FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0412, 824 aa 1>>>pF1KB0412 824 - 824 aa - 824 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6410+/-0.00102; mu= 9.7647+/- 0.062 mean_var=125.5922+/-24.590, 0's: 0 Z-trim(107.9): 64 B-trim: 13 in 1/51 Lambda= 0.114444 statistics sampled from 9785 (9849) to 9785 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16 Scan time: 3.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 5448 911.4 0 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 834 149.4 1.1e-35 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 825 147.9 3.2e-35 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 798 143.5 7.1e-34 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 782 140.8 4.6e-33 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 776 139.9 9.1e-33 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 679 123.9 6.7e-28 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 673 122.9 1.3e-27 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 653 119.5 9.9e-27 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 643 117.9 3.3e-26 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 620 114.1 5.7e-25 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 613 113.1 2e-24 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 603 111.3 3.8e-24 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 603 111.3 3.8e-24 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 602 111.2 5.8e-24 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 597 110.3 7.5e-24 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 581 107.6 3.9e-23 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 579 107.3 6e-23 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 553 103.1 1.2e-21 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 552 103.0 2e-21 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 552 103.0 2e-21 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 548 102.3 2.7e-21 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 545 101.8 5.2e-21 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 545 101.8 5.2e-21 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 526 98.7 3.8e-20 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 526 98.7 4.1e-20 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 522 98.0 5.4e-20 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 510 96.0 2.1e-19 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 510 96.0 2.1e-19 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 502 94.8 8.2e-19 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 502 94.8 8.2e-19 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 487 92.2 2.7e-18 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 487 92.2 3.2e-18 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 487 92.2 3.3e-18 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 487 92.2 3.3e-18 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 487 92.3 3.9e-18 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 480 91.1 9.3e-18 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 478 90.7 9.5e-18 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 471 89.6 1.8e-17 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 437 84.0 9.4e-16 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 432 83.1 1.6e-15 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 432 83.1 1.7e-15 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 432 83.1 1.7e-15 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 379 74.4 6.6e-13 CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 352 69.8 1e-11 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 352 69.9 1.2e-11 >>CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 (824 aa) initn: 5448 init1: 5448 opt: 5448 Z-score: 4866.2 bits: 911.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5448; 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CCDS11 ARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNR 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 pF1KB0 ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMR-IAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECV :.:.:::::.:::: :..... ::.. .: : : .. .: CCDS11 ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVT--EEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 DWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGLSVKSK >>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa) initn: 515 init1: 332 opt: 798 Z-score: 721.6 bits: 143.5 E(32554): 7.1e-34 Smith-Waterman score: 804; 34.2% identity (68.6% similar) in 401 aa overlap (38-437:16-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 SGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESL :.:. .:... . .:.. . . :. :... CCDS11 MATTATMATSGSARKRLLKE-EDMTKVEFETSEEVDVTPT-FDTM 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 LLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLE : . .:.:. : :::.:: .: .:: : :.:.:..:::::: .:: .:. : .. CCDS11 GLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQ 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 NLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKC-HIAVG :: ::::::::.::::.. . :.: :. ..::. :::: ...: .: :...: CCDS11 VRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMN-VQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAG 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 SPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATY .:::. ..:. : .:....:::::..:..: :.::: .: :: . :.. .::: CCDS11 TPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKG-FKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 PEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSR :. . . .:.: :: . .. .. .: :.::.. .:. : : . : .:.. CCDS11 PHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVERE-------EWKFDTLCDLYDT 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 IPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLIST . ..::..: : . ... :.. . .: . . :.: :..: . : ... :::::: CCDS11 LTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLIST 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 DLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIA :. .::.:. .:.:..: :.: . : :.:::::.::.: :..... .... .. : CCDS11 DVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFV-KNDDIRILRDIE 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 QKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQ : . .. .: CCDS11 QYYSTQIDEMPMNVADLI 400 410 >>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa) initn: 793 init1: 366 opt: 782 Z-score: 707.1 bits: 140.8 E(32554): 4.6e-33 Smith-Waterman score: 782; 35.2% identity (66.8% similar) in 398 aa overlap (54-447:37-426) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 AVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFE :. . . . :...::. .:... ::: CCDS46 DNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFE 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 RPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIA .:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: .:..: . ....:.. :::.: CCDS46 HPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELA 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 VQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK-C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLN :: . .. : ... ::.:: ...:. ::: : ::.::.:::: : . :: CCDS46 FQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLN 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 PGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDP :. ::::: ::.::. ....... :. : ::.. ::: . . . :.:.:: CCDS46 LKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDP 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 TFVRLNSSDP-SLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHS . ... .: ::.::: ... .::...: .:.. . :::...: . . CCDS46 MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD--------NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQ 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KB0 RAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNL : ::..: ..::: : .: :..::. . ..: :. :.:..:.: .::.: :.::. CCDS46 RCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNI 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KB0 VVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPI . : :.: : .::.::..::::::: ::..:. .. ... . .. ..:. ::: : CCDS46 AFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEI 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 pF1KB0 P-SGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNN :. .:. CCDS46 DISSYIEQTR 420 >>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa) initn: 775 init1: 370 opt: 776 Z-score: 