Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5427
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5427, 378 aa
1>>>pF1KB5427 378 - 378 aa - 378 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6867+/-0.000405; mu= 14.0425+/- 0.025
mean_var=63.6994+/-13.042, 0's: 0 Z-trim(112.2): 44 B-trim: 1103 in 2/53
Lambda= 0.160697
statistics sampled from 21016 (21061) to 21016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 7.600
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_064518 (OMIM: 614795) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 378) 2591 609.6 3.8e-174
XP_016866548 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 244) 1675 397.2 2.2e-110
XP_005267110 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 244) 1675 397.2 2.2e-110
XP_005261217 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_006724092 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_016883898 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
NP_064517 (OMIM: 614794) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_016883899 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_006724093 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_011527967 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
NP_001032642 (OMIM: 614794) 1-acyl-sn-glycerol-3-p ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_011527964 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 463) 1661 394.0 3.7e-109
XP_011527962 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 358) 1422 338.6 1.4e-92
XP_011527966 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 380) 1422 338.6 1.5e-92
XP_016883897 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 406) 1422 338.6 1.6e-92
XP_011527965 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 416) 1422 338.6 1.6e-92
XP_011527963 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 450) 1422 338.6 1.7e-92
XP_006715577 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 324) 1413 336.5 5.4e-92
XP_016883900 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_006724094 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016883902 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016883901 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016859235 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376) 387 98.6 2.5e-20
XP_005264302 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376) 387 98.6 2.5e-20
XP_011531045 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376) 387 98.6 2.5e-20
NP_001002257 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 376) 387 98.6 2.5e-20
XP_011531044 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376) 387 98.6 2.5e-20
NP_001291374 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 376) 387 98.6 2.5e-20
NP_872357 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltrans ( 414) 387 98.6 2.7e-20
XP_005264301 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 414) 387 98.6 2.7e-20
XP_011531043 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 414) 387 98.6 2.7e-20
XP_016859236 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 252) 282 74.2 3.7e-13
NP_060831 (OMIM: 614796) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 364) 261 69.4 1.5e-11
NP_001291375 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 252) 254 67.7 3.3e-11
XP_011531046 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 252) 254 67.7 3.3e-11
XP_016883903 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 233) 236 63.5 5.6e-10
XP_011533053 (OMIM: 614796) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 193) 138 40.8 0.0032
>>NP_064518 (OMIM: 614795) 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphat (378 aa)
initn: 2591 init1: 2591 opt: 2591 Z-score: 3247.4 bits: 609.6 E(85289): 3.8e-174
Smith-Waterman score: 2591; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB5 IDKGSAYGNSDSKQKLND
::::::::::::::::::
NP_064 IDKGSAYGNSDSKQKLND
370
>>XP_016866548 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce (244 aa)
initn: 1675 init1: 1675 opt: 1675 Z-score: 2102.8 bits: 397.2 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1675; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (135-378:1-244)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GWSLSERFGLLGGSKVLAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
160 170 180 190 200 210
350 360 370
pF1KB5 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
220 230 240
>>XP_005267110 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce (244 aa)
initn: 1675 init1: 1675 opt: 1675 Z-score: 2102.8 bits: 397.2 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1675; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (135-378:1-244)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GWSLSERFGLLGGSKVLAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
160 170 180 190 200 210
350 360 370
pF1KB5 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
220 230 240
>>XP_005261217 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce (376 aa)
initn: 1700 init1: 1651 opt: 1661 Z-score: 2082.2 bits: 394.0 E(85289): 3.1e-109
Smith-Waterman score: 1661; 61.9% identity (84.8% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
: : ..::.::. ::. .::..:::.:: .:: :: :::..:::.:..::::.: . ::
XP_005 MGLLAFLKTQFVLHLLVGFVFVVSGLVINFVQLCTLALWPVSKQLYRRLNCRLAYSLWSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
::::::::: ::::.::: . ..:::.:...:::.:::::::::.. ::::.::.:::
XP_005 LVMLLEWWSCTECTLFTDQATVERFGKEHAVIILNHNFEIDFLCGWTMCERFGVLGSSKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
:::::: :::.::: ::: :.:::.::::.:: ::. .:..: :::: ..::..::::::
XP_005 LAKKELLYVPLIGWTWYFLEIVFCKRKWEEDRDTVVEGLRRLSDYPEYMWFLLYCEGTRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
:: ::..::.:: ::::: ::.:::::::::. .:. ::..:.:::: :::::.:.::.:
XP_005 TETKHRVSMEVAAAKGLPVLKYHLLPRTKGFTTAVKCLRGTVAAVYDVTLNFRGNKNPSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
::.: ::::.::. :::.:::::: :. : . :::::::::::.:: : . : :: .
