 bits: 213.5 E(32554): 9.2e-56 Smith-Waterman score: 901; 61.3% identity (85.1% similar) in 222 aa overlap (2-221:3-223) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCP-RGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPA ::.:::::::::..:: ...: ...:: : . .:::....: ..::::.:.:: CCDS33 MAAAIASSLIRQKRQARESNSDRVSASKRRSSPSKDGRSLCERHVLGVFSKVRFCSGRK- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 RP-DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQ :: : ::::::::::.:: .::..:: .:::.:.:: ...:..: :::::::::::.:: CCDS33 RPVRRRPEPQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGTKDENSDYTLFNLIPVGLRVVAIQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 SAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDK ..: . :.:::.:: :::: :: ::.::: :::::::.:.:.::::..:::::.:::.: CCDS33 GVKASLYVAMNGEGYLYSSDVFTPECKFKESVFENYYVIYSSTLYRQQESGRAWFLGLNK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP :::.:::::::::: ..::.:: .:: ::.::::: . : . : CCDS33 EGQIMKGNRVKKTKPSSHFVPKPIEVCMYREPSLHEIGEKQGRSRKSSGTPTMNGGKVVN 180 190 200 210 220 230 CCDS33 QDST 240 >>CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (245 aa) initn: 817 init1: 715 opt: 823 Z-score: 1018.2 bits: 195.7 E(32554): 2.1e-50 Smith-Waterman score: 823; 58.7% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (2-225:3-223) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVC-PRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPA ::.:::::::::..:: : .: . : : :. :.:. : ..:.:.: :.. CCDS14 MAAAIASSLIRQKRQAREREKS---NACKCVSSPSKGKTSCDKNKLNVFSRVKLFGSKKR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 RPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQS : : ::::::::::::. :::..:: . ::.:.:: .. :..: :::::::::::.::. CCDS14 R-RRRPEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 AKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKE .. :.:::.:: ::.: :: ::.::: ::::::: :.: .:::..:::.:::::.:: CCDS14 VQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 GQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP :..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::.. : : :. .: CCDS14 GEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGG 180 190 200 210 220 230 CCDS14 KSMSHNEST 240 >>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (252 aa) initn: 771 init1: 771 opt: 780 Z-score: 965.0 bits: 185.9 E(32554): 2e-47 Smith-Waterman score: 780; 65.7% identity (85.7% similar) in 175 aa overlap (52-225:57-230) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 RPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGP-EPQLKGIVTKLFCRQG ::: . . ...: .::::::::.:.:::: CCDS95 RVSKLLDCFSPKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCG-KSLKKNKNPTDPQLKGIVTRLYCRQG 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 FYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFT .::: .:::...:: .:... : :::::::::::.::..: : :.:::.:: :: : :: CCDS95 YYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFT 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 AECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKL ::.::: :::::::.:.: ::::..:::::.:::.::::.:::::::::: ::::::: CCDS95 PECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKP 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 LEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP ::::::.:::::.: :. :. .: CCDS95 LEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT 210 220 230 240 250 >>CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 (181 aa) initn: 737 init1: 716 opt: 716 Z-score: 888.1 bits: 171.2 E(32554): 3.8e-43 Smith-Waterman score: 716; 66.2% identity (87.9% similar) in 157 aa overlap (65-221:5-161) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT :::::::::.:: .::..:: .:::.:.:: CCDS46 MESKEPQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGT 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY ...:..: :::::::::::.::..: . :.:::.:: :::: :: ::.::: :::::: CCDS46 KDENSDYTLFNLIPVGLRVVAIQGVKASLYVAMNGEGYLYSSDVFTPECKFKESVFENYY 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV :.:.:.::::..:::::.:::.::::.:::::::::: ..::.:: .:: ::.::::: . CCDS46 VIYSSTLYRQQESGRAWFLGLNKEGQIMKGNRVKKTKPSSHFVPKPIEVCMYREPSLHEI 100 110 120 130 140 150 220 pF1KE1 PEASPSSPPAP : . : CCDS46 GEKQGRSRKSSGTPTMNGGKVVNQDST 160 170 180 >>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (199 aa) initn: 723 init1: 705 opt: 713 Z-score: 883.8 bits: 170.6 E(32554): 6.6e-43 Smith-Waterman score: 713; 61.1% identity (82.9% similar) in 175 aa overlap (55-225:3-177) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 SAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP----DRGPEPQLKGIVTKLFCRQG :. ..: : . :::::::::::. ::: CCDS55 MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTKLYSRQG 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 FYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFT ..:: . ::.:.:: .. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: CCDS55 YHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFT 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 AECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKL ::.::: ::::::: :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: CCDS55 PECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKP 100 110 120 130 140 150 210 220 pF1KE1 LEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP :.::::.:::::.. : : :. .: CCDS55 LKVAMYKEPSLHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST 160 170 180 190 >>CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (192 aa) initn: 723 init1: 705 opt: 705 Z-score: 874.1 bits: 168.7 E(32554): 2.3e-42 Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:10-170) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT :::::::::::. :::..:: . ::.:.:: CCDS14 MALLRKSYSEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY .. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: :::::: CCDS14 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV : :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::.. CCDS14 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL 100 110 120 130 140 150 220 pF1KE1 PEASPSSPPAP : : :. .: CCDS14 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST 160 170 180 190 >>CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (226 aa) initn: 744 init1: 705 opt: 705 Z-score: 873.1 bits: 168.8 E(32554): 2.6e-42 Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:44-204) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT :::::::::::. :::..:: . ::.:.:: CCDS55 KKESPFRAKCHEIFCCPLKQVHHKENTEPEEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY .. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: :::::: CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV : :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::.. CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL 140 150 160 170 180 190 220 pF1KE1 PEASPSSPPAP : : :. .: CCDS55 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST 200 210 220 >>CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (255 aa) initn: 745 init1: 705 opt: 705 Z-score: 872.4 bits: 168.8 E(32554): 2.9e-42 Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:73-233) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT :::::::::::. :::..:: . ::.:.:: CCDS55 KKESPFRAKCHEIFCCPLKQVHHKENTEPEEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY .. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: :::::: CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV : :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::.. CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL 170 180 190 200 210 220 220 pF1KE1 PEASPSSPPAP : : :. .: CCDS55 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST 230 240 250 225 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:02:08 2016 done: Sun Nov 6 22:02:08 2016 Total Scan time: 2.440 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]