Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1062
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1062, 1454 aa
1>>>pF1KE1062 1454 - 1454 aa - 1454 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3436+/-0.00134; mu= 0.4874+/- 0.081
mean_var=329.9377+/-68.093, 0's: 0 Z-trim(110.4): 165 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.070609
statistics sampled from 11447 (11602) to 11447 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 5.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 6810 709.3 2e-203
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 6799 708.2 4.4e-203
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 5393 565.0 5.7e-160
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 2603 280.8 2.1e-74
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 780 95.1 1.8e-18
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 773 94.4 2.9e-18
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 723 89.2 7.8e-17
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15 (1250) 713 88.2 1.7e-16
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 717 88.8 1.7e-16
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 705 87.5 4e-16
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 634 80.2 5.5e-14
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 632 80.0 5.6e-14
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 626 79.4 8.4e-14
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 610 77.7 2.6e-13
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 603 76.9 3.5e-13
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 597 76.2 4.8e-13
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 597 76.3 5.3e-13
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 597 76.3 5.5e-13
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 590 75.6 8.6e-13
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 564 72.9 5.4e-12
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 560 72.6 7.6e-12
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 560 72.6 7.6e-12
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 566 73.4 8.1e-12
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 560 72.8 1.1e-11
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 539 70.4 3.2e-11
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 544 71.1 3.5e-11
>>CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461 aa)
initn: 5728 init1: 2852 opt: 6810 Z-score: 3765.4 bits: 709.3 E(32554): 2e-203
Smith-Waterman score: 9439; 96.8% identity (96.8% similar) in 1481 aa overlap (1-1454:1-1461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAERGARRLLSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAERGARRLLSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DTLSVRGSSVILNCSAYSEPSPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DTLSVRGSSVILNCSAYSEPSPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AGAQLIILEHDVAIPTLPPTSLTSATTDHLAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGAQLIILEH--------------------APATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880
pF1KE1 LYESAVTRPHT----------------VPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LYESAVTRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKA------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSSDKM
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 -----SGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNDQASGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 VIIAVFCTRRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VIIAVFCTRRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE1 PNPIMTDTPIPRNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNPIMTDTPIPRNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE1 FDSQPPQPVISAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPGSPWPIGTSMSLSDRANST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FDSQPPQPVISAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPGSPWPIGTSMSLSDRANST
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE1 ESVRNTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESVRNTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLK
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE1 SFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1420 1430 1440 1450
pF1KE1 EVQETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EVQETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
1430 1440 1450 1460
>>CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450 aa)
initn: 6997 init1: 4078 opt: 6799 Z-score: 3759.4 bits: 708.2 E(32554): 4.4e-203
Smith-Waterman score: 9471; 97.6% identity (97.6% similar) in 1470 aa overlap (1-1454:1-1450)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAERGARRLLSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAERGARRLLSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DTLSVRGSSVILNCSAYSEPSPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTLSVRGSSVILNCSAYSEPSPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AGAQLIILEHDVAIPTLPPTSLTSATTDHLAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGAQLIILEH--------------------APATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880
pF1KE1 LYESAVTRPHT----------------VPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LYESAVTRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKASGSGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKASGSGGK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 GSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE1 TSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE1 RNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMPFDSQPPQPVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMPFDSQPPQPVIS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE1 AHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPGSPWPIGTSMSLSDRANSTESVRNTPSTDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPGSPWPIGTSMSLSDRANSTESVRNTPSTDT
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE1 MPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAVPAIPPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAVPAIPPPG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE1 PPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAPEVQETTRMLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAPEVQETTRMLED
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450
pF1KE1 SESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
1430 1440 1450
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAAERGARRLLSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DTLSVRGSSVILNCSAYSEPSPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHN
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pF1KE1 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KPDEGYYQCVATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLV
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pF1KE1 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PFVRWEQNRQPLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVL
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pF1KE1 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PDPEVISDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLL
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310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AGGSLEISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQ
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pF1KE1 AGAQLIILEHDVAIPTLPPTSLTSATTDHLAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AGAQLIILEH--------------------APATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWR
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pF1KE1 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHG
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550 560 570 580 590 600
pF1KE1 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKG
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNL
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pF1KE1 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLD
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pF1KE1 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTP
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pF1KE1 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIP
770 780 790 800 810 820
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pF1KE1 LYESAVTRPHT----------------VPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LYESAVTRPHTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLP
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pF1KE1 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KHQKITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSST
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pF1KE1 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WSMTAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNA
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1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKA------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EIHDWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSSDKM
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 -----SGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNDQASGSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 VIIAVFCTRRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VIIAVFCTRRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE1 PNPIMTDTPIPRNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNPIMTDTPIPRNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE1 FDSQPPQPVISAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPGSPWPIGTSMSLSDRANST
:::::::
CCDS53 FDSQPPQ-----------------------------------------------------
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pF1KE1 ESVRNTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLK
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QSVRNTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLK
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pF1KE1 SFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPMPVVVPSAP
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pF1KE1 EVQETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EVQETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
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pF1KE1 LSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLSVRGSSV
: : .:..:: . :: :: :....::..:
CCDS11 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNV
10 20 30 40 50
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pF1KE1 ILNCSAYSEPS-PKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQC
.:.::: :. . : :.::::: : : :.:.: : .:::.:.:..::.:.::::: :::
CCDS11 LLDCSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQC
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 VATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNR
:.. . :.:::::::. ::: :: :: : ... :....:.::: .. .: ..:..:.
