Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3289, 803 aa
1>>>pF1KB3289 803 - 803 aa - 803 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9838+/-0.00109; mu= 8.9427+/- 0.067
mean_var=375.4577+/-69.654, 0's: 0 Z-trim(109.9): 2073 B-trim: 104 in 2/49
Lambda= 0.066190
statistics sampled from 15773 (18107) to 15773 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 9.660
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 3316 332.9 2.7e-90
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 3316 333.0 2.8e-90
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 3047 307.1 1.3e-82
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 3047 307.1 1.3e-82
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2347 240.7 2.5e-62
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2347 240.7 2.5e-62
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2347 240.8 2.6e-62
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2347 240.8 2.6e-62
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2347 240.8 2.6e-62
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2347 240.8 2.6e-62
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2347 240.8 2.6e-62
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2327 238.6 7.8e-62
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2327 238.6 7.8e-62
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2327 238.6 8.2e-62
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2297 235.8 6.1e-61
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
>>XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro (669 aa)
initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316 Z-score: 1742.0 bits: 332.9 E(85289): 2.7e-90
Smith-Waterman score: 3417; 63.7% identity (74.6% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
:. :::..:::::::.::::::::: :.::.::.:::.:::::::::.
XP_016 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVA------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
.: ::.. :: . .::: :::.:::.:: . .::::.
XP_016 -------------------DKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
:. .:::.
XP_016 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
:: . :. :
XP_016 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
110
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
::::: :::.: :: :.:. .:::::::.::::: :: : ::.::: .: .::.
XP_016 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
120 130 140 150 160
310 320 330 340 350
pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
::.::: ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
XP_016 VHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSG
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
::::::::::::: .:::::.:::.::::::::::.:::.: : : :..: ::::::::
XP_016 EKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFKCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPY
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTV
:::.::: : ::::: ::::::::::::::::::: : .::..:::. .::::: :.: :
XP_016 KCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKV
290 300 310 320 330 340
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
::::: ::..:::: :::::::::::::::::: . ::::::::::::::::::.:::.
XP_016 CGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKA
350 360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 FSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
: :::::.:: ::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQ
::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQ
470 480 490 500 510 520
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 AHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQS
::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
XP_016 AHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQS
530 540 550 560 570 580
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVG
:::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: :::::::. ::.::..
XP_016 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAA
590 600 610 620 630 640
780 790 800
pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
:......::::: .. .: .
XP_016 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
650 660
>>XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro (688 aa)
initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316 Z-score: 1741.9 bits: 333.0 E(85289): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 3508; 64.8% identity (76.6% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
:. :::..:::::::.::::::::: :.::.::.:::.::::::::: :
XP_016 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSV------------E
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
....: :: :::.:.:. ..: ::.. :: . .::: :::.:::.:: . .::::.
XP_016 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
50 60 70 80 90 100
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pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
:. .:::.
XP_016 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
110
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pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
:: . :. :
XP_016 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
120
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
::::: :::.: :: :.:. .:::::::.::::: :: : ::.::: .: .::.
XP_016 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350
pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
::.::: ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
XP_016 VHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSG
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
::::::::::::: .:::::.:::.::::::::::.:::.: : : :..: ::::::::
XP_016 EKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFKCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTV
:::.::: : ::::: ::::::::::::::::::: : .::..:::. .::::: :.: :
XP_016 KCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKV
310 320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
::::: ::..:::: :::::::::::::::::: . ::::::::::::::::::.:::.
XP_016 CGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKA
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 FSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
: :::::.:: ::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQ
::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQ
490 500 510 520 530 540
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 AHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQS
::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
XP_016 AHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQS
550 560 570 580 590 600
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVG
:::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: :::::::. ::.::..
XP_016 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAA
610 620 630 640 650 660
780 790 800
pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
:......::::: .. .: .
XP_016 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
670 680
>>XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro (700 aa)
initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316 Z-score: 1741.8 bits: 333.0 E(85289): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 3591; 65.7% identity (77.7% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
:. :::..:::::::.::::::::: :.::.::.:::.::::::::::: :::.:: .:
XP_006 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVGHHPFKHDVFLLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
....: :: :::.:.:. ..: ::.. :: . .::: :::.:::.:: . .::::.
XP_006 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
:. .:::.
XP_006 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
:: . :. :
XP_006 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
140
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
::::: :::.: :: :.:. .:::::::.::::: :: : ::.::: .: .::.
XP_006 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
150 160 170 180 190
310 320 330 340 350
pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
::.::: ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
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:......::::: .. .: .
XP_006 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
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pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
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NP_001 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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XP_016 KCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKV
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XP_016 AHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQS
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pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
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XP_016 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [Homo (700 aa)
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pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
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NP_006 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVGHHPFKHDVFLLE
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pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
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NP_006 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
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pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
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NP_006 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
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pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
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NP_006 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
140
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pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
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NP_006 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
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pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
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NP_006 VHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSG
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pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
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pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
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NP_006 CGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKA
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pF1KB3 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQ
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NP_006 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQ
500 510 520 530 540 550
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 AHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQS
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NP_006 AHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQS
560 570 580 590 600 610
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pF1KB3 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVG
:::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: :::::::. ::.::..
NP_006 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAA
620 630 640 650 660 670
780 790 800
pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
:......::::: .. .: .
NP_006 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro (502 aa)
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pF1KB3 LQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQKVHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVI
.::: ::: :::::::..::::::.::..
XP_016 MGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTV
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340 350 360 370 380 390
pF1KB3 EKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTAEKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPF
:::.:: .:::::::::.:.::::.:..::::::::::::: .:::::.:::.:::::::
XP_016 EKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPF
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pF1KB3 KCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEE
:::.:::.: : : :..: :::::::::::.::: : ::::: ::::::::::::::::
XP_016 KCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEE
100 110 120 130 140 150
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pF1KB3 CGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKS
::: : .::..:::. .::::: :.: :::::: ::..:::: ::::::::::::::::
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160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 PIGWISHHDGHRV-HKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFDHNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSD
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XP_011 AFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQ
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.::. . : : :.:::::::.::::::.: :.:.: .:. .:.::::.:::::::.: .
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XP_011 SSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKL
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pF1KB3 RIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
:.:.:.: :: .. :: ..::. :
XP_011 RLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHT
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initn: 1184 init1: 1184 opt: 1230 Z-score: 663.4 bits: 134.1 E(85289): 3.3e-30
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pF1KB3 KSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQKVHVGEKLKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKC
: ..::.: .:: .. . .. .:
XP_011 MEDSFQKVLLRKYEKCGHE-----NLQLRKGCKSVD---EC
10 20 30
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pF1KB3 KQCGKGFSRRSALNVHCKVHTAEKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACG
: .:... :: .: . . : ..: . ..: . . . : :::.: ::: :
XP_011 KVHKEGYNK---LN-QCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCV
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pF1KB3 KSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFS
::: : .:. :. :: ::.:: : : ::.: :...:: .::::::::::.:.
XP_011 KSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFK
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