Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0533
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0533, 3690 aa
  1>>>pF1KA0533 3690 - 3690 aa - 3690 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1517+/-0.00127; mu= 17.2092+/- 0.076
 mean_var=309.1938+/-59.084, 0's: 0 Z-trim(110.8): 158  B-trim: 15 in 1/53
 Lambda= 0.072939
 statistics sampled from 11710 (11867) to 11710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  8.570

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20         (3695) 26126 2766.3       0
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3277) 2681 299.2 3.4e-79
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3333) 2681 299.2 3.4e-79
CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (1724) 1743 200.1 1.2e-49
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18       (3075) 1432 167.7 1.2e-39
CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (1668) 1380 161.9 3.7e-38
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6           (3122) 1329 156.9 2.2e-36
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391) 1148 138.0 1.5e-30
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9          (1575) 1104 132.8   2e-29
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17          ( 604)  901 110.9   3e-23
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1816)  864 107.6 8.7e-22
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1823)  849 106.1 2.6e-21
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1           (1172)  823 103.1 1.3e-20
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1          (1111)  810 101.7 3.3e-20
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1           (1193)  810 101.7 3.5e-20
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1           (1609)  808 101.7 4.8e-20
CCDS6946.1 NTNG2 gene_id:84628|Hs108|chr9          ( 530)  658 85.2 1.4e-15
CCDS44180.1 NTNG1 gene_id:22854|Hs108|chr1         ( 539)  636 82.9   7e-15
CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7         ( 772)  564 75.6 1.7e-12
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7           (1786)  535 73.0 2.3e-11
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1        (1037)  518 70.9 5.7e-11


>>CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20              (3695 aa)
 initn: 25346 init1: 25346 opt: 26126  Z-score: 14867.9  bits: 2766.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 26126; 99.7% identity (99.8% similar) in 3695 aa overlap (1-3690:1-3695)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 CQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAYNFPYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAYNFPYC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 EAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGFNPLEFEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS33 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFEN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 ALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS33 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA0 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KA0 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KA0 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
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             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KA0 QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
       :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KA0 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS33 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KA0 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KA0 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPRSGHC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS33 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHC
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KA0 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KA0 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
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             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KA0 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KA0 SPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KA0 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
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pF1KA0 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
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pF1KA0 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

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pF1KA0 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
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pF1KA0 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
             2530      2540      2550      2560      2570      2580

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pF1KA0 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
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pF1KA0 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
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pF1KA0 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
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pF1KA0 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
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pF1KA0 DEDIGEKFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEDIGEQFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
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pF1KA0 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
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pF1KA0 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
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pF1KA0 LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELA
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             3070      3080      3090      3100      3110      3120
pF1KA0 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
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pF1KA0 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
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pF1KA0 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
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pF1KA0 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
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pF1KA0 PGLGPRGLQATARKASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVGILARH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGLGPRGLQATARKASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVGILARH
             3310      3320      3330      3340      3350      3360

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pF1KA0 RNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRS
             3370      3380      3390      3400      3410      3420

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pF1KA0 RPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSK
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             3490      3500      3510      3520      3530      3540
pF1KA0 LPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATL
             3490      3500      3510      3520      3530      3540

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pF1KA0 PDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQV-----LLRADDGAGEFSTSVTRPSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::
CCDS33 PDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVTEKQVLLRADDGAGEFSTSVTRPSVL
             3550      3560      3570      3580      3590      3600

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pF1KA0 CDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWPPA
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pF1KA0 YCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
             3670      3680      3690     

>>CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (3277 aa)
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               : ::   ::   :.::::. : .: :  : ::.  :..:.:::: ::::::.
CCDS45 MAAAARPRGRAL---GPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEA
               10           20        30        40        50       

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA0 ARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAH
       ::: :.:::::..:..: :.:  .:::::::::.: :. ..::.::.:: :.. .  :::
CCDS45 ARIWATATCGERGPGEGRPQP--ELYCKLVGGPTAPGS-GHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH
        60        70          80        90        100       110    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA0 PASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERS
       :..:::::.:::::::::: : .::.::.::::::.:::::.::::::::::::::::::
CCDS45 PVTNAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERS
          120       130       140       150       160       170    

         180       190       200       210       220       230     
pF1KA0 MDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLV
       .::: ::.:::.:: :: :::..:: ..   .:::: ..:.:::::::::::::.::::.
CCDS45 VDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI
          180       190       200       210       220       230    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KA0 NGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDIS
       :::::: ::..:  :::::::::.::::::::::::::..:: :::::::::::::::::
CCDS45 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSIKDIS
          240       250       260       270       280       290    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KA0 IGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANE
       :::.:::.:::..:. ..:   ::  : :::.::: :::::: :.::. :.::. ....:
CCDS45 IGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFR--CECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQSHE
          300       310         320       330       340       350  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KA0 CQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRS
       :..:::.:::..:::::.:.:..:: . .: : ::::::.:::.:.:::::.:  :.:: 
CCDS45 CEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGYYRP
            360       370       380       390       400       410  

         420       430       440       450       460       470     
pF1KA0 PNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTP
        . :.:.:  :  :.:. . .:: ::. .:::.:.::: :. :. :: :. .:: :   :
CCDS45 YGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADG-CEQGSGRCHCKPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCLRIP
            420       430        440       450       460       470 

         480       490       500       510       520       530     
pF1KA0 SSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYG
                ..:.                                               
CCDS45 ---------IFPV-----------------------------------------------
                                                                   

         540       550       560       570       580       590     
pF1KA0 PGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTL
               :.:.      :: .:. .      :                  : :.  :.:
CCDS45 --------STPSSE----DPVAGDIK------G------------------CDCNLEGVL
                 480                 490                           

         600       610       620       630       640       650     
pF1KA0 PEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPG
       :: ::  :::::.:   ::.:: :: :...:: :::: :                     
CCDS45 PEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWC---------------------
     500       510       520       530                             

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA0 YTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAY
                               :: :: .  :.  .::: ::: ::: ::: :. :::
CCDS45 ------------------------SALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAY
                              540       550       560       570    

         720         730       740       750       760       770   
pF1KA0 NFPYCEAGS--CHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGC
       .::.:...:  : :::   ..  :      :.:. :::::.:.:::  .:.:.  :: ::
CCDS45 DFPHCQGSSSACDPAGT--INSNLGY----CQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGC
          580       590             600       610       620        

           780       790       800       810       820       830   
pF1KA0 TRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDI
       ..:.:   ::..:..::. : :.: :: :: :..: .:.::.:.:....::::..:.:::
CCDS45 SECKCHKAGTVSGTGECRQGDGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDI
      630       640       650       660       670       680        

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 GGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGF
       ::::.. :   .:::.:: .. : .:..:  ..:.:::::.. :.:...::.:. .::::
CCDS45 GGALSSMCSGPSGVCQCREHVVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGF
      690       700       710       720       730       740        

           900       910       920         930       940       950 
pF1KA0 NPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNL--TSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREE
       .:: : .:::::::::. ::  .   ::.  .: .:: ...:::: :. .:::....   
CCDS45 DPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPS
      750       760       770       780       790       800        

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KA0 GRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVV
         .:       ::. . : :: ::::.:::  ::..:: ..:: :.  ..::::::::.:
CCDS45 WGAA-------QSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLV
      810              820       830       840       850       860 

            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KA0 LLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSL
       :::  ::::..::: ::: :.:    :.   ::::: :::.  :: . . ::     .. 
CCDS45 LLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQE---NCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGE
             870       880          890       900       910        

            1080      1090      1100      1110      1120      1130 
pF1KA0 PRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTP
       :::  ..: .:.:: ..  .: .:...:.. .:: :.:..::::..: :.  : : :.. 
CCDS45 PRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLFV-VDVNVK
      920       930       940       950       960       970        

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KA0 QRAP-QQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLV
       . .    : .... : ::.:::... : ....:...: ..:...: ...:::.:: : ..
CCDS45 SSGSVLAGQVNIYSCNYSVLCRSAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCII
       980       990      1000      1010      1020      1030       

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KA0 PIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTH
       :::::: :.:.:.: ::.:.: :  .::.:.      ::  .::   .:.    : :. :
CCDS45 PIEEFSAEYVRPQVHCIASYGRFVNQSATCVSLAHETPPTALIL---DVL---SGRPFPH
      1040      1050      1060      1070      1080            1090 

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KA0 AQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAH
            : .:       : . : : .    :. ::  :..  .:: ::::.:..: :: ::
CCDS45 ----LPQQSS------PSVDVLPGVT---LKAPQNQVTLRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAH
                      1100         1110      1120      1130        

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA0 PTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRW
       ::::..: ...:    :  .::::::  :::  :. :::  .:... :...::.::::. 
CCDS45 PTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEGQIEFDISEPEVAATVKVPEGKS
     1140      1150      1160      1170      1180      1190        

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KA0 LWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLF
       : :  ::::: . :..  :... .::: .::..:. ......:...: ::.:.: ::  :
CCDS45 LVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNSFYLDPQTASRFCKNSARSLVAF
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KA0 YNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARL
       :..:: :: :: .::::: : : ::::::. .::::.:.:::::..::: :.::.:: ::
CCDS45 YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIGRQCTRCATGHYGFPRCKPCSCGRRL
     1260      1270      1280      1290      1300      1310        

             1500      1510      1520      1530      1540      1550
pF1KA0 CDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQC
       :.:.:::: :::::. :.: .:. ..:. ::..::: ::::  :  : . : :: :::::
CCDS45 CEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQC
     1320      1330      1340      1350      1360      1370        

             1560      1570      1580      1590      1600      1610
pF1KA0 KCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQC
       .:.: .:::.:: :. ::. .:.: ::.:.. :: :::::: :: : :::::.: .:. :
CCDS45 RCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVC
     1380      1390      1400      1410      1420      1430        

             1620      1630      1640      1650      1660      1670
pF1KA0 SLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPG
         :.: :: :: :::: :::::....:.::   : .:::: :: : ..::  .:   .::
CCDS45 REGSFHLDPANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWHLETADRVDIPVSFNPG
     1440      1450      1460      1470      1480      1490        

             1680      1690      1700      1710      1720      1730
pF1KA0 TEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPME
       .. . :::...: ..  :     : :: :::::.:::::: : :. .:    ::. : .:
CCDS45 SNSMVADLQELPATIHSA----SWVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDM-VLLE
     1500      1510          1520      1530      1540       1550   

             1740      1750      1760      1770      1780      1790
pF1KA0 SRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASL
       ..::: : :..::: . :   : : ..:.:....:::::::. .:  ::::::: ::. :
CCDS45 KKPDVQLTGQHMSIIYEETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRL
          1560      1570      1580      1590      1600      1610   

             1800      1810      1820      1830      1840      1850
pF1KA0 EQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFY
        ...:..:.   .. ..: .:.:: :: .:.: .:  ::.: :: .: ::::: :.::.:
CCDS45 ADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYY
          1620      1630      1640      1650      1660      1670   

             1860      1870      1880      1890      1900      1910
pF1KA0 RDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPC
       :: :::. ::::::.:.:::..:  :::.::.::::: : :::::: :....    :  :
CCDS45 RDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS--C
          1680      1690      1700      1710      1720      1730   

             1920      1930      1940      1950      1960      1970
pF1KA0 VSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD
        .::::    .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.::::  .:.:::::.
CCDS45 RACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS
               1740      1750      1760      1770      1780        

             1980      1990      2000      2010      2020      2030
pF1KA0 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT
       :..::.    ...: ::::                                  ::     
CCDS45 CNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCIN---
     1790          1800                                            

             2040      2050      2060      2070      2080      2090
pF1KA0 EACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC
                               ::            :   .:: :             
CCDS45 ------------------------QE------------PKDSSPAEE-------------
                                          1810                     

             2100      2110      2120      2130      2140      2150
pF1KA0 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ
                                                                   
CCDS45 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             2160      2170      2180      2190      2200      2210
pF1KA0 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA
                    :. :: ::. ::.::   :  :  .. ::.:..::.    .......
CCDS45 -------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMRHMET
                  1820      1830      1840      1850      1860     

                2220      2230      2240      2250      2260       
pF1KA0 SIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAG
       .  ::..::   :: .. :   ....: ::.. :.:.:. . :  .:  .  .:. :  .
CCDS45 QAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNN
        1870      1880         1890      1900      1910      1920  

      2270      2280      2290      2300      2310      2320       
pF1KA0 TEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMR
       .. .   :: : . :. : :..        :.                            
CCDS45 VNRATQSAKELDVKIKNVIRNV--------HM----------------------------
           1930      1940                                          

      2330      2340      2350      2360      2370      2380       
pF1KA0 ARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREA
                            : :..   ..   ::..::.. :: : ..:: : :::  
CCDS45 ---------------------LNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRAR
                            1950      1960      1970      1980     

      2390      2400      2410       2420      2430      2440      
pF1KA0 LNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHS
       :..:.  ...:. ::..: ::   :.::. .:..  .. .   : .: ..: ..   :. 
CCDS45 LQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIALQL
        1990      2000       2010      2020      2030      2040    

       2450      2460      2470      2480      2490      2500      
pF1KA0 LDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSII
       ......: :.:::::. ::  : .... .: ...:  ::: :: ::..: .:: .:  : 
CCDS45 MEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQLEEIK
         2050      2060      2070      2080      2090      2100    

       2510      2520      2530      2540      2550      2560      
pF1KA0 LDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLL
        ... :.:.. :..:..::  ::.:..::::::..: . .. .  ::... :  .:. : 
CCDS45 RNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKAKTLS
         2110      2120      2130      2140      2150      2160    

