Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2155, 378 aa
  1>>>pF1KE2155 378 - 378 aa - 378 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6382+/-0.00135; mu= 14.8245+/- 0.080
 mean_var=131.3685+/-40.524, 0's: 0 Z-trim(101.2): 282  B-trim: 925 in 2/44
 Lambda= 0.111900
 statistics sampled from 5957 (6407) to 5957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.197), width:  16
 Scan time:  2.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378) 2460 409.6 2.3e-114
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372) 2416 402.5 3.1e-112
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357) 1007 175.0 8.9e-44
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369) 1007 175.1 9.1e-44
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  955 166.7 3.1e-41
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  841 148.2   1e-35
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  836 147.4 1.8e-35
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  788 139.7   4e-33
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  786 139.4   5e-33
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  786 139.4 5.4e-33
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  779 138.3 1.1e-32
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  772 137.1 2.4e-32
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  762 135.5 7.1e-32
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  760 135.2 8.9e-32
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  758 134.9 1.1e-31
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  749 133.4 3.1e-31
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  745 132.7 4.8e-31
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  734 131.0 1.7e-30
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  715 127.9 1.4e-29
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  711 127.3 2.2e-29
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  711 127.3 2.2e-29
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  689 123.7 2.5e-28
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  668 120.4 2.8e-27
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  661 119.2 5.8e-27
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  661 119.2 6.1e-27
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  645 116.6 3.4e-26
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  611 111.1 1.6e-24
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  611 111.2 1.6e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  611 111.2 1.7e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  573 105.0 1.1e-22
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  567 104.1 2.3e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  522 96.8 3.3e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  516 95.8 6.5e-20
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  503 93.7 2.9e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  490 91.6 1.2e-18
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  482 90.3 2.9e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  482 90.3 2.9e-18
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  481 90.1 3.2e-18
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  478 89.7 4.6e-18
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  477 89.4 4.8e-18
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350)  477 89.5   5e-18
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  473 88.8 7.6e-18
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  466 87.8 1.8e-17
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  465 87.5 1.9e-17
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  465 87.6 2.1e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  464 87.4 2.3e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  464 87.4 2.3e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  464 87.4 2.3e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  464 87.4 2.3e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  464 87.4 2.3e-17


>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (378 aa)
 initn: 2460 init1: 2460 opt: 2460  Z-score: 2166.8  bits: 409.6 E(32554): 2.3e-114
Smith-Waterman score: 2460; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
              310       320       330       340       350       360

              370        
pF1KE2 IRRSSMSVEAETTTTFSP
       ::::::::::::::::::
CCDS11 IRRSSMSVEAETTTTFSP
              370        

>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (372 aa)
 initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416  Z-score: 2128.5  bits: 402.5 E(32554): 3.1e-112
Smith-Waterman score: 2416; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (7-378:1-372)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77       MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMS
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCEL
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRH
          300       310       320       330       340       350    

              370        
pF1KE2 IRRSSMSVEAETTTTFSP
       ::::::::::::::::::
CCDS77 IRRSSMSVEAETTTTFSP
          360       370  

>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (357 aa)
 initn: 1007 init1: 603 opt: 1007  Z-score: 899.4  bits: 175.0 E(32554): 8.9e-44
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (28-377:1-352)

               10        20        30             40        50     
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN
                                  ..::: ...:.     :.... .  : :..::.
CCDS27                            MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ
                                          10        20        30   

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA
       : . ::: .: .. .:: :::.::.:.: :  :.::::: .:::::.::.:::.::::::
CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA
            40        50        60        70        80        90   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS
        .:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. ::  : . :: :
CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS
           100       110       120       130       140       150   

         180       190       200       210          220       230  
pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF
       :. :  ::.::..: :::.:::.... :.     :...    : ..   .. . ....::
CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF
           160       170       180         190       200       210 

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
       ..:...:. :: .::.::.::..  ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::.  . 
CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA
             220       230       240       250       260       270 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
       .  :.: .: ...: ..:: ..:  . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: : 
CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ-
             280       290       300       310       320       330 

            360       370            
pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP    
         : :  . :..:... .    : :     
CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
                 340       350       

>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (369 aa)
 initn: 1007 init1: 603 opt: 1007  Z-score: 899.2  bits: 175.1 E(32554): 9.1e-44
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (28-377:13-364)

               10        20        30             40        50     
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN
                                  ..::: ...:.     :.... .  : :..::.
CCDS27                MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ
                              10        20        30        40     

