FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3669, 463 aa 1>>>pF1KE3669 463 - 463 aa - 463 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3385+/-0.000912; mu= 17.9888+/- 0.055 mean_var=68.2733+/-13.612, 0's: 0 Z-trim(105.5): 32 B-trim: 131 in 1/50 Lambda= 0.155220 statistics sampled from 8451 (8477) to 8451 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 2.670 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 ( 463) 3062 694.8 4.8e-200 CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 ( 462) 2858 649.1 2.7e-186 CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 642) 739 174.7 2.5e-43 CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 684) 739 174.7 2.6e-43 CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 499) 704 166.8 4.7e-41 CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 636) 704 166.8 5.7e-41 CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 637) 704 166.8 5.7e-41 CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX ( 628) 688 163.3 6.8e-40 CCDS10642.1 TUFM gene_id:7284|Hs108|chr16 ( 455) 267 68.9 1.2e-11 >>CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 (463 aa) initn: 3062 init1: 3062 opt: 3062 Z-score: 3704.8 bits: 694.8 E(32554): 4.8e-200 Smith-Waterman score: 3062; 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CCDS47 MDQVN--WQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWY 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 KVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILRP : :. ::: .:.. :: : :::.:: ..::.: : : .:..:.: .. CCDS47 K---------GLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQT 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNV-CGDSKSDP : . : : : ::.. .: : .. : ::.:.... .... : : . :: . : CCDS47 GDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKV--P 480 490 500 510 520 530 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 PQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPKS . ..: ....:.: :. :. .. .:. . .: ... .:. . .:: CCDS47 IKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKF 540 550 560 570 580 590 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 LKSGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKNVEKKSGGAGKVTK : .:. :.::. .:. .: .... :::: .: .:.:.::. .... CCDS47 LTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE 600 610 620 630 640 460 pF1KE3 SAQKAQKAGK >>CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (684 aa) initn: 939 init1: 632 opt: 739 Z-score: 890.9 bits: 174.7 E(32554): 2.6e-43 Smith-Waterman score: 1079; 39.3% identity (69.3% similar) in 440 aa overlap (5-443:258-684) 10 20 30 pF1KE3 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGI : .:.:::::::.:::: ::..: :.: CCDS51 QSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNI 230 240 250 260 270 280 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 DKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAPG .:::..:.:.:. . ::.:: ::::::. :::::.:.:... ::::: ::..:::: CCDS51 NKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPG 290 300 310 320 330 340 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 HRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNK :.::: :::::..::: :::.: :. ::::::. .::::::.::. .::: :: :.::: CCDS51 HKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNK 350 360 370 380 390 400 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 MDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPATVPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFKGW ::... ....:..::. ... ..:. :.. . : :.: :: :.:.. : . : . CCDS51 MDQVN--WQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWY 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 KVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILRP : :. ::: .:.. :: : :::.:: ..::.: : : .:..:.: .. CCDS51 K---------GLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQT 470 480 490 500 510 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNV-CGDSKSDP : . : : : ::.. .: : .. : ::.:.... .... : : . :: . : CCDS51 GDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKV--P 520 530 540 550 560 570 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 PQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPKS . ..: ....:.: :. :. .. .:. . .: ... .:. . .:: CCDS51 IKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKF 580 590 600 610 620 630 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 LKSGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKNVEKKSGGAGKVTK : .:. :.::. .:. .: .... :::: .: .:.:.::. .... CCDS51 LTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE 640 650 660 670 680 460 pF1KE3 SAQKAQKAGK >>CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (499 aa) initn: 886 init1: 640 opt: 704 Z-score: 850.6 bits: 166.8 E(32554): 4.7e-41 Smith-Waterman score: 1020; 37.2% identity (67.5% similar) in 443 aa overlap (4-444:71-498) 10 20 30 pF1KE3 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG .: :.:.: :::::.:::: :...: : CCDS45 RPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGM 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 IDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAP .::::.::.:.:: : .. .. .:.:: . ::..: :.... ::: : ..::.::: CCDS45 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN ::..:. ::: :.:::: :::...: ::::.:. :.:::::::.:: : :::.::: .: CCDS45 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KMDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPAT-VPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFK :::. .:..::.: ... ..::.:.:: . :.: :: : :. : : ::. CCDS45 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWY- 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GWKVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGIL :. .. ::.. .: .: :.:::. : :: .::: .:..:.: . CCDS45 -----------IGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RPGMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNVCGDSKSD :. ... : . ..:: .. . . ::.:. . .:.. ..: : . : .. CCDS45 CKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDP-NN 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 PPQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPK . . : .:..:..: . : ::. :. :: ... : .:..::.: . :. 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