Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6405
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6405, 305 aa
  1>>>pF1KB6405 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9224+/-0.00102; mu= 11.3258+/- 0.061
 mean_var=57.4759+/-11.805, 0's: 0 Z-trim(102.1): 26  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.169173
 statistics sampled from 6776 (6785) to 6776 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.208), width:  16
 Scan time:  2.410

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31924.1 EIF2B1 gene_id:1967|Hs108|chr12        ( 305) 1931 479.9 1.1e-135
CCDS46244.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2         ( 522)  344 92.5 7.3e-19
CCDS33164.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2         ( 523)  344 92.5 7.3e-19
CCDS46245.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2         ( 543)  344 92.5 7.6e-19
CCDS82432.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2         ( 544)  344 92.5 7.6e-19
CCDS9836.1 EIF2B2 gene_id:8892|Hs108|chr14         ( 351)  317 85.9 4.7e-17
CCDS32923.1 MRI1 gene_id:84245|Hs108|chr19         ( 369)  251 69.8 3.5e-12


>>CCDS31924.1 EIF2B1 gene_id:1967|Hs108|chr12             (305 aa)
 initn: 1931 init1: 1931 opt: 1931  Z-score: 2549.7  bits: 479.9 E(32554): 1.1e-135
Smith-Waterman score: 1931; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MDDKELIEYFKSQMKEDPDMASAVAAIRTLLEFLKRDKGETIQGLRANLTSAIETLCGVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDDKELIEYFKSQMKEDPDMASAVAAIRTLLEFLKRDKGETIQGLRANLTSAIETLCGVD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SSVAVSSGGELFLRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSVAVSSGGELFLRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 DGATILTHAYSRVVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DGATILTHAYSRVVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 AAVGYIMEKADLVIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFVRLFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAVGYIMEKADLVIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFVRLFP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LNQQDVPDKFKYKADTLKVAQTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNQQDVPDKFKYKADTLKVAQTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDEL
              250       260       270       280       290       300

            
pF1KB6 IKLYL
       :::::
CCDS31 IKLYL
            

>>CCDS46244.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2              (522 aa)
 initn: 279 init1: 279 opt: 344  Z-score: 452.2  bits: 92.5 E(32554): 7.3e-19
Smith-Waterman score: 344; 31.7% identity (67.3% similar) in 202 aa overlap (103-296:310-511)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB6 LRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSR
                                     .: :. . :. . .  :..: .::... : 
CCDS46 NKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYQKISNGDVILVYGCSS
     280       290       300       310       320       330         

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB6 VVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADL
       .: :.:. : .  .:: : :..:.: : :..  ..: : .::.. .:  :..:.. ... 
CCDS46 LVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK
     340       350       360       370       380       390         

            200       210       220       230            240       
pF1KB6 VIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFV-RL----FPLNQQDVP
       :..::.... ::......:: :.:. :.:.: :  :  :..::  :.    :  :. : :
CCDS46 VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDP
     400       410       420       430       440       450         

       250        260         270       280       290       300    
pF1KB6 DKFKYK-ADTLKVA--QTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLY
       : .. : .. . .:  :.  .:.  .   : : : :. :..:.::..  :.:        
CCDS46 DDLQCKRGEHVALANWQNHASLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKS
     460       470       480       490       500       510         

          
pF1KB6 L  
          
CCDS46 SDQ
     520  

>>CCDS33164.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2              (523 aa)
 initn: 279 init1: 279 opt: 344  Z-score: 452.1  bits: 92.5 E(32554): 7.3e-19
Smith-Waterman score: 344; 31.7% identity (67.3% similar) in 202 aa overlap (103-296:311-512)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB6 LRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSR
                                     .: :. . :. . .  :..: .::... : 
CCDS33 NKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYQKISNGDVILVYGCSS
              290       300       310       320       330       340

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB6 VVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADL
       .: :.:. : .  .:: : :..:.: : :..  ..: : .::.. .:  :..:.. ... 
CCDS33 LVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK
              350       360       370       380       390       400

            200       210       220       230            240       
pF1KB6 VIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFV-RL----FPLNQQDVP
       :..::.... ::......:: :.:. :.:.: :  :  :..::  :.    :  :. : :
CCDS33 VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDP
              410       420       430       440       450       460

