Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0094
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0094, 535 aa
1>>>pF1KE0094 535 - 535 aa - 535 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4915+/-0.00109; mu= 18.5669+/- 0.066
mean_var=85.0376+/-16.751, 0's: 0 Z-trim(104.8): 33 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.139081
statistics sampled from 8060 (8092) to 8060 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2 ( 535) 3558 724.2 8.9e-209
CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 ( 534) 3188 650.0 2e-186
CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 ( 548) 3188 650.0 2e-186
CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15 ( 541) 2748 561.7 7.6e-160
CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19 ( 543) 2608 533.6 2.2e-151
CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16 ( 431) 755 161.7 1.5e-39
CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16 ( 473) 755 161.8 1.7e-39
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1 ( 896) 332 77.1 9.6e-14
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 601) 327 76.0 1.4e-13
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 754) 327 76.1 1.7e-13
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 864) 327 76.1 1.9e-13
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 910) 327 76.1 1.9e-13
>>CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2 (535 aa)
initn: 3558 init1: 3558 opt: 3558 Z-score: 3861.6 bits: 724.2 E(32554): 8.9e-209
Smith-Waterman score: 3558; 100.0% identity (100.0% similar) in 535 aa overlap (1-535:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
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CCDS17 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
490 500 510 520 530
>>CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 (534 aa)
initn: 3220 init1: 3188 opt: 3188 Z-score: 3460.4 bits: 650.0 E(32554): 2e-186
Smith-Waterman score: 3188; 87.0% identity (97.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
::::.. : ::.:.::.::::.:::..:: .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: ::..:::::::::..
CCDS80 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
:::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS80 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
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CCDS80 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
. ::.::::::: :: :::..::::::.:::.:::.:::::: : :.::::::.::..:
CCDS80 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
::::::::::::::::.::::..::: :::::::::::.:::::::::::::.:::::.:
CCDS80 PFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
:::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::: .:: ::.:::::.
CCDS80 LGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
490 500 510 520 530
>>CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11 (548 aa)
initn: 3220 init1: 3188 opt: 3188 Z-score: 3460.3 bits: 650.0 E(32554): 2e-186
Smith-Waterman score: 3188; 87.0% identity (97.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:15-546)
10 20 30 40
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFH
::::.. : ::.:.::.::::.:::..:: .:::::::::::::::
CCDS73 MEQPGTAASPVSGSMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDME
::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: :
CCDS73 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GIIPGNALVVDPKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRIS
:..:::::::::..::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::::
CCDS73 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIET
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS73 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QQLMRVYGALMWSLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLP
:::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS73 QQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREH
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..:::::::::.::: .:::::
CCDS73 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QISPGDFPNLKRMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPI
::::::::.:..::. ::.::::::: :: :::..::::::.:::.:::.:::::: :
CCDS73 QISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 QMVKGGAFEGTLHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGAN
:.::::::.::..:::::::::::::::::.::::..::: :::::::::::.:::::::
CCDS73 QVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGAN
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 AKKEMVRSKLPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLL
::::::.:::::.::::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::: .:: ::.
CCDS73 AKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLV
490 500 510 520 530 540
530
pF1KE0 PPSKRKVAE
:::::.