       2570       2580      2590      2600      2610       2620    
pF1KA0 ANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AMDTDE
       .::  : .:: . ...    :  ::.. .  :  : ..:. ..... . .  : ...  .
CCDS45 SNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQRGD
         2170      2180      2190      2200      2210      2220    

         2630      2640      2650      2660      2670      2680    
pF1KA0 TSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVS
        .  :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: .  :   ...:. .:. :: .::.
CCDS45 IDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVN
         2230      2240      2250      2260      2270      2280    

         2690      2700      2710      2720      2730      2740    
pF1KA0 TLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSG
        : . ::.:  :.  .... .  ...  : .. :.:::: ::: ::::: :::.:::.::
CCDS45 KLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSG
         2290      2300      2310        2320      2330      2340  

         2750      2760      2770      2780      2790      2800    
pF1KA0 VQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKV
       :..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... : ..
CCDS45 VEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQL
           2350      2360      2370      2380      2390      2400  

         2810      2820         2830         2840       2850       
pF1KA0 HWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQETKG-
         ::.::.   : :..:. . .   : :.   :...:  ::.... :    .   :: : 
CCDS45 TCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPGV
           2410       2420      2430      2440      2450      2460 

        2860      2870      2880      2890      2900      2910     
pF1KA0 -DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNF
        :  . ... :::: :.. ::::::::  :  :  : :: :.::::.: :::.:.:::::
CCDS45 YDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNF
            2470      2480      2490      2500      2510      2520 

        2920      2930      2940      2950      2960      2970     
pF1KA0 ERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSY
       ..::.:.:.  .:: : :       .: .:..:::.::.  . . .    : : .. .  
CCDS45 KKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQTTVD
            2530      2540           2550      2560       2570     

        2980      2990      3000      3010      3020      3030     
pF1KA0 SGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGS
        :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : :   .      .. ...::.  .:  
CCDS45 RGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-KIGKL
        2580      2590      2600      2610       2620       2630   

        3040      3050      3060      3070      3080       3090    
pF1KA0 RKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGCVKGI
       .::. . :.   : ..  :...   ..:::::.:      ..:. :  .  . :::.:..
CCDS45 QKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGIPI-----AIRERFNISTPAFRGCMKNL
          2640         2650      2660           2670      2680     

         3100      3110      3120      3130      3140       3150   
pF1KA0 KALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYSGFGF
       :  .  : :.  .:.::.  :. :  . :. .:   :  .:...... : : .. ..:::
CCDS45 KKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQASFGF
        2690        2700      2710      2720        2730      2740 

          3160      3170      3180         3190      3200      3210
pF1KA0 HSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAFYSNA
       .. : :..:  . .     ::.:..: . :.   .     :.   . ::  :::.  :. 
CCDS45 QTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSVISDN
            2750      2760      2770      2780      2790      2800 

             3220      3230      3240      3250      3260      3270
pF1KA0 TGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRL
       .:. : .:::: . . .      :.    .   : :::        :: :::::::::::
CCDS45 SGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVFVQRL
            2810            2820      2830             2840        

              3280      3290          3300      3310      3320     
pF1KA0 -LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPARH
        :.:. :.:: .:  . .:: : :.   : .     :    .   : :  .  .  :.  
CCDS45 SLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTPVAS
     2850       2860      2870      2880      2890      2900       

                3330      3340      3350        3360      3370     
pF1KA0 P--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVLPRSS
       :        ::   :. .... . :::   .::: :     : . :.  ...:..   ::
CCDS45 PRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT--SS
      2910      2920      2930      2940      2950      2960       

        3380      3390      3400      3410      3420      3430     
pF1KA0 RGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKN
       :::.. :.     .  .::.::.:..:  .   : .:: .:...   :.:: :    . .
CCDS45 RGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDGE
        2970         2980      2990      3000      3010      3020  

        3440      3450      3460      3470      3480      3490     
pF1KA0 RILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCVKRLR
       .  ::.:: ::     :  .  . . :    ...:. : :.. ..:: : .: ::.: ..
CCDS45 KGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCLKNFQ
           3030      3040          3050       3060       3070      

        3500      3510      3520      3530      3540      3550     
pF1KA0 LHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVT
       : ..:: .:.   ::. :. :::: :..:   :: ..:       :.  : . .:: ..:
CCDS45 LDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSLT
       3080      3090      3100      3110      3120      3130      

        3560      3570             3580      3590      3600        
pF1KA0 GLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLAVMKS
       :...:.:   . :  .: : :.:       :.:::  :::::  . ::::::: .::  .
CCDS45 GILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIK
       3140         3150      3160      3170      3180      3190   

     3610      3620      3630      3640      3650        3660      
pF1KA0 GNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRRLAVN
        ..:.::.:..:..:.: .    :..  ::.::: :  ...   :   .. ::.: . ::
CCDS45 QHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHVN
          3200      3210      3220      3230      3240      3250   

       3670      3680      3690
pF1KA0 RSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
       . :: .:...::.: :. .:::  
CCDS45 HIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
          3260      3270       

>>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (3333 aa)
 initn: 5885 init1: 1705 opt: 2681  Z-score: 1535.2  bits: 299.2 E(32554): 3.4e-79
Smith-Waterman score: 8908; 39.8% identity (64.3% similar) in 3735 aa overlap (8-3688:9-3331)

                10         20        30           40        50     
pF1KA0  MAKRLCAGSALCVRGPR-GPAPLLLVGLALLGA--ARAREE-AGGGFSLHPPYFNLAEG
               : ::   ::   :.::::. : .: :  : ::.  :..:.:::: ::::::.
CCDS42 MAAAARPRGRAL---GPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEA
               10           20        30        40        50       

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA0 ARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAH
       ::: :.:::::..:..: :.:  .:::::::::.: :. ..::.::.:: :.. .  :::
CCDS42 ARIWATATCGERGPGEGRPQP--ELYCKLVGGPTAPGS-GHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH
        60        70          80        90        100       110    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA0 PASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERS
       :..:::::.:::::::::: : .::.::.::::::.:::::.::::::::::::::::::
CCDS42 PVTNAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERS
          120       130       140       150       160       170    

         180       190       200       210       220       230     
pF1KA0 MDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLV
       .::: ::.:::.:: :: :::..:: ..   .:::: ..:.:::::::::::::.::::.
CCDS42 VDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI
          180       190       200       210       220       230    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KA0 NGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDIS
       :::::: ::..:  :::::::::.::::::::::::::..:: :::::::::::::::::
CCDS42 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSIKDIS
          240       250       260       270       280       290    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KA0 IGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANE
       :::.:::.:::..:. ..:   ::  : :::.::: :::::: :.::. :.::. ....:
CCDS42 IGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFR--CECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQSHE
          300       310         320       330       340       350  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KA0 CQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRS
       :..:::.:::..:::::.:.:..:: . .: : ::::::.:::.:.:::::.:  :.:: 
CCDS42 CEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGYYRP
            360       370       380       390       400       410  

         420       430       440       450       460       470     
pF1KA0 PNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTP
        . :.:.:  :  :.:. . .:: ::. .:::.:.::: :. :. :: :. .:: :   :
CCDS42 YGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADG-CEQGSGRCHCKPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCLRIP
            420       430        440       450       460       470 

         480       490       500       510       520       530     
pF1KA0 SSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYG
                ..:.                                               
CCDS42 ---------IFPV-----------------------------------------------
                                                                   

         540       550       560       570       580       590     
pF1KA0 PGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTL
               :.:.      :: .:. .      :                  : :.  :.:
CCDS42 --------STPSSE----DPVAGDIK------G------------------CDCNLEGVL
                 480                 490                           

         600       610       620       630       640       650     
pF1KA0 PEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPG
       :: ::  :::::.:   ::.:: :: :...:: :::: :                     
CCDS42 PEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWC---------------------
     500       510       520       530                             

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA0 YTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAY
                               :: :: .  :.  .::: ::: ::: ::: :. :::
CCDS42 ------------------------SALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAY
                              540       550       560       570    

         720         730       740       750       760       770   
pF1KA0 NFPYCEAGS--CHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGC
       .::.:...:  : :::   ..  :      :.:. :::::.:.:::  .:.:.  :: ::
CCDS42 DFPHCQGSSSACDPAGT--INSNLGY----CQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGC
          580       590             600       610       620        

           780       790       800       810       820       830   
pF1KA0 TRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDI
       ..:.:   ::..:..::. : :.: :: :: :..: .:.::.:.:....::::..:.:::
CCDS42 SECKCHKAGTVSGTGECRQGDGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDI
      630       640       650       660       670       680        

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 GGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGF
       ::::.. :   .:::.:: .. : .:..:  ..:.:::::.. :.:...::.:. .::::
CCDS42 GGALSSMCSGPSGVCQCREHVVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGF
      690       700       710       720       730       740        

           900       910       920         930       940       950 
pF1KA0 NPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNL--TSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREE
       .:: : .:::::::::. ::  .   ::.  .: .:: ...:::: :. .:::....   
CCDS42 DPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPS
      750       760       770       780       790       800        

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KA0 GRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVV
         .:       ::. . : :: ::::.:::  ::..:: ..:: :.  ..::::::::.:
CCDS42 WGAA-------QSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLV
      810              820       830       840       850       860 

            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KA0 LLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSL
       :::  ::::..::: ::: :.:    :.   ::::: :::.  :: . . ::     .. 
CCDS42 LLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQE---NCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGE
             870       880          890       900       910        

            1080      1090      1100      1110      1120      1130 
pF1KA0 PRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTP
       :::  ..: .:.:: ..  .: .:...:.. .:: :.:..::::..: :.  : : :.. 
CCDS42 PRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLFV-VDVNVK
      920       930       940       950       960       970        

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KA0 QRAP-QQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLV
       . .    : .... : ::.:::... : ....:...: ..:...: ...:::.:: : ..
CCDS42 SSGSVLAGQVNIYSCNYSVLCRSAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCII
       980       990      1000      1010      1020      1030       

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KA0 PIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTH
       :::::: :.:.:.: ::.:.: :  .::.:.      ::  .::   .:.    : :. :
CCDS42 PIEEFSAEYVRPQVHCIASYGRFVNQSATCVSLAHETPPTALIL---DVL---SGRPFPH
      1040      1050      1060      1070      1080            1090 

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KA0 AQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAH
            : .:       : . : : .    :. ::  :..  .:: ::::.:..: :: ::
CCDS42 ----LPQQSS------PSVDVLPGVT---LKAPQNQVTLRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAH
                      1100         1110      1120      1130        

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA0 PTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRW
       ::::..: ...:    :  .::::::  :::  :. :::  .:... :...::.::::. 
CCDS42 PTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEGQIEFDISEPEVAATVKVPEGKS
     1140      1150      1160      1170      1180      1190        

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KA0 LWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLF
       : :  ::::: . :..  :... .::: .::..:. ......:...: ::.:.: ::  :
CCDS42 LVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNSFYLDPQTASRFCKNSARSLVAF
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KA0 YNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARL
       :..:: :: :: .::::: : : ::::::. .::::.:.:::::..::: :.::.:: ::
CCDS42 YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIGRQCTRCATGHYGFPRCKPCSCGRRL
     1260      1270      1280      1290      1300      1310        

             1500      1510      1520      1530      1540      1550
pF1KA0 CDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQC
       :.:.:::: :::::. :.: .:. ..:. ::..::: ::::  :  : . : :: :::::
CCDS42 CEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQC
     1320      1330      1340      1350      1360      1370        

             1560      1570      1580      1590      1600      1610
pF1KA0 KCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQC
       .:.: .:::.:: :. ::. .:.: ::.:.. :: :::::: :: : :::::.: .:. :
CCDS42 RCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVC
     1380      1390      1400      1410      1420      1430        

             1620      1630      1640      1650      1660      1670
pF1KA0 SLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPG
         :.: :: :: :::: :::::....:.::   : .:::: :: : ..::  .:   .::
CCDS42 REGSFHLDPANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWHLETADRVDIPVSFNPG
     1440      1450      1460      1470      1480      1490        

             1680      1690      1700      1710      1720      1730
pF1KA0 TEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPME
       .. . :::...: ..  :     : :: :::::.:::::: : :. .:    ::. : .:
CCDS42 SNSMVADLQELPATIHSA----SWVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDM-VLLE
     1500      1510          1520      1530      1540       1550   

             1740      1750      1760      1770      1780      1790
pF1KA0 SRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASL
       ..::: : :..::: . :   : : ..:.:....:::::::. .:  ::::::: ::. :
CCDS42 KKPDVQLTGQHMSIIYEETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRL
          1560      1570      1580      1590      1600      1610   

             1800      1810      1820      1830      1840      1850
pF1KA0 EQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFY
        ...:..:.   .. ..: .:.:: :: .:.: .:  ::.: :: .: ::::: :.::.:
CCDS42 ADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYY
          1620      1630      1640      1650      1660      1670   

             1860      1870      1880      1890      1900      1910
pF1KA0 RDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPC
       :: :::. ::::::.:.:::..:  :::.::.::::: : :::::: :....    :  :
CCDS42 RDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS--C
          1680      1690      1700      1710      1720      1730   

             1920      1930      1940      1950      1960      1970
pF1KA0 VSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD
        .::::    .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.::::  .:.:::::.
CCDS42 RACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS
               1740      1750      1760      1770      1780        

             1980      1990      2000      2010      2020      2030
pF1KA0 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT
       :..::.    ...: ::::                                  ::     
CCDS42 CNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCIN---
     1790          1800                                            

