Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5616
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5616, 788 aa
1>>>pF1KB5616 788 - 788 aa - 788 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6023+/-0.00143; mu= 15.6446+/- 0.086
mean_var=191.9897+/-35.742, 0's: 0 Z-trim(107.1): 130 B-trim: 34 in 1/50
Lambda= 0.092563
statistics sampled from 9235 (9365) to 9235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 5529 752.2 7.2e-217
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 3122 430.8 4.2e-120
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 2896 400.6 5e-111
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 2794 387.0 6.1e-107
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 2621 363.8 5.3e-100
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2408 335.5 2.1e-91
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2065 289.7 1.3e-77
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 2020 283.6 7.6e-76
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 2018 283.4 9.8e-76
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1537 219.6 3.5e-56
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1537 219.6 3.6e-56
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1385 198.8 2.7e-50
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 510 81.6 2.5e-15
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 510 81.6 2.7e-15
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 510 81.7 2.9e-15
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 431 71.2 4.7e-12
>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa)
initn: 5529 init1: 5529 opt: 5529 Z-score: 4007.0 bits: 752.2 E(32554): 7.2e-217
Smith-Waterman score: 5529; 100.0% identity (100.0% similar) in 788 aa overlap (1-788:1-788)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 TNITYRGT
::::::::
CCDS11 TNITYRGT
>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa)
initn: 3007 init1: 2122 opt: 3122 Z-score: 2269.7 bits: 430.8 E(32554): 4.2e-120
Smith-Waterman score: 3122; 55.7% identity (78.9% similar) in 788 aa overlap (5-781:2-782)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPR-PRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPL
:: : ::.: .:.: :: ..: ::::. ...::..:: . : ::::: : .
CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPR-LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKE--DF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GSPR-----CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSS-QVTQVSPQR
:::: :::. ::.:..:. : :: :.: .::.. :::.::::... .: :..::.
CCDS30 GSPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTS
::. ::: :. .:..:::::::::::.::::::: :::::: .:..:::::: .::::::
CCDS30 IAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPC--YDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNE
:.:.:::.:::: .::. : . :. ::: : . .:.: ::..:.: :::.: :::
CCDS30 NFRLGFGSFVDKDISPFSY-TAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGI
::.:: ::::::::::::::..::.:: ::::::.:: :::::::: ::::::.:.:.
CCDS30 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELI
:::.:::::.. :.:.::. ::::::.:. :::...:::::::::.: ::.:.. ::
CCDS30 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKS
::::: .:. ::.:..:::..::..::::::: : : ::.:.: :.::: .. :: ..
CCDS30 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEK-EKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPN
: :::::::.:: . ..:.::... :. :...::::.::: : ::..: :.:.. :::
CCDS30 CEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCG
: ::: :.::. ::.:.:.::.::..:::.. . . :. : ::.:.:: ::.: :.
CCDS30 SARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRT
:: : :.:::: : .::::.:::.: :: .:::::.: ::.: : . . : :::.:
CCDS30 QCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 DTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGA
.:: . .: .:: ::.: ::.: : .::..:. :::::::::::. :..:::: . :
CCDS30 STCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KB5 LHDENTCNRYCRDEIES-VKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVE
:..::. ::::. . : . ..:: : ::. :::. : : : :::: : :..
CCDS30 -PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLR
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 EPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTAN
:::: . :. ...::.:.:.:::.::: : :::::.:::::.:::::. ::.::... :.
CCDS30 EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMAS
720 730 740 750 760 770
770 780
pF1KB5 NPLYKEATSTFTNITYRGT
::::.. :: :
CCDS30 NPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
780 790
>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa)
initn: 2296 init1: 921 opt: 2896 Z-score: 2106.7 bits: 400.6 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2896; 51.1% identity (78.6% similar) in 760 aa overlap (31-786:23-775)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
:. :. .:..:: ..:.::::..: . :
CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
: . ::: ::: .: . :: :::....:...::: . .::...:..:: . :.
CCDS22 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
::: .......:::.::::::.::::::: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.
CCDS22 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQS
:::.::.:::::.. .: : . ::: .. ::: ::.::.: ::... :::: ::.:.
CCDS22 GFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDG
.: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::::..:: .:...:..::::: ::::
CCDS22 ISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVG
::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::
CCDS22 LCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKI
.:. ::.:.::::..:: ..::.::::: : :.:::.: : :. .. :.: .:.