CCDS11 EASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 Q---PLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVLPDPEVI
: :. :.::. :::: : :: :: :.::: ... . . ..:.:...: :: .
CCDS11 QDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLLAGGSLE
.: ::..:: .: . :.:.:: : .:: : :.. :...::... .: .. ::.:..:
CCDS11 RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRS-KKYSLLGGSNLL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTG
::.::.::.: : :.. ::.: :.::::: . : ::..:.:.::.::::: ::: :.:
CCDS11 ISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQLI
::.:::.:.::::.:::::::.:: ::..::.::::::::::.:::..::::..::::
CCDS11 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ILEHDVAIPTLPPTSLTSATTDHLAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDP
: :..: .:. ::::::::: :::.::..:.:: :: .
CCDS11 -----VPKPAIPSSSV---------------LPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPA-EA
420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 HGDNLTYSVFYTKEGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSA
.:. :..::...:: :::. ::..:: .:.:. :: : ..: :::.: :. : ::::
CCDS11 KGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDKEQD
:..: ::::.:.:::. ::.: ..::::: .::: :. .:: .:.:.:. : .: :::.
CCDS11 PIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQN
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 VDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRN
..:.. :: ..::::.::::.: .:::..:::::: :..: :::::::: :::.:::: :
CCDS11 IEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVN
580 590 600 610 620 630
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pF1KE1 SKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLDRGTEYN
:.:: . : :: .:::: :::::::.::..:.... ::: ..: :. ::..:..:.
CCDS11 SRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEM-ETL-EPNNLWYLFTGLEKGSQYS
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 FRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNI
:.:.:.:.::::: ..: .::: :.::::..::. :::::::: .. :..::::: : ::
CCDS11 FQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNI
700 710 720 730 740 750
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pF1KE1 VVRGYAIGYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAV
::::: ::::.:::.:.:..:: :::::.:: :. ::::::.::::::.:::.::::::.
CCDS11 VVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESAT
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880
pF1KE1 TR------------------PHTVPD-PTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQ
:: : .::: :::.::::::: :.::..:..:::::.::.:
CCDS11 TRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQ
820 830 840 850 860 870
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pF1KE1 KITDSRYYTVRWKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSM
: .. : :::::.:.. :..:::. ..:.::: .:::::::.:::::::::.::::::::
CCDS11 KTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSM
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 TAHGTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIH
:::.::.: .::: :::.::...::::...::.:::: :::::::.::..:. : : :
CCDS11 TAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPID
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 DWVIEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKA---------
::..: . :.::::::..:.::: :::.::::::::.::.:. . ::: :.
CCDS11 DWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMAND
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 SGSGGKGSRLP------DLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVV
.: : :. : : .. .::.. . :::: : .::.:..:.:.:::::..:
CCDS11 QGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 VVIIAVFCTRRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSP
:::.::.::::....:.:::: .... : ::..::..:::::::::..:.: :.:
CCDS11 VVIVAVICTRRSSAQQRKKRA----THSAGKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPS
1120 1130 1140 1150 1160
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE1 DPNPIMTDTPIPRNSQDITPVDNSM-DSNIHQRRNSYRGHESED---SMSTL----AGRR
.: :.:: .. ::.:::..:. .... .. .:. :...:. ::::: :.::
CCDS11 GTDPAGRDSPI-QSCQDLTPVSHSQSETQLGSKSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARR
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE1 GMRPKMMMPFDSQPPQP-VISAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPG---SPWPI
. : :.:.:.:.: .: :.:: :. .:.. . . . : ::. .. :: : :.
