Result of FASTA (omim) for pFN21AB3125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3125, 594 aa
  1>>>pF1KB3125 594 - 594 aa - 594 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1905+/-0.000423; mu= 19.5498+/- 0.026
 mean_var=66.4141+/-13.304, 0's: 0 Z-trim(111.1): 66  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.157378
 statistics sampled from 19490 (19556) to 19490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.229), width:  16
 Scan time:  6.960

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 3997 916.9       0
XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 3997 916.9       0
NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 594) 3997 916.9       0
XP_016859246 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 395) 2618 603.7 3.6e-172
NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylas ( 585) 2618 603.8  5e-172
NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 ( 585) 2618 603.8  5e-172
NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 493) 1781 413.7  7e-115
XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 520) 1781 413.8 7.4e-115
NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid de ( 520) 1781 413.8 7.4e-115
XP_016861786 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 502) 1732 402.6 1.6e-111
NP_997242 (OMIM: 615601) acidic amino acid decarbo ( 521) 1732 402.6 1.6e-111
NP_038473 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_005246501 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_016859247 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_016874907 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1116 262.6 1.2e-69
XP_011536753 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1116 262.6 1.2e-69
XP_016861787 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 275) 1100 259.0 1.5e-68
XP_016874906 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1088 256.3 1.1e-67
XP_011536751 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1088 256.3 1.1e-67
XP_016874908 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 368) 1088 256.3 1.3e-67
XP_016874905 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 422) 1088 256.4 1.4e-67
XP_011536744 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 551) 1088 256.4 1.8e-67
NP_001231635 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 260) 1081 254.6 2.9e-67
NP_001076440 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 480)  453 112.2   4e-24
NP_000781 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amino-a ( 480)  453 112.2   4e-24
NP_001229817 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 402)  443 109.9 1.7e-23
NP_001229815 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 442)  439 109.0 3.4e-23
XP_005271802 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 442)  439 109.0 3.4e-23
XP_011513463 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 461)  438 108.8 4.1e-23
NP_002103 (OMIM: 137580,142704) histidine decarbox ( 662)  416 103.9 1.8e-21
NP_001229819 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 338)  362 91.5   5e-18
NP_001293075 (OMIM: 137580,142704) histidine decar ( 629)  354 89.8 2.9e-17
NP_001229816 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 432)  350 88.8 4.1e-17
NP_001229818 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 387)  336 85.6 3.4e-16
XP_016877587 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 553)  233 62.3 4.9e-09
XP_016877586 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 618)  233 62.3 5.4e-09
XP_016877585 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 621)  233 62.3 5.4e-09
XP_016877583 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 697)  233 62.4 5.9e-09
XP_016877588 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 437)  171 48.2   7e-05
XP_016877584 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 664)  171 48.3 9.9e-05
NP_001272379 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 429)  154 44.3   0.001
NP_001310950 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 471)  144 42.1  0.0052
XP_016878554 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 483)  144 42.1  0.0053
NP_001310949 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 497)  144 42.1  0.0055
NP_001272378 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 498)  144 42.1  0.0055
NP_001272377 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 697)  144 42.2  0.0072
XP_016878552 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 708)  144 42.2  0.0073
XP_006720928 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746)  144 42.2  0.0076
XP_016878553 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746)  144 42.2  0.0076
NP_001272374 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 760)  144 42.2  0.0077


>>XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat  (594 aa)
 initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997  Z-score: 4901.4  bits: 916.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590    
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
              550       560       570       580       590    

>>XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat  (594 aa)
 initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997  Z-score: 4901.4  bits: 916.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590    
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
              550       560       570       580       590    

>>NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarboxylas  (594 aa)
 initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997  Z-score: 4901.4  bits: 916.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590    
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
              550       560       570       580       590    

>>XP_016859246 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat  (395 aa)
 initn: 2618 init1: 2618 opt: 2618  Z-score: 3211.9  bits: 603.7 E(85289): 3.6e-172
Smith-Waterman score: 2618; 100.0% identity (100.0% similar) in 395 aa overlap (1-395:1-395)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::                         
XP_016 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIER                         
              370       380       390                              

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI

>>NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2   (585 aa)
 initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618  Z-score: 3209.4  bits: 603.8 E(85289): 5e-172
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (4-594:2-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
          ..:.:.  : ..  : .  .  : :  .:: ::.  :  .: :.:..:   .. :. 
NP_001   MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
                 10         20        30        40          50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ..  ..   : ....  .:  ...     ....... : : ::::: .::. :. :: .:
NP_001 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
          60        70         80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ..:::.:: :.:::::::.:::.:..::.    .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
NP_001 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
          120       130       140          150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       .:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.:: 
NP_001 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
             180       190       200       210       220       230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       . .:::::::::::::::..: ::.:.::::: :::::.:.:. ::::.::.:.::..::
NP_001 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
             240       250       260       270       280       290 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::.  .:
NP_001 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
             300       310       320       330       340       350 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       :::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
NP_001 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
             360       370       380       390       400       410 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
       .:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
NP_001 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
             420       430       440       450       460       470 

