Result of FASTA (omim) for
pFN21AB9948
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9948, 673 aa
1>>>pF1KB9948 673 - 673 aa - 673 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.3592+/-0.000647; mu= -20.3994+/- 0.038
mean_var=856.7383+/-189.337, 0's: 0 Z-trim(118.0): 1382 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.043818
statistics sampled from 28550 (30448) to 28550 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 11.210
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002729 (OMIM: 176970) protein kinase C beta typ ( 673) 4690 313.4 1.8e-84
NP_997700 (OMIM: 176970) protein kinase C beta typ ( 671) 4479 300.0 1.8e-80
NP_002728 (OMIM: 176960) protein kinase C alpha ty ( 672) 3850 260.3 1.7e-68
XP_016880325 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 645) 3589 243.8 1.6e-63
XP_016880326 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 621) 3472 236.3 2.6e-61
XP_016880327 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 3270 223.5 1.7e-57
XP_016880328 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 3270 223.5 1.7e-57
XP_016880329 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 3270 223.5 1.7e-57
NP_002730 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C g ( 697) 1864 134.8 1.1e-30
NP_001303258 (OMIM: 176980,605361) protein kinase ( 710) 1864 134.8 1.1e-30
XP_016880330 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 324) 1794 129.9 1.5e-29
XP_016859979 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1526 113.3 2.7e-24
XP_016859980 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1526 113.3 2.7e-24
XP_011531282 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1526 113.3 2.7e-24
XP_011531283 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1526 113.3 2.7e-24
XP_016859978 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1526 113.3 2.7e-24
XP_016859977 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1526 113.3 2.8e-24
XP_011531280 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1526 113.3 2.8e-24
XP_016859976 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1526 113.3 2.8e-24
XP_011531277 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1526 113.3 2.8e-24
XP_016859975 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1526 113.3 2.8e-24
XP_011531273 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1526 113.3 2.8e-24
NP_005391 (OMIM: 176975) protein kinase C epsilon ( 737) 1526 113.4 3e-24
XP_005264485 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 737) 1526 113.4 3e-24
XP_011531285 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 436) 1460 108.9 4e-23
XP_006712113 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 460) 1460 109.0 4.2e-23
XP_011531284 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 497) 1460 109.0 4.4e-23
XP_016876947 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 522) 1345 101.8 6.9e-21
XP_011535257 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 603) 1345 101.9 7.5e-21
XP_011535256 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 604) 1345 101.9 7.5e-21
NP_006246 (OMIM: 601367,605437) protein kinase C e ( 683) 1345 101.9 8.1e-21
NP_001269574 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 581) 1275 97.4 1.6e-19
XP_016871900 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 581) 1275 97.4 1.6e-19
NP_001310195 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 581) 1275 97.4 1.6e-19
NP_001269573 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 670) 1275 97.5 1.7e-19
XP_016871899 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 706) 1275 97.5 1.8e-19
NP_006248 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ty ( 706) 1275 97.5 1.8e-19
NP_001310194 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 706) 1275 97.5 1.8e-19
XP_006717528 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 706) 1275 97.5 1.8e-19
XP_005252553 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 740) 1275 97.6 1.8e-19
NP_006245 (OMIM: 176977,615559) protein kinase C d ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
NP_997704 (OMIM: 176977,615559) protein kinase C d ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
NP_001303256 (OMIM: 176977,615559) protein kinase ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
XP_016862344 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
XP_016862345 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
XP_006713322 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1265 96.9 2.7e-19
XP_006713320 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 692) 1265 96.9 2.7e-19
NP_001310196 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 627) 1189 92.0 7.2e-18
XP_005252554 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 697) 1189 92.1 7.6e-18
NP_002732 (OMIM: 601032) serine/threonine-protein ( 942) 1113 87.5 2.5e-16
>>NP_002729 (OMIM: 176970) protein kinase C beta type is (673 aa)
initn: 4690 init1: 4690 opt: 4690 Z-score: 1637.6 bits: 313.4 E(85289): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 4690; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFS
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB9 FVNSEFLKPEVKS
:::::::::::::
NP_002 FVNSEFLKPEVKS
670
>>NP_997700 (OMIM: 176970) protein kinase C beta type is (671 aa)
initn: 4474 init1: 4328 opt: 4479 Z-score: 1565.5 bits: 300.0 E(85289): 1.8e-80
Smith-Waterman score: 4479; 96.6% identity (98.1% similar) in 668 aa overlap (1-667:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB9 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACG-RNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
::::::::::::::::::::: :.. :::. :::.: ::: :. : :.::.:: ::
NP_997 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVELTPTDKLFIMNLDQNEFAGF
610 620 630 640 650 660
660 670
pF1KB9 SFVNSEFLKPEVKS
:..: ::.
