Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9870
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9870, 477 aa
  1>>>pF1KB9870 477 - 477 aa - 477 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1551+/-0.000877; mu= 19.1148+/- 0.053
 mean_var=145.6442+/-57.065, 0's: 0 Z-trim(108.1): 228  B-trim: 1241 in 2/48
 Lambda= 0.106274
 statistics sampled from 9546 (10010) to 9546 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.307), width:  16
 Scan time:  3.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477) 3285 516.2  3e-146
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446) 1045 172.7 7.1e-43
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  553 97.2 3.3e-20
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  500 89.3 1.2e-17
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  478 85.8 1.1e-16
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  469 84.3 2.5e-16
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  464 83.6 4.4e-16
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  457 82.6 9.9e-16
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  456 82.5 1.2e-15
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  444 80.4 3.4e-15
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  444 80.4 3.5e-15
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  444 80.5 3.8e-15
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  444 80.6 3.9e-15
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  444 80.6   4e-15
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  444 80.6   4e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  417 76.4 6.6e-14
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  417 76.4 6.7e-14
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  416 76.1 6.8e-14
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  417 76.4 6.8e-14
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  417 76.4   7e-14
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  416 76.2 7.2e-14
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  414 75.9 9.1e-14
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  404 74.4 2.7e-13
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  400 73.8 4.3e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  396 73.1 5.7e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  396 73.1 5.7e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  396 73.1 5.8e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  396 73.1 5.9e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  396 73.1 5.9e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  396 73.1 6.1e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  396 73.2 6.3e-13
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365)  389 72.0 1.2e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  388 72.0 1.5e-12
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  385 71.5 2.1e-12
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11           ( 419)  370 69.2 9.8e-12
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  370 69.3 1.1e-11
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  368 68.9 1.2e-11
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  368 68.9 1.3e-11
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  368 68.9 1.3e-11
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  365 68.6   2e-11
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400)  361 67.8 2.5e-11
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  357 67.1 3.6e-11
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  356 67.1 4.6e-11


>>CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4                 (477 aa)
 initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285  Z-score: 2739.0  bits: 516.2 E(32554): 3e-146
Smith-Waterman score: 3285; 100.0% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGNVL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGAFCDVWVAFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGAFCDVWVAFD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 IMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQLNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQLNW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 HRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIPVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIPVAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 MIVTYTRIYRIAQVQIRRISSLERAAEHAQSCRSSAACAPDTSLRASIKKETKVLKTLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MIVTYTRIYRIAQVQIRRISSLERAAEHAQSCRSSAACAPDTSLRASIKKETKVLKTLSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 IMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 FNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       
pF1KB9 GNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAESVWELDCEGEISLDKITPFTPNGFH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAESVWELDCEGEISLDKITPFTPNGFH
              430       440       450       460       470       

>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5                 (446 aa)
 initn: 1627 init1: 784 opt: 1045  Z-score: 883.2  bits: 172.7 E(32554): 7.1e-43
Smith-Waterman score: 1647; 58.2% identity (79.1% similar) in 450 aa overlap (40-477:23-444)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB9 AYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGNVLVCAAIVRSR
                                     ...:::.:.:::. :::::.:::::..: :
CCDS43         MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFR
                       10        20        30        40        50  

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB9 HLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGAFCDVWVAFDIMCSTASIL
       :::...:: :..:::::::.::.::::::::::.::.::::.::..::::::::::::::
CCDS43 HLRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSFCNIWVAFDIMCSTASIL
             60        70        80        90       100       110  

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB9 NLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQLNWHRDQAASWG
       :::::::::::::: ::::.:::: . :......:::::.:::::::::.::. . .:  
CCDS43 NLCVISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTS--
            120       130       140       150       160       170  

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB9 GLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIPVAIMIVTYTRIY
           :.. .: :   : .       .::::::.::::::::.::::::::::::::::::
CCDS43 ----PSD-GNATSLAETI-------DNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIY
                   180              190       200       210        

     250       260       270              280       290       300  
pF1KB9 RIAQVQIRRISSLERAAEHAQSCRSSAA------CA-PDTSLRASIKKETKVLKTLSVIM
       :::: :::::..::::: ::..:.....      :. :..:.. :.:.::::::::::::
CCDS43 RIAQKQIRRIAALERAAVHAKNCQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIM
      220       230       240       250       260       270        

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB9 GVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFN
       :::::::::::::::..::: :  :  :  : :.. .:::::::::::::::::.:::::
CCDS43 GVFVCCWLPFFILNCILPFC-GSGETQP--F-CIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFN
      280       290        300          310       320       330    