CCDS11 APRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQ---YPGILPSPTCGY-PHPQFTLRPVPF
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE1 GTSMSLSDR---ANSTESVRNTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDS
: .:. :: :. ..:: . :.: :.: :. ::.::
CCDS11 PT-LSV-DRGFGAGRSQSVSEGPTT---------------QQPPMLPPSQPEHSSSEEAP
1290 1300 1310 1320
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE1 GQSLPTAHVRPSHPLKSFAVPAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGT
....::: :::.:::.::: : .::: . .: .: :::::: . . :::::.:
CCDS11 SRTIPTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMS-AIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE1 LGRSRPPM-PVVVPSAPEV-QETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
:..: :. :: ::.:::: .:. . ::: . :: :.:...:: ::::::.:::::
CCDS11 AGKARSPLLPVSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
CCDS11 F
>>CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KE1 PSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRT--FTPFYFLVEPVDTLSVRGSSVI
:. .: : : .. .: : . .: .
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:::.: ..:.: ::: : : .. .:: .:.:::.::::. .::.....:::: :
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::: . :: .:..:.: :: : : ..: : .:. :...:. . : . :.
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.. .:: :. : . .: :.:. . ..:.: : :: . . :. .:: :: :
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:.:.:: :. .. ... . : : : :.::..: :.. : . : . .:.
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.::.: :.. : ..:.. . : :. :.. . .: . .. .:: :.: : . :
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. :: :.. : :... .. .:: : .:. .: . :
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.... .: . . ... . : : .:.... .:.::: . : : : : : .: .:
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.. :.:.: . .: :... : :.:.::: :: ..:: .:. : .
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. : .:. : :. . :... : . . . .: .
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:. :. : .: .:.. : . . :..: : . ... .. :. : : .
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: .. .. .:. . ..... :.. : :..... . . .. : :.
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:. :... . .:. . ...: : . .. .. . . :.... :..
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:..::. .: ... : : .. .. : : : : . : ::.. . :
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: .:. . : :.. : . . :. . : : ::
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.... . : . . .. . . :.. . . : .: .. :. : :.
CCDS54 ADFAQAVAAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQKTRP
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CCDS54 QNDGKGRGNKAAKRDLPPAKTHLIQEDILPYCRPTFPTSNNPRDPSSSSSMSSRGSGSRQ
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CCDS42 LDCQAHGEVPIKVTWLKNGAKM---SENKRIEVLSNGSLYISEVEGRRGEQSDEGFYQCL
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CCDS42 TLPMTMDRITALPTGVLQIYDVSQRDSGNYRCIAATVAHRRKSMEASLTVIPAKESKSFH
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250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMK-NEEALDTESSERLVLLAGGSLE
... :. .. . : ::: :.:.: : : :.: . .....:. ... .:..:.:
CCDS42 TPTIIAGPQNITTSLHQTVVLECMATGNPKPIISWSRLDHKSIDVFNTR---VLGNGNLM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ISDVTEDDAGTYFCIADN-GNETIE-AQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEV
:::: . ::.: : : . :.... :.: ::: : : :.. : .. .. : :..
CCDS42 ISDVRLQHAGVYVCRATTPGTRNFTVAMATLTVLAPPSFVEWPESLTRPRAGTARFVCQA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQ
: :.: ..:.::: . . .:. . . : . .. :...:::.:::. :. . :.
CCDS42 EGIPSPKMSWLKNGRKIHSNGRIKMYNSK-LVINQIIPEDDAIYQCMAENSQGSILSRAR
360 370 380 390 400
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pF1KE1 LIILEHDVAIPTLPPTSLTSATTDHLAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPAS
: .. . :. :::: .: : .:. : :.:. :
CCDS42 LTVV----------------MSEDR---------PSAPYNVHAETMSSSAILLAWERPLY
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pF1KE1 DPHGDNLTYSVFYTK-EGIARERVENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGE
. ..::: : : ::. : :.::.:
CCDS42 NSD-KVIAYSVHYMKAEGLNNE---------EYQVVI-----------------------
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pF1KE1 SSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRAYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDK
:.:
CCDS42 --------------------------------------------------------GND-
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pF1KE1 EQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLE
..: : :. :. ..:.: .::: : . . :. :: ::: :. .::
CCDS42 ------TTH-YIIDDLEPASNYTFYIVAYMPMGASQMSDHVTQNTLEDVPLRPPE-ISLT
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:. .:.: : : . ::.. :.. .: ....: . . :: :.::: .