CCDS22 LLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNG
:::.:::. ... : ... . . :::::. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:
CCDS22 GDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
::.:.:::: : :: .: .:::.: :. . : :. .: :: ::.: ::::.:: :
CCDS22 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
.:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:.:.::.:.: : ::: :::::: ::.:.: .
CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSED
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
:.:::::: : ::.::: .::. : :::.:::: : :. :. :.::. : ..: :
CCDS22 GVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--C
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKG
:. ...: .: .:: .:.:. ..:..:.. : :. ::.:.. ..: .:::
CCDS22 VDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKP
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 PDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEA
:.: ...:.: ::::::.. : :::::...::::: :::: ::..:::.:..::::. .
CCDS22 PNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGS
710 720 730 740 750 760
780
pF1KB5 TSTFTNITYRGT
:::: :.::.
CCDS22 TSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
770 780
>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa)
initn: 2227 init1: 921 opt: 2794 Z-score: 2033.4 bits: 387.0 E(32554): 6.1e-107
Smith-Waterman score: 2794; 51.6% identity (78.7% similar) in 731 aa overlap (58-786:10-733)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 PNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSE
: : . ::: ::: .: . :: :::.
CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQ
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDL
...:...::: . .::...:..:: . :.::: .......:::.::::::.::::::
CCDS74 VEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 SYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDM
: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.:::.::.:::::.. . :: . ::: ..
CCDS74 SASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVK-TTPEEIANPCSSI
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 KTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRN
::: ::.::.: ::... :::: ::.:..: : :.:::::::::::.:: :::::::
CCDS74 PYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRN
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 DASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLS
:. :::::..:: .:...:..::::: :::: ::. : :.:: ::...::..: . .::
CCDS74 DSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLV
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 QKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVR
:.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::.:. ::.:.::::..:: ..::.:::::
CCDS74 QNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVG
: :.:::.: : :. .. :.: .:.:::.:::. ... : ... . . :::::
CCDS74 GDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVG
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 FKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRP
. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:::.:.:::: : :: .: .:::.: :.
CCDS74 LGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLS
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHG
. : :. .: :: ::.: ::::.:: : .:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:
CCDS74 T--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 QCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEK
.:.::.:.: : ::: :::::: ::.:.: .:.:::::: : ::.::: .::. : :::.
CCDS74 DCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCER
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 CPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKN
:::: : :. :. :.::. : ..: : :. ...: .: .:: .:.:. ..
CCDS74 CPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--CVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQG
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 EDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLI
:..:.. : :. ::.:.. ..: .::: :.: ...:.: ::::::.. : :::::.
CCDS74 ENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLV
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780
pF1KB5 TIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
..::::: :::: ::..:::.:..::::. .:::: :.::.
CCDS74 SFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
700 710 720 730 740
>>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (693 aa)
initn: 2227 init1: 921 opt: 2621 Z-score: 1908.9 bits: 363.8 E(32554): 5.3e-100
Smith-Waterman score: 2621; 52.6% identity (79.5% similar) in 665 aa overlap (123-786:23-680)
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 RPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKD
.......:::.::::::.::::::: :: :
CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDD
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 DLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLP
:: .:..::..:. .: :::::.:.:::.::.:::::.. .: : . ::: .. :::
CCDS74 DLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLP
60 70 80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 MFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLL
::.::.: ::... :::: ::.:..: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::
CCDS74 TFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLL
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 VFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINL
::..:: .:...:..::::: :::: ::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. :
CCDS74 VFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLL
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 IFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEEL
:::::.. :.::.::..::::.:::.:. ::.:.::::..:: ..::.::::: : :
CCDS74 IFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGL
240 250 260 270 280 290
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLI
.:::.: : :. .. :.: .:.:::.:::. ... : ... . . :::::. :.:
CCDS74 NLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALE
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 VQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDEC
. :. .:.: :: ..: :: .:..:::.:.:::: : :: .: .:::.: :. . : :
CCDS74 LLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSC
360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 SPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGD
. .: :: ::.: ::::.:: : .:.: : ::.::.:::::.:: .:.:.:.:.::.
CCDS74 KEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGE
410 420 430 440 450 460
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 CLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPD
:.: : ::: :::::: ::.:.: .:.:::::: : ::.::: .::. : :::.:::: :
CCDS74 CVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGD
470 480 490 500 510 520
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 ACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKD-AVNCTYKNEDDCVV
:. :. :.::. : ..: : :. ...: .: .:: .:.:. ..:..:..