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA
       : . ::: .: .. .:: :::.::.:.: :  :.::::: .:::::.::.:::.::::::
CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA
          50        60        70        80        90       100     

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS
        .:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. ::  : . :: :
CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS
         110       120       130       140       150       160     

         180       190       200       210          220       230  
pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF
       :. :  ::.::..: :::.:::.... :.     :...    : ..   .. . ....::
CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF
         170       180       190         200       210       220   

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
       ..:...:. :: .::.::.::..  ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::.  . 
CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA
           230       240       250       260       270       280   

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
       .  :.: .: ...: ..:: ..:  . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: : 
CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ-
           290       300       310       320       330       340   

            360       370            
pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP    
         : :  . :..:... .    : :     
CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
               350       360         

>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6                 (374 aa)
 initn: 539 init1: 317 opt: 955  Z-score: 853.8  bits: 166.7 E(32554): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (26-377:13-373)

               10        20        30           40        50       
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFK
                                :   : ... ::.   ::  ..  ::: ..::.:.
CCDS52              MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFS
                            10        20        30          40     

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
         :.:: ::.::  ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: :
CCDS52 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS
          50        60        70        80        90       100     

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE2 -AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISK
        :. .:::.   :::. .:: ..:  ::::: :::.:::.:::::... : :.:.:  ::
CCDS52 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSK
         110       120       130       140       150       160     

        180       190       200       210           220       230  
pF1KE2 LSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGF
       . :. .: :....:   ....  :. ... .  :    . ..: ..  . .   ....::
CCDS52 IICLVVWGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGF
         170       180         190       200       210       220   

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
       ..::. : :::  :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::..
CCDS52 FIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLG
           230       240       250       260       270        280  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
         . .:.  : .. .  ::  :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. ..  
CCDS52 KMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK
            290       300       310       320       330       340  

              360           370        
pF1KE2 RQWSSC--RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP
        .  ::  :.     :..: ... .....:. 
CCDS52 SSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
            350       360       370    

>>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3               (350 aa)
 initn: 810 init1: 456 opt: 841  Z-score: 754.7  bits: 148.2 E(32554): 1e-35
Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (69.8% similar) in 358 aa overlap (23-377:3-349)

               10        20        30           40        50       
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFK
                             : :.. :: :  .:    : ::. .: .: :.:::.: 
CCDS30                     MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFA
                                   10        20        30        40

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
         :::.. .:.  .:: ::..::  : :.:. .: ::.:.:::::::.:.:.:::::: .
CCDS30 KVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVN
               50        60        70        80        90       100

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL
       :...::.:  .::.  :.: ..: ::: .: :::::::::.... :    .. :     .
CCDS30 AVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWI
              110       120       130       140           150      

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 SCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLL
        :  .:. : .::::.:..  .. ..    .    .   ..:.:  :. .. :::.::.:
CCDS30 ICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFL
        160       170       180       190       200         210    

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 AMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSST
        :. ::..  :::..  :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ...  .    ..
CCDS30 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
          220       230       240       250       260       270    

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 CELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSS
       :..::...:: .:: :.:  . :.::.::.:.:..:.: ..:. :  :  : .. ::  :
CCDS30 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--S
          280       290       300       310       320           330

       360       370        
pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
        ...  .: .  .: :.::: 
CCDS30 VEEFPFDSEG-PTEPTSTFSI
              340        350

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 721 init1: 416 opt: 836  Z-score: 750.2  bits: 147.4 E(32554): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 836; 37.3% identity (71.2% similar) in 354 aa overlap (27-375:5-351)

               10        20        30        40           50       
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESL---CSKKDVRNFK
                                 ...:  . ..   .: :.::.   :.:. .. : 
CCDS26                       MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFG
                                     10        20        30        

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
         ::: .::..   :::::..:::. . .:::..:::.::::::..:.::...::::.: 
CCDS26 ELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYY
       40        50        60        70        80        90        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL
       :: .::::. .::.:  .: ..:.::..... .:::::.:::.:: .   :::.:  . .
CCDS26 AADQWVFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSL--RARTLTYGVI
      100       110       120       130       140         150      

       180       190         200       210       220       230     
pF1KE2 SCVGIWILATVLSIPELLYSD--LQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVP
       . .. : .:.  :.: .:.:    .:. .    . :: .   ... ....   ..:...:
CCDS26 TSLATWSVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEIN--ILGLVIP
        160       170       180       190       200         210    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 LLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS
       :  : ::: .::::: . .: ..:::.:.:.::::.:. :  ::: :.. .:...... .
CCDS26 LGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQ
          220       230       240       250       260       270    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW
       . : . . :. : ..: .:: :.::.::..: :.: :::. ...:::   : .   : :.
CCDS26 D-CTFERYLDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKT--CRGLFVLCQY
           280       290       300       310       320         330 