            370       380         390          400       410       
pF1KB9 ADFQKVFAQLLGCSHFCSRT--PVETVNISNE---LISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNA
       :::.:.:. :::: ..:  :   .:::.:.:.   ..: ...           ....:.:
CCDS43 ADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHA
          340       350       360       370       380       390    

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB9 VTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAESVWELDCEGEISLDKITPFTPNGFH
       :  :. :  . :: . . : ..  . ::     : ::  :: . ..::.:: :.: :: :
CCDS43 V--GSSEDLKKEEAAGIARPLE--KLSP-----ALSVI-LDYDTDVSLEKIQPITQNGQH
            400       410              420        430       440    

CCDS43 PT
         

>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 608 init1: 239 opt: 553  Z-score: 476.2  bits: 97.2 E(32554): 3.3e-20
Smith-Waterman score: 597; 31.7% identity (59.8% similar) in 410 aa overlap (1-373:1-371)

               10        20        30          40        50        
pF1KB9 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPP--LGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGN
       : : .... . : : :  ..:   ::.  : .  :  :   ..  : .:... . :.:.:
CCDS23 MSPLNQSAEGLP-QEASNRSL---NATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSN
               10         20           30        40        50      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 VLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGA-FCDVWV
       ..: ..:. .:.:..  .: .: :::..::.:..:::: . .  ..  : ::  .::.:.
CCDS23 AFVLTTILLTRKLHTP-ANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWL
         60        70         80        90       100       110     

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 AFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQ
       . :: : :::::.::::..::::::.  ..:... :   : .:....:..:: ::. :  
CCDS23 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPP--
         120       130       140       150       160       170     

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 LNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIP
       : :.. .:      .. . :.:                   :..  .:.: :.  .::::
CCDS23 LFWRQAKAQE----EMSDCLVN------------------TSQI--SYTIYSTCGAFYIP
           180           190                           200         

       240       250               260       270                   
pF1KB9 VAIMIVTYTRIYRIAQVQI--------RRISSLERAAEHAQS--C---------RSSAAC
        ...:. : :::: :. .:        .:... .  .  : :  :         .: .: 
CCDS23 SVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAG
     210       220       230       240       250       260         

      280                     290       300       310       320    
pF1KB9 AP-----------DTSL---RASIKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSG
       .:           :..:   : :  .: :. : :..:.:.:. ::::::... ..:.:  
CCDS23 SPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRD
     270       280       290       300       310       320         

          330       340       350       360        370       380   
pF1KB9 HPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYA-FNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTP
            ::         :: :.:.:. :: .::.::. :: .:...: ...          
CCDS23 SCWIHPA--------LFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS    
     330               340       350       360       370           

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 VETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQT

>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20              (572 aa)
 initn: 636 init1: 241 opt: 500  Z-score: 430.5  bits: 89.3 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 678; 34.3% identity (63.9% similar) in 385 aa overlap (24-381:78-423)

                      10        20        30          40        50 
pF1KB9        MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSA--GAPPLGPSQVVTACLLTLLI
                                     :. :.:.:  :.  .. . : .. .:. .:
CCDS13 GGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFI
        50        60        70        80        90       100       

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 IWTLLGNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFG-
       . .. ::.::  ... .:::.. .:: :::.:::.::...  :.:..:. :: :.: :: 
CCDS13 LMAVAGNLLVILSVACNRHLQT-VTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGR
       110       120        130       140       150       160      

              120       130       140       150       160       170
pF1KB9 AFCDVWVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSIL
       ::::::.: :..: :::::.::.:::::: .. . ..:   ::.: : ....: :.....
CCDS13 AFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALV
        170       180       190       200       210       220      

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 ISFIPVQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSS
       .:  :. :.:..           :      .: .: :         :  . .  ::. ::
CCDS13 VSVGPL-LGWKE-----------P------VPPDERF---------CGITEEAGYAVFSS
        230                         240                250         

              240       250        260       270             280   
pF1KB9 LISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQVQIRRI-SSLERAAEHAQS------CRSSAACAPDT-
       . :::.:.:...: : :.: .:.   : . ....:   .:.       ::..:. :  . 
CCDS13 VCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAH
     260       270       280       290       300       310         

                           290       300       310       320       
pF1KB9 --------SLRASIK-------KETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPE
               ..:.:..       .: :. :::....:::: ::.:::..   .:. :  :.
CCDS13 GMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFV---LPLGSLFPQ
     320       330       340       350       360          370      