XP_005 LGILYGKKYEADMCVRRFPLEDIPLDEKEAAQWLHKLYQEKDALQEIYNQKGMFPGEQFK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
: ::::::.:.: ::...: :.:.:..... ::: : . .:. .:: ::: .:::::
XP_005 PARRPWTLLNFLSWATILLSPLFSFVLGVFASGSPLLILTFLGFVGAASFGVRRLIGVTE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB5 IDKGSAYGNSDSKQKLND
:.:::.:::.. :.:
XP_005 IEKGSSYGNQEFKKKE
370
>>XP_006724092 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce (376 aa)
initn: 1700 init1: 1651 opt: 1661 Z-score: 2082.2 bits: 394.0 E(85289): 3.1e-109
Smith-Waterman score: 1661; 61.9% identity (84.8% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
: : ..::.::. ::. .::..:::.:: .:: :: :::..:::.:..::::.: . ::
XP_006 MGLLAFLKTQFVLHLLVGFVFVVSGLVINFVQLCTLALWPVSKQLYRRLNCRLAYSLWSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
::::::::: ::::.::: . ..:::.:...:::.:::::::::.. ::::.::.:::
XP_006 LVMLLEWWSCTECTLFTDQATVERFGKEHAVIILNHNFEIDFLCGWTMCERFGVLGSSKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
:::::: :::.::: ::: :.:::.::::.:: ::. .:..: :::: ..::..::::::
XP_006 LAKKELLYVPLIGWTWYFLEIVFCKRKWEEDRDTVVEGLRRLSDYPEYMWFLLYCEGTRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
:: ::..::.:: ::::: ::.:::::::::. .:. ::..:.:::: :::::.:.::.:
XP_006 TETKHRVSMEVAAAKGLPVLKYHLLPRTKGFTTAVKCLRGTVAAVYDVTLNFRGNKNPSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
::.: ::::.::. :::.:::::: :. : . :::::::::::.:: : . : :: .
XP_006 LGILYGKKYEADMCVRRFPLEDIPLDEKEAAQWLHKLYQEKDALQEIYNQKGMFPGEQFK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
: ::::::.:.: ::...: :.:.:..... ::: : . .:. .:: ::: .:::::
XP_006 PARRPWTLLNFLSWATILLSPLFSFVLGVFASGSPLLILTFLGFVGAASFGVRRLIGVTE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB5 IDKGSAYGNSDSKQKLND
:.:::.:::.. :.:
XP_006 IEKGSSYGNQEFKKKE
370
>>XP_016883898 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce (376 aa)
initn: 1700 init1: 1651 opt: 1661 Z-score: 2082.2 bits: 394.0 E(85289): 3.1e-109
Smith-Waterman score: 1661; 61.9% identity (84.8% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
: : ..::.::. ::. .::..:::.:: .:: :: :::..:::.:..::::.: . ::
XP_016 MGLLAFLKTQFVLHLLVGFVFVVSGLVINFVQLCTLALWPVSKQLYRRLNCRLAYSLWSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
::::::::: ::::.::: . ..:::.:...:::.:::::::::.. ::::.::.:::
XP_016 LVMLLEWWSCTECTLFTDQATVERFGKEHAVIILNHNFEIDFLCGWTMCERFGVLGSSKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
:::::: :::.::: ::: :.:::.::::.:: ::. .:..: :::: ..::..::::::
XP_016 LAKKELLYVPLIGWTWYFLEIVFCKRKWEEDRDTVVEGLRRLSDYPEYMWFLLYCEGTRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
:: ::..::.:: ::::: ::.:::::::::. .:. ::..:.:::: :::::.:.::.:
XP_016 TETKHRVSMEVAAAKGLPVLKYHLLPRTKGFTTAVKCLRGTVAAVYDVTLNFRGNKNPSL
190 200 210 220 230 240
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