             2040      2050      2060      2070      2080      2090
pF1KA0 EACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC
                               ::            :   .:: :             
CCDS42 ------------------------QE------------PKDSSPAEE-------------
                                          1810                     

             2100      2110      2120      2130      2140      2150
pF1KA0 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ
                                                                   
CCDS42 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             2160      2170      2180      2190      2200      2210
pF1KA0 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA
                    :. :: ::. ::.::   :  :  .. ::.:..::.    .......
CCDS42 -------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMRHMET
                  1820      1830      1840      1850      1860     

                2220      2230      2240      2250      2260       
pF1KA0 SIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAG
       .  ::..::   :: .. :   ....: ::.. :.:.:. . :  .:  .  .:. :  .
CCDS42 QAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNN
        1870      1880         1890      1900      1910      1920  

      2270      2280      2290       2300      2310      2320      
pF1KA0 TEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQ-TGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEM
       .. .   :: : . :. : :..  :..: .:  : .: ..:::. . :  ::..:.. :.
CCDS42 VNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGEGN-NVPSGD-FSREWAEAQRMMREL
           1930      1940      1950       1960       1970      1980

       2330      2340      2350      2360      2370      2380      
pF1KA0 RARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLRE
       : :..:     :::.   .: :: :..   ..   ::..::.. :: : ..:: : ::: 
CCDS42 RNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRA
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

       2390      2400      2410       2420      2430      2440     
pF1KA0 ALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLH
        :..:.  ...:. ::..: ::   :.::. .:..  .. .   : .: ..: ..   :.
CCDS42 RLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIALQ
             2050       2060      2070      2080      2090         

        2450      2460      2470      2480      2490      2500     
pF1KA0 SLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSI
        ......: :.:::::. ::  : .... .: ...:  ::: :: ::..: .:: .:  :
CCDS42 LMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQLEEI
    2100      2110      2120      2130      2140      2150         

        2510      2520      2530      2540      2550      2560     
pF1KA0 ILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQL
         ... :.:.. :..:..::  ::.:..::::::..: . .. .  ::... :  .:. :
CCDS42 KRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKAKTL
    2160      2170      2180      2190      2200      2210         

        2570       2580      2590      2600      2610       2620   
pF1KA0 LANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AMDTD
        .::  : .:: . ...    :  ::.. .  :  : ..:. ..... . .  : ...  
CCDS42 SSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQRG
    2220      2230      2240      2250      2260      2270         

          2630      2640      2650      2660      2670      2680   
pF1KA0 ETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSV
       . .  :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: .  :   ...:. .:. :: .::
CCDS42 DIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSV
    2280      2290      2300      2310      2320      2330         

          2690      2700      2710      2720      2730      2740   
pF1KA0 STLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRS
       . : . ::.:  :.  .... .  ...  : .. :.:::: ::: ::::: :::.:::.:
CCDS42 NKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKS
    2340      2350      2360        2370      2380      2390       

          2750      2760      2770      2780      2790      2800   
pF1KA0 GVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKK
       ::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... : .
CCDS42 GVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQ
      2400      2410      2420      2430      2440      2450       

          2810      2820         2830         2840       2850      
pF1KA0 VHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQETKG
       .  ::.::.   : :..:. . .   : :.   :...:  ::.... :    .   :: :
CCDS42 LTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPG
      2460       2470      2480      2490      2500      2510      

         2860      2870      2880      2890      2900      2910    
pF1KA0 --DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYN
         :  . ... :::: :.. ::::::::  :  :  : :: :.::::.: :::.:.::::
CCDS42 VYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYN
       2520      2530      2540      2550      2560      2570      

         2920      2930      2940      2950      2960      2970    
pF1KA0 FERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVS
       :..::.:.:.  .:: : :       .: .:..:::.::.  . . .    : : .. . 
CCDS42 FKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQTTV
       2580      2590           2600      2610       2620      2630

         2980      2990      3000      3010      3020      3030    
pF1KA0 YSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGG
         :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : :   .      .. ...::.  .: 
CCDS42 DRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-KIGK
             2640      2650      2660      2670       2680         

         3040      3050      3060      3070      3080       3090   
pF1KA0 SRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGCVKG
        .::. . :.   : ..  :...   ..:::::.:      ..:. :  .  . :::.:.
CCDS42 LQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGIPI-----AIRERFNISTPAFRGCMKN
     2690         2700      2710      2720           2730      2740

          3100      3110      3120      3130      3140       3150  
pF1KA0 IKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYSGFG
       .:  .  : :.  .:.::.  :. :  . :. .:   :  .:...... : : .. ..::
CCDS42 LKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQASFG
             2750        2760      2770        2780      2790      

           3160      3170      3180         3190      3200         
pF1KA0 FHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAFYSN
       :.. : :..:  . .     ::.:..: . :.   .     :.   . ::  :::.  :.
CCDS42 FQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSVISD
       2800      2810      2820      2830      2840      2850      

    3210      3220      3230      3240      3250      3260         
pF1KA0 ATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQR
        .:. : .:::: . . .      :.    .   : :::        :: ::::::::::
CCDS42 NSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVFVQR
       2860      2870            2880             2890      2900   

    3270       3280      3290          3300      3310      3320    
pF1KA0 L-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPAR
       : :.:. :.:: .:  . .:: : :.   : .     :    .   : :  .  .  :. 
CCDS42 LSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTPVA
           2910      2920      2930      2940      2950      2960  

                 3330      3340      3350        3360      3370    
pF1KA0 HP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVLPRS
        :        ::   :. .... . :::   .::: :     : . :.  ...:..   :
CCDS42 SPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT--S
           2970      2980      2990      3000      3010        3020

         3380      3390      3400      3410      3420      3430    
pF1KA0 SRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEK
       ::::.. :.     .  .::.::.:..:  .   : .:: .:...   :.:: :    . 
CCDS42 SRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDG
             3030         3040      3050      3060      3070       

         3440      3450      3460      3470      3480      3490    
pF1KA0 NRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCVKRL
       ..  ::.:: ::     :  .  . . :    ...:. : :.. ..:: : .: ::.: .
CCDS42 EKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCLKNF
      3080      3090      3100          3110       3120       3130 

         3500      3510      3520      3530      3540      3550    
pF1KA0 RLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAV
       .: ..:: .:.   ::. :. :::: :..:   :: ..:       :.  : . .:: ..
CCDS42 QLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSL
            3140      3150      3160      3170      3180      3190 

         3560      3570             3580      3590      3600       
pF1KA0 TGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLAVMK
       ::...:.:   . :  .: : :.:       :.:::  :::::  . ::::::: .::  
CCDS42 TGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTI
               3200      3210      3220      3230      3240        

      3610      3620      3630      3640      3650        3660     
pF1KA0 SGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRRLAV
       . ..:.::.:..:..:.: .    :..  ::.::: :  ...   :   .. ::.: . :
CCDS42 KQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHV
     3250      3260      3270      3280      3290      3300        

        3670      3680      3690
pF1KA0 NRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
       :. :: .:...::.: :. .:::  
CCDS42 NHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
     3310      3320      3330   

>>CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (1724 aa)
 initn: 1764 init1: 673 opt: 1743  Z-score: 1004.8  bits: 200.1 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 2841; 32.3% identity (58.5% similar) in 1917 aa overlap (1818-3688:40-1722)

      1790      1800      1810      1820       1830      1840      
pF1KA0 ASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGAL-ASNVELCLCPASYRGDSCQECA
                                     : ::. : :: ::       .: .  : :.
CCDS11 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVE-------FRPS--QGCS
      10        20        30        40        50                 60

       1850      1860      1870      1880      1890      1900      
pF1KA0 PGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDP
       ::.::: :::. ::::::.:.:::..:  :::.::.::::: : :::::: :....    
CCDS11 PGYYRDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG
               70        80        90       100       110       120

       1910      1920      1930      1940      1950      1960      
pF1KA0 SAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSC
       :  : .::::    .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.::::  .:.::
CCDS11 S--CRACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSC
                   130       140       150       160       170     

       1970      1980      1990      2000      2010      2020      
pF1KA0 QPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCT
       :::.:..::.    ...: ::::                                  :: 
CCDS11 QPCSCNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCI
         180           190                                         

       2030      2040      2050      2060      2070      2080      
pF1KA0 PCGTEACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSG
                                   ::            :   .:: :         
CCDS11 N---------------------------QE------------PKDSSPAEE---------
                                  200                              

       2090      2100      2110      2120      2130      2140      
pF1KA0 QCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCS
                                                                   
CCDS11 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       2150      2160      2170      2180      2190      2200      
pF1KA0 QQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLH
                        :. :: ::. ::.::   :  :  .. ::.:..::.    ...
CCDS11 -----------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR
                      210       220       230       240       250  

       2210         2220      2230      2240      2250      2260   
pF1KA0 RLNASIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQ
       .....  ::..::   :: .. :   ....: ::.. :.:.:. . :  .:  .  .:. 
CCDS11 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQT
            260       270          280       290       300         

          2270      2280      2290       2300      2310      2320  
pF1KA0 LLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQ-TGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERL
       :  ... .   :: : . :. : :..  :..: .:  : .: ..:::. . :  ::..:.
CCDS11 LNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGEGN-NVPSGD-FSREWAEAQRM
     310       320       330       340       350         360       

           2330      2340      2350      2360      2370      2380  
pF1KA0 LWEMRARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLM
       . :.: :..:     :::.   .: :: :..   ..   ::..::.. :: : ..:: : 
CCDS11 MRELRNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLS
       370       380       390       400       410       420       

           2390      2400      2410       2420      2430      2440 
pF1KA0 DLREALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVF
       :::  :..:.  ...:. ::..: ::   :.::. .:..  .. .   : .: ..: .. 
CCDS11 DLRARLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTN
       430       440       450        460       470       480      

            2450      2460      2470      2480      2490      2500 
pF1KA0 RLLHSLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALN
         :. ......: :.:::::. ::  : .... .: ...:  ::: :: ::..: .:: .
CCDS11 IALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQ
        490       500       510       520       530       540      

            2510      2520      2530      2540      2550      2560 
pF1KA0 LSSIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDR
       :  :  ... :.:.. :..:..::  ::.:..::::::..: . .. .  ::... :  .
CCDS11 LEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRK
        550       560       570       580       590       600      

            2570       2580      2590      2600      2610          
pF1KA0 AQQLLANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-A
       :. : .::  : .:: . ...    :  ::.. .  :  : ..:. ..... . .  : .
CCDS11 AKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHG
        610       620       630       640       650       660      

    2620      2630      2640      2650      2660      2670         
pF1KA0 MDTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDA
       ..  . .  :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: .  :   ...:. .:. ::
CCDS11 IQRGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDA
        670       680       690       700       710       720      

    2680      2690      2700      2710      2720      2730         
pF1KA0 GHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKF
        .::. : . ::.:  :.  .... .  ...  : .. :.:::: ::: ::::: :::.:
CCDS11 DNSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRF
        730       740       750         760       770       780    

    2740      2750      2760      2770      2780      2790         
pF1KA0 NGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSL
       ::.:::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:...
CCDS11 NGKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAV
          790       800       810       820       830       840    

    2800      2810      2820         2830         2840       2850  
pF1KA0 RDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQ
        : ..  ::.::.   : :..:. . .   : :.   :...:  ::.... :    .   
CCDS11 VDGQLTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKP
          850        860       870       880       890       900   

             2860      2870      2880      2890      2900      2910
pF1KA0 ETKG--DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVV
       :: :  :  . ... :::: :.. ::::::::  :  :  : :: :.::::.: :::.:.
CCDS11 ETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVL
           910       920       930       940       950       960   

             2920      2930      2940      2950      2960      2970
pF1KA0 SLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQEL
       :::::..::.:.:.  .:: : :       .: .:..:::.::.  . . .    : : .
CCDS11 SLYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTI
           970       980            990      1000       1010       

             2980      2990      3000      3010      3020      3030
pF1KA0 RLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVF
       . .   :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : :   .      .. ...::. 
CCDS11 QTTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-
      1020      1030      1040      1050      1060       1070      

             3040      3050      3060      3070      3080          
pF1KA0 LLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRG
        .:  .::. . :.   : ..  :...   ..:::::.     : ..:. :  .  . ::
CCDS11 KIGKLQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGI-----PIAIRERFNISTPAFRG
        1080         1090      1100      1110           1120       

    3090      3100      3110      3120      3130      3140         
pF1KA0 CVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVY
       :.:..:  .  : :.  .:.::.  :. :  . :. .:   :  .:...... : : .. 
CCDS11 CMKNLKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQ
      1130      1140        1150      1160        1170      1180   

     3150      3160      3170      3180         3190      3200     
pF1KA0 SGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVA
       ..:::.. : :..:  . .     ::.:..: . :.   .     :.   . ::  :::.
CCDS11 ASFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVS
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

        3210      3220      3230      3240      3250      3260     
pF1KA0 FYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNV
         :. .:. : .:::: . . .      :.    .   : :::        :: ::::::
CCDS11 VISDNSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNV
          1250      1260            1270      1280             1290

        3270       3280      3290          3300      3310      3320
pF1KA0 FVQRL-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSR
       ::::: :.:. :.:: .:  . .:: : :.   : .     :    .   : :  .  . 
CCDS11 FVQRLSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQD
             1300       1310      1320      1330      1340         

                     3330      3340      3350        3360      3370
pF1KA0 QPARHP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHV
        :.  :        ::   :. .... . :::   .::: :     : . :.  ...:..
CCDS11 TPVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQT
    1350      1360      1370      1380      1390      1400         

