Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3662, 976 aa
1>>>pF1KE3662 976 - 976 aa - 976 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9593+/-0.00131; mu= -1.3732+/- 0.075
mean_var=363.0196+/-78.433, 0's: 0 Z-trim(108.1): 634 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.067315
statistics sampled from 9345 (10098) to 9345 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1 ( 976) 6628 659.6 9e-189
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 986) 3324 338.7 3.5e-92
CCDS86924.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 949) 3261 332.6 2.4e-90
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs109|chr7 ( 976) 2932 300.6 1e-80
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1015) 2829 290.7 1.1e-77
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1016) 2817 289.5 2.4e-77
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs109|chr3 ( 983) 2651 273.4 1.7e-72
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs109|chr7 ( 987) 2298 239.1 3.5e-62
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs109|chr3 ( 998) 1991 209.3 3.3e-53
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1037) 1850 195.6 4.5e-49
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1038) 1850 195.6 4.5e-49
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs109|chr3 ( 984) 1830 193.6 1.7e-48
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 986) 1796 190.3 1.6e-47
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 (1055) 1796 190.4 1.7e-47
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs109|chr6 ( 998) 1787 189.5 3e-47
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 987) 1771 187.9 8.8e-47
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1004) 1756 186.4 2.5e-46
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs109|chr3 ( 539) 1616 172.6 2e-42
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs109|chr1 (1005) 1598 171.1 1e-41
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs109|chr1 ( 495) 1434 154.8 4e-37
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs109|chr1 (1008) 1324 144.5 1e-33
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs109|chr3 (1130) 1303 142.5 4.7e-33
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs109|chr7 (1022) 1088 121.6 8.4e-27
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs109|chr7 ( 729) 1010 113.8 1.3e-24
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs109|chr6 ( 279) 983 110.8 4.1e-24
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs109|chr1 ( 295) 937 106.3 9.5e-23
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs109|chr6 ( 505) 760 89.4 2e-17
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs109|chr15 (1367) 761 90.0 3.7e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 491) 748 88.2 4.5e-17
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 512) 748 88.2 4.6e-17
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs109|chr15 (1366) 754 89.3 5.9e-17
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs109|chr19 (1370) 751 89.0 7.3e-17
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs109|chr19 (1382) 751 89.0 7.3e-17
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs109|chr4 ( 527) 736 87.1 1.1e-16
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 453) 731 86.5 1.3e-16
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 504) 732 86.7 1.3e-16
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 505) 732 86.7 1.3e-16
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 525) 732 86.7 1.4e-16
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 526) 732 86.7 1.4e-16
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 659) 732 86.8 1.6e-16
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 693) 732 86.8 1.7e-16
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 822) 731 86.8 2e-16
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1052) 730 86.8 2.5e-16
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 732 87.1 2.5e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1065) 730 86.8 2.5e-16
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 732 87.1 2.5e-16
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 694) 717 85.4 4.5e-16
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 752) 717 85.4 4.8e-16
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 764) 717 85.4 4.8e-16
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20 ( 488) 712 84.7 5e-16
>>CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1 (976 aa)
initn: 6628 init1: 6628 opt: 6628 Z-score: 3502.8 bits: 659.6 E(33420): 9e-189
Smith-Waterman score: 6628; 100.0% identity (100.0% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGML
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 RGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 IRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 IRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 SEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAY
910 920 930 940 950 960
970
pF1KE3 SLLGLKDQVNTVGIPI
::::::::::::::::
CCDS16 SLLGLKDQVNTVGIPI
970
>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 (986 aa)
initn: 3194 init1: 1526 opt: 3324 Z-score: 1768.6 bits: 338.7 E(33420): 3.5e-92
Smith-Waterman score: 3324; 52.3% identity (77.1% similar) in 980 aa overlap (8-969:8-976)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MELQAARACFALLWG-C-ALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNI
: :. :.: : :.... . ..::.::: .. :::::.. : ::. . .:
CCDS24 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEV-SI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 MND--MPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCK
:.. :: :.::::: .:.:::::.:. : :.:..::.:::.:::::.:: ..::
CCDS24 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 ETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRK
::::::: ::: : ... :.:::::: :: .. :. : .:::.: :.::::..:
CCDS24 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVV
::::::::.:::.::.::::.::::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::...
