Result of FASTA (ccds) for pFN21AE9574
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9574, 350 aa
  1>>>pF1KE9574 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5687+/-0.00102; mu= 14.3469+/- 0.060
 mean_var=113.3727+/-34.452, 0's: 0 Z-trim(104.2): 308  B-trim: 1047 in 2/46
 Lambda= 0.120454
 statistics sampled from 7247 (7782) to 7247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.239), width:  16
 Scan time:  2.670

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350) 2296 410.6 9.7e-115
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19        ( 337)  774 146.1   4e-35
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  628 120.8 1.8e-27
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12           ( 482)  516 101.5 1.6e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  498 98.2 1.2e-20
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  488 96.4 3.7e-20
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  487 96.3 4.2e-20
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  483 95.6 6.9e-20
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14          ( 352)  482 95.4 7.7e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  480 95.1 9.8e-20
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  480 95.1   1e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  479 94.9 1.2e-19
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19         ( 385)  477 94.6 1.5e-19
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12        ( 371)  472 93.7 2.6e-19
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12        ( 373)  472 93.7 2.7e-19
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  472 93.7 2.7e-19
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  472 93.7 2.9e-19
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  471 93.5   3e-19
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  471 93.5   3e-19
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  469 93.2 3.9e-19
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  469 93.2   4e-19
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  469 93.2   4e-19
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  469 93.2   4e-19
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  469 93.2   4e-19
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  469 93.2 4.1e-19
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  469 93.3 4.3e-19
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  469 93.3 4.6e-19
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  463 92.1 7.6e-19
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  463 92.1 7.6e-19
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  463 92.1 7.8e-19
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  463 92.2 8.4e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  457 91.1 1.7e-18
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  456 90.9 1.8e-18
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  456 90.9 1.8e-18
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  447 89.3 5.1e-18
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  446 89.2 5.9e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  446 89.2 6.6e-18
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  445 89.0 6.7e-18
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  445 89.0 7.1e-18
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  445 89.0 7.1e-18
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  436 87.4   2e-17
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  432 86.7 3.2e-17
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  430 86.4 4.1e-17
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  429 86.2 4.7e-17
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  428 86.0 5.2e-17
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  427 85.8 5.8e-17
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  426 85.7 6.8e-17
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  425 85.5 7.4e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  425 85.5 7.5e-17
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18         ( 349)  423 85.1 9.3e-17


>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19               (350 aa)
 initn: 2296 init1: 2296 opt: 2296  Z-score: 2173.4  bits: 410.6 E(32554): 9.7e-115
Smith-Waterman score: 2296; 99.4% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVW
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 YASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 YFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 LKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINCCINPIIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 LKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKKLDSLCVSFAYINCCINPIIY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350
pF1KE9 VVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
              310       320       330       340       350

>>CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19             (337 aa)
 initn: 769 init1: 601 opt: 774  Z-score: 744.2  bits: 146.1 E(32554): 4e-35
Smith-Waterman score: 797; 38.4% identity (68.9% similar) in 341 aa overlap (10-343:9-335)

               10        20        30           40        50       
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDIL---ALVIFAVVFLVGVLGNAL
                .:: :.: .    . :::  ...  . : :    : ..:..::::: :::.
CCDS12  MGNDSVSYEYGDYSDLS----DRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAM
                10            20        30        40        50     

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE9 VVWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLIL
       :.::..  :.: ..: :.:.:::::.: ::.:::: . :..  :::.:...:  :::.::
CCDS12 VAWVAGKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIIL
          60        70        80        90       100       110     

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE9 LNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVV
       :.::::.::::..:::  .:.. : : .. . :  . .::..:: ::::::.:: .:: .
CCDS12 LTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRL
         120       130       140       150       160       170     

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE9 REEYFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRS
       ..:.:: .. : :::. ..  : ::. .:...::: ::.... :.. .:   :. :  : 
CCDS12 HQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALL--CWAARRCRP
         180       190       200       210       220         230   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE9 TKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINCCINP
         :     :.:..::. : ::.. :....   :.:  .    . . : :..:  . :.::
CCDS12 LGT-----AIVVGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNP
                240       250       260       270       280        