             3380      3390      3400      3410      3420      3430
pF1KA0 LPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSV
          :::::.. :.     .  .::.::.:..:  .   : .:: .:...   :.:: :  
CCDS11 T--SSRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVF
    1410        1420         1430      1440      1450      1460    

             3440      3450      3460      3470      3480      3490
pF1KA0 RWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGC
         . ..  ::.:: ::     :  .  . . :    ...:. : :.. ..:: : .: ::
CCDS11 GHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGC
         1470      1480      1490          1500       1510         

             3500      3510      3520      3530      3540      3550
pF1KA0 VKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVR
       .: ..: ..:: .:.   ::. :. :::: :..:   :: ..:       :.  : . .:
CCDS11 LKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIR
     1520      1530      1540      1550      1560      1570        

             3560      3570             3580      3590      3600   
pF1KA0 PLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRL
       : ..::...:.:   . :  .: : :.:       :.:::  :::::  . ::::::: .
CCDS11 PRSLTGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSV
     1580      1590         1600      1610      1620      1630     

          3610      3620      3630      3640      3650        3660 
pF1KA0 AVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMR
       ::  . ..:.::.:..:..:.: .    :..  ::.::: :  ...   :   .. ::.:
CCDS11 AVTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLR
        1640      1650      1660      1670      1680      1690     

            3670      3680      3690
pF1KA0 RLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
        . ::. :: .:...::.: :. .:::  
CCDS11 NIHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
        1700      1710      1720    

>>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18            (3075 aa)
 initn: 2084 init1: 520 opt: 1432  Z-score: 825.2  bits: 167.7 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 3083; 25.3% identity (49.1% similar) in 3816 aa overlap (22-3688:5-3071)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
                            .::: : :  ::. :...     : :  .::: .:.:..
CCDS32                  MRGGVLLV-LLLCVAAQCRQRG-----LFPAILNLASNAHIST
                                 10        20             30       

               70        80        90       100         110        
pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDIC--TAANSNKAHPAS
       .:::::..:         ...::::        :.. .:.  : ::  ..::  . :: :
CCDS32 NATCGEKGP---------EMFCKLVEHV-----PGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPIS
        40                 50             60        70        80   

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA0 NAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDF
       .:::::. ::::: .. : ::. :..:::: :::.::::.:: ::.:::  :.::::.: 
CCDS32 HAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD-
            90       100       110       120       130       140   

      180       190             200       210       220       230  
pF1KA0 GRTYQPWQFFASSKRDCLERF------GPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVV
       : :..:::..: :  .:: :.      :: : .    :: .:::. :::.::::.::: .
CCDS32 GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRA---DDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHT
            150       160       170          180       190         

            240       250       260       270            280       
pF1KA0 SLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALR-----DPTVTRRY
       ::.::::.: ..:  : : :::.:  .:::. :  :: . ::  . :     :: :::::
CCDS32 SLINGRPSADDLS--PKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRY
     200       210         220       230       240       250       

       290       300       310       320       330       340       
pF1KA0 YYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKP
       ::::::::.:: :.:.:::..:   . :   .::: :.::::: .:.:::::..::::.:
CCDS32 YYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTK--KLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRP
       260       270       280         290       300       310     

       350       360       370       380       390       400       
pF1KA0 ATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCER
       .:..:.: :..:::...: :::::  : ... : .  : ..::::::.: ..: :.::: 
CCDS32 GTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCET
         320       330       340       350       360       370     

       410       420       430       440       450       460       
pF1KA0 CLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTG
       :. :.:: : : . ::.                ::      :::                
CCDS32 CIDGYYR-P-HKV-SPY----------------EDEP----CRP----------------
         380                          390                          

       470       480       490       500       510       520       
pF1KA0 FPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCE
                                 :.:. .:. ...: ::               : .
CCDS32 --------------------------CNCDPVGSLSSVCIKD-------------DLHSD
                                  400       410                    

       530       540       550       560       570       580       
pF1KA0 LCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLC
       :        : ::                 ::: :. :. :  ::::  ::  .: :  :
CCDS32 LHN------GKQP-----------------GQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSC
       420                              430       440       450    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KA0 GCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAG
       ::.:.:.   . ::                                              
CCDS32 GCNPVGS---ASDE----------------------------------------------
          460                                                      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KA0 GLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRC
                                   ::                         ::   
CCDS32 ----------------------------PC-------------------------TG---
                                                                   

       710       720       730       740       750       760       
pF1KA0 DTCVPGAYNFPYCEAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSP
                                          ::.:. .::: .::::::::..:. 
CCDS32 -----------------------------------PCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKE
                                        470       480       490    

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA0 SNPEGCTRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCR
       .::.::..: :       ::..       :       ::.  .  .:..  :  .     
CCDS32 KNPRGCSECFC------FGVSDV------CSSLSWPVGQV--NSMSGWLVTDLISPRKIP
          500             510             520         530       540

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA0 SCRCDIGGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGH
       : .  .::    : .  . . :  :.            .:              :.::..
CCDS32 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPK------------YYW-------------AAPEAY
              550       560                                570     

       890       900       910       920       930       940       
pF1KA0 AMRFGFNPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVS
          .: .   : .:     .   ::.                     :. . ::  . : 
CCDS32 ---LGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVET--------------------VDSNLMS-HADVI
            580       590                           600        610 

       950       960       970       980       990       1000      
pF1KA0 VREEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFV-LNPGTWALRVEAEGVL
       .. .: . .     .:.. ... :  :  ...:  :   : :  ..      : .   ::
CCDS32 IKGNGLTLS-----TQAEGLSLQPYEE--YLNVV-RLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVL
             620            630          640       650       660   

       1010      1020      1030      1040      1050      1060      
pF1KA0 LDYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCR
        . . ::  : :..: . :   :. .   ..... :  .            :: .:  :.
CCDS32 ANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVV------------AADVEH-CE
           670       680       690       700                    710

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KA0 QDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGV
               ::              ::.. .  :.      : : .       :.    :.
CCDS32 --------CPQGY-----------TGTSCESCLS------GYYRV-------DGILFGGI
                                 720             730               

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KA0 AVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHG
                       .::     :.: :             .: .:           ::
CCDS32 C---------------QPCE----CHGHA-------------AECNV-----------HG
                     740                        750                

       1190      1200      1210      1220      1230      1240      
pF1KA0 VTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGL
       :                ..:  .:.. : .   :::. . .: .     :::    : . 
CCDS32 VC---------------IAC--AHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTP-GDCQ----PCAC
                        760         770       780            790   

       1250      1260      1270      1280      1290      1300      
pF1KA0 PLTHAQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGY
       ::: :..    .::.          : :        :  . ..        : :    ::
CCDS32 PLTIASN---NFSPTCHLN------DGDEVVCDWCAPGYSGAWCE------RCA---DGY
           800                810       820             830        

       1310      1320         1330       1340      1350      1360  
pF1KA0 QPAHPTFPVEVLIN---AGRVWQGHANASFCPHGYG-CRTLVVCEGQALLDVTHSELTVT
         ..:: : :  .    .: :    ..:. :    : :   . : :..  : .: :    
CCDS32 Y-GNPTVPGESCVPCDCSGNV--DPSEAGHCDSVTGEC---LKCLGNT--DGAHCE----
          840       850         860       870            880       

           1370      1380      1390      1400      1410      1420  
pF1KA0 VRVPEGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRN
        :  .:  .. : : .  .:  .     :  .  :.. . :  .     .:. ..  : .
CCDS32 -RCADG--FYGDAVTA--KNCRAC----ECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQ
              890         900           910       920       930    

            1430      1440      1450      1460      1470      1480 
pF1KA0 AAASL-SLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPN-
          .  .:  ..: :::.:  .:...  :   : :: :   : :. :.::: :.... . 
CCDS32 CLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEG-QCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDG
          940       950       960        970       980       990   

                1490      1500      1510      1520      1530       
pF1KA0 -CRPCDCG--ARLCDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQE
        : ::::      ::  ::.:.:::.:    :  :.   .:    :::. ::::  :   
CCDS32 SCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVG---
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

      1540      1550      1560      1570      1580      1590       
pF1KA0 LTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCD-------
        :   ::. .:.:.:. .  :: :: :: :.. .: : ::::   ::.  .:.       
CCDS32 STHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCG
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

               1600      1610      1620      1630       1640       
pF1KA0 --PLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRS-SSYTRQEF
           :: : ::::: ::.:..:  :::.: : :: ::. ::: : .. :    .:.:   
CCDS32 CVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPV
             1120      1130      1140      1150      1160      1170

      1650      1660      1670      1680         1690      1700    
pF1KA0 VDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPE---AFPELYWQAPPSYLGDR
       .      :: .  :   .    :. .   :.     .: .   : : .::. : .. ::.
CCDS32 TLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEP-FYWRLPQQFQGDQ
             1180      1190      1200      1210       1220         

         1710      1720      1730      1740        1750      1760  
pF1KA0 VSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGNQM--SITFLEPAYPTPGHVHRGQL
       . .::: :.: .   .  :     .:  :.:...:...  .. ...   :  :  .. ..
CCDS32 LMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFE--PQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEV
    1230      1240      1250        1260      1270      1280       

           1770        1780      1790      1800      1810          
pF1KA0 QLVEGNFRH--TETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPA-
        . :. ...  . ... :.::..: ::...: . :.: ..:  .   .  ...::.  : 
CCDS32 AMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAE
      1290      1300      1310      1320      1330      1340       

       1820      1830      1840      1850              1860        
pF1KA0 ---GQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDV------KGL--FLGRCVPCQCHG
           .  .:: .: :.:: .  : :::.::::..:        .:   ... ::::.:..
CCDS32 KLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNN
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

     1870      1880      1890      1900      1910      1920        
pF1KA0 HSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGC
       ::: : :..: :..:  :: : ::. : .:....    .. :. : :: : :.. :.  :
CCDS32 HSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPPAS-FSPTC
      1410      1420      1430      1440      1450      1460       

     1930        1940      1950      1960      1970      1980      
pF1KA0 VLRGGRT-QC-LCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDP
       ::.: .  .:  :  :: :  ::::. ...::: . :.::: :::. .:.          
CCDS32 VLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGS----------
       1470      1480      1490      1500      1510                

       1990      2000      2010      2020      2030      2040      
pF1KA0 LTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPRSGHCLCKAGV
                               .:.                   ::  ::.:.:. :.
CCDS32 -----------------------VHGD-------------------CDRTSGQCVCRLGA
                              1520                         1530    

       2050      2060      2070      2080      2090      2100      
pF1KA0 TGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGY
       .: :::.:.  :.                                               
CCDS32 SGLRCDECEPRHI-----------------------------------------------
         1540                                                      

       2110      2120      2130      2140      2150      2160      
pF1KA0 WGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEV
         : :  :  :.                                                
CCDS32 --LMETDCVSCD------------------------------------------------
        1550                                                       

       2170      2180      2190      2200      2210      2220      
pF1KA0 CDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLRSPLGPH
        :.:: .::.::.. :  . ...  : ::    . .. :  :. .   :: .: .    .
CCDS32 -DECVGVLLNDLDEIGDAVLSLN--LTGII--PVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQK
       1560      1570        1580        1590      1600      1610  

       2230      2240      2250      2260      2270      2280      
pF1KA0 HETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVD
            .:: . ... .: .   :.    ... .....   .::  . ... :  ::. ..
CCDS32 DLGKIKLEGVAEETDNLQKKLTRM----LASTQKVNR---ATERIFKESQDLAIAIERLQ
           1620      1630          1640         1650      1660     

       2290             2300      2310      2320      2330         
pF1KA0 RTLSELMSQTG-------HLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAE
        ...:.: .:         . : :..  . .:   .: :.      :. ::.   .  : 
CCDS32 MSITEIMEKTTLNQTLDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEI------MQIRDFTQLHQNAT
        1670      1680      1690      1700            1710         

    2340      2350      2360      2370      2380      2390         
pF1KA0 AELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDAT-REA
        :: ::. ::...::. ..  :: ..:   .   :..:.  :    ::: : ..:  .:.
CCDS32 LELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVLSKHNNEL-KAAEALVREAEAKMQES
    1720      1730      1740      1750      1760       1770        

     2400          2410        2420       2430      2440      2450 
pF1KA0 QEL----NSRNQERLEEAL--QRKQELSRDNATL-QATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAK
       ..:    :.  .:  .. :  :..:.:. .  .  .. . ::     .:   :. :.. .
CCDS32 NHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQ
     1780      1790      1800      1810      1820      1830        

            2460      2470      2480      2490      2500      2510 
pF1KA0 EELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQ
       ..:   .:..      :...:.  . .     ::  :: :: .. .::  : : . .. .
CCDS32 DKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVD----LVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRN
     1840      1850      1860          1870      1880      1890    

            2520      2530      2540      2550      2560      2570 
pF1KA0 DRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTA
         :.  :  :. ..  : . .. .:. : .: . . .:  ... ..::. ..  .  :. 
CCDS32 VSLN--ATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTET--SLLSESLVSNGKAAVQRSSR
           1900      1910      1920      1930        1940      1950

            2580        2590      2600      2610      2620         
pF1KA0 LEEAMLQEQQRLG--LVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETS--K
       .    :.: . :.  :   ::. .. . .  : ... .:   :. ...: . .   .   
CCDS32 F----LKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRD
                 1960      1970      1980      1990      2000      

      2630      2640      2650      2660               2670        
pF1KA0 KIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYE----GLRG-----QDLGQAVLD
       : :..: .:. :...:. .  .. ......   ...       ::      ::  .:.: 
CCDS32 KGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLL
       2010      2020      2030      2040      2050      2060      

