Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6236
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6236, 239 aa
  1>>>pF1KE6236 239 - 239 aa - 239 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6773+/-0.000752; mu= 13.8615+/- 0.046
 mean_var=82.6424+/-16.647, 0's: 0 Z-trim(110.5): 38  B-trim: 44 in 1/50
 Lambda= 0.141082
 statistics sampled from 11646 (11684) to 11646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.359), width:  16
 Scan time:  2.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13645.1 CLDN14 gene_id:23562|Hs108|chr21       ( 239) 1598 334.2 4.6e-92
CCDS14524.1 CLDN2 gene_id:9075|Hs108|chrX          ( 230)  741 159.8 1.4e-39
CCDS5560.1 CLDN4 gene_id:1364|Hs108|chr7           ( 209)  661 143.5 1.1e-34
CCDS471.1 CLDN19 gene_id:149461|Hs108|chr1         ( 224)  651 141.4 4.6e-34
CCDS3295.1 CLDN1 gene_id:9076|Hs108|chr3           ( 211)  649 141.0 5.8e-34
CCDS5559.1 CLDN3 gene_id:1365|Hs108|chr7           ( 220)  639 139.0 2.5e-33
CCDS44125.1 CLDN19 gene_id:149461|Hs108|chr1       ( 211)  631 137.4 7.3e-33
CCDS10487.1 CLDN9 gene_id:9080|Hs108|chr16         ( 217)  630 137.2 8.6e-33
CCDS11096.1 CLDN7 gene_id:1366|Hs108|chr17         ( 211)  623 135.7 2.3e-32
CCDS10488.1 CLDN6 gene_id:9074|Hs108|chr16         ( 220)  606 132.3 2.6e-31
CCDS5249.1 CLDN20 gene_id:49861|Hs108|chr6         ( 219)  580 127.0   1e-29
CCDS13586.1 CLDN17 gene_id:26285|Hs108|chr21       ( 224)  558 122.5 2.3e-28
CCDS13763.2 CLDN5 gene_id:7122|Hs108|chr22         ( 303)  558 122.6 2.9e-28
CCDS13587.1 CLDN8 gene_id:9073|Hs108|chr21         ( 225)  552 121.3 5.4e-28
CCDS5717.1 CLDN15 gene_id:24146|Hs108|chr7         ( 228)  462 103.0 1.8e-22
CCDS53306.1 CLDN19 gene_id:149461|Hs108|chr1       ( 218)  442 98.9 2.9e-21
CCDS9476.1 CLDN10 gene_id:9071|Hs108|chr13         ( 228)  435 97.5   8e-21
CCDS54081.1 CLDN7 gene_id:1366|Hs108|chr17         ( 145)  417 93.7   7e-20
CCDS54824.1 CLDN24 gene_id:100132463|Hs108|chr4    ( 220)  392 88.7 3.3e-18
CCDS9475.1 CLDN10 gene_id:9071|Hs108|chr13         ( 226)  373 84.9   5e-17
CCDS43286.1 CLDN22 gene_id:53842|Hs108|chr4        ( 220)  369 84.0 8.6e-17
CCDS44736.1 CLDN25 gene_id:644672|Hs108|chr11      ( 229)  352 80.6 9.7e-16
CCDS33862.1 CLDN18 gene_id:51208|Hs108|chr3        ( 261)  334 77.0 1.4e-14
CCDS3095.1 CLDN18 gene_id:51208|Hs108|chr3         ( 261)  323 74.7 6.5e-14
CCDS3213.1 CLDN11 gene_id:5010|Hs108|chr3          ( 207)  293 68.6 3.7e-12


>>CCDS13645.1 CLDN14 gene_id:23562|Hs108|chr21            (239 aa)
 initn: 1598 init1: 1598 opt: 1598  Z-score: 1766.4  bits: 334.2 E(32554): 4.6e-92
Smith-Waterman score: 1598; 100.0% identity (100.0% similar) in 239 aa overlap (1-239:1-239)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230         
pF1KE6 LCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
              190       200       210       220       230         