NP_997 SYTNPEFVINV
670
>>NP_002728 (OMIM: 176960) protein kinase C alpha type [ (672 aa)
initn: 4039 init1: 2056 opt: 3850 Z-score: 1350.6 bits: 260.3 E(85289): 1.7e-68
Smith-Waterman score: 3850; 80.3% identity (92.1% similar) in 674 aa overlap (1-673:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::: : . ... . :::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::
NP_002 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::
NP_002 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : ::::
NP_002 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::
NP_002 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
:::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :
NP_002 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 LRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLS
::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::.
NP_002 LRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 ERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFV
.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
NP_002 DRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 MEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
:::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::
NP_002 MEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 IKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQA
:::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_002 IKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 PFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAF
::.::::::::::::::::.::::.:::::.::::::::::.::::::::::::..::::
NP_002 PFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSICKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 FRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
:: ::::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.::::
NP_002 FRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGF
600 610 620 630 640 650
660 670
pF1KB9 SFVNSEFLKPEVKS
:.:: .:..: ..:
NP_002 SYVNPQFVHPILQSAV
660 670
>>XP_016880325 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (645 aa)
initn: 3783 init1: 1806 opt: 3589 Z-score: 1261.6 bits: 243.8 E(85289): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 3589; 81.2% identity (92.4% similar) in 621 aa overlap (1-620:1-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::: : . ... . :::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::
XP_016 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::
XP_016 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : ::::
XP_016 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::
XP_016 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
:::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :
XP_016 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 LRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLS
::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::.
XP_016 LRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 ERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFV
.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
XP_016 DRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 MEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
:::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::
XP_016 MEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 IKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQA
:::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_016 IKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 PFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAF
::.::::::::::::::::.::::.:::::..:::::::::.::::::::::::..::::
XP_016 PFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 FRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
:: ::::::: .:::::.:::
XP_016 FRRIDWEKLENREIQPPFKPKVTLCTKMHWLQWASRSSVSTFPEPWVTK
600 610 620 630 640
>>XP_016880326 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (621 aa)
initn: 3652 init1: 2055 opt: 3472 Z-score: 1221.8 bits: 236.3 E(85289): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 3472; 80.4% identity (92.9% similar) in 607 aa overlap (68-673:17-619)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGFGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDD
.::::::::::::::::::::::::: .::
XP_016 MQPASANLQAPLSCSPHVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDD
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTE
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::
XP_016 PRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTE
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 RRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKC
.:::::..:.. . : : :::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::.
XP_016 KRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRS
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKL
.:::.:::.: :.:: ::::::::::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.::
XP_016 TLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDR
:.::::::.:::.: :.: :::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::
XP_016 LNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDR
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 MKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL
.:::::::::::::::::::::..::::.::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFF
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::.::::::::.:::::
XP_016 LDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFF
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQ
:...::::::::::::::::::::::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::
XP_016 LHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQ
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 PYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLM
::::::::::.::::::::::: ::.::::::::::::::::.::::.:::::..:::::
XP_016 PYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLM
470 480 490 500 510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 TKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRH
::::.::::::::::::..:::::: ::::::: .:::::.:::.::..:::::.::::
XP_016 TKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRG
530 540 550 560 570 580
640 650 660 670
pF1KB9 PPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:::::::: :: :::::.:::::.:: .:..: ..:
XP_016 QPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
590 600 610 620
>>XP_016880327 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 3444 init1: 2055 opt: 3270 Z-score: 1153.1 bits: 223.5 E(85289): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 3270; 79.8% identity (92.8% similar) in 580 aa overlap (95-673:9-584)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYG
:.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLV
::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : :::::::.
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLI
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEI
:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::::::
XP_016 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEI
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQK
:::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :::::
XP_016 WDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQK
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKG
::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::..:::
XP_016 FEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYV
:.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::
XP_016 TEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
:::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::::::
XP_016 NGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 DFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEG
:::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: ::.:
XP_016 DFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYI
:::::::::::::::.::::.:::::..:::::::::.::::::::::::..:::::: :
XP_016 EDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRI
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 DWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVN
:::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.:::::.::
XP_016 DWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVN
520 530 540 550 560 570
670
pF1KB9 SEFLKPEVKS
.:..: ..:
XP_016 PQFVHPILQSAV
580
>>XP_016880328 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 3444 init1: 2055 opt: 3270 Z-score: 1153.1 bits: 223.5 E(85289): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 3270; 79.8% identity (92.8% similar) in 580 aa overlap (95-673:9-584)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYG
:.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLV
::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : :::::::.