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
       .::::::::::  ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .:  .: ::::
NP_001 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
             480       490       500       510       520       530 

              550       560       570       580       590    
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
        ::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
NP_001 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
             540       550       560       570       580     

>>NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 [Ho  (585 aa)
 initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618  Z-score: 3209.4  bits: 603.8 E(85289): 5e-172
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (4-594:2-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
          ..:.:.  : ..  : .  .  : :  .:: ::.  :  .: :.:..:   .. :. 
NP_000   MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
                 10         20        30        40          50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
       ..  ..   : ....  .:  ...     ....... : : ::::: .::. :. :: .:
NP_000 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
          60        70         80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
       ..:::.:: :.:::::::.:::.:..::.    .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
NP_000 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
          120       130       140          150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
       .:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.:: 
NP_000 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
             180       190       200       210       220       230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
       . .:::::::::::::::..: ::.:.::::: :::::.:.:. ::::.::.:.::..::
NP_000 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
             240       250       260       270       280       290 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
       ::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::.  .:
NP_000 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
             300       310       320       330       340       350 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
       :::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
NP_000 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
             360       370       380       390       400       410 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
       .:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
NP_000 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
             420       430       440       450       460       470 

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
       .::::::::::  ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .:  .: ::::
NP_000 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
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              550       560       570       580       590    
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
        ::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
NP_000 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
             540       550       560       570       580     

>>NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid dec  (493 aa)
 initn: 1461 init1: 760 opt: 1781  Z-score: 2183.4  bits: 413.7 E(85289): 7e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:7-493)

            80        90       100       110       120         130 
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
                                     ::.  :.  .:. ::..:  ....  ..: 
NP_001                         MADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
                                       10        20        30      

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
        . : :: ....:..: . ..   ::: .. :: .:::  :: ...:.:.::::::::::
NP_001 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
         40        50           60        70        80        90   

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
        .:::  .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .:::::  ::::: ::
NP_001 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
           100       110       120       130       140         150 

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pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
       :.:::::..  :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
NP_001 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
             160       170       180       190       200       210 

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pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
       : .::::..: :.: .:  :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
NP_001 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
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pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
       :::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.  
NP_001 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
        :.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.:  :.: .:.. . ::.::
NP_001 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
             340       350       360       370       380       390 

              500       510       520       530       540       550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
         ..:.:: ::.:.  ::: .:::::..: ::::  .::. .:.: :::: .:  :.. :
NP_001 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
             400         410       420       430       440         

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pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
       . :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
NP_001 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
     450       460       470       480       490   

>>XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine sulfin  (520 aa)
 initn: 1461 init1: 760 opt: 1781  Z-score: 2183.1  bits: 413.8 E(85289): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:34-520)

            80        90       100       110       120         130 
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
                                     ::.  :.  .:. ::..:  ....  ..: 
XP_011 PLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
            10        20        30        40        50        60   

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pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
        . : :: ....:..: . ..   ::: .. :: .:::  :: ...:.:.::::::::::
XP_011 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
            70        80           90       100       110       120

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
        .:::  .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .:::::  ::::: ::
XP_011 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
              130       140       150       160       170          

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
       :.:::::..  :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
XP_011 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
      180       190       200       210       220       230        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
       : .::::..: :.: .:  :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
XP_011 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
      240       250       260       270       280       290        

             380       390       400       410       420        430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
       :::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.  
XP_011 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
      300       310       320       330       340       350        

              440       450       460       470       480       490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
        :.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.:  :.: .:.. . ::.::
XP_011 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
      360       370       380       390       400       410        

              500       510       520       530       540       550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
         ..:.:: ::.:.  ::: .:::::..: ::::  .::. .:.: :::: .:  :.. :
XP_011 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
      420       430         440       450       460       470      

              560       570       580       590    
pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
       . :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
XP_011 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
        480       490       500       510       520

>>NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid decarb  (520 aa)
 initn: 1461 init1: 760 opt: 1781  Z-score: 2183.1  bits: 413.8 E(85289): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:34-520)

            80        90       100       110       120         130 
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
                                     ::.  :.  .:. ::..:  ....  ..: 
NP_057 PLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
            10        20        30        40        50        60   

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
        . : :: ....:..: . ..   ::: .. :: .:::  :: ...:.:.::::::::::
NP_057 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
            70        80           90       100       110       120

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
        .:::  .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .:::::  ::::: ::
NP_057 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
              130       140       150       160       170          

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
       :.:::::..  :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
NP_057 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
      180       190       200       210       220       230        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
       : .::::..: :.: .:  :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
NP_057 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
      240       250       260       270       280       290        

             380       390       400       410       420        430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
       :::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.  
NP_057 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
      300       310       320       330       340       350        

              440       450       460       470       480       490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
        :.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.:  :.: .:.. . ::.::
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