     2680      2690      2700      2710      2720      2730        
pF1KA0 AGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMK
       ::..:. .:     :. .:. :.          :: ...... ::.:::  :...:: ..
CCDS32 AGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKM-----LEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVS
       2070      2080      2090           2100      2110      2120 

     2740      2750      2760      2770      2780      2790        
pF1KA0 FNGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVS
        . :. ..   :.   . . :..: . ..  ::       : ...:.::  :. :...: 
CCDS32 AD-RDCIRAYQPQ--ISSTNYNTLTLNVKTQEP-------DNLLFYLGSSTAS-DFLAVE
             2130        2140      2150             2160       2170

     2800      2810      2820       2830      2840      2850       
pF1KA0 LRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE-KFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGD
       .:  .: ....:: ..  .   :  : . .. .. . :  ..: .::   ..: .. :. 
CCDS32 MRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSV---KEMSSNQKSP
             2180      2190      2200      2210         2220       

         2860      2870      2880      2890      2900      2910    
pF1KA0 TV---APGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYN
       :    .::. ..:..  . ..: :::  . .   : ..   ..::.    :: . ..:.:
CCDS32 TKTSKSPGTANVLDVNNSTLMF-VGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWN
      2230      2240       2250      2260      2270      2280      

          2920      2930      2940      2950      2960      2970   
pF1KA0 F-ERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLV
       . ::  .      : :  :... ::    . ..::.:.. .   :  .:. .. . .   
CCDS32 YIEREGKC-----RGCFGSSQNEDP----SFHFDGSGYSVVE-KSLPATVTQIIMLFNTF
       2290           2300          2310       2320      2330      

          2980        2990      3000      3010      3020      3030 
pF1KA0 SYSGVLFFLKQQS--QFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFL
       : .:.:..: . .  .:: . . .: . .. :.:.:    . :      ....   .. .
CCDS32 SPNGLLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSG---PITLLTDRRYNNGTW-YKIAF
       2340      2350      2360      2370         2380       2390  

            3040      3050                3060      3070      3080 
pF1KA0 LGGSRKRVLVRVERATVYSVEQ--------DNDLEL--ADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLF
         . .. ::. ..  .. . :         ..::.    :  :.::.: ...   .::  
CCDS32 QRNRKQGVLAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRV---VRRGV
           2400      2410      2420      2430      2440            

            3090      3100      3110      3120      3130      3140 
pF1KA0 PTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA
        : . : ::.:...   .  :: : :. ::  ::  . .  :...:   :...:  ....
CCDS32 TTKSFV-GCIKNLEISRSTFDLLR-NSYGVRKGCLLEPI--RSVSFLKGGYIELPPKSLS
    2450       2460      2470       2480        2490      2500     

            3150      3160      3170      3180         3190        
pF1KA0 PLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRV---SLQLLRTEVKTQAGFAD
       : .  . .   : ....:...    . :   . . ....:   :..:.  ....... .:
CCDS32 PESEWLVT---FATTNSSGIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGD
        2510         2520      2530      2540      2550      2560  

     3200      3210               3220      3230      3240         
pF1KA0 GAPHYVAFYSNATG---------VWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPR------
       :.    :.    ::         . :  . ..  ..  .. : :..       :      
CCDS32 GTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSN
           2570      2580      2590      2600      2610      2620  

          3250            3260       3270      3280      3290      
pF1KA0 LLLGGLPES-GTIY-----NFSGCISN-VFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CAPA
       : .::.::. ::       .: :::.: .:  .::      :... .:  .:.   :   
CCDS32 LYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKNLIFNLELL------DFNSAVGHEQVDLDTC---
           2630      2640      2650            2660      2670      

        3300      3310      3320       3330      3340      3350    
pF1KA0 LQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPARHPA-CMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSH--LE
         .. : :.: .      . :.   .:   :  :..   :. .  ..::: . .::  : 
CCDS32 WLSERPKLAPDA------EDSKLLPEPRAFPEQCVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILP
          2680            2690      2700      2710      2720       

           3360      3370      3380      3390        3400      3410
pF1KA0 FVGILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNG--HFVAQMEGLGT
       :    .:..    ::....  .: ::. . :.   .. .. : : .:  ::. .. : : 
CCDS32 FNQSAVRKKLSVELSIRTF--ASSGLIYYMAHQNQADYAV-LQLHGGRLHFMFDL-GKG-
      2730      2740        2750      2760       2770       2780   

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pF1KA0 RLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQ--HQGAEHPQPHTLF
       : ...       :.:: :.. . : . ....::     .:.:      .:.       ..
CCDS32 RTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDG-----RESPMVTVVGDGTMLDVEGLFY
           2790      2800      2810           2820      2830       

     3470      3480       3490      3500        3510      3520     
pF1KA0 VGGLPASSHSSKLP-VTVGFSGCVKRLRLHGRPLG--APTRMAGVTPCILGPLEAGLFFP
       .::::.. .. :.  .: .. .:.  . .... :   .:.    :. :     : : .: 
CCDS32 LGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNRCYAVAQE-GTYFD
      2840      2850      2860      2870      2880      2890       

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pF1KA0 GSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPY-LQL---QVLLRADDG
       ::: .  .     .  ::.. :: :  . .:... .. :..    :.:   .::.....:
CCDS32 GSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNG
       2900      2910      2920      2930      2940      2950      

            3590         3600      3610      3620       3630       
pF1KA0 AGEFSTSVTRP---SVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGP-LLAAAAGAPAP
       ::.. :.. .:   .:::::.:: : . :: . . : ::...  . .:   .... .  :
CCDS32 AGRI-TAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGAESPHTQSTSVDTNNP
       2960       2970      2980      2990      3000      3010     

      3640      3650        3660      3670          3680      3690 
pF1KA0 LYLGGLPEPMAVQPW--PPAYCGCMRRLAVNRSPVAMT----RSVEVHGAVGASGCPAA 
       .:.:: :  .  .      .. ::.:.::. .:: ...    :. :.:: :   .::   
CCDS32 IYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAFELHG-VFLHSCPGTE
        3020      3030      3040      3050      3060       3070    

CCDS32 S
        

>>CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18              (1668 aa)
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      1790      1800      1810      1820       1830      1840      
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CCDS59 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVE-------FRPS--QGCS
      10        20        30        40        50                 60

       1850      1860      1870      1880      1890      1900      
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       ::.::: :::. ::::::.:.:::..:  :::.::.::::: : :::::: :....    
CCDS59 PGYYRDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG
               70        80        90       100       110       120

       1910      1920      1930      1940      1950      1960      
pF1KA0 SAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSC
       :  : .::::    .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.::::  .:.::
CCDS59 S--CRACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSC
                   130       140       150       160       170     

       1970      1980      1990      2000      2010      2020      
pF1KA0 QPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCT
       :::.:..::.    ...: ::::                                  :: 
CCDS59 QPCSCNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCI
         180           190                                         

       2030      2040      2050      2060      2070      2080      
pF1KA0 PCGTEACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSG
                                   ::            :   .:: :         
CCDS59 N---------------------------QE------------PKDSSPAEE---------
                                  200                              

       2090      2100      2110      2120      2130      2140      
pF1KA0 QCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCS
                                                                   
CCDS59 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       2150      2160      2170      2180      2190      2200      
pF1KA0 QQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLH
                        :. :: ::. ::.::   :  :  .. ::.:..::.    ...
CCDS59 -----------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR
                      210       220       230       240       250  

       2210         2220      2230      2240      2250      2260   
pF1KA0 RLNASIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQ
       .....  ::..::   :: .. :   ....: ::.. :.:.:. . :  .:  .  .:. 
CCDS59 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQT
            260       270          280       290       300         

          2270      2280      2290      2300      2310      2320   
pF1KA0 LLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLL
       :  ... .   :: : . :. : :..        :.                        
CCDS59 LNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNV--------HM------------------------
     310       320       330                                       

          2330      2340      2350      2360      2370      2380   
pF1KA0 WEMRARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMD
                                : :..   ..   ::..::.. :: : ..:: : :
CCDS59 -------------------------LNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSD
                                340       350       360       370  

          2390      2400      2410       2420      2430      2440  
pF1KA0 LREALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFR
       ::  :..:.  ...:. ::..: ::   :.::. .:..  .. .   : .: ..: ..  
CCDS59 LRARLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNI
            380       390        400       410       420       430 

           2450      2460      2470      2480      2490      2500  
pF1KA0 LLHSLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNL
        :. ......: :.:::::. ::  : .... .: ...:  ::: :: ::..: .:: .:
CCDS59 ALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQL
             440       450       460       470       480       490 

           2510      2520      2530      2540      2550      2560  
pF1KA0 SSIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRA
         :  ... :.:.. :..:..::  ::.:..::::::..: . .. .  ::... :  .:
CCDS59 EEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKA
             500       510       520       530       540       550 

           2570       2580      2590      2600      2610       2620
pF1KA0 QQLLANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AM
       . : .::  : .:: . ...    :  ::.. .  :  : ..:. ..... . .  : ..
CCDS59 KTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGI
             560       570       580       590       600       610 

             2630      2640      2650      2660      2670      2680
pF1KA0 DTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAG
       .  . .  :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: .  :   ...:. .:. :: 
CCDS59 QRGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDAD
             620       630       640       650       660       670 

             2690      2700      2710      2720      2730      2740
pF1KA0 HSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFN
       .::. : . ::.:  :.  .... .  ...  : .. :.:::: ::: ::::: :::.::
CCDS59 NSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFN
             680       690       700         710       720         

             2750      2760      2770      2780      2790      2800
pF1KA0 GRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLR
       :.:::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... 
CCDS59 GKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVV
     730       740       750       760       770       780         

             2810      2820         2830         2840       2850   
pF1KA0 DKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQE
       : ..  ::.::.   : :..:. . .   : :.   :...:  ::.... :    .   :
CCDS59 DGQLTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPE
     790       800        810       820       830       840        

            2860      2870      2880      2890      2900      2910 
pF1KA0 TKG--DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVS
       : :  :  . ... :::: :.. ::::::::  :  :  : :: :.::::.: :::.:.:
CCDS59 TPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLS
      850       860       870       880       890       900        

            2920      2930      2940      2950      2960      2970 
pF1KA0 LYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELR
       ::::..::.:.:.  .:: : :       .: .:..:::.::.  . . .    : : ..
CCDS59 LYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQ
      910       920       930            940       950        960  

            2980      2990      3000      3010      3020      3030 
pF1KA0 LVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFL
        .   :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : :   .      .. ...::.  
CCDS59 TTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-K
            970       980       990      1000      1010        1020

            3040      3050      3060      3070      3080       3090
pF1KA0 LGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGC
       .:  .::. . :.   : ..  :...   ..:::::.     : ..:. :  .  . :::
CCDS59 IGKLQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGI-----PIAIRERFNISTPAFRGC
             1030         1040      1050           1060      1070  

             3100      3110      3120      3130      3140          
pF1KA0 VKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYS
       .:..:  .  : :.  .:.::.  :. :  . :. .:   :  .:...... : : .. .
CCDS59 MKNLKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQA
           1080        1090      1100      1110        1120        

    3150      3160      3170      3180         3190      3200      
pF1KA0 GFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAF
       .:::.. : :..:  . .     ::.:..: . :.   .     :.   . ::  :::. 
CCDS59 SFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSV
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

       3210      3220      3230      3240      3250      3260      
pF1KA0 YSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVF
        :. .:. : .:::: . . .      :.    .   : :::        :: :::::::
CCDS59 ISDNSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVF
     1190      1200            1210      1220             1230     

       3270       3280      3290          3300      3310      3320 
pF1KA0 VQRL-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQ
       :::: :.:. :.:: .:  . .:: : :.   : .     :    .   : :  .  .  
CCDS59 VQRLSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDT
        1240       1250      1260      1270      1280      1290    

                    3330      3340      3350        3360      3370 
pF1KA0 PARHP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVL
       :.  :        ::   :. .... . :::   .::: :     : . :.  ...:.. 
CCDS59 PVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT
         1300      1310      1320      1330      1340      1350    

            3380      3390      3400      3410      3420      3430 
pF1KA0 PRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVR
         :::::.. :.     .  .::.::.:..:  .   : .:: .:...   :.:: :   
CCDS59 --SSRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFG
           1360         1370      1380      1390      1400         

            3440      3450      3460      3470      3480      3490 
pF1KA0 WEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCV
        . ..  ::.:: ::     :  .  . . :    ...:. : :.. ..:: : .: ::.
CCDS59 HDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCL
    1410      1420      1430      1440           1450       1460   

            3500      3510      3520      3530      3540      3550 
pF1KA0 KRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRP
       : ..: ..:: .:.   ::. :. :::: :..:   :: ..:       :.  : . .::
CCDS59 KNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRP
          1470      1480      1490      1500      1510      1520   

            3560      3570             3580      3590      3600    
pF1KA0 LAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLA
        ..::...:.:   . :  .: : :.:       :.:::  :::::  . ::::::: .:
CCDS59 RSLTGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVA
          1530         1540      1550      1560      1570      1580

         3610      3620      3630      3640      3650        3660  
pF1KA0 VMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRR
       :  . ..:.::.:..:..:.: .    :..  ::.::: :  ...   :   .. ::.: 
CCDS59 VTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRN
             1590      1600      1610      1620      1630      1640

           3670      3680      3690
pF1KA0 LAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
       . ::. :: .:...::.: :. .:::  
CCDS59 IHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ
             1650      1660        