CCDS74 PCNSKRSCIECHLSAAGQAREE--CVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLI
530 540 550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 RFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRK
: :. ::.:.. ..: .::: :.: ...:.: ::::::.. : :::::...::::
CCDS74 TFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRK
590 600 610 620 630 640
760 770 780
pF1KB5 EFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
: :::: ::..:::.:..::::. .:::: :.::.
CCDS74 EVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
650 660 670 680 690
>>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa)
initn: 1701 init1: 479 opt: 2408 Z-score: 1754.5 bits: 335.5 E(32554): 2.1e-91
Smith-Waterman score: 2480; 45.1% identity (73.7% similar) in 778 aa overlap (29-787:25-797)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSD-----E
: : ...:: .:. ..: :.::.. :
CCDS71 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 ALPLGSPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQ-----VTQVS
..: : ::: : : : .: :..:: : . . ... ......: . . .::..
CCDS71 GMPT-SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRK
::...:::: . ..:... ...::::.:.:::::::::::::: ....::: : ..::.
CCDS71 PQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFN
.::..:::::.::.: : ::. .: . :.::: . .. : :.::.::.::.. ::
CCDS71 ITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAK-LRNPCTSEQN-CTSPFSYKNVLSLTNKGEVFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAG
: : :: .: : :.::::::::::..:: ::::: ...::::.::: :.: ::.:.:
CCDS71 ELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRN-VTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSEL
:: :::::::. .: :. : .::::.. ...:::..::. ::::::. .:.. ..:
CCDS71 IVLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB5 IPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLN--NEVIPG
:: ..::.:: .::::.:::.:::... :.: :: : : ...:... : : : . .
CCDS71 IPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGEN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAE
..: ...::: :.: : ::.. :: :.:.:: . . : . . :.: ::...
CCDS71 GRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE-CSPREGQPVCSQRGEC
:.: .:..::::::::.:::. : .: .:::: .. ..: : .... .::. :::
CCDS71 PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGEC
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LCGQCVCHSSD-FGKI-TGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCN
.::::::.. : ..: .::.::::.:.: : .: .:.:.: :.: : :. ..:: :.
CCDS71 VCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 CTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKK
:. :.:: .::: .:.::: :::: : : .: :.::: : :: .:. .::::.:.
CCDS71 CSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRA
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 FDRGALHDENT--CNRYCRDEIESVKEL-KDTGKDAVN-CTYKNEDDCVVRFQYYEDSSG
:..: .: : :. . ..:: .: . . : :. : :. ::: : : ....
CCDS71 FNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNN
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 KSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERA
. ...:::.:::: ::::. .. .:...:.::::: :::::::. ::::.::::::.:.
CCDS71 EVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKM
720 730 740 750 760 770
770 780
pF1KB5 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
:::::..::.:: :..: .: :.:
CCDS71 NAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
780 790
>>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 (798 aa)
initn: 1114 init1: 607 opt: 2065 Z-score: 1506.9 bits: 289.7 E(32554): 1.3e-77
Smith-Waterman score: 2065; 40.3% identity (68.1% similar) in 762 aa overlap (38-786:50-791)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 RPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLGSP----R
:::.:. : ::::.. . .. :
CCDS88 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDS
: .:.:: .: : .: : .. .::.:.:::. . :... ::..:::. . ::: .
CCDS88 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA--TQLAPQRVRVTLRPGEP
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFV
...... ..: ::::.:::::::::::::: ...:: : ......: ..:::::.::
CCDS88 QQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRD
:: : :.. . : :..:: : :...:::.:: .. :..:: .:::: : :
CCDS88 DKTVLPFVS-TVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLD
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 APEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGS
.::::::::.::..:.:.::::: .:.:::::.: : : ::.:.:: .:.::.::. :
CCDS88 SPEGGFDAILQAALCQEQIGWRN-VSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDS
.. :: :: .::::.: ... :: ::. ::::: .. .::. :.::: ..:: :: ::
CCDS88 NGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDS
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KB5 SNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK----SCMGLKIGD
:::.:::.:::... : : :: .:: . .:... : . : : .: ..:..
CCDS88 SNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQ
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNG
::.: . .. : : . . .. .::.. :::.. ::: : ....:.. .:..:.:
CCDS88 TVTFWVSLQATHCLPEPHL-LRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPHCSDGQG
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TFECGVCRCGPGWLGSQCECS-EEDYRPSQQDEC-SPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
..:::: :.:: :: :::: : :. .. : .: :.:: .:.: ::.: :
CCDS88 HLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCS--
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
:. .:. ::::: :: :..: .:.: :.:.:: : : .. :: :.:. :.:.: .