CCDS24 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNS--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEH
. :.:.:..:::::::::.:::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :
CCDS24 -EEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 TLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGG
. :::::: :..::::: .: :::::::::::: : . ..:.:.:. ::..::
CCDS24 SYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 REDIVYSVTCEQCWP-ESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEAR
:.:: :.:.:..: . ..: :: ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . :
CCDS24 RQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 NGVSGLVTSRSFRTASVSI--NQTEPPKVRL-EGRSTTSLSVS--WSIPPPQQSRVWKYE
:::: . . ...::.. ::. : .. : ... .: ::. : : .. . .::
CCDS24 NGVSKYNPNPD-QSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYE
420 430 440 450 460 470
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pF1KE3 VTYRKKGDSN--SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLS
: : .: :.: :: . :: . .. . : : :.:. .:.: : : : :. : : .
CCDS24 VKYYEK-DQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNT
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 -PE---GSGNLAVIGGVAV-GVVLLLVLAGVGFFIHRRR-KNQRARQSPEDVYFSKSEQL
: :.: ... :.: : :.:.:. ..: : ::: : ..:.: .. ...
CCDS24 VPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE----EKHLN
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 KPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVP
. ..::::: ::::::::: .:. :: ::. .::::.:::::: .: ::. ::.:.
CCDS24 QGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREIC
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 VAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDK
:::::::::::.::: :::.::.:::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.::
CCDS24 VAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDA
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 FLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSR
:::..::.:.:.:::::::::..:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.::
CCDS24 FLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSR
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 VLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELS
::::::::.::: ::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..:
CCDS24 VLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMS
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 NHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLK
:..:.:::..:.::: ::::: :..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.:::
CCDS24 NQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLK
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 TLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTND
. . : . : . :. : .:..::..:::..: ..: :::::..: ::.....
CCDS24 RTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQE
890 900 910 920 930 940
950 960 970
pF1KE3 DIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
:. :::. ::..: :. ... :.
CCDS24 DLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
950 960 970 980
>>CCDS86924.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 (949 aa)
initn: 3131 init1: 1463 opt: 3261 Z-score: 1735.8 bits: 332.6 E(33420): 2.4e-90
Smith-Waterman score: 3261; 52.9% identity (77.6% similar) in 954 aa overlap (8-942:8-949)
10 20 30 40 50
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CCDS86 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEV-SI
10 20 30 40 50
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CCDS86 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
60 70 80 90 100 110
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CCDS86 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
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CCDS86 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNS--
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CCDS86 -EEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPH
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CCDS86 RQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAV
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: : .: :.: :: . :: . .. . : : :.:. .:.: : : : :. : : .
CCDS86 VKYYEK-DQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNT
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: :.: ... :.: : :.:.:. ..: : ::: : ..:.: . :. .....
CCDS86 VPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLNQG--
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CCDS86 ---VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREI
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CCDS86 CVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLD
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pF1KE3 KFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
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CCDS86 AFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMS
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CCDS86 RVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
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CCDS86 SNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSL
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CCDS86 KRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQ
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.
CCDS86 E
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10 20 30 40 50 60
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CCDS58 MERRWPLGLGLVLLLCA-PLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILN
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CCDS58 GTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGC
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CCDS58 KETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTR
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CCDS58 RGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPG--PAGLVEVAGTCLPHAR
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CCDS58 ASPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCL
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CCDS58 ADTGGRQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANY
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CCDS58 GANLTYELHVLNQ-DEERYQMVLEP--RVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHE
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CCDS58 FRTSPPVSRG---LTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVD
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CCDS58 REDKLWLKP---YVDLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLP
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CCDS58 SQDCKT-VAIKTLKDTSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFM
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CCDS58 ENGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKV
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CCDS58 SDFGLTRLL-DDFDGTYETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGD
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CCDS58 KPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLL
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CCDS58 ANPHSLRTIANFDPRMTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMEC
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CCDS58 VLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
950 960 970
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10 20 30
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CCDS35 GAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSR
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CCDS35 TVMGDLGWIAFPKN-GWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRI
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CCDS35 FIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTEL
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pF1KE3 DFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPET
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CCDS35 DLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 IAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQ
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CCDS35 ITGADSSQLLEVSGSCVNHSVT---DEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQ
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280 290 300 310 320 330
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CCDS35 VCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRN
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CCDS35 AISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKN
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CCDS35 TSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKN
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:.:.::. : .. . .::. : .: . .::.. ... ..: . : : ..:. :..:
CCDS35 SISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRAR
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: : :. :. ::.: . .... ::. .:.:::.:: :. :: .. :: .