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLI
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEI
:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::::::
XP_016 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEI
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQK
:::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :::::
XP_016 WDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQK
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKG
::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::..:::
XP_016 FEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYV
:.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::
XP_016 TEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
:::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::::::
XP_016 NGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 DFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEG
:::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: ::.:
XP_016 DFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYI
:::::::::::::::.::::.:::::..:::::::::.::::::::::::..:::::: :
XP_016 EDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRI
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 DWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVN
:::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.:::::.::
XP_016 DWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVN
520 530 540 550 560 570
670
pF1KB9 SEFLKPEVKS
.:..: ..:
XP_016 PQFVHPILQSAV
580
>>XP_016880329 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 3444 init1: 2055 opt: 3270 Z-score: 1153.1 bits: 223.5 E(85289): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 3270; 79.8% identity (92.8% similar) in 580 aa overlap (95-673:9-584)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYG
:.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLV
::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : :::::::.
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLI
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEI
:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::::::
XP_016 PMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEI
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQK
:::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :::::
XP_016 WDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQK
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKG
::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::..:::
XP_016 FEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYV
:.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::
XP_016 TEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
:::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::::::
XP_016 NGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 DFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEG
:::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: ::.:
XP_016 DFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYI
:::::::::::::::.::::.:::::..:::::::::.::::::::::::..:::::: :
XP_016 EDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRI
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 DWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVN
:::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.:::::.::
XP_016 DWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVN
520 530 540 550 560 570
670
pF1KB9 SEFLKPEVKS
.:..: ..:
XP_016 PQFVHPILQSAV
580
>>NP_002730 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C gamma (697 aa)
initn: 3565 init1: 1536 opt: 1864 Z-score: 671.9 bits: 134.8 E(85289): 1.1e-30
Smith-Waterman score: 3396; 69.5% identity (86.3% similar) in 691 aa overlap (1-673:1-687)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
:: . : ::: . : :::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::.
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10 20 30 40 50
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pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::.::::: ::::.:::::::: :::: ::: .::::.::::..:.::::::::::::
NP_002 GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGS
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:::::.::::::. : ::::.::: .::::::.::::::::. .. . : . : : .
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:.::.::::::::::::::::::::.. .::::.:.: .::: ::::: :.:: .: .::
NP_002 ARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 LSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANE
::::.:::: ::::::::..:::.::: :: ::::.:::.::::::.:::: .. :
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240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 ELRQKFE----------RAKISQGTK-VPEEKTTNTVSKFDNNGNRD-RMKLTDFNFLMV
: :::: :.... ... .: . . : : : :....::.::::
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:::::::::::.::.:.:::::.:::::::..:::::.::.:::::::: :: .: :
NP_002 LGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHF
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410 420 430 440 450 460
pF1KB9 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
:::::: ::: ::::::::::.::::::::::.:.::::::.:::::::::::::...::
NP_002 LTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGI
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pF1KB9 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
:::::::::::::.::::::.::::::::.. :.::.:::::::::::::::::::::::
NP_002 IYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
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:::.:::::::::::: ::.::::.::::.:::..:.::::.:.::::::::..::::::
NP_002 DWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGK
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::: ::.:: :. :.:::.::::.::: :: ::..:. :::..::::.:::: :.:::
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pF1KB9 PDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
::. :. .:::..:.::..:: .:..:...:
NP_002 PDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
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>>NP_001303258 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C ga (710 aa)
initn: 3565 init1: 1536 opt: 1864 Z-score: 671.9 bits: 134.8 E(85289): 1.1e-30
Smith-Waterman score: 3396; 69.5% identity (86.3% similar) in 691 aa overlap (1-673:1-687)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
:: . : ::: . : :::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::.
NP_001 MAGLGPGVGDSEGGPRPL-FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGI
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pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::.::::: ::::.:::::::: :::: ::: .::::.::::..:.::::::::::::
NP_001 GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDR-DVLIVLVRD
:::::.::::::. : ::::.::: .::::::.::::::::. .. . : . : : .
NP_001 LLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 AKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRR
:.::.::::::::::::::::::::.. .::::.:.: .::: ::::: :.:: .: .::
NP_001 ARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANE
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NP_001 LSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPV---ADADNC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 ELRQKFE----------RAKISQGTK-VPEEKTTNTVSKFDNNGNRD-RMKLTDFNFLMV
: :::: :.... ... .: . . : : : :....::.::::
NP_001 SLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL----PG-KPPF
:::::::::::.::.:.:::::.:::::::..:::::.::.:::::::: :: .: :
NP_001 LGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
:::::: ::: ::::::::::.::::::::::.:.::::::.:::::::::::::...::
NP_001 LTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
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NP_001 IYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
:::.:::::::::::: ::.::::.::::.:::..:.::::.:.::::::::..::::::
NP_001 DWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGK
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 RLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTP
::: ::.:: :. :.:::.::::.::: :: ::..:. :::..::::.:::: :.:::
NP_001 RLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTP
600 610 620 630 640 650
650 660 670
pF1KB9 PDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
::. :. .:::..:.::..:: .:..:...:
NP_001 PDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVISCTPAFQLCPRGF
660 670 680 690 700 710
673 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]