CCDS73 PPSKRRHE
>>CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15 (541 aa)
initn: 2751 init1: 2719 opt: 2748 Z-score: 2983.2 bits: 561.7 E(32554): 7.6e-160
Smith-Waterman score: 2748; 75.3% identity (90.7% similar) in 535 aa overlap (1-532:1-535)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFSWLGTD--DRRRKD-PEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDN
::::.: . :.: .. :::. ::..:: :.::::: ::::::::::::::::.:
CCDS10 MFSWMGRQAGGRERAGGADAVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFEN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KPMVLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVD
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. :: ::::::::
CCDS10 KPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEW
::::::::. :::::::::.:.:::: ::.::::::.::::::::::::::::: ::.:
CCDS10 PKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALM
:::::::::::::::::::::::::.:::.....::.:::::::::..::::::::::::
CCDS10 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 WSLGKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDL
:::::..:::::.::::::::..:: :::.::::: :::::::::::..::.::::::
CCDS10 WSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IKRARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLK
::::::::::::::: :::::::::::.:::.::.. : ::: ...::.::: ::::..:
CCDS10 IKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGT
::.::. ::.::. :: ::.:.::.::.. :. :: :. :::.. : :.:.::::.::
CCDS10 AMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDGT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LHGPFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLP
.:::..:::::: :: :. :::::.:::.:::.::::::..:::.:.::::::: ::::
CCDS10 TEGPFNQGYGEGAKEGADEEEWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEMVTSKLP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 NSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
:::::::::::: : :::::..:::::.::::.::.:.:::. :: ::.:::.::
CCDS10 NSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRKSLPKA
490 500 510 520 530 540
CCDS10 D
>>CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19 (543 aa)
initn: 2602 init1: 2142 opt: 2608 Z-score: 2831.4 bits: 533.6 E(32554): 2.2e-151
Smith-Waterman score: 2608; 71.7% identity (89.0% similar) in 537 aa overlap (1-532:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
::::: : ..::...::. .::.::..::::::::::: ::::::::::::.:::
CCDS12 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
::..::::::::.::.:::::. :: :.::::::: :.:::.:: :: .::::::::: :
CCDS12 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
:::::: :::.:::::.:::::: ::::::.::::::::: :::.:::::: :::.::::
CCDS12 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
::: ::::::::::.:::::::.: ::..::::.::::::::..::::::::::::::.:
CCDS12 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
::.:.::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::::::.:::.:::::::::.::
CCDS12 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
:::..::::::: :::::::::::.::::.:. .: :...:. ::.:::::::. ..::
CCDS12 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
. :.:.::.::. :: ::::..:.::.::::.:: :.:::: . :.::::::: :
CCDS12 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE0 PF---GHGYG-EGAGEGIDD-AEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSK
:: : . : . :: :: :::::..:: ::::::.:.:.:::..:..:: :: .:
CCDS12 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
:::::::.::::.:.:.::::::.:::::.:::..::::: :: .:: .:.:::::.
CCDS12 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
490 500 510 520 530 540
CCDS12 SAE
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: . ...: . :.:.:.:.. :::. :...:... . :... .:::
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::..: .:.::.:.: ::: :. . : ::::. : ..:.: : : ....:
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.:.: :...:: :::.. :. ... ::..:...:..:::::.. ::.::::::::.:
CCDS81 IDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNKADNLATQMLMRVYGALFW
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::. ..:. : :::..::: . ...:: :: .:..:.... .: :. .
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..: ...:: ... . : .: .: .:.. :..:.. . :. : . ..:
CCDS81 QHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKM--TFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTILAKTNVSK
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:.:: . ..: . . .:.:. :...
CCDS81 FDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAITQELPGLLGSLGLGKNP
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>>CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16 (473 aa)
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10 20 30 40
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: . ...: . :.:.:.:.. :::. :..
CCDS42 GQAEETEDANEEAPLRDRSHIEKTLMLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKY
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50 60 70 80 90 100
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.:... . :... .:::::..: .:.::.:.: ::: :. . : ::::. : ..
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:.: : : ....: . : :. ::. ::.... ..:. .:: .. .:::::. .
CCDS42 MHGPKLKTIEGIVMAADSARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIEN
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170 180 190 200 210 220
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.::. ::: : : .:: .:.: :...:: :::.. :. ... ::..:...:..:::
CCDS42 RKQQ-ERGYPFNDVCQWFIDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNK
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230 240 250 260 270 280
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::.. ::.::::::::.:::. ..:. : :::..::: . ...:: :: .:..
CCDS42 ADNLATQMLMRVYGALFWSLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLE
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290 300 310 320 330
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:.... .: :. . ..: ...:: ... . : .: .: .:.. :..:..
CCDS42 DLNQVIENRLENKIAFIRQHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKM--TFFSDGELVFKDIVED
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. :. : . ..: :.:: . ..: . . .:.:. :...
CCDS42 PDKFYIFKTILAKTNVSKFDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERA
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CCDS55 NGFLSGDKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVP
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CCDS55 MSLPPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSTLL
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CCDS58 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
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CCDS58 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]