FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1445, 293 aa 1>>>pF1KE1445 293 - 293 aa - 293 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3353+/-0.000949; mu= 14.4973+/- 0.056 mean_var=57.4803+/-11.565, 0's: 0 Z-trim(104.0): 38 B-trim: 41 in 1/46 Lambda= 0.169167 statistics sampled from 7646 (7684) to 7646 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16 Scan time: 2.310 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 293) 2000 496.5 9.8e-141 CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 204) 1295 324.4 4.4e-89 CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 464) 451 118.5 9.4e-27 CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 479) 451 118.5 9.7e-27 CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 496) 451 118.5 1e-26 CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 538) 451 118.5 1.1e-26 CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 408 108.0 1.4e-23 CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 408 108.0 1.5e-23 CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 391 103.9 2.3e-22 CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 ( 277) 386 102.6 3.5e-22 CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 455) 378 100.7 2.1e-21 CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 366 97.8 1.7e-20 CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 366 97.8 1.8e-20 CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 278) 352 94.3 1.1e-19 CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 303) 351 94.0 1.4e-19 CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 336) 351 94.1 1.6e-19 CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 388) 351 94.1 1.8e-19 CCDS159.2 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 333) 286 78.2 9.2e-15 CCDS158.1 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 416) 286 78.2 1.1e-14 CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 235 65.7 4.8e-11 CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 234 65.5 5.4e-11 CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 235 65.8 5.8e-11 CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 235 65.8 6.1e-11 CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 234 65.5 6.8e-11 CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 234 65.5 7.7e-11 CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 234 65.5 8e-11 >>CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 (293 aa) initn: 2000 init1: 2000 opt: 2000 Z-score: 2640.1 bits: 496.5 E(32554): 9.8e-141 Smith-Waterman score: 2000; 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CCDS23 -------ETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQS 380 390 400 410 420 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LCEMLGKY-GSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFP ::. : . . .. .:: :: .::.. : . .:: :.: . : ::: :: CCDS23 LCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNK-----DDKKNMGK-QMPQPTFTLRKKL-VFP 430 440 450 460 470 pF1KE1 KSN CCDS23 SD >>CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (496 aa) initn: 443 init1: 169 opt: 451 Z-score: 593.3 bits: 118.5 E(32554): 1e-26 Smith-Waterman score: 452; 35.6% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (37-290:243-494) 10 20 30 40 50 pF1KE1 LRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFF--------WH :.: . :: ::.:.. : : CCDS42 FSKGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH 220 230 240 250 260 270 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEEL--LLKIHEVSTVSHADADCFVC .. .: :: : :: : .: ::.: .: .:.. .:::... ..:.. :::.: CCDS42 -SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQL--MDHSNMDCFIC 280 290 300 310 320 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 VFLSHGEGNHIYAYDAK-IEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGN--QHDVPVI .::::. . ::. :.. : ::. : : :: ::.::::.:.::::.:. :. .:: CCDS42 CILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPV- 330 340 350 360 370 380 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 PLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYT--LPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQD .:.. . :.: .: : .: ::::. ...... :.:. ..:.::::. 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