CCDS88 --GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPE
560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
: ::::.:.:.:. : :.. : :: :..:: : : ...:.:: : : : ..:
CCDS88 GGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPL--ATNC
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NRYC--RDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPK
. : . .. . : : : .. :. . : .:. : .: : .:. :
CCDS88 STACAHTNVTLALAPILDDGW----CKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRV--RPQ-EK
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 GPD-ILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYK
: : ...:. .:.:. .::. .: ..: . :.::.:...::.:. . .: .:::::
CCDS88 GADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYK
720 730 740 750 760 770
780
pF1KB5 EATSTFTNITYRGT
: .: : ..
CCDS88 SAITTTINPRFQEADSPTL
780 790
>>CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (681 aa)
initn: 2296 init1: 912 opt: 2020 Z-score: 1475.2 bits: 283.6 E(32554): 7.6e-76
Smith-Waterman score: 2203; 44.3% identity (68.5% similar) in 759 aa overlap (31-786:23-668)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
:. :. .:..:: ..:.::::..: . :
CCDS63 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LG-SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALR
: . ::: ::: .: . :: :::....:...::: . .::...:..:: . :.
CCDS63 SGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRI
::: .......:::.::::::.::::::: :: ::: .:..::..:. .: :::::.:.
CCDS63 LRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQS
:::.::.:::::.. .: : . ::: .. ::: ::.::.: ::... :::: ::.:.
CCDS63 GFGSFVEKPVSPFVKTTP-EEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDG
.: : :.:::::::::::.:: ::::::::. :::::..:: .:...:..::::: ::::
CCDS63 ISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVG
::. : :.:: ::...::..: . .:: :.:. ::::::.. :.::.::..::::.:::
CCDS63 LCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKI
.:. ::.:.::::..:: ..::.::::: : :.:::.: : :. .. :.: .:.
CCDS63 LLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNG
:::.:::. ... : ... . . :::::. :.: . :. .:.: :: ..: :: .:..:
CCDS63 GDTASFSVTVNIPHC-ERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
::.:.:::: : :: .: .:::.: :. . : :. .: :: ::.: ::::.:: :
CCDS63 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGE-DMLST--DSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
.:.: : ::.::.:::::.:
CCDS63 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHK---------------------------------------
530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
:::: :: :.:.
CCDS63 GLLC-------------------GD-------------FSKD------------------
550
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGP
.:.:. ..:..:.. : :. ::.:.. ..: .::: :
CCDS63 -------------------GSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPP
560 570 580 590
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEAT
.: ...:.: ::::::.. : :::::...::::: :::: ::..:::.:..::::. .:
CCDS63 NIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGST
600 610 620 630 640 650
780
pF1KB5 STFTNITYRGT
::: :.::.
CCDS63 STFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
660 670 680
>>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 (769 aa)
initn: 1251 init1: 374 opt: 2018 Z-score: 1473.2 bits: 283.4 E(32554): 9.8e-76
Smith-Waterman score: 2075; 40.3% identity (68.3% similar) in 791 aa overlap (6-782:5-763)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
:: :: ::: .: ..: . :: ::::..:. .: :.::. . :
CCDS13 MLGLRP-PL----LALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LGSP---RCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIA
:.: ::: . .:: .:: ..: :.: :.. ::. ..: :.:::...
CCDS13 -GDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK---------QLSPQKVT
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNL
: ::: .. :.. :... ::.:.:::::::::: ::: ....:: : . ..: .
CCDS13 LYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKK
:::::.:::: : :.. . :. :.::: . . : : :...::: ::.. ..:. :: :
CCDS13 RIGFGSFVDKTVLPFVN-THPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPN
: .: : ::::::.::.::...: :.::::: ...::::.:: :.: ::.:..:. ::
CCDS13 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRN-VTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTT
::.::. :: :. :. .::::.: ...::...::. ::::: .:. :.. .:.:: ..
CCDS13 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK--SCM
:: :: :::::..:: .::.:. :.: :. ::. :...... : :. . . .:
CCDS13 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHR
:..:. ..:.... . : ::. ::.:. .:: : . ::: .:.: :. :.. :
CCDS13 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQ--SFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL-
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 CNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE--CSPREGQPVCSQRGECLCGQ
:. :.: .:::.::: :..:..:::. . : ::. : : ... .:: :.:.:::
CCDS13 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQG-RSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQ
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KB5 CVCHSSDF-GK-ITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQ--CSCGDCLCDSDWTGYYCNCT
:.::.:: :: : :.::::: ..: ::.:..:.: :. : :: : : . : :.:
CCDS13 CLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCE
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 TRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFD
:. :.. . :::::.:.:. : : . : :..:: ::. : :.:: ::.
