Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6909
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6909, 205 aa
  1>>>pF1KB6909 205 - 205 aa - 205 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8549+/-0.00061; mu= 12.4808+/- 0.037
 mean_var=88.1342+/-17.702, 0's: 0 Z-trim(113.7): 17  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.136616
 statistics sampled from 14291 (14308) to 14291 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.44), width:  16
 Scan time:  2.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5583.1 HSPB1 gene_id:3315|Hs108|chr7           ( 205) 1405 285.7 1.4e-77
CCDS9189.1 HSPB8 gene_id:26353|Hs108|chr12         ( 196)  395 86.6 1.1e-17
CCDS8351.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11          ( 175)  384 84.4 4.5e-17
CCDS82651.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|c ( 173)  360 79.7 1.2e-15
CCDS13695.1 CRYAA gene_id:1409|Hs108|chr21         ( 173)  360 79.7 1.2e-15
CCDS81626.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11         ( 108)  345 76.6 6.3e-15
CCDS12475.1 HSPB6 gene_id:126393|Hs108|chr19       ( 160)  320 71.8 2.6e-13
CCDS82652.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|c ( 136)  313 70.3   6e-13
CCDS8352.1 HSPB2 gene_id:3316|Hs108|chr11          ( 182)  309 69.6 1.3e-12


>>CCDS5583.1 HSPB1 gene_id:3315|Hs108|chr7                (205 aa)
 initn: 1405 init1: 1405 opt: 1405  Z-score: 1506.5  bits: 285.7 E(32554): 1.4e-77
Smith-Waterman score: 1405; 100.0% identity (100.0% similar) in 205 aa overlap (1-205:1-205)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
              130       140       150       160       170       180

              190       200     
pF1KB6 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
              190       200     

>>CCDS9189.1 HSPB8 gene_id:26353|Hs108|chr12              (196 aa)
 initn: 441 init1: 303 opt: 395  Z-score: 430.9  bits: 86.6 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 405; 39.6% identity (62.0% similar) in 187 aa overlap (1-174:1-176)

               10           20        30        40               50
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSW---DPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEE----WSQWLG---GSS
       :.. ..:::  . ::    :::::    :::.:..::.  .:..    : .:     .:.
CCDS91 MADGQMPFSC-HYPSRLRRDPFRDSPLSSRLLDDGFGMDPFPDDLTASWPDWALPRLSSA
               10         20        30        40        50         

                 60        70        80        90       100        
pF1KB6 WPGYVRP--LPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDE
       ::: .:   .: .   .   ..:: .:          .     .. :.: ..:. : :.:
CCDS91 WPGTLRSGMVPRGPTATARFGVPAEGR----------TPPPFPGEPWKVCVNVHSFKPEE
      60        70        80                  90       100         

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB6 LTVKTKDGVVEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAP
       : :::::: ::..:::::.:.: : .:. ::.:  ::  :::. : .:::::: : .:::
CCDS91 LMVKTKDGYVEVSGKHEEKQQEGGIVSKNFTKKIQLPAEVDPVTVFASLSPEGLLIIEAP
     110       120       130       140       150       160         

       170       180       190       200     
pF1KB6 -MPKLATQSNEITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
        .:  .:                               
CCDS91 QVPPYSTFGESSFNNELPQDSQEVTCT           
     170       180       190                 

>>CCDS8351.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11               (175 aa)
 initn: 420 init1: 349 opt: 384  Z-score: 419.9  bits: 84.4 E(32554): 4.5e-17
Smith-Waterman score: 417; 44.4% identity (64.3% similar) in 171 aa overlap (18-188:13-166)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
                        ::  ..  :::::: ::   :  .     . :  : :.::   
CCDS83      MDIAIHHPWIRRPFFPFHSPSRLFDQFFGEHLLESDLFP-TSTSLSPFYLRP---
                    10        20        30         40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
                 :.. :: :  ...:.::.:   ::. :.:::.::.:.:: ::.   :.:.
CCDS83 ----------PSFLRAPS-WFDTGLSEMRLEKDRFSVNLDVKHFSPEELKVKVLGDVIEV
                         60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
        :::::::::::.::: : ::: .:  :::  ..:::: .:.:::..:  ...  . : :
CCDS83 HGKHEERQDEHGFISREFHRKYRIPADVDPLTITSSLSSDGVLTVNGPRKQVS--GPERT
              110       120       130       140       150          

              190       200     
pF1KB6 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
       ::.: : .                 
CCDS83 IPITREEKPAVTAAPKK        
      160       170             

>>CCDS82651.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|chr21  (173 aa)
 initn: 382 init1: 327 opt: 360  Z-score: 394.4  bits: 79.7 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 364; 41.4% identity (60.9% similar) in 174 aa overlap (18-188:16-166)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
                        ::   :: :::::: ::   .  .   .:...           
CCDS82   MDVTIQHPWFKRTLGPF---YP-SRLFDQFFGEGLFEYDLLPFLSST-----------
                 10            20        30        40              