       250        260         270       280       290       300    
pF1KB6 DKFKYK-ADTLKVA--QTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLY
       : .. : .. . .:  :.  .:.  .   : : : :. :..:.::..  :.:        
CCDS33 DDLQCKRGEHVALANWQNHASLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKS
              470       480       490       500       510       520

          
pF1KB6 L  
          
CCDS33 SDQ
          

>>CCDS46245.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2              (543 aa)
 initn: 279 init1: 279 opt: 344  Z-score: 451.8  bits: 92.5 E(32554): 7.6e-19
Smith-Waterman score: 344; 31.7% identity (67.3% similar) in 202 aa overlap (103-296:331-532)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB6 LRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSR
                                     .: :. . :. . .  :..: .::... : 
CCDS46 NKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYQKISNGDVILVYGCSS
              310       320       330       340       350       360

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB6 VVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADL
       .: :.:. : .  .:: : :..:.: : :..  ..: : .::.. .:  :..:.. ... 
CCDS46 LVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK
              370       380       390       400       410       420

            200       210       220       230            240       
pF1KB6 VIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFV-RL----FPLNQQDVP
       :..::.... ::......:: :.:. :.:.: :  :  :..::  :.    :  :. : :
CCDS46 VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDP
              430       440       450       460       470       480

       250        260         270       280       290       300    
pF1KB6 DKFKYK-ADTLKVA--QTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLY
       : .. : .. . .:  :.  .:.  .   : : : :. :..:.::..  :.:        
CCDS46 DDLQCKRGEHVALANWQNHASLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKS
              490       500       510       520       530       540

          
pF1KB6 L  
          
CCDS46 SDQ
          

>>CCDS82432.1 EIF2B4 gene_id:8890|Hs108|chr2              (544 aa)
 initn: 279 init1: 279 opt: 344  Z-score: 451.8  bits: 92.5 E(32554): 7.6e-19
Smith-Waterman score: 344; 31.7% identity (67.3% similar) in 202 aa overlap (103-296:332-533)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB6 LRFISLASLEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSR
                                     .: :. . :. . .  :..: .::... : 
CCDS82 NKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYQKISNGDVILVYGCSS
             310       320       330       340       350       360 

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB6 VVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLSGKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADL
       .: :.:. : .  .:: : :..:.: : :..  ..: : .::.. .:  :..:.. ... 
CCDS82 LVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK
             370       380       390       400       410       420 

            200       210       220       230            240       
pF1KB6 VIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFV-RL----FPLNQQDVP
       :..::.... ::......:: :.:. :.:.: :  :  :..::  :.    :  :. : :
CCDS82 VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDP
             430       440       450       460       470       480 

       250        260         270       280       290       300    
pF1KB6 DKFKYK-ADTLKVA--QTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLY
       : .. : .. . .:  :.  .:.  .   : : : :. :..:.::..  :.:        
CCDS82 DDLQCKRGEHVALANWQNHASLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKS
             490       500       510       520       530       540 

          
pF1KB6 L  
          
CCDS82 SDQ
          

>>CCDS9836.1 EIF2B2 gene_id:8892|Hs108|chr14              (351 aa)
 initn: 233 init1: 166 opt: 317  Z-score: 419.6  bits: 85.9 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 326; 27.5% identity (60.5% similar) in 309 aa overlap (5-304:56-344)

                                         10            20        30
pF1KB6                           MDDKELIEYFKSQMKE----DPDMASAVAAIRTL
                                     ::.: .. . ..    .:. ...   .: .
CCDS98 GGPRSSEEMARETLGLLRQIITDHRWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGNMVRRV
          30        40        50        60        70        80     

               40        50        60        70        80          
pF1KB6 LEFLKRDKGETIQGLRANLTSAIETLCGVDSSVAVSSGGELFLRFISLASLEYS-DYSKC
       :...... :. ..: :.. ..  :.:  .     ..:::          . ..:  :.. 
CCDS98 LKIIREEYGR-LHG-RSDESDQQESLHKL-----LTSGG---------LNEDFSFHYAQL
          90         100       110                     120         

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB6 KKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSRVVLRVLEAAVAAKKRFS
       .. .::  . .: ..  . ..::      :... .:.: ..::.:   :. : : :..: 
CCDS98 QSNIIEAINELLVELEGTMENIAAQALEHIHSNEVIMTIGFSRTVEAFLKEA-ARKRKFH
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