FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4314, 323 aa 1>>>pF1KE4314 323 - 323 aa - 323 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6571+/-0.000876; mu= 13.6759+/- 0.052 mean_var=65.4913+/-13.516, 0's: 0 Z-trim(105.8): 29 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.158483 statistics sampled from 8571 (8598) to 8571 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16 Scan time: 2.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 2171 505.2 2.8e-143 CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 2123 494.2 5.7e-140 CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1907 444.8 4.2e-125 CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1903 443.9 7.8e-125 CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1807 422.0 3.2e-118 CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1313 309.0 3.2e-84 CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1188 280.4 1.2e-75 CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1163 274.7 6.1e-74 CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1064 252.1 4.3e-67 CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1020 242.0 4.6e-64 CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 952 226.5 2.4e-59 CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 918 218.7 4.9e-57 CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 813 194.6 3.9e-50 CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 593 144.4 1.1e-34 CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 587 143.0 2.7e-34 CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 348 88.3 6e-18 CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 348 88.4 7e-18 >>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa) initn: 2171 init1: 2171 opt: 2171 Z-score: 2685.8 bits: 505.2 E(32554): 2.8e-143 Smith-Waterman score: 2171; 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CCDS73 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP :.:::::. : :::::..:: ::::.:::::::::::::::::::::::.: :::::::: CCDS73 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV ::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. :::::::::::::: CCDS73 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::. 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CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMIL :.. :::.:. :.::::: :. .::::::::: ::::::.::.::::::.: ::.:: CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE ::::::.::: :::::::::.: ::: ::...:::..::: ::. :. ::. .:: ::. CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID : .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: :.:.:.:: :::: :. 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CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMIL :.. :::.:. :.::::: :. .::::::::: ::::::.::.::::::.: ::.:: CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE ::::::.::: :::::::::.: ::: ::...:::..::: ::. :. ::. .:: ::. 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