CCDS42 SRSPTDILISWLPIPAKYRRGQVVLYRLSFRLSTENS-IQVLELPGTTHEYLLEGLKPDS
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 EYNFRVAALTINGTGPATDWLSAETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPL-VTSIVVSWTPPE
: :..: : : : .. : : .: .. ...:. : ::..:: :.: : :
CCDS42 VYLVRITAATRVGLGESSVWTSHRTPKA--TSVKAPKSPE-LHLEPLNCTTISVRWQQDV
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pF1KE1 NQNIVVRGYAIGYGI-GSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPL
... ...:: . : :. . : .: :. ::. .::: .: . : :.::. .:
CCDS42 EDTAAIQGYKLYYKEEGQQENGPIFLDTKDLLYTLSGLDPRRKYHVRLLAYNNIDDGYQA
650 660 670 680 690 700
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pF1KE1 YESAVT------RPHTVPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSRYY
... : : . :: : : :: . :. . ..: . : .. : :. :
CCDS42 DQTVSTPGCVSVRDRMVP-PPP--PPHHLYAKANTSSSIFLHWRRPAFTAAQIIN----Y
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pF1KE1 TVRWK-TNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSMTAHGTTF
:.: . ... . ... .:: ::.::: :::.: . . :: :: ... .:.
CCDS42 TIRCNPVGLQNASLVLYLQTSETHMLVQGLEPNTKYEFAVRLHVDQLSSPWSPVVYHSTL
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pF1KE1 ELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIHDWVIEPV
.:..:: : :. : : .:.:.::. . .: : : :.. .: .
CCDS42 PEAPAGPPVGVKVTLIED--DTALVSWKPPDGPETVVTRYTILYASRKAWIAGEWQVLHR
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pF1KE1 VGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRT-PK-ASGSGGKGSRLPDLG
: ...:. . : ::.: : : ::.:..:.. . :: .: :. . .:: .
CCDS42 EGAITMALLENLVAGNVYIVKISASNEVGEGPFSNSVELAVLPKETSESNQRPKRLD--S
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 SDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRTTSHQKKKR
.: : .:: : ::.. . : :.::. ... . .. : :. .:.
CCDS42 ADAKV-YSGYY--H------LDQKSMTGIAVGVGIALTCILICVLILIYR---SKARKSS
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pF1KE1 AACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIPRNSQDITP
:. . ::...
CCDS42 ASKTAQNGTQQLPRTSASLASGNEVGKNLEGAVGNEESLMPMIMPNSFIDAKGGTDLIIN
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CCDS10 VTWSKDGD--TLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYSCLAH-GP
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::.. :.:: . .: : :. .:: ..: ...: ..:.... .:.. ::... : .
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:.: ::.:.: : .. :.:.: ::::. ... ..:.:. :.: . : :.:.
CCDS10 PRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTRGQDVVI
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. : . : ::.::. ::::. ::: ..:.... : ...:. .: :...
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CCDS10 PWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASGEPR
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:...:..:: . :. :. . :. . .: :.:::.:::..: : :.:.: ..
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.. : ::::: :.:. .:. . ..:. : . :.
CCDS10 VRE------------------------G-LPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERP--EMHS
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... .:. : : :: ..:. :.: ...:
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:.:. ::
CCDS10 ----DTTELQVRDLEPN-------------------------------------------
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:..: : : : ..:. .: : ....:: .:. :.:. . :.:::: :: . . .
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pF1KE1 VRGYAI------------------GYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITL
:: . : : . . ... : . : . .: :. : . :
CCDS10 -SGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKL
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:::. .: .. :. .:: : : .::. :.: : .: . : ..
CCDS10 VAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTT
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::.. :::: : . . : .... . :. :::: : :::.:. .
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. .. ... .:. :..::.:. . . :.:. ..: ::.: ::.:. :.: ::..
CCDS10 GPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRL--SPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNH
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. :.:.. . :: .. ... : :: :.::. ::. : ::.:
CCDS10 TQPEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFS--------------
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:: :. . . .: : :: . . :::.: . .. ..: .:.