       300       310           320       330       340       350
pF1KE9 IIYVVAGQGFQGRLRKSLPSL----LRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
       ....  :..   .::.:::.     ::.   ..  :  .:: ... :. :       
CCDS12 MLFLYFGRA---QLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV     
      290          300       310       320       330            

>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2                 (355 aa)
 initn: 561 init1: 336 opt: 628  Z-score: 606.8  bits: 120.8 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 628; 31.2% identity (68.1% similar) in 317 aa overlap (16-327:18-331)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE9   MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALV
                        : :  .:.. ...  . : :   ..::.. ..:..:. :::.:
CCDS23 MEDLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQ-LGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIV
               10        20        30         40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE9 VWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILL
       .: :.:. :.:....::::::.:::.  : ::. .. .... :::::   :.       :
CCDS23 IWFTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQL
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE9 NMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVR
       ::.::...:..:: :... ...:.  .  :    . :.    : :: :.  :.. .: . 
CCDS23 NMFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTV
     120       130       140       150       160       170         

      180       190            200       210       220       230   
pF1KE9 EEYFPPKVLCGVDYS-HDKR----RERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRR
       :  :  ..::  ... ::      :..... :....:.:.::::..:::  ..... .: 
CCDS23 E--FNNHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRS
     180         190       200       210       220       230       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE9 ATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDSLCVSFAYINC
          :.. . ....::..: . : ::.. .:    .. .: .  ...    : ...:..: 
CCDS23 ILISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNS
       240       250       260       270       280       290       

           300       310       320       330       340       350 
pF1KE9 CINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV 
       :.:::.::. .. ::.:.:.:.  .:. .: : :                        
CCDS23 CLNPILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
       300       310       320       330       340       350     

>>CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12                (482 aa)
 initn: 747 init1: 516 opt: 516  Z-score: 500.0  bits: 101.5 E(32554): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 516; 47.9% identity (83.8% similar) in 142 aa overlap (36-177:22-163)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KE9 YTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVWVTAFE
                                     : ::..::....::.:. ::.::.::....
CCDS85          MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLK
                        10        20        30        40        50 

          70        80        90       100       110       120     
pF1KE9 AKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNMYASIL
        .::.:.::::.:..::.: ::.::. .. .. . .::.:   :...::.:.:::.::..
CCDS85 MQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVF
              60        70        80        90       100       110 

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE9 LLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREEYFPPK
       ::..:: :: :.::::::::: :..:.:   :.  : .:... :: :.:: .        
CCDS85 LLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNR
             120       130       140       150       160       170 

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE9 VLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRSTKTLKVVV
                                                                   
CCDS85 CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQP
             180       190       200       210       220       230 

>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17              (369 aa)
 initn: 434 init1: 256 opt: 498  Z-score: 484.5  bits: 98.2 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 498; 31.0% identity (60.9% similar) in 348 aa overlap (12-347:23-359)

                          10        20         30        40        
pF1KE9            MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPV-DKTSNTLRVPDILALVIFAVVF
                             :   . .: . . :  : :::.     .:... : :: 
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNA-----VLTFIYF-VVC
               10        20        30        40             50     

       50        60         70        80        90       100       
pF1KE9 LVGVLGNALVVWVTAFEAK-RTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGA
       ..:. ::.::..:    :: .::. :..::::.:: :  :.::.:  ...  : :::: :
CCDS11 IIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVH-WPFGKA
           60        70        80        90       100        110   

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE9 ACSILPSLILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLL
        : .. ..  .:...::. :...: ::.: : .::   ..:    : .   ..::..::.
CCDS11 ICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLV
           120       130       140       150       160       170   

       170       180       190        200       210       220      
pF1KE9 TIPSFLYRVVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRR-ERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFIL
        .: ..:  .: . .  .  : ...  ..     .  :  ..:::: ::  . .:: ::.
CCDS11 ILPIMIYAGLRSNQWG-RSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFII
           180        190       200       210       220       230  

               230       240       250        260       270        
pF1KE9 L-------RTWSRRATRSTKTLKVVVAVVASFFIF-WLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLL
       .       :. : .  .: : .  .:..:.. ::: :::. . ..  :     :::  : 
CCDS11 IKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVS-SVSMAISPTPALK
            240       250       260       270        280       290 