         360       370              
pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP      
        .  .:  ..    . : .:         
CCDS26 CGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLHDAL
             340       350       360

>>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11                (372 aa)
 initn: 746 init1: 359 opt: 788  Z-score: 708.1  bits: 139.7 E(32554): 4e-33
Smith-Waterman score: 788; 37.2% identity (73.0% similar) in 352 aa overlap (35-377:25-370)

           10        20        30        40         50           60
pF1KE2 KPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFES-LCSKKD---VRNFKAWF
                                     :: . : .: :. ::   .   . .::: :
CCDS84       MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYN-DTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVF
                     10        20         30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
       .:. ::.: ..:..:: ::..     .. .. :.:.:..:::::.:... ::: .  .. 
CCDS84 VPVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSV
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
       .::.:. .:: ..:..:..:. . ::: ::..:::.:::.:: :.::: :.: : ...: 
CCDS84 GWVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHR-RLLSI-HITCG
           120       130       140       150       160         170 

              190       200        210          220       230      
pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAM-RCSLITEH---VEAFITIQVAQMVIGFLVPL
        ::... .:..::.:.. ....  .... ::..  :.   ..:..: .    : :::.:.
CCDS84 TIWLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPM
             180       190       200       210       220       230 

        240       250        260       270       280       290     
pF1KE2 LAMSFCYLVIIRTLLQA-RNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS
       :.:..::. ... : :: :  .:.::..: : :. .:..   ::. :.. .:.: .. ..
CCDS84 LVMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVD
             240       250       260       270       280       290 

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW
       .::.:. .: .:  .   :. ..::.::.::.: :::::.:: .:.  ::: .  .: : 
CCDS84 NTCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQL
             300       310       320       330       340       350 

         360       370         
pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP 
             ::::.: :.:..:...  
CCDS84 FPS--WRRSSLS-ESENATSLTTF
               360        370  

>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX               (368 aa)
 initn: 690 init1: 369 opt: 786  Z-score: 706.4  bits: 139.4 E(32554): 5e-33
Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (31-373:28-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
                                     :: :.: . :       : .    ::   :
CCDS14    MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
                  10        20         30         40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
       :: .::.. ..:::::: :. . .  .   . :::.::.::::: :..::::.:: .:: 
CCDS14 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160         170        
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS
       .::::  .::.  :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:.   ::: :    .
CCDS14 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
       :...: :  ....:.... . ...   .: .:.    .: .  ...: :.: :::.:::.
CCDS14 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
             180       190       200       210        220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
       :..::  :. .:: .:. .: .:......:::.: .   ::. :::.. . ...  . .:
CCDS14 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
              240       250       260       270       280       290

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pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
          .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :.  ::: .:. : :: ::
CCDS14 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
              300       310       320       330       340       350

       360       370        
pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
        :  : :: :  .:..     
CCDS14 SR--RDSSWSETSEASYSGL 
                360         

>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX               (415 aa)
 initn: 690 init1: 369 opt: 786  Z-score: 705.9  bits: 139.4 E(32554): 5.4e-33
Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (31-373:75-411)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
                                     :: :.: . :       : .    ::   :
CCDS48 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF
           50        60        70         80         90       100  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
       :: .::.. ..:::::: :. . .  .   . :::.::.::::: :..::::.:: .:: 
CCDS48 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
            110       120       130       140       150       160  

              130       140       150       160         170        
pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS
       .::::  .::.  :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:.   ::: :    .
CCDS48 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T
            170       180       190       200       210            

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
       :...: :  ....:.... . ...   .: .:.    .: .  ...: :.: :::.:::.
CCDS48 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV
      220       230       240       250        260       270       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
       :..::  :. .:: .:. .: .:......:::.: .   ::. :::.. . ...  . .:
CCDS48 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC
       280       290       300       310       320       330       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS
          .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :.  ::: .:. : :: ::
CCDS48 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS
       340       350       360       370       380       390       

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pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
        :  : :: :  .:..     
CCDS48 SR--RDSSWSETSEASYSGL 
         400       410      




378 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 15:46:16 2016 done: Sun Nov  6 15:46:16 2016
 Total Scan time:  2.200 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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