>>CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6                (3122 aa)
 initn: 1666 init1: 498 opt: 1329  Z-score: 766.6  bits: 156.9 E(32554): 2.2e-36
Smith-Waterman score: 3282; 25.3% identity (48.5% similar) in 3852 aa overlap (15-3689:3-3121)

               10        20          30            40        50    
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLV--GLALLGAARAREE----AGGGFSLHPPYFNLAE
                     :  :   :::.  ::. . : : ...    :    .: :  .::: 
CCDS51             MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLAS
                           10        20        30        40        

           60        70        80        90       100         110  
pF1KA0 GARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICT--AANSN
       .: :...:::::..:         ..:::::        :.: .:.  : ::.  ..: :
CCDS51 NALITTNATCGEKGP---------EMYCKLVEHV-----PGQPVRNPQCRICNQNSSNPN
       50        60                 70             80        90    

            120       130       140       150       160       170  
pF1KA0 KAHPASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVL
       . :: .::::: . ::::: .. :.::. :..:::: :::..:::..: ::::::  :.:
CCDS51 QRHPITNAIDGKNTWWQSPSIKNGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWIL
          100       110       120       130       140       150    

            180       190             200       210       220      
pF1KA0 ERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLE------RFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLE
       :::.:    :.:::. : .  .::       : :: .    ..:: .:::. ::.: :::
CCDS51 ERSLD-DVEYKPWQYHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPS---YAKDDEVICTSFYSKIHPLE
           160       170       180       190          200       210

        230       240       250       260       270       280      
pF1KA0 NGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPT----
       :::: .::.::::.: .   :: : :::.:  .:::: :  :: . ::  : .::     
CCDS51 NGEIHISLINGRPSADD--PSPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDP
              220         230       240       250       260        

             290       300       310         320       330         
pF1KA0 -VTRRYYYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPF--RLQCTCQHNTCGGTCDRCCPG
        ::::::::.::::.:: :.:.::: ::    : ::   . .: :.::::: .::.::::
CCDS51 IVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARAC----PLDPATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPG
      270       280       290           300       310       320    

     340       350       360       370       380       390         
pF1KA0 FNQQPWKPATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHH
       :.:.::. .:  . .::..:::.:.: .:::: .: ::  : .. : : ::::::.: ..
CCDS51 FHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQN
          330       340       350       360       370       380    

     400       410           420       430       440       450     
pF1KA0 TTGVNCERCLPGFYR----SPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSG
       :.:.::: :  ::.:    :::.:                              ::    
CCDS51 TAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYP------------------------------RP----
          390       400                                     410    

         460       470       480       490       500       510     
pF1KA0 ERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRC
                      : :                    : :.  :. ...: :: . .: 
CCDS51 ---------------CQP--------------------CHCDPIGSLNEVCVKDEKHAR-
                                                 420       430     

         520       530       540       550       560       570     
pF1KA0 LCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCA
             .:      ::                          :.:.:..:: :..:::::
CCDS51 ------RGL-----AP--------------------------GSCHCKTGFGGVSCDRCA
                                               440       450       

         580       590       600       610       620       630     
pF1KA0 PGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCD
        ::                                              :.:.:.::.:.
CCDS51 RGYT---------------------------------------------GYPDCKACNCS
       460                                                    470  

         640       650       660       670       680       690     
pF1KA0 PRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQ
         :. ..                                               ::  : 
CCDS51 GLGSKNE-----------------------------------------------DPCFG-
                                                           480     

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 CSCRPRVTGLRCDTCVPGAYNFPYCEAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSC
                                                      ::.:. .::: .:
CCDS51 -----------------------------------------------PCICKENVEGGDC
                                                         490       

         760       770       780       790       800       810     
pF1KA0 DRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGF
       .::: ::..:. .: .:: .: :.      ::..                     :....
CCDS51 SRCKSGFFNLQEDNWKGCDECFCS------GVSN--------------------RCQSSY
       500       510       520                                 530 

         820       830       840       850       860       870     
pF1KA0 FGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLR
       .   . .         :..:    .   :  :              : .:  : . ... 
CCDS51 WTYGKIQ---------DMSGWYLTDLPGRIRVA-------------PQQDD-LDSPQQIS
                      540       550                    560         

         880       890       900        910       920        930   
pF1KA0 LELEEAATPEGHAMRFGFNPLEFENFSWRGYAQ-MAPVQPRIVARLNLT-SPDLFWLVFR
       .   ::     :.            . : . :  ..   : . ..:..: : ::     .
CCDS51 ISNAEARQALPHS------------YYWSAPAPYLGNKLPAVGGQLTFTISYDL-----E
      570       580                   590       600       610      

           940       950       960       970       980       990   
pF1KA0 YVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNP
         .. .  :  .. .  :: . . .  :::.. : . :: : . . . ..   : :... 
CCDS51 EEEEDTERVL-QLMIILEGNDLSIS--TAQDE-VYLHPSEEHTNVLLLKE---ESFTIHG
             620        630         640        650          660    

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KA0 GTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLD
         . .: .      .....:  :  . .:::  .: .  .    . :. :    .  : :
CCDS51 THFPVRRK------EFMTVL--ANLKRVLLQ--ITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTD
          670               680         690       700       710    

          1060      1070      1080      1090      1100      1110   
pF1KA0 GFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVV
       :  : :.   .:.        ::     :..      :::. .       :.  :   ..
CCDS51 G--SIAAAVEVCQ--------CP-----PGY------TGSSCES----CWPRHRRVNGTI
            720                    730                 740         

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KA0 EYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASV
        ..        :.                .::     : : :.. .:             
CCDS51 -FG--------GIC---------------EPCQ----CFGHAESCDD-------------
      750                                  760                     

          1180      1190      1200      1210      1220      1230   
pF1KA0 RLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPII
        .:.:                         ..: .  :  ::    :::. . .: .   
CCDS51 -VTGEC------------------------LNCKDHTG--GPYCDKCLPGFYGEPTKGTS
       770                               780         790       800 

          1240      1250      1260      1270      1280      1290   
pF1KA0 LRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHV
        .:::    : ..:       .  .::.    :   ..  :. :.    :.       . 
CCDS51 -EDCQPCACPLNIP-------SNNFSPTCHLDRS-LGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGY-
              810              820        830       840       850  

          1300      1310      1320      1330      1340      1350   
pF1KA0 PTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLD
         .:. .    . :: . .  ..  :  :   .  ..  .:  :   :   .:    . :
CCDS51 --FGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFSI-PGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGD
               860       870        880       890       900        

          1360      1370      1380      1390      1400      1410   
pF1KA0 VTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISP
       .. ..     :   :                  : . :   ... .   .  .:: . . 
CCDS51 AVDAKNCQPCRCNAG------------------GSFSEVCHSQTGQCECRANVQGQRCDK
      910       920                         930       940       950

          1420      1430      1440      1450      1460      1470   
pF1KA0 SSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCAT
             :.  :....:    :  ::.:.  :. .  ::  .::: :.  : :. :.::: 
CCDS51 ------CK--AGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEE-SGQCWCQPGVTGKKCDRCAH
                      960       970       980        990      1000 

          1480          1490      1500      1510      1520         
pF1KA0 GYWGFPN--CRPCDCG--ARLCDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECN
       ::..: .  :  :.:.  .  ::  ::.::::: ::   :  : :.:.:    .::. ::
CCDS51 GYFNFQEGGCTACECSHLGNNCDPKTGRCICPPNTIGEKCSKCAPNTWGHSITTGCKACN
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

    1530      1540      1550      1560      1570      1580         
pF1KA0 CSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVC
       ::  :     :  :....:::.:.:. .: .:  :: :  .::::  :::   ::   .:
CCDS51 CSTVG---SLDFQCNVNTGQCNCHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCNLCDCFLPGTDATTC
               1070      1080      1090      1100      1110        

    1590               1600      1610      1620      1630      1640
pF1KA0 DP---------LTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSS
       :           :::: :: ::.: .::.:  : :.::: :: ::. :.:::.: .:  .
CCDS51 DSETKKCSCSDQTGQCTCKVNVEGIHCDRCRPGKFGLDAKNPLGCSSCYCFGTTTQCSEA
     1120      1130      1140      1150      1160      1170        

             1650      1660        1670      1680              1690
pF1KA0 SYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVP--HERQPGTEMLRADLRHVPEAVPEA--------FP
       .        .. :: :.... ..:   :    :      ..: :: : .         . 
CCDS51 KGL------IRTWVTLKAEQTILPLVDEALQHTTTKGIVFQH-PEIVAHMDLMREDLHLE
     1180            1190      1200      1210       1220      1230 

             1700      1710      1720      1730      1740          
pF1KA0 ELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN---QMSITFL
        .::. : .. : .. .::: :.: .. :...   :  ..  :.:...:.   .  :   
CCDS51 PFYWKLPEQFEGKKLMAYGGKLKYAIYFEAREETGFSTYN--PQVIIRGGTPTHARIIVR
            1240      1250      1260      1270        1280         

      1750      1760      1770          1780      1790      1800   
pF1KA0 EPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRH----TETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFSQIS
       . : :  :.. : .....: ....     ... ::.::... .: ... . :.: .... 
CCDS51 HMAAPLIGQLTRHEIEMTEKEWKYYGDDPRVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFM
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

          1810      1820          1830      1840      1850         
pF1KA0 SAVSLRRVALEVASPAGQGAL----ASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYR-------D
           . ....:::   :.:.     :. .: : :: .: : ::. : :::::        
CCDS51 RQSRISEISMEVAEQ-GRGTTMTPPADLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGGR
    1350      1360       1370      1380      1390      1400        

           1860      1870      1880      1890      1900      1910  
pF1KA0 VKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVS
       . :  :: ::::::.:::. : : ...: .:::.: :  ::::  :...        : .
CCDS51 TPGPTLGTCVPCQCNGHSSLCDPETSICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQ
     1410      1420      1430      1440      1450      1460        

           1920      1930        1940      1950      1960      1970
pF1KA0 CPCPLSVPSNNFAEGCVLRG-GRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD
       : :::   ::::. .:: .:    .:  :  :: :  :::::::. :.:   :.::: :.
CCDS51 CACPLISSSNNFSPSCVAEGLDDYRCTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECE
     1470      1480      1490      1500      1510      1520        

             1980      1990      2000      2010      2020      2030
pF1KA0 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT
       :    ::                                 ::.  .:             
CCDS51 C----DP---------------------------------YGSLPVP-------------
         1530                                                      

             2040      2050      2060      2070      2080      2090
pF1KA0 EACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC
         ::: .: : :. :.:::.:: :.. :                : :: ::         
CCDS51 --CDPVTGFCTCRPGATGRKCDGCKHWH----------------AREGWEC---------
       1540      1550      1560                      1570          

             2100      2110      2120      2130      2140      2150
pF1KA0 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ
                                                                   
CCDS51 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             2160      2170      2180      2190      2200      2210
pF1KA0 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA
                  . :   :.:. ::: :: :       ..... .:: ..   :  ...  
CCDS51 -----------VFC--GDECTGLLLGDLAR-------LEQMVMSINLTGPLPAP-YKMLY
                         1580             1590      1600       1610

             2220      2230      2240      2250      2260      2270
pF1KA0 SIADLQSQLRSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEA
       .. .. ..:.  :.:..   . ... : . ..:  .  .:  .:. .  .. :    .: 
CCDS51 GLENMTQELKHLLSPQRAPERLIQLAEGNLNTLVTEMNELLTRATKVTADGEQTGQDAER
             1620      1630      1640      1650      1660      1670

             2280      2290      2300      2310          2320      
pF1KA0 TLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLA----EVERLLWEM
       :  .::.:   :. . :  .: ... . . : .. .   : . :.:     :..... :.
CCDS51 TNTRAKSLGEFIKELARD-AEAVNEKA-IKLNETLGTRDEAFERNLEGLQKEIDQMIKEL
             1680       1690       1700      1710      1720        

       2330      2340      2350      2360      2370      2380      
pF1KA0 RARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLRE
       : ..: . .  :: ::.::. :: .:.. ..    ::. .  . :..::...  . :  .
CCDS51 RRKNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREKLADYKNKVDDAWD
     1730      1740      1750      1760      1770      1780        

       2390      2400      2410      2420      2430      2440      
pF1KA0 ALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHS
        : .:.:  :::..: . ::. .    ..:. .   .  .. ::. . : :  . ::   
CCDS51 LLREATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEGNDILDEANRLADE
     1790      1800      1810      1820      1830      1840        

       2450      2460      2470      2480         2490      2500   
pF1KA0 LDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEA---AEAHAQQLGQLALNLS
       ...  . .: . ..:      : .... .:   .  .:.:    ::.:: ::     : :
CCDS51 INSIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAESHAAQL-----NDS
     1850      1860      1870      1880      1890      1900        

          2510         2520      2530      2540        2550        
pF1KA0 SIILDVNQDR---LTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHT--WATVVRQGL
       : .::   :.   ..  :  : .::: : . .. :: .: .: . : ..   ::  :  :
CCDS51 SAVLDGILDEAKNISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEATKLATGPRGLL
          1910      1920      1930      1940      1950      1960   

     2560      2570      2580      2590      2600      2610        
pF1KA0 VDRAQQLLANSTALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML
        . :.  : .:  . .   .  . .      :.: .:..... :.. .:   .. . . :
CCDS51 KEDAKGCLQKSFRILNEAKKLANDVKENEDHLNGLKTRIENADARNGDLLRTLNDTLGKL
          1970      1980      1990      2000      2010      2020   

