Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5408
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5408, 336 aa
1>>>pF1KE5408 336 - 336 aa - 336 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6610+/-0.000921; mu= 14.1459+/- 0.055
mean_var=73.1372+/-15.294, 0's: 0 Z-trim(105.7): 42 B-trim: 88 in 1/48
Lambda= 0.149970
statistics sampled from 8635 (8675) to 8635 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 1.230
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1599.1 KCNK1 gene_id:3775|Hs109|chr1 ( 336) 2238 493.6 9.8e-140
CCDS12513.1 KCNK6 gene_id:9424|Hs109|chr19 ( 313) 807 184.0 1.5e-46
CCDS31608.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 307) 696 159.9 2.4e-39
CCDS8106.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 252) 583 135.5 4.7e-32
CCDS41673.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 ( 257) 583 135.5 4.8e-32
CCDS9880.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 538) 523 122.6 7.3e-28
CCDS9882.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 543) 523 122.6 7.4e-28
CCDS9881.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 ( 543) 523 122.6 7.4e-28
CCDS47422.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 294) 517 121.2 1.1e-27
CCDS4843.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 309) 517 121.2 1.1e-27
CCDS8067.1 KCNK4 gene_id:50801|Hs109|chr11 ( 393) 504 118.5 9.7e-27
CCDS31024.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 411) 504 118.5 1e-26
CCDS41466.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 422) 504 118.5 1e-26
CCDS41467.1 KCNK2 gene_id:3776|Hs109|chr1 ( 426) 504 118.5 1e-26
CCDS47421.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 322) 488 115.0 9e-26
CCDS47420.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 262) 484 114.0 1.4e-25
CCDS4841.1 KCNK5 gene_id:8645|Hs109|chr6 ( 499) 468 110.7 2.6e-24
CCDS4842.1 KCNK17 gene_id:89822|Hs109|chr6 ( 332) 417 99.6 3.9e-21
CCDS87391.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 ( 197) 376 90.6 1.2e-18
CCDS1727.1 KCNK3 gene_id:3777|Hs109|chr2 ( 394) 379 91.4 1.3e-18
CCDS47419.1 KCNK17 gene_id:89822|Hs109|chr6 ( 271) 372 89.8 2.8e-18
CCDS6377.1 KCNK9 gene_id:51305|Hs109|chr8 ( 374) 366 88.6 9e-18
CCDS13337.1 KCNK15 gene_id:60598|Hs109|chr20 ( 330) 342 83.4 3e-16
CCDS9889.1 KCNK13 gene_id:56659|Hs109|chr14 ( 408) 273 68.5 1.1e-11
>>CCDS1599.1 KCNK1 gene_id:3775|Hs109|chr1 (336 aa)
initn: 2238 init1: 2238 opt: 2238 Z-score: 2622.4 bits: 493.6 E(33420): 9.8e-140
Smith-Waterman score: 2238; 100.0% identity (100.0% similar) in 336 aa overlap (1-336:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK
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CCDS15 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTTGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQVVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYNQK
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CCDS15 IVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYNQK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 FSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
310 320 330
>>CCDS12513.1 KCNK6 gene_id:9424|Hs109|chr19 (313 aa)
initn: 874 init1: 645 opt: 807 Z-score: 949.6 bits: 184.0 E(33420): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 833; 45.5% identity (73.5% similar) in 310 aa overlap (18-309:3-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKLK
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CCDS12 MRRGALLAGALA-AYAAYLVLGALLVARLEGPHEARLRAELETLR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE5 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWN-----WDFTSALFFASTVL
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CCDS12 AQLLQRSPCVAAPALDAFVERVLAAGRLGRVVLANASGSANASDPAWDFASALFFASTLI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 STTGYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFS
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CCDS12 TTVGYGYTTPLTDAGKAFSIAFALLGVPTTMLLLTASAQRLSLLLTHVPLSWLSMRWGWD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KQVVAIVHAV-LLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPG
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CCDS12 PRRAACWHLVALLGVVVTVCFL-VPAVIFAHLEEAWSFLDAFYFCFISLSTIGLGDYVPG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE5 EGYNQKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKK------DKDE
:. .: .: :::. .: ::.:::.::..::.:: .. .:. . ... . . ::
CCDS12 EAPGQPYRALYKVLVTVYLFLGLVAMVLVLQTFRHVSDLHGLTELILLPPPCPASFNADE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE5 D-QVHII-----EHDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
: .: :. :.::: :: :: :.