>>CCDS14524.1 CLDN2 gene_id:9075|Hs108|chrX               (230 aa)
 initn: 766 init1: 707 opt: 741  Z-score: 823.9  bits: 159.8 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 741; 47.8% identity (78.3% similar) in 230 aa overlap (1-226:1-227)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::: ..::.:..:..::..:::.. .:: :. ...::..:.:::.. :::::::. ::::
CCDS14 MASLGLQLVGYILGLLGLLGTLVAMLLPSWKTSSYVGASIVTAVGFSKGLWMECATHSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
       : ::.:: .::.:: :.:::.:.:: :  .:..::  .:.::.::   . . ::   :. 
CCDS14 ITQCDIYSTLLGLPADIQAAQAMMVTSSAISSLACIISVVGMRCTVFCQESRAKDRVAVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       ::..:::.::: .. :.:. . ....::.::.:..::::::.:::::.::: .:::.: .
CCDS14 GGVFFILGGLLGFIPVAWNLHGILRDFYSPLVPDSMKFEIGEALYLGIISSLFSLIAGII
              130       140       150       160       170       180

              190           200       210       220       230      
pF1KE6 LCLSCQDEAP----YRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLN
       ::.::...      :  ::: : :: ..    :. ::: . ..  . :.:          
CCDS14 LCFSCSSQRNRSNYYDAYQAQPLATRSSPR--PG-QPPKVKSEFNSYSLTGYV       
              190       200       210          220       230       

          
pF1KE6 DYV

>>CCDS5560.1 CLDN4 gene_id:1364|Hs108|chr7                (209 aa)
 initn: 708 init1: 643 opt: 661  Z-score: 736.5  bits: 143.5 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 661; 45.9% identity (77.3% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-206)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::: ..:..:. :. :: .....   :: :: :: .:.::.:. .  .::::.:: .:::
CCDS55 MASMGLQVMGIALAVLGWLAVMLCCALPMWRVTAFIGSNIVTSQTIWEGLWMNCVVQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
        .::..: :::::::::::::::..:: ......   .:.: ::: : .   ::.   :.
CCDS55 QMQCKVYDSLLALPQDLQAARALVIISIIVAALGVLLSVVGGKCTNCLEDESAKAKTMIV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       .:..:.::::. .: ::::.....:.:::::. ::.: :.: .::.:. .:.: :.:: :
CCDS55 AGVVFLLAGLMVIVPVSWTAHNIIQDFYNPLVASGQKREMGASLYVGWAASGLLLLGGGL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230         
pF1KE6 LCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
       :: .:  ..  .::.:   :. ..: .                                
CCDS55 LCCNCPPRTD-KPYSAKYSAARSAAASNYV                             
              190        200                                      

>>CCDS471.1 CLDN19 gene_id:149461|Hs108|chr1              (224 aa)
 initn: 669 init1: 386 opt: 651  Z-score: 725.1  bits: 141.4 E(32554): 4.6e-34
Smith-Waterman score: 651; 44.8% identity (75.1% similar) in 221 aa overlap (1-218:1-219)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::....::::..:.. : :: . .: ::.:......:  :.:::.  .:::: :. .:::
CCDS47 MANSGLQLLGYFLALGGWVGIIASTALPQWKQSSYAGDAIITAVGLYEGLWMSCASQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTP-AKTTFAI
         ::..: :::::   .:.::::::.. ::. .: . .:.:::::: . ..: ::   ::
CCDS47 QVQCKLYDSLLALDGHIQSARALMVVAVLLGFVAMVLSVVGMKCTRVGDSNPIAKGRVAI
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 LGGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGT
        ::.:::::::  ..:::: .. :.:.:.::  : . ..:.: ::..:. :..:...::.
CCDS47 AGGALFILAGLCTLTAVSWYATLVTQEFFNPSTPVNARYEFGPALFVGWASAGLAVLGGS
              130       140       150       160       170       180

     180       190         200       210       220       230       
pF1KE6 LLCLSCQDEAPYRPYQAP-P-RATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLND
       .:: .: .  : :: ..: : :   ..:   :. . ::. :                   
CCDS47 FLCCTCPE--PERPNSSPQPYRPGPSAAAREPVVKLPASAKGPLGV              
                190       200       210       220                  