       330       340       350       360        370       380      
pF1KB9 GPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFNA-DFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVET
         :      :: .: :. :.:. :: .::.::  .. .:...: .:: :.  : :     
CCDS13 LKP------SEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ--CRRRRRRR
              380       390       400       410       420          

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB9 VNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPD
                                                                   
CCDS13 PLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRR
      430       440       450       460       470       480        

>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 399 init1: 287 opt: 478  Z-score: 413.1  bits: 85.8 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 752; 36.1% identity (59.9% similar) in 421 aa overlap (8-381:9-399)

                10        20        30                      40     
pF1KB9  MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGS---AGAPP---LGP--------SQVVTA-
               :.. ::...    : .: :...     ..::   : :        ::  :: 
CCDS75 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAG
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB9 --CLLTLLIIWTLLGNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAE
          :..:...  . ::::: .::... .:.. .::.::.::: .:: ..:::.:. :.  
CCDS75 MGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQT-LTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
               70        80        90        100       110         

            110        120       130       140       150       160 
pF1KB9 VAGYWPFGAF-CDVWVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMV
       : : : .:.: :..:.. :..: :::: .::::..::: ::. ::::.  .:.  :  .:
CCDS75 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
     120       130       140       150       160       170         

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB9 GLAWTLSILISFIPVQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSL
         .:..: :.::.:. ..: : ..      :      :         .:    . ::   
CCDS75 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAES------DEARRCYN---------DP----KCCDFVT
     180       190       200             210                    220

             230       240       250       260            270      
pF1KB9 NRTYAISSSLISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQVQIRRISSLER-----AAEHAQSCRS--
       ::.:::.::..:::.:. ::  .: :..: :: :...:.: ::      :.  .   :  
CCDS75 NRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPV
              230       240       250       260       270       280

                        280       290               300       310  
pF1KB9 --------------SAACAPDTSLRASIKK--------ETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPF
                     .:: :: .. ::. ..        : :.::::..:::::. :::::
CCDS75 PAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPF
              290       300       310       320       330       340

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB9 FILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFNADFQKVFAQL
       :. : .  :   : :  :       .  :  : :.:.:::..::.::  . ::.:.:  :
CCDS75 FLANVVKAF---HRELVP-------DRLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQGL
                 350              360       370       380       390

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB9 LGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEG
       : :..  .:                                                   
CCDS75 LCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAG
              400       410       420       430       440       450

>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 572 init1: 240 opt: 469  Z-score: 406.5  bits: 84.3 E(32554): 2.5e-16
Smith-Waterman score: 607; 32.9% identity (59.5% similar) in 410 aa overlap (3-373:12-384)

                        10        20        30         40        50
pF1KB9          MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLG-PSQVVTACLLTLL
                  ::... :  : :  : .  .:. ..        .. : .:. . ::.:.
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVP-QANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALI
               10        20         30        40        50         

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 IIWTLLGNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFG
        . : :.:..: :.. :.:.:..  .: .:.::::.::.:..:::: ...  :.: : .:
CCDS49 TLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTP-ANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLG
      60        70        80         90       100       110        

               120       130       140       150       160         
pF1KB9 -AFCDVWVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSI
        . :: :.. :: : :::::.::::..::::::.   .:. : : . : ::..:.:..::
CCDS49 QVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSI
      120       130       140       150       160       170        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 LISFIPVQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISS
        ::. :  . :.. .:                  ::.  :  ::...        :.. :
CCDS49 SISLPP--FFWRQAKA------------------EEEVSECVVNTDHI------LYTVYS
      180         190                         200             210  

     230       240            250        260       270             
pF1KB9 SLISFYIPVAIMIVTYTRIY-----RI-AQVQIRRISSLERAAEHAQSCRSSAACA----
       .. .::.:. ..:. : :::     ::  :.  :  . : ::   ..:  :... .    
CCDS49 TVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINS
            220       230       240       250       260       270  

       280                              290       300       310    
pF1KB9 --PDT-------------SLRAS----------IKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFI
         ::.             ..:.:            .: :. :::..:.:.:. :::::::
CCDS49 RVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFI
            280       290       300       310       320       330  

          320       330        340       350       360        370  
pF1KB9 LNCMVPFCSGHPEGPPAGFPC-VSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAF-NADFQKVFAQL
       .. ..:.:.           :    . :: :.:.:. :: .::.::.. : ::...: .:
CCDS49 ISLVMPICKD---------ACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKL
            340                350       360       370       380   

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB9 LGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEG
       .                                                           
CCDS49 IRFKCTS                                                     
           390                                                     