CCDS12 DDRVDILGPQPESHQQLSASSHTDYASIPR
290 300 310
>>CCDS31608.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 (307 aa)
initn: 593 init1: 297 opt: 696 Z-score: 819.9 bits: 159.9 E(33420): 2.4e-39
Smith-Waterman score: 696; 41.3% identity (71.3% similar) in 293 aa overlap (21-308:7-298)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWC-FGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKL
: .:.::...:: : .:::::...: : :. :::
CCDS31 MGGLRPWSRYGLLVVAHLLALGLGAVVFQALEGPPACRLQAELRAE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 KRRFLEEHE-CLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTT
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CCDS31 LAAFQAEHRACLPPGALEELLGTALATQAHGVSTLGNSSEGRTWDLPSALLFAASILTTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQV
:::: .::: ::::::..:...:.: .: :.:.... . : :: . ..: .:
CCDS31 GYGHMAPLSPGGKAFCMVYAALGLPASLA-LVATLRHCLLPVLSRPRAWVAVHWQLSPAR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VAIVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYN
.:...:: ::....: : ..:: :. :. : ..: . :::: ::::::: : .::.: .
CCDS31 AALLQAVALGLLVASSFVLLPALVLWGLQGDCSLLGAVYFCFSSLSTIGLEDLLPGRGRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QK--FRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKD-KDEDQVHIIE
. . .: .... ::::::.:::...::: :: ... . :.: . ::: :.
CCDS31 LHPVIYHLGQLALLGYLLLGLLAMLLAVETFSELPQVRAMGKFFRPSGPVTAEDQGGILG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE5 HDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
.:.:..:.. :
CCDS31 QDELALSTLPPAAPASGQAPAC
290 300
>>CCDS8106.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 (252 aa)
initn: 498 init1: 292 opt: 583 Z-score: 689.1 bits: 135.5 E(33420): 4.7e-32
Smith-Waterman score: 583; 44.0% identity (72.9% similar) in 218 aa overlap (21-236:7-223)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWC-FGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKL
: .:.::...:: : .:::::...: : :. :::
CCDS81 MGGLRPWSRYGLLVVAHLLALGLGAVVFQALEGPPACRLQAELRAE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 KRRFLEEHE-CLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTT
: ::. :: ::..:: .: .. .:::.:.:.: . .::. :::.::...:.::
CCDS81 LAAFQAEHRACLPPGALEELLGTALATQAHGVSTLGNSSEGRTWDLPSALLFAASILTTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQV
:::: .::: ::::::..:...:.: .: :.:.... . : :: . ..: .:
CCDS81 GYGHMAPLSPGGKAFCMVYAALGLPASLA-LVATLRHCLLPVLSRPRAWVAVHWQLSPAR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VAIVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYN
.:...:: ::....: : ..:: :. :. : ..: . :::: ::::::: : .::.:
CCDS81 AALLQAVALGLLVASSFVLLPALVLWGLQGDCSLLGAVYFCFSSLSTIGLEDLLPGRGRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQ
CCDS81 LHPVIYHLGQLALLGGGTSLQGTAWEG
230 240 250
>>CCDS41673.1 KCNK7 gene_id:10089|Hs109|chr11 (257 aa)
initn: 498 init1: 292 opt: 583 Z-score: 689.0 bits: 135.5 E(33420): 4.8e-32
Smith-Waterman score: 583; 44.0% identity (72.9% similar) in 218 aa overlap (21-236:7-223)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWC-FGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQELRKL
: .:.::...:: : .:::::...: : :. :::
CCDS41 MGGLRPWSRYGLLVVAHLLALGLGAVVFQALEGPPACRLQAELRAE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 KRRFLEEHE-CLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTT
: ::. :: ::..:: .: .. .:::.:.:.: . .::. :::.::...:.::
CCDS41 LAAFQAEHRACLPPGALEELLGTALATQAHGVSTLGNSSEGRTWDLPSALLFAASILTTT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQV
:::: .::: ::::::..:...:.: .: :.:.... . : :: . ..: .:
CCDS41 GYGHMAPLSPGGKAFCMVYAALGLPASLA-LVATLRHCLLPVLSRPRAWVAVHWQLSPAR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VAIVHAVLLGFVTVSCFFFIPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGYN
.:...:: ::....: : ..:: :. :. : ..: . :::: ::::::: : .::.:
CCDS41 AALLQAVALGLLVASSFVLLPALVLWGLQGDCSLLGAVYFCFSSLSTIGLEDLLPGRGRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDEDQVHIIEHDQ
CCDS41 LHPVIYHLGQLALLGKSSHLTACGGRGKRSLD
230 240 250
>>CCDS9880.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 (538 aa)
initn: 488 init1: 193 opt: 523 Z-score: 613.9 bits: 122.6 E(33420): 7.3e-28
Smith-Waterman score: 523; 35.1% identity (71.4% similar) in 245 aa overlap (25-264:76-315)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQ
:.:. ..::: :..:: ..: :.:. ..
CCDS98 SSRATVVARMEGTSQGGLQTVMKWKTVVAIFVVV--VVYLVTGGLVFRALEQPFESSQKN
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ELRKLKRRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWN-WDFTSALFFAST
. : .::..: :.: :.:: .. ..:.:.: ::: ..:.:.: . ::. ::.:::.:
CCDS98 TIALEKAEFLRDHVCVSPQELETLIQHALDADNAGVSPIGNSSNNSSHWDLGSAFFFAGT
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VLSTTGYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHI--R
:..: :::. .: ..::: :::.:...:::. ..:... ... . . . .. .
CCDS98 VITTIGYGNIAPSTEGGKIFCILYAIFGIPLFGFLLAGIGDQLGTIFGKSIARVEKVFRK
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220
pF1KE5 WGFSKQVVAIVHAVLLGFVTVSCFFF--IPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLG
:. . .. ..: :. ..:. : :::..:. .: :. :::.:: ..:.:.:.:
CCDS98 KQVSQTKIRVISTIL--FILAGCIVFVTIPAVIFKYIEG-WTALESIYFVVVTLTTVGFG
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DYVPGEGYNQKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDED
:.: : . . ..:: :: . ..:.:: . .::
CCDS98 DFVAGGNAGINYREWYKPLVWFWILVGLAYFAAVLSMIGDWLRVLSKKTKEEVGEIKAHA
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KE5 QVHIIEHDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
CCDS98 AEWKANVTAEFRETRRRLSVEIHDKLQRAATIRSMERRRLGLDQRAHSLDMLSPEKRSVF
350 360 370 380 390 400
>>CCDS9882.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 (543 aa)
initn: 488 init1: 193 opt: 523 Z-score: 613.8 bits: 122.6 E(33420): 7.4e-28
Smith-Waterman score: 523; 35.1% identity (71.4% similar) in 245 aa overlap (25-264:81-320)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLQSLAGSSCVRLVERHRSAWCFGFLVLGYLLYLVFGAVVFSSVELPYEDLLRQ
:.:. ..::: :..:: ..: :.:. ..
CCDS98 SSRATVVARMEGTSQGGLQTVMKWKTVVAIFVVV--VVYLVTGGLVFRALEQPFESSQKN
60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ELRKLKRRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWN-WDFTSALFFAST
. : .::..: :.: :.:: .. ..:.:.: ::: ..:.:.: . ::. ::.:::.:
CCDS98 TIALEKAEFLRDHVCVSPQELETLIQHALDADNAGVSPIGNSSNNSSHWDLGSAFFFAGT
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VLSTTGYGHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHI--R
:..: :::. .: ..::: :::.:...:::. ..:... ... . . . .. .