         
pF1KE6 YV

>>CCDS3295.1 CLDN1 gene_id:9076|Hs108|chr3                (211 aa)
 initn: 639 init1: 386 opt: 649  Z-score: 723.2  bits: 141.0 E(32554): 5.8e-34
Smith-Waterman score: 653; 44.8% identity (72.4% similar) in 221 aa overlap (1-219:1-209)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::....:::::.:.::: .:....: ::.::  ...: ::.:: .. .:::: :: .:::
CCDS32 MANAGLQLLGFILAFLGWIGAIVSTALPQWRIYSYAGDNIVTAQAMYEGLWMSCVSQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPA-KTTFAI
         ::... ::: : . :::.:::::.. ::. ::   :..:::: .: .   . :  .:.
CCDS32 QIQCKVFDSLLNLSSTLQATRALMVVGILLGVIAIFVATVGMKCMKCLEDDEVQKMRMAV
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 LGGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGT
       .::..:.::::  .::..:  : .::.::.:. : . ..:.::::. :. ..:: :.::.
CCDS32 IGGAIFLLAGLAILVATAWYGNRIVQEFYDPMTPVNARYEFGQALFTGWAAASLCLLGGA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210        220       230        
pF1KE6 LLCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQP-PAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDY
       ::: ::            :: ::.  .  :  .: :.. ::                   
CCDS32 LLCCSC------------PRKTTSYPTPRPYPKPAPSSGKDYV                 
                          190       200       210                  

        
pF1KE6 V

>>CCDS5559.1 CLDN3 gene_id:1365|Hs108|chr7                (220 aa)
 initn: 683 init1: 629 opt: 639  Z-score: 712.0  bits: 139.0 E(32554): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 648; 42.2% identity (71.3% similar) in 237 aa overlap (3-239:2-220)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
         : .... :  :. :: .::..   :: :: .: .:.::.:. .  .::::.:: .:::
CCDS55  MSMGLEITGTALAVLGWLGTIVCCALPMWRVSAFIGSNIITSQNIWEGLWMNCVVQSTG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
        .::..: :::::::::::::::.:.. ::....   :..: .:: :..   ::. ..:.
CCDS55 QMQCKVYDSLLALPQDLQAARALIVVAILLAAFGLLVALVGAQCTNCVQDDTAKAKITIV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       .:.::.::.:: .: :::..: ....::::..: ..: :.: .::.:. ...:.:.::.:
CCDS55 AGVLFLLAALLTLVPVSWSANTIIRDFYNPVVPEAQKREMGAGLYVGWAAAALQLLGGAL
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230         
pF1KE6 LCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
       :: ::           :::    :: :  .:. :      :. .  ..  .::  .:::
CCDS55 LCCSC-----------PPREKKYTA-TKVVYSAP------RSTGPGASLGTGYDRKDYV
     180                  190        200             210       220

>>CCDS44125.1 CLDN19 gene_id:149461|Hs108|chr1            (211 aa)
 initn: 642 init1: 386 opt: 631  Z-score: 703.4  bits: 137.4 E(32554): 7.3e-33
Smith-Waterman score: 631; 46.5% identity (77.8% similar) in 198 aa overlap (1-197:1-196)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::....::::..:.. : :: . .: ::.:......:  :.:::.  .:::: :. .:::
CCDS44 MANSGLQLLGYFLALGGWVGIIASTALPQWKQSSYAGDAIITAVGLYEGLWMSCASQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTP-AKTTFAI
         ::..: :::::   .:.::::::.. ::. .: . .:.:::::: . ..: ::   ::
CCDS44 QVQCKLYDSLLALDGHIQSARALMVVAVLLGFVAMVLSVVGMKCTRVGDSNPIAKGRVAI
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 LGGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGT
        ::.:::::::  ..:::: .. :.:.:.::  : . ..:.: ::..:. :..:...::.
CCDS44 AGGALFILAGLCTLTAVSWYATLVTQEFFNPSTPVNARYEFGPALFVGWASAGLAVLGGS
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 LLCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
       .:: .: .  : :: ..:                                          
CCDS44 FLCCTCPE--PERPNSSPQPYRPGPSAAAREYV                           
                190       200       210                            

>>CCDS10487.1 CLDN9 gene_id:9080|Hs108|chr16              (217 aa)
 initn: 623 init1: 623 opt: 630  Z-score: 702.2  bits: 137.2 E(32554): 8.6e-33
Smith-Waterman score: 630; 45.6% identity (73.8% similar) in 206 aa overlap (1-200:1-206)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::::...:::. :. :: .:::..  :: :. :: .:..:..:    .:::: :: .:::
CCDS10 MASTGLELLGMTLAVLGWLGTLVSCALPLWKVTAFIGNSIVVAQVVWEGLWMSCVVQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
        .::..: ::::::::::::::: ::. ::. ..   :. : .:: :..   ::. ... 
CCDS10 QMQCKVYDSLLALPQDLQAARALCVIALLLALLGLLVAITGAQCTTCVEDEGAKARIVLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       .:....:::.: .. : ::.. ..:.:::::.  ..: :.: .::::. ...: ..:: :
CCDS10 AGVILLLAGILVLIPVCWTAHAIIQDFYNPLVAEALKRELGASLYLGWAAAALLMLGGGL
              130       140       150       160       170       180