701.7 bits: 139.9 E(32554): 9.1e-33 Smith-Waterman score: 783; 34.1% identity (65.6% similar) in 419 aa overlap (26-440:20-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE :.: : ::.: . .:.. :. . . CCDS12 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQ-ESTPAPPK-----KDIK------GSYVSIH 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA . :...::. .:... :::.:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: . CCDS12 SSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLAT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK :... : .. .:.. :::.: :: . .. : ... ::.:: ...:. ::: CCDS12 LQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKK 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KB0 -C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQ : :..::.:::: :.. .. ... :.::: ::.::. ....... :. : :: CCDS12 NCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 MLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDP-SLIGLKQYY-KVVNSYPLAHKVFEEK . ::: . . . :.:.:: : ... .: ::.::: :. .: :: CCDS12 CMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDS---------EK 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 TQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLK ...: .:.. . :::...: . .: . ::..: ..::: : .: :..::. . ..: CCDS12 NRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFK 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 HFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRG :. :.:..:.: .::.: :.::.: : :.: : .::.::..::::::: ::..:. CCDS12 DFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDE 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 EEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQI .. ... . .. ..:. ::. : CCDS12 NDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR 400 410 420 >>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (479 aa) initn: 644 init1: 215 opt: 679 Z-score: 614.4 bits: 123.9 E(32554): 6.7e-28 Smith-Waterman score: 679; 34.3% identity (64.6% similar) in 376 aa overlap (64-430:94-460) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI :: : :. .:.:. : ::.::: .: .:. CCDS10 KLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENAL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 PL--GRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVIT :: .. .::.:..:::::: .: :... : : : :.:: :.:.: .:: CCDS10 PLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCLSPTYELALQTGKVIE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB0 AIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFIL .: . :. . :. : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.: CCDS10 QMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD :::: .. . :.: : :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. . CCDS10 DEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS .: .:::: . .: .:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: :: CCDS10 ETLDTIKQYYVLCSSR-------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELS 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW ..: . .::.: .:: .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.: CCDS10 KEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDK 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KB0 ------ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGL :::.:::::.:::: ::.:.. . :.. :: .. : CCDS10 DGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEI 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 MEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGL CCDS10 EKIAN >>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 (478 aa) initn: 636 init1: 215 opt: 673 Z-score: 609.1 bits: 122.9 E(32554): 1.3e-27 Smith-Waterman score: 673; 34.0% identity (64.4% similar) in 376 aa overlap (64-430:93-459) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI :: : :. .:.:. : ::.::: .: .:. CCDS10 KLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENAL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 P--LGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVIT : :.. .::.:..:::::: .: :. . . : : :.:: :.:.: .:: CCDS10 PMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB0 AIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFIL .: . :. . :. : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.: CCDS10 QMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD :::: .. . :.: : :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. . CCDS10 DEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS .: .:::: . .: .:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: :: CCDS10 ETLDTIKQYYVLCSSR-------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELS 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW ..: . .::.: .:: .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.: CCDS10 KEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDK 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KB0 ------ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGL :::.:::::.:::: ::.:.. . :.. :: .. : CCDS10 DGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEI 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 MEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGL CCDS10 EKIAN >>CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (347 aa) initn: 294 init1: 264 opt: 653 Z-score: 593.4 bits: 119.5 E(32554): 9.9e-27 Smith-Waterman score: 653; 36.7% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (64-371:34-334) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI :... ::. .:.:. : :::.:: .: .:: CCDS58 SQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 -PLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITA : . : :.:.::.:::::: .:. :... :. .:: :.::::::.: ::..:. : CCDS58 LPCIK-GYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMA 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KB0 IGIKMEGLECHVFIGGTPLSQD--KTRLKKCHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFIL .: : : ::. :::: . . : ... :: ::.:::. .... ::.: :..:.: CCDS58 LGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVL 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD ::::..: .: :..:: :...: .. :.. .:::.: . .. :.:::: . ... . CCDS58 DEADEMLSRG-FKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS .: :..:.: :. : : . : .:. . ..::..: : . ... :.. . CCDS58 LTLEGIRQFYINVERE-------EWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMH 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW .. : . . :.:.:..: : ... ::::.::: .. CCDS58 ARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGKLYPQNRSRWTVWP 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 pF1KB0 ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVD >>CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (370 aa) initn: 608 init1: 215 opt: 643 Z-score: 584.0 bits: 117.9 E(32554): 3.3e-26 Smith-Waterman score: 643; 34.0% identity (64.6% similar) in 359 aa overlap (81-430:2-351) 60 70 80 90 100 pF1KB0 TRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPL--GRCGLDLIVQAKS ::.::: .: .:.:: .. .::.:..: CCDS42 MGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQS 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 GTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGG ::::: .: :... : : : :.:: :.:.: .:: .: . :. . : CCDS42 GTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRG 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 TPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQIN . : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.::::: .. . :.: CCDS42 NKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSI 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 WIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYP : :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. . .: .:::: . .: CCDS42 RIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSR- 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 LAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQ .:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: ::..: . .::.: .: CCDS42 ------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQ 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 pF1KB0 RLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW------ETYMHRIGRAG : .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.: :::.:::::.: CCDS42 RAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTG 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KB0 RFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHT ::: ::.:.. . :.. :: .. : CCDS42 RFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN 330 340 350 360 370 824 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 18:51:43 2016 done: Mon Nov 7 18:51:44 2016 Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]