Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8500
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8500, 862 aa
1>>>pF1KB8500 862 - 862 aa - 862 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1147+/-0.00113; mu= 6.7275+/- 0.068
mean_var=124.5003+/-24.590, 0's: 0 Z-trim(105.7): 22 B-trim: 44 in 1/50
Lambda= 0.114945
statistics sampled from 8563 (8576) to 8563 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5343.1 PMS2 gene_id:5395|Hs108|chr7 ( 862) 5683 954.5 0
CCDS83155.1 PMS2 gene_id:5395|Hs108|chr7 ( 756) 4945 832.1 0
CCDS46473.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 770) 468 89.6 2.2e-17
CCDS46474.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 893) 468 89.7 2.6e-17
CCDS2302.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 932) 468 89.7 2.7e-17
CCDS2663.1 MLH1 gene_id:4292|Hs108|chr3 ( 756) 449 86.5 1.9e-16
CCDS82544.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 181) 386 75.9 7.2e-14
CCDS82543.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 165) 385 75.7 7.4e-14
>>CCDS5343.1 PMS2 gene_id:5395|Hs108|chr7 (862 aa)
initn: 5683 init1: 5683 opt: 5683 Z-score: 5098.4 bits: 954.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5683; 99.8% identity (99.9% similar) in 862 aa overlap (1-862:1-862)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERAESSSTEPAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSLDAGATNIDLKLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MERAESSSTEPAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSLDAGATNIDLKLKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YGVDLIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTQVETFGFRGEALSSLCALSDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQKTPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQKTPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQLGQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQLGQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQSLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNLFYISGFISQCTHGVGRSSTDRQFFFINRRPCDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNLFYISGFISQCTHGVGRSSTDRQFFFINRRPCDPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KVCRLVNEVYHMYNRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KVCRLVNEVYHMYNRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GMFDSDVNKLNVSQQPLLDVEGNLIKMHAADLEKPMVEKQDQSPSLRTGEEKKDVSISRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GMFDSDVNKLNVSQQPLLDVEGNLIKMHAADLEKPMVEKQDQSPSLRTGEEKKDVSISRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 REAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSPLGQKRGMLSSSTSGAISDKGVLRSQKEAVSSSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS53 REAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSPLGQKRGMLSSSTSGAISDKGVLRPQKEAVSSSHG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PSDPTDRAEVEKDSGHGSTSVDSEGFSIPDTGSHCSSEYAASSPGDRGSQEHVDSQEKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PSDPTDRAEVEKDSGHGSTSVDSEGFSIPDTGSHCSSEYAASSPGDRGSQEHVDSQEKAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ETDDSFSDVDCHSNQEDTGCKFRVLPQPTNLATPNTKRFKKEEILSSSDICQKLVNTQDM
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KTDDSFSDVDCHSNQEDTGCKFRVLPQPTNLATPNTKRFKKEEILSSSDICQKLVNTQDM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 SASQVDVAVKINKKVVPLDFSMSSLAKRIKQLHHEAQQSEGEQNYRKFRAKICPGENQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SASQVDVAVKINKKVVPLDFSMSSLAKRIKQLHHEAQQSEGEQNYRKFRAKICPGENQAA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EDELRKEISKTMFAEMEIIGQFNLGFIITKLNEDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDELRKEISKTMFAEMEIIGQFNLGFIITKLNEDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 QRLIAPQTLNLTAVNEAVLIENLEIFRKNGFDFVIDENAPVTERAKLISLPTSKNWTFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QRLIAPQTLNLTAVNEAVLIENLEIFRKNGFDFVIDENAPVTERAKLISLPTSKNWTFGP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 QDVDELIFMLSDSPGVMCRPSRVKQMFASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QDVDELIFMLSDSPGVMCRPSRVKQMFASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHP
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB8 WNCPHGRPTMRHIANLGVISQN
::::::::::::::::::::::
CCDS53 WNCPHGRPTMRHIANLGVISQN
850 860
>>CCDS83155.1 PMS2 gene_id:5395|Hs108|chr7 (756 aa)
initn: 4945 init1: 4945 opt: 4945 Z-score: 4438.0 bits: 832.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4945; 99.6% identity (99.9% similar) in 746 aa overlap (117-862:11-756)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HHTSKIQEFADLTQVETFGFRGEALSSLCALSDVTISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQK
:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MWGRRRKLRRLNDVTISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQK
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 TPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKEYAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKEYAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQL
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 GQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQSLIPFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQSLIPFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 FYISGFISQCTHGVGRSSTDRQFFFINRRPCDPAKVCRLVNEVYHMYNRHQYPFVVLNIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FYISGFISQCTHGVGRSSTDRQFFFINRRPCDPAKVCRLVNEVYHMYNRHQYPFVVLNIS