>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8                 (408 aa)
 initn: 377 init1: 269 opt: 464  Z-score: 402.2  bits: 83.6 E(32554): 4.4e-16
Smith-Waterman score: 654; 33.0% identity (60.8% similar) in 400 aa overlap (1-381:1-365)

                10        20        30        40        50         
pF1KB9 MLP-PGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGNV
       : : :  :..  :  .     :: ..:  ...: : .    .... ::.: .. :. ::.
CCDS60 MAPWPHENSSLAP--WPDLPTLAPNTA--NTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNL
               10          20          30        40        50      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 LVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGAF-CDVWVA
       :: .::. . .:.. :::::..:::..:: ..:::.:  :.  ..:.::.::  :..:..
CCDS60 LVIVAIAWTPRLQT-MTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTS
         60        70         80        90       100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 FDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQL
        :..: :::: .::...:::: :.. :.::   .:.: : . : :.:..:  .:: :.. 
CCDS60 VDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMS
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB9 NWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIPV
       .: :       : :   .  . .:            . :  . :  :.. :: .:::.:.
CCDS60 QWWRV------GADAEAQRCHSNP------------RCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPL
         180             190                   200       210       

      240       250              260       270         280         
pF1KB9 AIMIVTYTRIYRIAQVQIR-------RISSLERAAEHAQSCRSS--AACAPDTSLRASIK
        .:. .:.:.. .:  :.:       :.   :     ..:   .  ..:::  .. :  .
CCDS60 LVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGR
       220       230       240       250       260       270       

     290               300       310       320       330       340 
pF1KB9 K--------ETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTF
       .        : ..: ::..:::.:. ::::::. : .  .      : :.  :     .:
CCDS60 RPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRAL------GGPSLVPG---PAF
       280       290       300       310             320           

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB9 DVFVWFGWANSSLNPVIYAFNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQDIV
        .. :.:.:::..::.::  . ::...: .:: :   :.:                    
CCDS60 LALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL-CR--CGRRLPPEPCAAARPALFPSGVP
      330       340       350       360          370       380     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB9 FHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAESVWELDCEG
                                                                   
CCDS60 AARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS                                     
         390       400                                             

>>CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX               (458 aa)
 initn: 476 init1: 182 opt: 457  Z-score: 395.9  bits: 82.6 E(32554): 9.9e-16
Smith-Waterman score: 511; 29.2% identity (57.4% similar) in 390 aa overlap (25-383:39-393)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB9       MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWT
                                     :.  :.    : :  :   :  ....:: :
CCDS14 HSFLVHLIGLLVWQSDISVSPVAAIVTDIFNTSDGGRFKFPDG-VQNWPALSIVIIIIMT
       10        20        30        40        50         60       

           60        70        80        90       100        110   
pF1KB9 LLGNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGY-WPFGAF-
       . ::.::  :.   ..:. : :: :..:::..:..:.::::: . .: .  : ::.  . 
CCDS14 IGGNILVIMAVSMEKKLH-NATNYFLMSLAIADMLVGLLVMPLSLLAILYDYVWPLPRYL
        70        80         90       100       110       120      

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB9 CDVWVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILIS
       : ::...:.. :::::..::.::.::: ::  :....:  ..  :.. ....:..:: .:
CCDS14 CPVWISLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIAIVWAISIGVS
        130       140       150       160       170       180      

            180       190       200       210       220        230 
pF1KB9 FIPVQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNR-TYAISSSL
        .:. .   ::.                   :. :    ::  .:   ::  .... .:.
CCDS14 -VPIPVIGLRDE-------------------EKVF----VNNTTC--VLNDPNFVLIGSF
         190                          200             210       220

             240       250                              260        
pF1KB9 ISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQVQI-----------------------RRISSLERAAEH
       ..:.::..::..::     . . :                        :  .  : .:. 
CCDS14 VAFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALMLLHGHTEEPPGLSLDFLKCCKRNTAEEENSANP
              230       240       250       260       270       280

      270           280       290       300       310       320    
pF1KB9 AQSC----RSSAACAPDTSLRASIKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSG
        :.     :..    :  ...: :..: :. :.:.... ::.  : :::: : .  .:  
CCDS14 NQDQNARRRKKKERRPRGTMQA-INNERKASKVLGIVFFVFLIMWCPFFITNILSVLCEK
              290       300        310       320       330         