     2620      2630      2640      2650      2660                  
pF1KA0 AMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGL-----------
       .   ..:. :.  .:  : .:.:::  : .:.  ...:..  . .:. :           
CCDS51 SAIPNDTAAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNYNKLADSVAKTNAVV
          2030      2040      2050      2060      2070      2080   

      2670      2680      2690      2700      2710      2720       
pF1KA0 RGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQAR
       .  . .. . ::  .:..::.   .:. ::     . ...    :. .:....::: :::
CCDS51 KDPSKNKIIADADATVKNLEQEADRLIDKL-----KPIKELEDNLKKNISEIKELINQAR
          2090      2100      2110           2120      2130        

      2730      2740      2750      2760      2770      2780       
pF1KA0 GAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGS
         :...:: .. .:     .:: .     ..:. .   ..        .. : ...:.::
CCDS51 KQANSIKVSVSSGGDC---IRTYKPEIKKGSYNNIVVNVK-------TAVADNLLFYLGS
     2140      2150         2160      2170             2180        

      2790      2800      2810      2820       2830      2840      
pF1KA0 RQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGEKF-AAVSLDRTLQFGHMSVTV
        .   :.... .:  :: .....: .   :   :  : ...   .  .:: . : .:: .
CCDS51 AKFI-DFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRTGRNGTISVRA
     2190       2200      2210      2220      2230      2240       

           2850      2860      2870      2880      2890      2900  
pF1KA0 ----ERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEM
           . ...  :. .:  ::   .:..  . ..: :::  . .     .:   . ::.  
CCDS51 LDGPKASIVPSTHHSTSPPGYT-ILDVDANAMLF-VGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGE
      2250      2260       2270      2280       2290      2300     

           2910      2920      2930      2940       2950           
pF1KA0 DTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSY-LDGTGFARIS----FD
         .... ..:.:: :  . :    . :. : .. :   ..:.  .:: :.: .:    . 
CCDS51 TYFDNKPIGLWNF-REKEGDC---KGCTVSPQVED---SEGTIQFDGEGYALVSRPIRWY
        2310       2320         2330         2340      2350        

      2960      2970      2980        2990      3000      3010     
pF1KA0 SQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFL--KQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQ
        .:::.  :.  .:  : :..:..:  ..  .:. . . .: . . ::.:.:. ..:  :
CCDS51 PNISTVM-FK--FRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKVSYDLGSGMASVVSNQ
     2360         2370      2380      2390      2400      2410     

        3020      3030      3040             3050         3060     
pF1KA0 PPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRV-------ERATVYSVEQDN---DLELADAYYL
            .  .   . : :.  .:.. . .       :.  . :   .:   ::.  :  :.
CCDS51 -----NHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNNFGLDLKADDKIYF
             2420      2430      2440      2450      2460      2470

        3070      3080      3090       3100      3110      3120    
pF1KA0 GGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIK-ALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRA
       ::.:  .      :   .  .  ::.: :. .   :  :.  . .::. ::. . .   .
CCDS51 GGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGVTKGCSLENV--YT
             2480      2490      2500      2510      2520          

         3130      3140      3150      3160        3170      3180  
pF1KA0 MTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSA--LLYYRASPDGLCQVSLQQGRVS
       ..:   ::..:.    .:.  ..  ...: . ..:.  ::   ..:    .   : :.. 
CCDS51 VSFPKPGFVELS---PVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPAPPRRKRRQTGQAY
     2530      2540         2550      2560      2570      2580     

               3190                     3200      3210       3220  
pF1KA0 LQLL----RTEVKTQAG---------------FADGAPHYVAFYSNATGVW-LYVDDQLQ
         .:    : ::. ..:               : ::  : :     . :.. . ::.. .
CCDS51 YAILLNRGRLEVHLSTGARTMRKIVIRPEPNLFHDGREHSV-HVERTRGIFTVQVDENRR
        2590      2600      2610      2620       2630      2640    

                        3230      3240      3250      3260         
pF1KA0 QMK------PHR-------GPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQR
        :.      : .       : :::.::.:       : ..:       : ::: :. .. 
CCDS51 YMQNLTVEQPIEVKKLFVGGAPPEFQPSP-------LRNIPP------FEGCIWNLVINS
         2650      2660      2670                   2680      2690 

    3270      3280      3290        3300          3310      3320   
pF1KA0 LLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA-PALQAQTPGLGPRGL----QATARKASRRSRQPA
       .  :.   :. . ..  :.. : ::   :. .  : .:  .    . .   :        
CCDS51 V--PM---DFARPVSFKNADIGRCAHQKLREDEDGAAPAEIVIQPEPVPTPAFPTPTPVL
                 2700      2710      2720      2730      2740      

          3330      3340      3350      3360      3370      3380   
pF1KA0 RHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVGILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTA
        :  :    .      : ::: : .::. ..   .. .:  .. ..:  ..  :::.. :
CCDS51 THGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIAFDDTKVKNRLTIELEVRTEAESGLLFYMA
       2750      2760      2770      2780      2790      2800      

          3390        3400      3410      3420      3430      3440 
pF1KA0 RLRPGSPSLALFLSNG--HFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVT
       :.  .. . .. : ::  .:  .. .  :.    ..  .  :.:::...   :.. .: .
CCDS51 RINHADFA-TVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTKIND--GQWHKIKIMRSKQEGILYV
       2810       2820      2830      2840        2850      2860   

            3450      3460      3470      3480       3490      3500
pF1KA0 DGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKL-PVTVGFSGCVKRLRLHGRP
       :::   .  .:..            :.::::: .  . .. ::: ...:::. :..   :
CCDS51 DGASNRTI-SPKKADI---LDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVRNLHMAEAP
          2870          2880      2890      2900      2910         

               3510      3520      3530      3540      3550        
pF1KA0 --LGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVTGLI
         :  ::    :  :. .  . : .: :.: . ..    . : :. .:.: :  ..::..
CCDS51 ADLEQPTSSFHVGTCFANA-QRGTYFDGTGFAKAVGGFKVGL-DLLVEFEFRTTTTTGVL
    2920      2930       2940      2950      2960       2970       

     3560          3570      3580        3590      3600      3610  
pF1KA0 FHLGQARTP----PYLQLQVLLRADDGAGEFST--SVTRPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVL
       . ... .       ... ......:.:::.:..  ..  :. :::::::.... :  . .
CCDS51 LGISSQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTANKIKHRI
      2980      2990      3000      3010      3020      3030       

           3620      3630       3640         3650      3660        
pF1KA0 RLEVDAQSNHTVGPLLAA-AAGAPAPLYLGGLPEPM---AVQPWPPAYCGCMRRLAVNRS
       .: ::... .. .:  :. .: .  :...::.:. .   ..    : . ::.: : ....
CCDS51 ELTVDGNQVEAQSPNPASTSADTNDPVFVGGFPDDLKQFGLTTSIP-FRGCIRSLKLTKG
      3040      3050      3060      3070      3080       3090      

          3670      3680      3690
pF1KA0 ---P--VAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
          :  : .....:..: :   .::: 
CCDS51 TGKPLEVNFAKALELRG-VQPVSCPAN
       3100      3110       3120  

>>CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1               (4391 aa)
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pF1KA0 YFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPR
                                     .:   ::.   :: :.          : ::
CCDS30 TTSLPPRPETTIMRQPPVTHAPQPLLPGSVRPLPCGPQEAACRNGH----------CIPR
              260       270       280       290                 300

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pF1KA0 GALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPC---HCS-----AEGSLHAAC
          : ::   :   :. :   .   .:.:     :.  ::   ::.      .:..   :
CCDS30 ---DYLC--DGQEDCEDG---SDELDCGPPPPCEPNEFPCGNGHCALKLWRCDGDFD--C
                   310          320       330       340         350

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pF1KA0 DPRSGQCSC---RPR-VTG---LRC---DTCVPGAYNFPYCEAGSCHPA-----GLAPVD
       . :. . .:   ::. : :   .::   . :.:...   .:.  :  :      :  : .
CCDS30 EDRTDEANCPTKRPEEVCGPTQFRCVSTNMCIPASF---HCDEESDCPDRSDEFGCMPPQ
              360       370       380          390       400       

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pF1KA0 PALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRC---KPGF-----WGLSPSNPEGCTRCSCDLRGTL--
        . :  .     :...   .:       : .     ::  ::.:.  :  :   ::::  
CCDS30 VVTPPRESIQASRGQTVTFTCVAIGVPTPIINWRLNWGHIPSHPR-VTVTSEGGRGTLII
       410       420       430       440       450        460      

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pF1KA0 -------GGVAECQP--GTGQCFCKPHVCGQACAS---CKDGFFGLDQADYFGCRSCRCD
               :.  :.   . :. :  :    .   .   : :: : :...   .:  : : 
CCDS30 RDVKESDQGAYTCEAMNARGMVFGIPDGVLELVPQRGPCPDGHFYLEHSA--ACLPCFCF
        470       480       490       500       510         520    

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pF1KA0 IGGALGQSCEPRTGVCRCR---PNT-QGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHA
          .. :: .      : :   :.  .: . . ::.    : :   .:... .   : . 
CCDS30 GITSVCQSTRRFRDQIRLRFDQPDDFKGVNVTMPAQPG-TPPLSSTQLQIDPS-LHEFQL
          530       540       550       560        570        580  

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pF1KA0 MRFGFNPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSV
       . ..   :  ..: :       : :  .  ...  . .: . :   . :: .    : .:
CCDS30 VDLSRRFLVHDSF-W-----ALPEQ-FLGNKVDSYGGSLRYNVRYELARGMLEPVQRPDV
            590             600        610       620       630     

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pF1KA0 REEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEP-FVLNPGTWALRVEAEGVLL
          :     :.    :.  .  : :.:. ..  :  :.:  .: . :  . :.:   :: 
CCDS30 VLMG-----AGYRLLSR--GHTP-TQPGALNQRQVQFSEEHWVHESGRPVQRAELLQVLQ
              640         650        660       670       680       

      1010      1020      1030         1040      1050      1060    
pF1KA0 DYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEAC---TYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEAL
       .  ..: .. :.. . .. ...     :   .....  . .   . :. :.   .::   
CCDS30 SLEAVLIQTVYNTKMASVGLSDIAMDTTVTHATSHGRAHSVEECRCPI-GY---SGLS--
       690       700       710       720       730           740   

          1070      1080      1090      1100      1110      1120   
pF1KA0 CRQ-DNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQE
       :.. :  . :        :. : : ::.: . . . .   :  : . :  .. : .. : 
CCDS30 CESCDAHFTR-------VPGGPYLGTCSGCNCNGHASSCDPVYG-HCLNCQH-NTEGPQC
             750              760       770        780        790  

          1130      1140      1150      1160      1170             
pF1KA0 VGVAVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTA------
           .     : .    : .::    .   ..:  .:    .  :..:.    :      
CCDS30 NKCKAGFFGDAMKATATSCRPCPCPYI--DASRRFSD-TCFLDTDGQATCDACAPGYTGR
            800       810         820        830       840         

        1180      1190      1200      1210      1220      1230     
pF1KA0 --EQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILR
         :.     .:  . :  .  :   :  : : . .:..: .. ::   :  .     .  
CCDS30 RCESCAPGYEGNPIQPGGKCRPVNQEI-VRC-DERGSMGTSGEAC---RCKNNVVGRLCN
     850       860       870         880       890          900    

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pF1KA0 DCQVIPL------PPGLPLTHAQDLT-PAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVV
       .:    .      : :      . ..    : .  : .   : .   ::  .   .:. .
CCDS30 ECADGSFHLSTRNPDGCLKCFCMGVSRHCTSSSWSRAQLHGASE---EPGHFSLTNAAST
          910       920       930       940          950       960 

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pF1KA0 FTTH----VPTLGRYAF-----LLHGYQPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYG
        ::.     :: :. .:     :: :  :   ..: . : .    . :.   .   ..  
CCDS30 HTTNEGIFSPTPGELGFSSFHRLLSG--PYFWSLPSRFLGDKVTSYGGELRFTVTQRSQP
             970       980         990      1000      1010         

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pF1KA0 CRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYD
         : .  .:: :. .  ... .  .: .        ...::    ..     .:  . . 
CCDS30 GSTPL--HGQPLVVLQGNNIILEHHVAQEPSPGQPSTFIVPFREQAWQRPDGQPATREHL
    1020        1030      1040      1050      1060      1070       

    1400      1410      1420      1430      1440      1450         
pF1KA0 FISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPC
       ...  . .   :  : ..   .. ....:.   . : :   .:.:   :. :    :: :
CCDS30 LMALAGIDTLLIRASYAQQPAESRVSGISM---DVAVP---EETGQD-PALEV--EQCSC
      1080      1090      1100         1110          1120          

    1460      1470      1480              1490       1500      1510
pF1KA0 HAHVIGRDCSRCATGYWGFPN------CRPCDCG--ARLCDELTGQCI-CPPRTIPPDCL
            : .:. : :::   :.      :. :.:   .. :.  :: :  :  .:  : : 
CCDS30 PPGYRGPSCQDCDTGYTRTPSGLYLGTCERCSCHGHSEACEPETGACQGCQHHTEGPRCE
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

                 1520      1530      1540         1550       1560  
pF1KA0 LCQPQTFG----CHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTC--DTDSGQ-CK-CRPNVTGRRCD
        :::  .:      :   :. : : :      .  ::  :::.   :  : :. .::.:.
CCDS30 QCQPGYYGDAQRGTPQ-DCQLCPCYGDPAAGQAAHTCFLDTDGHPTCDACSPGHSGRHCE
     1190      1200       1210      1220      1230      1240       