               70        80         90       100       110         
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQ-LSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVE
                .: : ..: :  :.::.::.:   :.. . :::.::.:..::::..:  ::
CCDS82 --------ISPYYRQSLFRTVLDSGISEVRSDRDKFVIFLDVKHFSPEDLTVKVQDDFVE
                    50        60        70        80        90     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 ITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK--LATQSN
       : :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: ::  .:  .  : .   
CCDS82 IHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDATHA
         100       110       120       130       140       150     

       180       190       200     
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
       : .:::. : .                 
CCDS82 ERAIPVSREEKPTSAPSS          
         160       170             

>>CCDS13695.1 CRYAA gene_id:1409|Hs108|chr21              (173 aa)
 initn: 382 init1: 327 opt: 360  Z-score: 394.4  bits: 79.7 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 364; 41.4% identity (60.9% similar) in 174 aa overlap (18-188:16-166)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
                        ::   :: :::::: ::   .  .   .:...           
CCDS13   MDVTIQHPWFKRTLGPF---YP-SRLFDQFFGEGLFEYDLLPFLSST-----------
                 10            20        30        40              

               70        80         90       100       110         
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQ-LSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVE
                .: : ..: :  :.::.::.:   :.. . :::.::.:..::::..:  ::
CCDS13 --------ISPYYRQSLFRTVLDSGISEVRSDRDKFVIFLDVKHFSPEDLTVKVQDDFVE
                    50        60        70        80        90     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 ITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK--LATQSN
       : :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: ::  .:  .  : .   
CCDS13 IHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDATHA
         100       110       120       130       140       150     

       180       190       200     
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
       : .:::. : .                 
CCDS13 ERAIPVSREEKPTSAPSS          
         160       170             

>>CCDS81626.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11              (108 aa)
 initn: 341 init1: 321 opt: 345  Z-score: 381.4  bits: 76.6 E(32554): 6.3e-15
Smith-Waterman score: 345; 52.5% identity (75.2% similar) in 101 aa overlap (88-188:1-99)

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 LPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGV
                                     .:   ::. :.:::.::.:.:: ::.   :
CCDS81                               MRLEKDRFSVNLDVKHFSPEELKVKVLGDV
                                             10        20        30

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 VEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSN
       .:. :::::::::::.::: : ::: .:  :::  ..:::: .:.:::..:  ...  . 
CCDS81 IEVHGKHEERQDEHGFISREFHRKYRIPADVDPLTITSSLSSDGVLTVNGPRKQVS--GP
               40        50        60        70        80          

       180       190       200     
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
       : :::.: : .                 
CCDS81 ERTIPITREEKPAVTAAPKK        
       90       100                

>>CCDS12475.1 HSPB6 gene_id:126393|Hs108|chr19            (160 aa)
 initn: 367 init1: 289 opt: 320  Z-score: 352.3  bits: 71.8 E(32554): 2.6e-13
Smith-Waterman score: 330; 38.4% identity (58.5% similar) in 159 aa overlap (14-167:9-146)

               10             20        30        40        50     
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSW-----DPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYV
                    :::      :.      .::::: ::   :  : .     .  : :.
CCDS12      MEIPVPVQPSWLRRASAPLPGLSAPGRLFDQRFGEGLLEAELAALCPTTLAPYYL
                    10        20        30        40        50     

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 RPLPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKD
       :        .:.:: :             :...     .. : :::.::.:.:..::.  
CCDS12 R--------APSVALP-------------VAQVPTDPGHFSVLLDVKHFSPEEIAVKVVG
                  60                     70        80        90    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB6 GVVEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQ
         ::. ..:::: ::::...: : :.: :::::::. :.:.:::::.:...:        
CCDS12 EHVEVHARHEERPDEHGFVAREFHRRYRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPASAQAP
          100       110       120       130       140       150    

         180       190       200     
pF1KB6 SNEITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
                                     
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        ::: :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: ::  .:  .  : .
CCDS82 FVEIHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDA
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          : .:::. : .                 
CCDS82 THAERAIPVSREEKPTSAPSS          
         120       130                

>>CCDS8352.1 HSPB2 gene_id:3316|Hs108|chr11               (182 aa)
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       :. : :: .    :.   ..   : ::: .: ::   ::::    :  . . :: :::  
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         : :.        :::       :.::.: .  .... :::.::.:::.::.: :...:
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       ....: .: :.::..:: : : :.::  ::: .: ..:: .: :..:::    .: :. :
CCDS83 VSARHPQRLDRHGFVSREFCRTYVLPADVDPWRVRAALSHDGILNLEAPRGGRHLDTEVN
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CCDS83 EVYISL-------LPAPPDPEEEEEAAIVEP
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