          330       340       350       360        370       380   
pF1KB9 HPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYA-FNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTP
         .        . :  ..::::.:.. :..::..:. ::  ....:.. : :..   . :
CCDS14 SCNQK------LMEKLLNVFVWIGYVCSGINPLVYTLFNKIYRRAFSNYLRCNYKVEKKP
     340             350       360       370       380       390   

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 VETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQT
                                                                   
CCDS14 PVRQIPRVAATALSGRELNVNIYRHTNEPVIEKASDNEPGIEMQVENLELPVNPSSVVSE
           400       410       420       430       440       450   

>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5                (520 aa)
 initn: 550 init1: 236 opt: 456  Z-score: 394.5  bits: 82.5 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 645; 32.1% identity (62.4% similar) in 399 aa overlap (2-375:5-365)

                  10        20          30        40         50    
pF1KB9    MLPPGSNGTAYPGQFALYQQ--LAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACL-LTLLIIWT
           :  : : .: :....  ..  ..  : .....  : :  ...... : :  .:...
CCDS43 MNPDLDTGHNTSA-PAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFA
               10         20        30        40        50         

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB9 LLGNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFG-AFC
       ..::.::  ... .::::.  :: :::.::..::.... :.:..:. :: ::: .:  ::
CCDS43 IVGNILVILSVACNRHLRTP-TNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFC
      60        70         80        90       100       110        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 DVWVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISF
       :.:.: :..: :::::.::.::.::: ..   ..:   .:.: :.. .  .:.:: .::.
CCDS43 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
      120       130       140       150       160       170        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB9 IPVQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLIS
        :. :.: .. :        ::                 . ..:  . .  ::. ::: :
CCDS43 GPL-LGW-KEPA--------PN-----------------DDKECGVTEEPFYALFSSLGS
      180                 190                        200       210 

           240       250       260                      270        
pF1KB9 FYIPVAIMIVTYTRIYRIAQVQIRRISS-----LERAAE----------HAQSCRSSAAC
       ::::.:...: : :.: .:.   . . .     .  . :          : ..  :. : 
CCDS43 FYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAK
             220       230       240       250       260       270 

        280          290       300       310       320       330   
pF1KB9 A--PDTSLRASI---KKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGF
       .  : .:. ...   ..: :. :::....:.:. :::::::    .:. :      :   
CCDS43 GHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFI---ALPLGSLFSTLKP---
             280       290       300       310          320        

           340       350       360        370       380       390  
pF1KB9 PCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFNA-DFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVETVNISNE
       :   ...: :  :.:. :: :::.::  .. .:...:...:::                 
CCDS43 P---DAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLG
            330       340       350       360       370       380  

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB9 LISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAE
                                                                   
CCDS43 GCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSGSQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELC
            390       400       410       420       430       440  

>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (342 aa)
 initn: 608 init1: 274 opt: 444  Z-score: 386.3  bits: 80.4 E(32554): 3.4e-15
Smith-Waterman score: 574; 34.7% identity (62.1% similar) in 314 aa overlap (24-315:6-291)

               10        20        30        40            50      
pF1KB9 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTL----LIIWTLL
                              :::  .:  . : .: ..  : :: .    ::.. .:
CCDS83                   MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVL
                                 10        20        30        40  

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB9 GNVLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFG-AFCDV
       ::.::  ...  :::.. .:. .::.:::.::...  :.:..:. :: ::: :: .::..
CCDS83 GNILVILSVACHRHLHS-VTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNI
             50         60        70        80        90       100 

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB9 WVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIP
       :.: :..: ::::..::.::.::: ..: :.::   .::: .:. .  .:.::..::. :
CCDS83 WAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGP
             110       120       130       140       150       160 

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB9 VQLNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFY
       . ..:..                   :  ::          :. . .  :.. :.: :::
CCDS83 L-FGWRQ-------------------PAPED-------ETICQINEEPGYVLFSALGSFY
                                 170              180       190    

         240       250       260                       270         
pF1KB9 IPVAIMIVTYTRIYRIAQVQIRRISS----------------LERAAEHAQSCRSSAACA
       .:.::..: : :.: .:. . : ..:                 .. :  . :  .::   
CCDS83 LPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTK
          200       210       220       230       240       250    

     280        290       300       310       320       330        
pF1KB9 PDTSLRA-SIKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSE
          :.:  ....: :. :::....: :: ::::::..                       
CCDS83 THFSVRLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPV
          260       270       280       290       300       310    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB9 TTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTPVETVNISNELISYNQ
                                                                   
CCDS83 HHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW                                
          320       330       340                                  




477 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 20:57:07 2016 done: Sat Nov  5 20:57:08 2016
 Total Scan time:  3.150 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com