CCDS98 VITTIGYGNIAPSTEGGKIFCILYAIFGIPLFGFLLAGIGDQLGTIFGKSIARVEKVFRK
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220
pF1KE5 WGFSKQVVAIVHAVLLGFVTVSCFFF--IPAAVFSVLEDDWNFLESFYFCFISLSTIGLG
:. . .. ..: :. ..:. : :::..:. .: :. :::.:: ..:.:.:.:
CCDS98 KQVSQTKIRVISTIL--FILAGCIVFVTIPAVIFKYIEG-WTALESIYFVVVTLTTVGFG
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DYVPGEGYNQKFRELYKIGITCYLLLGLIAMLVVLETFCELHELKKFRKMFYVKKDKDED
:.: : . . ..:: :: . ..:.:: . .::
CCDS98 DFVAGGNAGINYREWYKPLVWFWILVGLAYFAAVLSMIGDWLRVLSKKTKEEVGEIKAHA
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KE5 QVHIIEHDQLSFSSITDQAAGMKEDQKQNEPFVATQSSACVDGPANH
CCDS98 AEWKANVTAEFRETRRRLSVEIHDKLQRAATIRSMERRRLGLDQRAHSLDMLSPEKRSVF
350 360 370 380 390 400
>>CCDS9881.1 KCNK10 gene_id:54207|Hs109|chr14 (543 aa)
initn: 488 init1: 193 opt: 523 Z-score: 613.8 bits: 122.6 E(33420): 7.4e-28
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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CCDS98 TIALEKAEFLRDHVCVSPQELETLIQHALDADNAGVSPIGNSSNNSSHWDLGSAFFFAGT
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
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CCDS98 VITTIGYGNIAPSTEGGKIFCILYAIFGIPLFGFLLAGIGDQLGTIFGKSIARVEKVFRK
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180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270 280
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:.: : . . ..:: :: . ..:.:: . .::
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>>CCDS47422.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 (294 aa)
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10 20 30 40 50 60
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. .:. . ..:::: . ..:
CCDS47 YISVYRSLAAIWILLGLAWLALILPLGPLLLHRCCQLWLLSRGLGVKDGAASDPSGLPRP
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>>CCDS4843.1 KCNK16 gene_id:83795|Hs109|chr6 (309 aa)
initn: 475 init1: 355 opt: 517 Z-score: 610.6 bits: 121.2 E(33420): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 517; 36.0% identity (69.5% similar) in 239 aa overlap (26-264:17-251)
10 20 30 40 50 60
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:.:.:. ::..::..:. .: : :.... :
CCDS48 MPSAGLCSCWGGRVLPLLLAYVCYLLLGATIFQLLERQAEAQSRDQFQLEK
10 20 30 40 50
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pF1KE5 RRFLEEHECLSEQQLEQFLGRVLEASNYGVSVLSNASGNWNWDFTSALFFASTVLSTTGY
::::.. ::.. .:::. ..:: ::. .:... :::: :..:::.::..: ::
CCDS48 LRFLENYTCLDQWAMEQFVQVIMEAWVKGVNPKGNSTNPSNWDFGSSFFFAGTVVTTIGY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GHTVPLSDGGKAFCIIYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITVHVTRRPVLYFHIRWGFSKQVVA
:. .: ...:..::..:...:::....::. . . .:.. . : . ::..
CCDS48 GNLAPSTEAGQVFCVFYALLGIPLNVIFLNHLGTGLRAHLAAIERWEDRPRRSQVLQVLG
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CCDS48 LALFLTLGTLVILIF---PPMVFSHVEG-WSFSEGFYFAFITLSTIGFGDYVVGTDPSKH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]