FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2155, 378 aa 1>>>pF1KE2155 378 - 378 aa - 378 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6382+/-0.00135; mu= 14.8245+/- 0.080 mean_var=131.3685+/-40.524, 0's: 0 Z-trim(101.2): 282 B-trim: 925 in 2/44 Lambda= 0.111900 statistics sampled from 5957 (6407) to 5957 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16 Scan time: 2.200 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 2460 409.6 2.3e-114 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 2416 402.5 3.1e-112 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 1007 175.0 8.9e-44 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 1007 175.1 9.1e-44 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 955 166.7 3.1e-41 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 841 148.2 1e-35 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 836 147.4 1.8e-35 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 788 139.7 4e-33 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 786 139.4 5e-33 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 786 139.4 5.4e-33 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 779 138.3 1.1e-32 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 772 137.1 2.4e-32 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 762 135.5 7.1e-32 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 760 135.2 8.9e-32 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 758 134.9 1.1e-31 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 749 133.4 3.1e-31 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 745 132.7 4.8e-31 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 734 131.0 1.7e-30 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 715 127.9 1.4e-29 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 711 127.3 2.2e-29 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 711 127.3 2.2e-29 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 689 123.7 2.5e-28 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 668 120.4 2.8e-27 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 661 119.2 5.8e-27 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 661 119.2 6.1e-27 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 645 116.6 3.4e-26 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 611 111.1 1.6e-24 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 611 111.2 1.6e-24 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 611 111.2 1.7e-24 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 573 105.0 1.1e-22 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 567 104.1 2.3e-22 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 522 96.8 3.3e-20 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 516 95.8 6.5e-20 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 503 93.7 2.9e-19 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 490 91.6 1.2e-18 CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 482 90.3 2.9e-18 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 482 90.3 2.9e-18 CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 481 90.1 3.2e-18 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 478 89.7 4.6e-18 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 477 89.4 4.8e-18 CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 477 89.5 5e-18 CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 473 88.8 7.6e-18 CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 466 87.8 1.8e-17 CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 465 87.5 1.9e-17 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 465 87.6 2.1e-17 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 464 87.4 2.3e-17 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 464 87.4 2.3e-17 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 464 87.4 2.3e-17 CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 464 87.4 2.3e-17 CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 464 87.4 2.3e-17 >>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa) initn: 2460 init1: 2460 opt: 2460 Z-score: 2166.8 bits: 409.6 E(32554): 2.3e-114 Smith-Waterman score: 2460; 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CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA : . ::: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.:::::: CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS .:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: : CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF :. : ::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....:: CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN ..:...:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. . CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL . :.: .: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: : CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ- 280 290 300 310 320 330 360 370 pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP : : . :..:... . : : CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL 340 350 >>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa) initn: 1007 init1: 603 opt: 1007 Z-score: 899.2 bits: 175.1 E(32554): 9.1e-44 Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (28-377:13-364) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN ..::: ...:. :.... . : :..::. CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA : . ::: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.:::::: CCDS27 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS .:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: : CCDS27 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF :. : ::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....:: CCDS27 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN ..:...:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. . CCDS27 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL . :.: .: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: : CCDS27 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ- 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE2 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP : : . :..:... . : : CCDS27 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL 350 360 >>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa) initn: 539 init1: 317 opt: 955 Z-score: 853.8 bits: 166.7 E(32554): 3.1e-41 Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (26-377:13-373) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFK : : ... ::. :: .. ::: ..::.:. CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS :.:: ::.:: ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: : CCDS52 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 -AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISK :. .:::. :::. .:: ..: ::::: :::.:::.:::::... : :.:.: :: CCDS52 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGF . :. .: :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....:: CCDS52 IICLVVWGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN ..::. : ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::.. CCDS52 FIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL . .:. : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. .. CCDS52 KMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE2 RQWSSC--RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP . :: :. :..: ... .....:. CCDS52 SSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM 350 360 370 >>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 (350 aa) initn: 810 init1: 456 opt: 841 Z-score: 754.7 bits: 148.2 E(32554): 1e-35 Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (69.8% similar) in 358 aa overlap (23-377:3-349) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFK : :.. :: : .: : ::. .: .: :.:::.: CCDS30 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS :::.. .:. .:: ::..:: : :.:. .: ::.:.:::::::.:.:.:::::: . CCDS30 KVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVN 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL :...::.: .::. :.: ..: ::: .: :::::::::.... : .. : . CCDS30 AVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWI 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLL : .:. : .::::.:.. .. .. . . ..:.: :. .. :::.::.: CCDS30 ICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFL 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 AMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSST :. ::.. :::.. :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ... . .. CCDS30 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 CELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSS :..::...:: .:: :.: . :.::.::.:.:..:.: ..:. : : : .. :: : CCDS30 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--S 280 290 300 310 320 330 360 370 pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP ... .: . .: :.::: CCDS30 VEEFPFDSEG-PTEPTSTFSI 340 350 >>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 721 init1: 416 opt: 836 Z-score: 750.2 bits: 147.4 E(32554): 1.8e-35 Smith-Waterman score: 836; 37.3% identity (71.2% similar) in 354 aa overlap (27-375:5-351) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESL---CSKKDVRNFK ...: . .. .: :.::. :.:. .. : CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFG 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS ::: .::.. :::::..:::. . .:::..:::.::::::..:.::...::::.: CCDS26 ELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYY 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL :: .::::. .::.: .: ..:.::..... .:::::.:::.:: . :::.: . . CCDS26 AADQWVFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSL--RARTLTYGVI 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SCVGIWILATVLSIPELLYSD--LQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVP . .. : .:. :.: .:.: .:. . . :: . ... .... ..:...: CCDS26 TSLATWSVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEIN--ILGLVIP 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS : : ::: .::::: . .: ..:::.:.:.::::.:. : ::: :.. .:...... . CCDS26 LGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQ 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW . : . . :. : ..: .:: :.::.::..: :.: :::. ...::: : . : :. CCDS26 D-CTFERYLDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKT--CRGLFVLCQY 280 290 300 310 320 330 360 370 pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP . .: .. . : .: CCDS26 CGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLHDAL 340 350 360 >>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 (372 aa) initn: 746 init1: 359 opt: 788 Z-score: 708.1 bits: 139.7 E(32554): 4e-33 Smith-Waterman score: 788; 37.2% identity (73.0% similar) in 352 aa overlap (35-377:25-370) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 KPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFES-LCSKKD---VRNFKAWF :: . : .: :. :: . . .::: : CCDS84 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYN-DTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK .:. ::.: ..:..:: ::.. .. .. :.:.:..:::::.:... ::: . .. CCDS84 VPVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV .::.:. .:: ..:..:..:. . ::: ::..:::.:::.:: :.::: :.: : ...: CCDS84 GWVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHR-RLLSI-HITCG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAM-RCSLITEH---VEAFITIQVAQMVIGFLVPL ::... .:..::.:.. .... .... ::.. :. ..:..: . : :::.:. CCDS84 TIWLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LAMSFCYLVIIRTLLQA-RNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS :.:..::. ... : :: : .:.::..: : :. .:.. ::. :.. .:.: .. .. CCDS84 LVMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW .::.:. .: .: . :. ..::.::.::.: :::::.:: .:. ::: . .: : CCDS84 NTCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQL 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP ::::.: :.:..:... CCDS84 FPS--WRRSSLS-ESENATSLTTF 360 370 >>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa) initn: 690 init1: 369 opt: 786 Z-score: 706.4 bits: 139.4 E(32554): 5e-33 Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (31-373:28-364) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF :: :.: . : : . :: : CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK :: .::.. ..:::::: :. . . . . :::.::.::::: :..::::.:: .:: CCDS14 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS .:::: .::. :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:. ::: : . CCDS14 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA :...: : ....:.... . ... .: .:. .: . ...: :.: :::.:::. CCDS14 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC :..:: :. .:: .:. .: .:......:::.: . ::. :::.. . ... . .: CCDS14 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :. ::: .:. : :: :: CCDS14 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP : : :: : .:.. CCDS14 SR--RDSSWSETSEASYSGL 360 >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 690 init1: 369 opt: 786 Z-score: 705.9 bits: 139.4 E(32554): 5.4e-33 Smith-Waterman score: 786; 38.4% identity (70.2% similar) in 346 aa overlap (31-373:75-411) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF :: :.: . : : . :: : CCDS48 SPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDY-GENES-DSCCTSPPCPQDFSLNFDRAF 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK :: .::.. ..:::::: :. . . . . :::.::.::::: :..::::.:: .:: CCDS48 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 pF1KE2 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHR--ARVLLISKLS .:::: .::. :.....:..: ::: :::.:::. ::.:.. .:. ::: : . CCDS48 QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTL----T 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 CVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA :...: : ....:.... . ... .: .:. .: . ...: :.: :::.:::. CCDS48 CLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQV-GRTALRVLQLVAGFLLPLLV 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC :..:: :. .:: .:. .: .:......:::.: . ::. :::.. . ... . .: CCDS48 MAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNC 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL-RQWSS .....: .:: .:. ..::.::.::::.:::::. .. :. ::: .:. : :: :: CCDS48 GRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS 340 350 360 370 380 390 360 370 pF1KE2 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP : : :: : .:.. CCDS48 SR--RDSSWSETSEASYSGL 400 410 378 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 15:46:16 2016 done: Sun Nov 6 15:46:16 2016 Total Scan time: 2.200 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]