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE9 NKLDSLCVSFAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKS-FTR
       . .: . : ..: : : :::.:.  ...:.  ... :  :..   :...   .::.  .:
CCDS11 GMFD-FVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVL-CLVKVSGTDDGERSDSKQDKSR
              300       310       320        330       340         

       340       350       
pF1KE9 STVDTMAQKTQAV       
        .  : .:.:          
CCDS11 LNETTETQRTLLNGDLQTSI
     350       360         

>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2                (350 aa)
 initn: 423 init1: 174 opt: 488  Z-score: 475.4  bits: 96.4 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 488; 29.5% identity (62.0% similar) in 353 aa overlap (5-341:3-345)

               10        20        30             40        50     
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSN-----TLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGN
           : : :..  .:: .   .  :.:.  .     :  .   .... .:.:::...:::
CCDS24   MSNITDPQMWDFDDLNFTGM-PPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSLLGN
                 10        20         30        40        50       

          60         70        80        90       100       110    
pF1KE9 ALVVWVTAF-EAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPS
       .::. :  . .. :... ...::::.::.:  :.:::  .: :  . : ::   :...  
CCDS24 SLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFGTFLCKVVSL
        60        70        80        90       100         110     

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE9 LILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLY
       :  .:.:..::::: ::.::.: . .     . .   :. ..:   :::.. :..: ::.
CCDS24 LKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQK-RHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPFFLF
         120       130       140        150       160       170    

          180         190       200        210       220       230 
pF1KE9 RVVREEYFPPKV--LCGVDYSHDKRRERAVA-IVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWS
          :. : : .   .:    ..:  . : :  :.  ..::. ::... .:: : :   ..
CCDS24 ---RQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFK
             180       190       200       210       220       230 

             240       250       260            270       280      
pF1KE9 RRATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQV-----TGIMMSFLEPSSPTFLLLNK-LDSLC
        .  .. ....:. :::  :.. ::::..     : .  . .. :      ... ::.  
CCDS24 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATE
             240       250       260       270       280       290 

         290       300       310       320       330        340    
pF1KE9 VSFAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRES-KSFTRSTVDTMA
       . ..... :.:::::.  ::.:.  . : :   .......: ..:.   :.: :.:.   
CCDS24 I-LGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILA--MHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSS
              300       310       320         330       340        

          350
pF1KE9 QKTQAV
             
CCDS24 NL    
      350    

>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 383 init1: 294 opt: 487  Z-score: 474.4  bits: 96.3 E(32554): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 487; 28.2% identity (63.3% similar) in 319 aa overlap (7-313:6-314)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVW
             :: ::    . :  :  :: .:...     ..:   ....::..:..:: ::: 
CCDS27  METPNTTEDYDTTTEFDYGD-ATPCQKVNERAFGAQLLP-PLYSLVFVIGLVGNILVVL
                10        20         30         40        50       

                70        80        90       100       110         
pF1KE9 VTA-FEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLN
       : . ..  .....:..::::..:.:  ..:: .. .   .  : :: : :.:: ..   .
CCDS27 VLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLP-FWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTG
        60        70        80         90       100       110      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE9 MYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVRE
       .:. :...  .. ::.: . . ..    : . .. :.  . :.::.: ..:.. .  .. 
CCDS27 LYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQW
        120       130       140       150       160       170      

     180       190        200        210       220       230       
pF1KE9 EYFPPKVLCGVDYSHDKRRE-RAVAIVRLVL-GFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRATRS
       :.   .  :.. . :.. :: .    ..: : :.. :::.. :::: :.     :   ..
CCDS27 EF--THHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKK
          180       190       200       210       220       230    

       240       250       260       270       280                 
pF1KE9 TKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLNKLDS-----LCVS----F
       .:..... ...  ::.:: ::..: :..: ..     ::. .. ..     : :.    .
CCDS27 SKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLT-ILISVFQD----FLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVI
          240       250        260           270       280         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE9 AYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQ
       :: .::.::.::. .:. :.  ::.                                   
CCDS27 AYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEH
     290       300       310       320       330       340         

>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2                (360 aa)
 initn: 399 init1: 155 opt: 483  Z-score: 470.5  bits: 95.6 E(32554): 6.9e-20
Smith-Waterman score: 483; 30.2% identity (63.9% similar) in 341 aa overlap (10-339:19-352)