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 VDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLIGMFDSDVNKLNVSQQPLLDVEGNLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLIGMFDSDVNKLNVSQQPLLDVEGNLIK
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 MHAADLEKPMVEKQDQSPSLRTGEEKKDVSISRLREAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MHAADLEKPMVEKQDQSPSLRTGEEKKDVSISRLREAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSP
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 LGQKRGMLSSSTSGAISDKGVLRSQKEAVSSSHGPSDPTDRAEVEKDSGHGSTSVDSEGF
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LGQKRGMLSSSTSGAISDKGVLRPQKEAVSSSHGPSDPTDRAEVEKDSGHGSTSVDSEGF
350 360 370 380 390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SIPDTGSHCSSEYAASSPGDRGSQEHVDSQEKAPETDDSFSDVDCHSNQEDTGCKFRVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SIPDTGSHCSSEYAASSPGDRGSQEHVDSQEKAPKTDDSFSDVDCHSNQEDTGCKFRVLP
410 420 430 440 450 460
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QPTNLATPNTKRFKKEEILSSSDICQKLVNTQDMSASQVDVAVKINKKVVPLDFSMSSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QPTNLATPNTKRFKKEEILSSSDICQKLVNTQDMSASQVDVAVKINKKVVPLDFSMSSLA
470 480 490 500 510 520
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 KRIKQLHHEAQQSEGEQNYRKFRAKICPGENQAAEDELRKEISKTMFAEMEIIGQFNLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KRIKQLHHEAQQSEGEQNYRKFRAKICPGENQAAEDELRKEISKTMFAEMEIIGQFNLGF
530 540 550 560 570 580
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 IITKLNEDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQGQRLIAPQTLNLTAVNEAVLIENLEIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IITKLNEDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQGQRLIAPQTLNLTAVNEAVLIENLEIF
590 600 610 620 630 640
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 RKNGFDFVIDENAPVTERAKLISLPTSKNWTFGPQDVDELIFMLSDSPGVMCRPSRVKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKNGFDFVIDENAPVTERAKLISLPTSKNWTFGPQDVDELIFMLSDSPGVMCRPSRVKQM
650 660 670 680 690 700
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 FASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIANLGVISQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIANLGVISQN
710 720 730 740 750
>>CCDS46473.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 (770 aa)
initn: 656 init1: 441 opt: 468 Z-score: 425.5 bits: 89.6 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 656; 24.9% identity (54.4% similar) in 868 aa overlap (15-856:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERAESSSTEPAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSLDAGATNIDLKLKD
.: . .:. . :.:.. :. ..::::.:::::::::..:.::..
CCDS46 MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLEN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGVDLIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTQVETFGFRGEALSSLCALSDV
:: : ::: ::: :.. . ...:..::::. :: .. :.:::::::.:.: ...:
CCDS46 YGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYYTSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB8 TISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQKTPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKK-
:.: :. . .:. ..: .:.:... : .::::.. .::..:::: :.: . ::
CCDS46 LITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRLFKNLPVR-KQFYSTAKKC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 --EYAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQLGQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQ
: :. ..: .. :.. .:. ... . .. : : . ::.: ..
CCDS46 KDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNKAVIWQKSRVSDH-----KMALMSVLGTAVMN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SLIPFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNLFYISGFISQCT--HGVGRSST-DRQFFFINR
.. : : .: .:.:::. .: :. :: .:.:.:::
CCDS46 NMESF-QYHSEES---------------QIYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINS
230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB8 RPCDPAKVCRLVNEVYHMY----NRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQ-EEK
:: . .:. . :.. . . :: :.:.: . ::.:.:::: :.::: .:.
CCDS46 RPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFFLKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKES
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 LLLAV--LKTSLIGMFDS----DVNKLNVSQQPLLDVEGNLIKMHAADLEKPMVEKQDQS
.:.:. : :. : . : . :: .:: .. : : .:. ::.. ..
CCDS46 VLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIV-----LSKTAETDVLFNKVESSGKN
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KB8 PSLRTGEEKKDVSI----SRLREAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSPLGQKRGMLSSSTS
: . :.:. . ... : ..: . :. . . . ... . ....:.
CCDS46 YS------NVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTK
380 390 400 410 420 430
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pF1KB8 GAISDKGVLRSQKEAVSSSHGPSDPTDRAEVEKDSGHGSTSVDSEGFSIPDTGSHCSSEY
.:..: .. . : .. .. . . .. .. . .. .: : . ..: . :::
CCDS46 NAFQDISMSNVSWENSQTEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEI
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 AASSPGDRGSQEHVDSQEKAPETDDSFSDVDCHSNQEDTGCKFRVLPQPTNLATPNTKRF
.: :. :. .. .. . ... : ... :: . .: :
CCDS46 SA----DEWSRGNILKN----SVGENIEPVKILVPEKSLPCKV----SNNNYPIP-----
500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 KKEEILSSSDICQKLVNTQDMSASQVDVAVKINKKVVPLDFSMSSLAKRIKQLHHEAQQS
:.. . : :.: :. : ....: . ....:. .: :.: . : :.