CCDS35 TAAGYGVFSRRFEFETTPVFAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGV-LLSGRRCGYS
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pF1KE3 RARQSPED--VYFSKSE-QLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAG
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CCDS35 KAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAG
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pF1KE3 EFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVI
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CCDS35 EFGEVCSGRLKLP-GKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVV
670 680 690 700 710 720
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pF1KE3 SKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAA
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CCDS35 TKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAA
730 740 750 760 770 780
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pF1KE3 RNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWS
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CCDS35 RNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWS
790 800 810 820 830 840
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pF1KE3 FGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRP
.:::::::..::::::::..:..:.::...:.:::.:::::.:.::::..:::.:: ::
CCDS35 YGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRP
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 KFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYT
:: .::..:::::: :.:::::.. . ::: : : . .:.:.::::.::: .::
CCDS35 KFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYT
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970
pF1KE3 EHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
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CCDS35 EIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
970 980 990 1000 1010
>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1016 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAA-----AAQGKEVVLLDFA
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CCDS75 GAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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CCDS75 TVMGDLGWIAFPKN-GWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRI
70 80 90 100 110 120
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CCDS75 FIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTEL
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pF1KE3 DFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPET
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CCDS75 DLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT
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pF1KE3 IAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQ
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CCDS75 ITGADSSQLLEVSGSCVNHSVT---DEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQ
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.: ::::: . : .:: :. :..::: ::. .:: .:: .: ::::::::.
CCDS75 VCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRN
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:.:.::. : .. . .::. : .: . .::.. ... ..: . : : ..:. :..:
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: : :. :. ::.: .: .:.. . ::. .:.:::.:: :. :: .. ::
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..:.:.::. ..: ... .: ..::.:::::::::::: .:. ::. ::.: ..::::
CCDS75 SKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGA
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690 700 710 720 730 740
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750 760 770 780 790 800
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:::::.:::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::::::..::::::::::
CCDS75 ARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVW
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pF1KE3 SFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARR
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CCDS75 SYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSR
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870 880 890 900 910 920
pF1KE3 PKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQY
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CCDS75 PKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRY
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930 940 950 960 970
pF1KE3 TEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
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CCDS75 TEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
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CCDS29 EHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKET
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CCDS29 FNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGF
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CCDS29 TQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRK
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CCDS29 DVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGV
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CCDS29 EKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSI
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CCDS29 EDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQ
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CCDS29 DVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKII
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pF1KE3 ADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDI
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CCDS29 TSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDM
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:..:: . : ::.: :. .:. : .. .:.
CCDS29 KKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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CCDS57 EEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKE
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CCDS57 TFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPL
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CCDS57 SKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETV---PRELVVPVAGSCVVD
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CCDS57 AV-PAPGPSPSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSC
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:: .. . :.. :.:. :.::: :: . ::: :::::. ... :....:.:.
CCDS57 QPCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSA
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CCDS57 PLESGGREDLTYALRCRECRP-GGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTF
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: : ::::.:.:. :. ..:. .. :: : :. : .:::..:..: .. :
CCDS57 EVTALNGVSSLATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAV
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pF1KE3 WKYEVTYRKKGDSNSYNVR--RTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEF
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CCDS57 LDYEVKYHEKGAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHS
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CCDS57 QYLIGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLK-APG
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CCDS57 KKESCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMEN
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CCDS57 GALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSD
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::::: ::.. . :::.: ::::::::::::::..::::::::.::.::::::::..::
CCDS57 FGLSRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGE
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pF1KE3 RPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLI
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CCDS57 RPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMI
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pF1KE3 RAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEK
: : ::: .: . .: : . . : .:.:::..::: .: : : :::. ..:
CCDS57 RNPASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFEL
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pF1KE3 VVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
: :.. .:. :::: : ::::.: :. .:.:.. : :
CCDS57 VSQISAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKP-GTPGGTGGPAPQY
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>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs109|chr3 (998 aa)
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CCDS32 RARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES-G
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pF1KE3 WDLMQNIMNDM-PIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPG
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CCDS32 WEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPN
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pF1KE3 GASSCKETFNLYYAESDLDYGTN----FQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVE
.::::::::.: :.: : .. ... ..:.::::::: : ..: .: :..
CCDS32 IPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESF--SRLDAGRV--NTK
130 140 150 160 170
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pF1KE3 ERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATV
:: :::.. :::::::: :::..:.:::..:::: :.: ::::..:.. ::. .
CCDS32 VRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIA
180 190 200 210 220 230
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