                        10        20          30        40         
pF1KE9          MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLD--LNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFL
                         : ..:. ..::   :   .    ..:..   ....:.:.:::
CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFL
               10        20        30        40        50        60

      50        60         70        80        90       100        
pF1KE9 VGVLGNALVVWVTAF-EAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAA
       ...:::.::. :  . .. :... ...::::.::.:  :.:::  .: :  . : ::   
CCDS24 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFGTFL
               70        80        90       100         110        

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE9 CSILPSLILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLT
       :...  :  .:.:..::::: ::.::.: . .     . .   . .: :   :::.:::.
CCDS24 CKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFI-CLSIWGLSLLLA
      120       130       140       150       160        170       

      170        180       190       200        210       220      
pF1KE9 IPSFLYR-VVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVA-IVRLVLGFLWPLLTLTICYTFIL
       .: .:.: .:      :   :  :....    : .  :.   .::. ::: . .:: : :
CCDS24 LPVLLFRRTVYSSNVSPA--CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTL
       180       190         200       210       220       230     

        230       240       250       260       270         280    
pF1KE9 LRTWSRRATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPS--SPTFLLLNKLD-S
          .. .  .. ....:. :::  :.. ::::... .  .... .  . :    :..: .
CCDS24 RTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRA
         240       250       260       270       280       290     

             290       300       310       320       330        340
pF1KE9 LCVS--FAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESK-SFTRSTV
       : ..  .. .. :.::.::.  :: :.  : : :   ........:. ..:. ::. :. 
CCDS24 LDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILA--IHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSS
         300       310       320       330         340       350   

              350
pF1KE9 DTMAQKTQAV
                 
CCDS24 GHTSTTL   
           360   

>>CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14               (352 aa)
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               10        20        30          40        50        
pF1KE9 MNSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVP--DILALVIFAVVFLVGVLGNALV
                            .::  . .  .: :   ..::.....:.. ::. ::..:
CCDS96                      MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFV
                                    10        20        30         

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pF1KE9 VW-VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLIL
       :: .     ::...:.  ::::.::.   :. : .:  .. .  : :: :.: .   .  
CCDS96 VWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAP-FFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCG
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       ..::::.::....: :: : : .:.  :..:  ..:  . :  : :..::. : . ::.:
CCDS96 VSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTV
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            : :.   ::   :  . .:   . : . : ::: :.:...  :. :  :  .:: 
CCDS96 ----VPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF
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        :: .: ..:: .. .:  :::::.:...  .   :  ..  . :..:  ::     ...
CCDS96 RRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIAL
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pF1KE9 AYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKS----LPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMA
       :...  .::..:. :: :.   ::..    . .::... .: : .:.. :. ..      
CCDS96 AFLSSSVNPVLYACAGGGL---LRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPA
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CCDS96 ALEPGPSESLTASSPLKLNELN
              340       350  

>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 396 init1: 313 opt: 480  Z-score: 467.8  bits: 95.1 E(32554): 9.8e-20
Smith-Waterman score: 480; 32.3% identity (65.6% similar) in 285 aa overlap (43-312:40-313)

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pF1KE9 HYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVWVTA-FEAKRTIN
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CCDS27 TFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMT
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pF1KE9 AIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNMYASILLLATIS
        :..::::..:.:  ..:: ..   :. :.: :: . :..: ..   ..:. :...  ..
CCDS27 NIYLLNLAISDLLFLVTLP-FWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLT
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pF1KE9 ADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVREEYFPPKVLCGVD
        ::.: . . ..    : . .. :.  :.::::.: ..: :..  . :: :  ..::.. 
CCDS27 IDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYET-EELFE-ETLCSAL
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pF1KE9 YSHDKRRE-RAVAIVRL-VLGFLWPLLTLTICYTFI---LLRTWSRRATRSTKTLKVVVA
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CCDS27 YPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSK---KKYKAIRLIFV
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       ..: ::::: ::.:. :..:    :  ..:. :      .::  . :.  .:: .::.::
CCDS27 IMAVFFIFWTPYNVA-ILLS----SYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNP
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pF1KE9 IIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV    
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CCDS27 VIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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