                 190          200       210       220       230    
pF1KE6 LCLSC---QDEAPYRP---YQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYR
       :: .:   : : :  :   :. : :.                                  
CCDS10 LCCTCPPPQVERPRGPRLGYSIPSRSGASGLDKRDYV                       
              190       200       210                              

>>CCDS11096.1 CLDN7 gene_id:1366|Hs108|chr17              (211 aa)
 initn: 396 init1: 396 opt: 623  Z-score: 694.6  bits: 135.7 E(32554): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 623; 44.0% identity (77.8% similar) in 207 aa overlap (1-203:1-207)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       ::....::::: ...:: :: .  : .:.:. ....: ::.:: .. :::::.:: .:::
CCDS11 MANSGLQLLGFSMALLGWVGLVACTAIPQWQMSSYAGDNIITAQAMYKGLWMDCVTQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTT-FAI
       ...:..: :.:::   :::.:::::.: .:. .:   :..:::::::.    .: . .:.
CCDS11 MMSCKMYDSVLALSAALQATRALMVVSLVLGFLAMFVATMGMKCTRCGGDDKVKKARIAM
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 LGGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGT
        :: .::.:::  .:: ::  ...: .:::::.:...:.:.: :...:. .:.: ..::.
CCDS11 GGGIIFIVAGLAALVACSWYGHQIVTDFYNPLIPTNIKYEFGPAIFIGWAGSALVILGGA
              130       140       150       160       170       180

     180          190       200       210       220       230      
pF1KE6 LLCLSC---QDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAYQPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLN
       ::  ::   ...: ::  .. :.....                                 
CCDS11 LLSCSCPGNESKAGYRVPRSYPKSNSSKEYV                             
              190       200       210                              

>>CCDS10488.1 CLDN6 gene_id:9074|Hs108|chr16              (220 aa)
 initn: 614 init1: 586 opt: 606  Z-score: 675.7  bits: 132.3 E(32554): 2.6e-31
Smith-Waterman score: 606; 41.7% identity (72.0% similar) in 218 aa overlap (1-217:1-214)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MASTAVQLLGFLLSFLGMVGTLITTILPHWRRTAHVGTNILTAVSYLKGLWMECVWHSTG
       :::...:.:: .:..:: :. :..  :: :. :: .:..:..:    .:::: :: .:::
CCDS10 MASAGMQILGVVLTLLGWVNGLVSCALPMWKVTAFIGNSIVVAQVVWEGLWMSCVVQSTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 IYQCQIYRSLLALPQDLQAARALMVISCLLSGIACACAVIGMKCTRCAKGTPAKTTFAIL
        .::..: ::::::::::::::: ::. :.. ..    . : ::: :..   .:. ... 
CCDS10 QMQCKVYDSLLALPQDLQAARALCVIALLVALFGLLVYLAGAKCTTCVEEKDSKARLVLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GGTLFILAGLLCMVAVSWTTNDVVQNFYNPLLPSGMKFEIGQALYLGFISSSLSLIGGTL
       .: .:...:.: .. : ::.. ....:::::.  ..: :.: .::::. .:.: :.:: :
CCDS10 SGIVFVISGVLTLIPVCWTAHAIIRDFYNPLVAEAQKRELGASLYLGWAASGLLLLGGGL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210        220       230         
pF1KE6 LCLSCQDEAPYRPYQAPPRATTTTANTAPAY-QPPAAYKDNRAPSVTSATHSGYRLNDYV
       :: .:    :    :.: .  .  ...:::  . :. :                      
CCDS10 LCCTC----PSGGSQGPSHYMARYSTSAPAISRGPSEYPTKNYV                
                  190       200       210       220                




239 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 11:20:17 2016 done: Tue Nov  8 11:20:17 2016
 Total Scan time:  2.010 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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