CCDS46 --EQMNLNEDSCNKKSNVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASAL---FVQDHRPQFLI
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 EGEQNYRKFRAKICPGENQAAEDELRKEISKTMFAEMEIIGQFNLGFIITKLNEDIFIVD
:. .. :. . . : :. ::. .: : .. :: . . :. .
CCDS46 ENPKTSL---------EDATLQIE---ELWKTL-SEEEKLNLFNGSHYL-----DV-LYK
600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 QHATDEKYNFEMLQQHTVLQGQRLIAPQTLNLTAVNEAVLIENLEIFRKNGFDFVIDENA
. : :..:. : :. :: : ::: . . ..
CCDS46 MTADDQRYS-----GSTYLSDPRLTA-----------------------NGFKIKLIPGV
640 650 660
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 PVTERAKLISLPTSKNWTFGPQDVDELI--FMLSDSPGVM-CRPSRVKQMFASRACRKSV
.:: : .. .: :. :.. .. .. :. ::: .: ... ..: : :
CCDS46 SITENYLEIEGMANCLPFYGVADLKEILNAILNRNAKEVYECRPRKVISYLEGEAVRLSR
670 680 690 700 710 720
820 830 840 850 860
pF1KB8 MIGTALNTSEMKKLITHMGEM--DHPWNCPHGRPTMRHIANLGVISQN
.. :. ... .: .: .. .. .: :::: ..:.. :
CCDS46 QLPMYLSKEDIQDIIYRMKHQFGNEIKECVHGRPFFHHLTYLPETT
730 740 750 760 770
>>CCDS46474.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 (893 aa)
initn: 634 init1: 404 opt: 468 Z-score: 424.4 bits: 89.7 E(32554): 2.6e-17
Smith-Waterman score: 570; 26.0% identity (55.1% similar) in 630 aa overlap (15-625:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MERAESSSTEPAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSLDAGATNIDLKLKD
.: . .:. . :.:.. :. ..::::.:::::::::..:.::..
CCDS46 MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLEN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGVDLIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTQVETFGFRGEALSSLCALSDV
:: : ::: ::: :.. . ...:..::::. :: .. :.:::::::.:.: ...:
CCDS46 YGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYYTSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TISTCHASAKVGTRLMFDHNGKIIQKTPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKE
:.: :. . .:. ..: .:.:... : .::::.. .::..:::: :.: . ::
CCDS46 LITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRLFKNLPVR-KQFYSTAKK-
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YAKMVQVLHAYCIISAGIRVSCTNQLGQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQLQSLI
: ... :..:.:.
CCDS46 ---------------------CKDEI---------------------------KKIQDLL
170
250 260 270 280 290
pF1KB8 -PFVQLPPSDSVCEEYGLSCSDALHNLFYISGFISQCT--HGVGRSST-DRQFFFINRRP
: : :. . .:: .:.:::. .: :. :: .:.:.::: ::
CCDS46 MSFGILKPDLRIV---------FVHNKIYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINSRP
180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CDPAKVCRLVNEVYHMY----NRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQ-EEKLL
. .:. . :.. . . :: :.:.: . ::.:.:::: :.::: .:..:
CCDS46 VHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFFLKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVL
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KB8 LAV--LKTSLIGMFDS----DVNKLNVSQQPLLDVEGNLIKMHAADLEKPMVEKQDQSPS
.:. : :. : . : . :: .:: .. : : .:. ::.. .. :
CCDS46 IALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIV-----LSKTAETDVLFNKVESSGKNYS
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 LRTGEEKKDVSI----SRLREAFSLRHTTENKPHSPKTPEPRRSPLGQKRGMLSSSTSGA
. :.:. . ... : ..: . :. . . . ... . ....:..:
CCDS46 ------NVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNA
350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
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..: .. . : .. .. . . .. .. . .. .: : . ..: . ::: .:
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:. :. .. .. . ... : ... :: . .: :
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:.. . : :.: :. : ....: . ....:. .: :.:
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:: . .:. . :.. . . :: :.:.: . ::.:.:::: :.::: .:.
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: . :.:. . ... : ..: . :. . . . ... . ....:.
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: : .. .: . . .: .::... . . . ::. : :.: :
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CCDS82 MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLEN
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CCDS82 LITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGSH-SVTQAGLQWHHLGSLQPLPPRLK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]