CCDS10 ----RLQDVIT-LQEKLSDS----------LDMHSVTGIIVGV---CLGLLCLLACMCAG
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pF1KE1 -RRTTSHQKKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLEL---KPIDKSPDPNPI
::. ... . .. :. . .. . ::. :: : .: : :: :. .
CCDS10 LRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRAR-LGPPSPPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDV
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pF1KE1 MTDTPIPRNSQDITPVDNSMDSNIHQRRNSYRGHESEDSMSTLAGRRGMRPKMMMPFDSQ
CCDS10 EDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCELPQAGPRPALTRALLPP
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CCDS43 MVHVARLLLLLLTFFLRTDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
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pF1KE1 SPKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLP--DGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQCVATVESLGT
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CCDS43 RPKIVWNKKG---KKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPR-DEAIYECVAS-NNVGE
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pF1KE1 IISRTAKLIVA-------GLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNRQP
: : ...: : :.: . :. . : .: . : .... : . : .. :
CCDS43 I-SVSTRLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLP
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pF1KE1 LLLDD---RVIKLPS---------GMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKV
. .. :. .: : : : : .. :.: : :.::. ... .:: ..: :
CCDS43 VDTSNNNGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYV
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pF1KE1 LPDPEVIS-DLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLV
:: : :. . : .: . ::: : : : .::: . : : :.. .
CCDS43 RELREVRRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDD---M
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.. . ::..:: . ...: :.: . .::: :..::.: : : : : . .. .
CCDS43 PIGRNVLELNDVRQ--SANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALP---KPPGTPVVTESTAT
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pF1KE1 IVFECEVTGKPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHN------LQVLGLVKSDEGFYQCI
. .:.: :. .. . :.. .. :: . .: :: .. .. .
CCDS43 SITLTWDSGNPEPVSYYIIQHK---PKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVV
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: :..: . ::. . . :.. ::. :::::: : ..:
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. : . :. : .:.:. : :.:: . ..:.: .: .. :.: : ::.: .
CCDS43 STTILVQWKEPE-EPNGQIQGYRVYYTMD--PTQHVNNWMKHNVADSQITTIGNLVPQKT
440 450 460 470 480
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: .:.: .. :.: :. ..: :: : :: :..: : ::: ..: : : .
CCDS43 YSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGV--PGQPLNFKAEPESETSILLSWTPPRSDT--
490 500 510 520 530 540
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pF1KE1 IQNYKLYYMEKGTDKEQDVDVS-SHSYTINGLKKYTEYSFRVVAYNKHGPGVSTPDVAVR
: ::.: : . .:: . . . :: ..::: . : ::..: . .: :.:: ....:
CCDS43 IANYELVYKDGEHGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLGASTAEISAR
550 560 570 580 590 600
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pF1KE1 TLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQITGYKIRYRKASRKSDVTETL-
:... ::: ::..: .: ::.. :::: ::: :: :.:.: .. ..: . .
CCDS43 TMQSKPSAPPQDISCTSPSSTSILVSWQPPPVEKQNGIITEYSIKYTAVDGEDDKPHEIL
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. . . :.: :.. ::: . :.: : : :: . ::. .... : : : ..
CCDS43 GIPSDTTKYLLEQLEKWTEYRITVTAHTDVGPGPES--LSV-LIRTNEDVPSGP--PRKV
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.:. . ::. ::: .: :..:. .::: . : : :..: .. .: . ..
CCDS43 EVEAVNSTSVKVSWRSPVPNKQHGQIRGYQVHYVRMENGEPKGQPMLKDVMLADAQWEFD
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. : .:.: . : .:. :... :.: : ..:. : . : .: :
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...: .: : : : . . . : ... . .. : . .. . .:
CCDS43 VINHTQMNTALIQWH----PPVDTFGPLQGYRLKFGRKDMEPLTTLEFSEKED-HFTATD
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CCDS43 IHKGASYVFR-LSARNKVGFGEEMVKEISIPEEVPTGFPQNL---HSEGTTSTSVQLSWQ
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:: .: :: :: : . : :.: . . . .: : . : :: : :..:..
CCDS43 PPVLAERNGIITKYTLLYR-DINIPLLP-MEQLIVPADTTMTLTGLKPDTTYDVKVRAHT
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::: ::.: .:::::
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