CCDS13 RTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFE
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 RGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQY-YEDSSGKSILY
.: . ..:. : : . .: :. .: .. . : : . .:. . ..:
CCDS13 KGPFG--KNCSAACPGLQLSNNPVK--GR---TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIY
640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 VVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWD
: : :: ::.: ... .....:.:::. :.::: :: . : .:. .::.:. ...:.
CCDS13 VDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN
690 700 710 720 730 740
770 780
pF1KB5 TANNPLYKEATSTFTNITYRGT
. .:::.: ::.: :
CCDS13 N-DNPLFKSATTTVMNPKFAES
750 760
>>CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752 aa)
initn: 1003 init1: 506 opt: 1537 Z-score: 1122.1 bits: 219.6 E(32554): 3.5e-56
Smith-Waterman score: 1655; 36.6% identity (64.4% similar) in 759 aa overlap (3-742:2-734)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGP--NICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALP
: ::: : :: .: :.:: .:...: : : :.:: .:. :. ::.:.:: .
CCDS58 MAGPRPSP-WARLL-LAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDEMF-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LGSPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRL
. ::. . .:: .: ::: : .. :. .. . . .:.::: . .::
CCDS58 -RDRRCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDT-----TLRRSQMSPQGLRVRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIG
:: . ..: ..: . . :::.: :::.: ::.::: .....: .:: . .:::. ::
CCDS58 RPGEERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLTSDYTIG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSV
:: :::: : . : : :..: . : :..:.:..::..: .: .... . .
CCDS58 FGKFVDKVSVPQTDMRP-EKLKEP----WPNSDPPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQGERI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGR--LAGIVQPND
: : ::::::::::.:..:: . :::: :..:::::.:.. : :: ::::.. ::
CCDS58 SGNLDAPEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGIMSRND
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTV
.::. . . :. :.::::. ... :...:: :::::. . :.. .: ...
CCDS58 ERCHLDTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYFPVSSL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLK
:::. ::::...:. .:...:::...... : :. : .. ... ... : .
CCDS58 GVLQEDSSNIVELLEEAFNRIRSNLDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQKTRTGSFHIRRG-E
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB5 IG-DTVSFSIEAKVRG---C--PQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCD-CACQAQAEP
.: :.. .: : : :.... .. .:: .:.:.: ... . :: :.:. : :
CCDS58 VGIYQVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKP-SFSDGLKMDAGIICDVCTCELQKEV
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQ--PVCSQRGEC
: ::. :: : :: : :. :: :. :.:: . :. . : :::. : :: ::::
CCDS58 RSARCSF-NGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSL--SDIQPCL-REGEDKP-CSGRGEC
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LCGQCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCT
::.:::.. :. :..:: :.:.: : .: .:. .:.:: :.:.:. ::: :.:
CCDS58 QCGHCVCYGE--GRYEGQFCEYDNFQCPRTSGFLCNDRGRCSMGQCVCEPGWTGPSCDCP
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 TRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDT-CEKCPTC--PDACTFKKECVECK
. ::..::: .:.:::.:::: : : : . : :: :: . : : . ::.:.
CCDS58 LSNATCIDSNGGICNGRGHCECGRCHCHQQSLYTDTICEINYSAIHPGLCEDLRSCVQCQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 KFDRGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDD-CVVRFQYYEDSSG--
. : . . ::.. : ... : ::: . . .: :....::: :. . . :..
CCDS58 AWGTGEKKGR-TCEE-CNFKVKMVDELKRAEEVVVRCSFRDEDDDCTYSYTMEGDGAPGP
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 KSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERA
.: . : .. .:: : .. : .. . :..: :: ::
CCDS58 NSTVLVHKKKDCPPGSFWWLIPLLLL-LLPLLALLLLLCWKYCACCKACLALLPCCNRGH
700 710 720 730 740 750
770 780
pF1KB5 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
CCDS58 MVGFKEDHYMLRENLMASDHLDTPMLRSGNLKGRDVVRWKVTNNMQRPGFATHAASINPT
760 770 780 790 800 810
788 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:15:01 2016 done: Sat Nov 5 22:15:01 2016
Total Scan time: 4.040 Total Display time: 0.270
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]