           1570                   1580      1590      1600         
pF1KA0 TCSPGFHGYPR----CR-----P----CDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQ
        :.::..: :     :.     :    :.:   :.. . ::  .::: :: .:.:  :..
CCDS30 RCAPGYYGNPSQGQPCQRDSQVPGPIGCNCDPQGSVSSQCDA-AGQCQCKAQVEGLTCSH
      1250      1260      1270      1280       1290      1300      

    1610      1620      1630      1640            1650      1660   
pF1KA0 CSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQ----EFV--DMEGWVLLSTDRQ--
       :    : :.:.:: ::  :::.: :..: ::.:::.    .:.  :..:..:.. .:.  
CCDS30 CRPHHFHLSASNPDGCLPCFCMGITQQCASSAYTRHLISTHFAPGDFQGFALVNPQRNSR
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

             1670      1680      1690      1700      1710      1720
pF1KA0 -VVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSET
        .     .:  :  . .. .  .   :.:   ::: : .: ::.:..::: ::: : : :
CCDS30 LTGEFTVEPVPEGAQLSFGNFAQLGHESF---YWQLPETYQGDKVAAYGGKLRYTL-SYT
       1370      1380      1390         1400      1410       1420  

             1730      1740      1750      1760      1770      1780
pF1KA0 QRGDVFVPMESRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSR
         :    :. : ::: . ::.. ..  .::   : .  :.   . . .: .    . ..:
CCDS30 A-GPQGSPL-SDPDVQITGNNIMLVASQPALQGPER--RSYEIMFREEFWRRPDGQPATR
            1430       1440      1450        1460      1470        

             1790      1800      1810      1820       1830         
pF1KA0 EELMMVLASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQG-ALASNVELCLCPASYRG
       :.:.:.::.:..: ::: ::..  :.:.  :.::::.:. ..   : .:: : :: .: :
CCDS30 EHLLMALADLDELLIRATFSSVPLAASISAVSLEVAQPGPSNRPRALEVEECRCPPGYIG
     1480      1490      1500      1510      1520      1530        

    1840      1850      1860      1870      1880      1890         
pF1KA0 DSCQECAPGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGF
        :::.::::. :  .::.::.:  :.:.:::: : : .:.: .::::. :  :: :  :.
CCDS30 LSCQDCAPGYTRTGSGLYLGHCELCECNGHSDLCHPETGACSQCQHNAAGEFCELCAPGY
     1540      1550      1560      1570      1580      1590        

    1900       1910      1920       1930       1940      1950      
pF1KA0 MSSRDDPSAP-CVSCPCPLSVPSNNFAEGC-VLRGGRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFF
       ...    .   :  : :::. : : :.. :  : .:  .:  :.:::.:  ::.:.::. 
CCDS30 YGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENMFSRTCESLGAGGYRCTACEPGYTGQYCEQCGPGYV
     1600      1610      1620      1630      1640      1650        

       1960      1970      1980      1990      2000      2010      
pF1KA0 GNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALL
       ::: : :..: :                                                
CCDS30 GNPSVQGGQCLPETNQAPLVVEVHPARSIVPQGGSHSLRCQVSGSPPHYFYWSREDGRPV
     1660      1670      1680      1690      1700      1710        

>>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9               (1575 aa)
 initn: 873 init1: 246 opt: 1104  Z-score: 641.8  bits: 132.8 E(32554): 2e-29
Smith-Waterman score: 1885; 30.5% identity (55.5% similar) in 1373 aa overlap (1431-2692:265-1569)

             1410      1420      1430      1440      1450          
pF1KA0 ISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEP-FGGQ--C
                                     .. :.: : :.   . .  : :  .::  :
CCDS69 LISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGR-CKCN---GHASECGPDVAGQLAC
          240       250       260       270           280       290

      1460      1470                1480      1490                 
pF1KA0 PCHAHVIGRDCSRCATGYWGFP----------NCRPCDCGARL--CD---ELT------G
        :. .. : :: ::   .   :          .: ::.:..:   :    ::       :
CCDS69 RCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGG
              300       310       320       330       340       350

        1500      1510      1520      1530      1540      1550     
pF1KA0 QCI-CPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPN
       .:  :  .:  : :  :: . .   : . :. :.:.. :  .:    :: :.: : :.:.
CCDS69 RCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQ---CD-DTGTCACKPT
              360       370       380       390           400      

        1560      1570        1580      1590      1600      1610   
pF1KA0 VTGRRCDTCSPGFHGYPR--CRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLG
       ::: .:: : ::::.  .  :::: :. ::.   .::: .:.: :::::.:  ::.:  :
CCDS69 VTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLD-TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
        410       420       430        440       450       460     

          1620      1630      1640        1650          1660       
pF1KA0 TFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFV--DM----EGWVLLSTDRQVVPHER
       ::.:.  :: ::. :::.: .. : :..  . . .  :.    :::   :.  .  : . 
CCDS69 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
         470       480       490       500       510       520     

      1670      1680      1690      1700      1710      1720       
pF1KA0 QPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFV
       .:.  .:           ::   ::   :: ..:::.  :::  :   :  ..  ::  .
CCDS69 SPNGVLLS----------PEDEEEL--TAPEKFLGDQRFSYGQPLI--LTFRVPPGDSPL
         530                 540         550         560       570 

      1730      1740      1750      1760      1770      1780       
pF1KA0 PMESRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSRE----EL
       :.. :    :.:. ..... . .   :  .  :. . ::  :.  :: . :.      ..
CCDS69 PVQLR----LEGTGLALSLRHSSLSGPQDA--GHPREVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHF
                 580       590         600       610       620     

          1790      1800       1810      1820      1830      1840  
pF1KA0 MMVLASLEQLQIRALFS-QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSC
       . .::.: .:..:.  . . .. : : .: :  : : : .  :: ::.: ::..: :. :
CCDS69 QRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICSCPTGYTGQFC
         630       640       650       660        670       680    

           1850       1860      1870      1880      1890      1900 
pF1KA0 QECAPGFYRDV-KGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMS
       . ::::. :.. .:   . :::: :. :.  : :..:.:: :.:.:::  ::::  ::..
CCDS69 ESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYG
          690       700       710        720        730       740  

             1910      1920      1930       1940      1950         
pF1KA0 SRDDPSAP-CVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFFGNP
       .    .:  :  :::: .   ... :.      .. :  : ::  :  :: :  ::::.:
CCDS69 NPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPES-----REVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDP
            750       760            770       780       790       

    1960         1970      1980      1990      2000      2010      
pF1KA0 L-VLG--SSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALL
       : ..:  . :. :.:::: ::: . ..::::.: :  ::..::: .:: :  ::::.:: 
CCDS69 LGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAV-GNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALA
       800       810       820        830       840       850      

          2020      2030          2040      2050      2060         
pF1KA0 P---GNCTRCDCTPCGTEA----CDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRP
       :    .:  :.: : :. .    ::: .:.: :   ::.: :.::  : : ..   ::: 
CCDS69 PRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRS
        860       870       880       890       900       910      

    2070       2080      2090      2100      2110       2120       
pF1KA0 CACGP-AAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQC-PGG----R
       : : : ... ..:::..::: ::::. :  : .:  :..:.  .::: :.: : :    .
CCDS69 CKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQ
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pF1KA0 CDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGA
       :  ..: : : ::. : .:: : ..  . . :       ::. :  : .:. ..  .  :
CCDS69 CH-ENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADG------THCQQCPSCYALVKEEAAKLKA
         980       990      1000            1010      1020         

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pF1KA0 LLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRL--NASIADL-QSQLRSPLGPHHETAQQLEVLEQQS
        :   .  :.: . .:  :. :  :  .:  .:. :..   : : ..   .:.  ::   
CCDS69 RLTLTEGWLQGSDCGS-PWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLP-GAREAFLEQMMSLEGAV
    1030      1040       1050      1060      1070       1080       

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pF1KA0 TSLGQDARRLGGQA----VGTRDQASQL------LAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDR---
        .  .. .::.  :    .:..   .::      : ..:  . :: ..::...  ..   
CCDS69 KAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQEGPS
      1090      1100      1110      1120      1130      1140       

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pF1KA0 ---TLSELMSQT-----GHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEM-RARDLGAPQAAA
            :.: ...     .:   :.  : .. . : .      :::.. ..:     :   
CCDS69 QPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVALETQRDL
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pF1KA0 E---AELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDAT
       :    :. :::. :  .  ..  : : ...:::   ....   :  . :  :   :.   
CCDS69 EDRYQEVQAAQKALRTAVAEV--LPEAESVLATV--QQVGADTAPYLALL-ASPGALPQK
      1210      1220        1230        1240      1250       1260  

        2400      2410      2420       2430      2440      2450    
pF1KA0 REAQELNSRNQERLEEALQRKQELSRDNA-TLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEEL
        .:..:. . .  ::...   :... . : :::.   ::. :: ..  : .  ..:.  :
CCDS69 SRAEDLGLKAKA-LEKTVASWQHMATEAARTLQT---AAQATLRQTEPLTKLHQEARAAL
           1270       1280      1290         1300      1310        

         2460       2470      2480      2490      2500       2510  
pF1KA0 ERLAASLDGARTPLL-QRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIIL-DVNQ-
        . ..:...: . ..  :    .  : ::.. .  .  : :  . : ..:. .: :. . 
CCDS69 TQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQ--RKADSVSDRLLADTRKK
     1320      1330      1340      1350        1360      1370      

                2520       2530        2540          2550          
pF1KA0 ----DRLTQRAIE-ASNAYSRILQAVQAAEDAA--GQAL----QQADHTWATVVRQG---
           .:.   :   .:.: ..  .:   :.:.:  ..::    .:: .  . .. :    
CCDS69 TKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQAT
       1380      1390      1400      1410      1420      1430      

      2560      2570      2580      2590      2600      2610       
pF1KA0 LVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAM
       : . .::.::. .  .:  :.: .:.:   :.:.  . :.:. : .   ::  :.. . .
CCDS69 LQQASQQVLASEARRQE--LEEAERVG---AGLSEMEQQIRESRIS---LEKDIETLSEL
       1440      1450        1460         1470         1480        

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pF1KA0 LA----MDTDETSKKIAHAKAVAAE----AQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRG
       ::    .:: ..  .  .    : :       .   .: .:. .... .. . : .:...
CCDS69 LARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFES
     1490      1500      1510      1520      1530      1540        

    2670      2680      2690      2700      2710      2720         
pF1KA0 QDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGA
        ::..   :  ... .. ..::.                                     
CCDS69 -DLAEIRADK-QNLEAILHSLPENCASWQ                               
      1550       1560      1570                                    

>>CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17               (604 aa)
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                        10        20        30        40        50 
pF1KA0          MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFN
                            :::  ::.  ...: :        .: :      : . :
CCDS11 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRG--GPGLSMFAGQAAQPDP-CSDENGHPRRCIPDFVN
               10        20          30        40         50       

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA0 LAEGARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANS
        : :  . .:.:::.  :::         ::      :..   .. .:.  : .:.:.. 
CCDS11 AAFGKDVRVSSTCGRP-PAR---------YC------VVSERGEERLRS--CHLCNASDP
        60        70                        80        90           

             120           130        140       150       160      
pF1KA0 NKAHPASNAIDGTERW----WQSPPLSRGLEY-NEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPR
       .:::: .   : ..      :::      :.. ..:..::.::. :.:.:: ..:  :::
CCDS11 KKAHPPAFLTDLNNPHNLTCWQSENY---LQFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFC-SPR
     100       110       120          130       140       150      

        170       180       190       200       210         220    
pF1KA0 PDLWVLERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDA--AICTTEYSRIVP
       :.  .. .:::.:::. :.::.... :   .:  :.    ::...   :.::  .. . :
CCDS11 PESMAIYKSMDYGRTWVPFQFYSTQCRKMYNR--PHRAP-ITKQNEQEAVCTDSHTDMRP
         160       170       180         190        200       210  

          230       240       250       260       270       280    
pF1KA0 LENGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVT
       : .: :. : ..:::.: .:. ::.:.... ::..:. : :      : .:   .: .  
CCDS11 LSGGLIAFSTLDGRPSAHDFDNSPVLQDWVTATDIRVAFSRL-----HTFGDENEDDSEL
            220       230       240       250            260       

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pF1KA0 RR--YYYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQ
        :  :.:...:...:::: :.:::  : ..:  :   : : :.::: :  :::: :   .
CCDS11 ARDSYFYAVSDLQVGGRCKCNGHAARC-VRDRDDS--LVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYD
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pF1KA0 QPWKPATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTG
       .::. :::  :::: .:::  ::  : .. :. .      :.:  ..::::..:.:.:.:
CCDS11 RPWQRATAREANECVACNCNLHARRCRFNMELYK------LSGR-KSGGVCLNCRHNTAG
          330       340       350             360        370       

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pF1KA0 VNCERCLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDG-TCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVC
        .:. :  :.::. ..:.   ..:. :.:.   . : ::.. ::.: :. . .:  :. :
CCDS11 RHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKACDCHPVGAAGKTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRC
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pF1KA0 AEGF----TGFPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNA-------CRKDP
       :.:.    . .  :   : .   :  . .   .  .::    ...:.        :.:: 
CCDS11 AKGYQQSRSPIAPCIKIPVAPPTTAASSVEEPE--DCDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDY
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pF1KA0 RVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGAT
        :   . : .  :                                               
CCDS11 AVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYKQGTSRIRRGDQSLWIRSRDIACKCPKIKPLKKY
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3690 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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