FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5618, 533 aa 1>>>pF1KE5618 533 - 533 aa - 533 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8886+/-0.00043; mu= 1.1553+/- 0.027 mean_var=157.2405+/-31.930, 0's: 0 Z-trim(115.0): 156 B-trim: 982 in 3/59 Lambda= 0.102280 statistics sampled from 25097 (25254) to 25097 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 8.670 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011533253 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 560) 870 140.7 1.1e-32 XP_016875898 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 NP_758961 (OMIM: 189973) ETS-related transcription ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_016875901 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_016875900 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_016875899 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_011533252 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_005266334 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_005266333 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_016875902 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32 XP_011529609 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 595) 824 133.9 1.3e-30 XP_005262446 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 663) 824 133.9 1.5e-30 NP_001120669 (OMIM: 300775) ETS-related transcript ( 663) 824 133.9 1.5e-30 NP_001412 (OMIM: 300775) ETS-related transcription ( 663) 824 133.9 1.5e-30 XP_011529610 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 586) 822 133.6 1.6e-30 NP_001138825 (OMIM: 189973) ETS-related transcript ( 595) 779 127.3 1.3e-28 XP_005252919 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 277) 335 61.6 3.5e-09 NP_001193544 (OMIM: 605439) ETS homologous factor ( 277) 335 61.6 3.5e-09 XP_005252918 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 299) 335 61.7 3.7e-09 XP_016873023 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 298) 329 60.8 6.9e-09 XP_011518287 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09 XP_011518286 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09 NP_036285 (OMIM: 605439) ETS homologous factor iso ( 300) 326 60.3 9.4e-09 XP_005252917 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09 XP_011518285 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 303) 326 60.3 9.5e-09 NP_001193545 (OMIM: 605439) ETS homologous factor ( 322) 326 60.3 1e-08 XP_005252914 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 321) 322 59.7 1.5e-08 NP_001244097 (OMIM: 311040) ETS domain-containing ( 95) 306 57.2 2.6e-08 NP_001107595 (OMIM: 311040) ETS domain-containing ( 428) 312 58.3 5.4e-08 XP_016884828 (OMIM: 311040) PREDICTED: ETS domain- ( 428) 312 58.3 5.4e-08 NP_005220 (OMIM: 311040) ETS domain-containing pro ( 428) 312 58.3 5.4e-08 NP_001107781 (OMIM: 602191) ETS-related transcript ( 371) 309 57.8 6.5e-08 NP_004424 (OMIM: 602191) ETS-related transcription ( 371) 309 57.8 6.5e-08 NP_001239223 (OMIM: 608144) SAM pointed domain-con ( 319) 305 57.2 8.5e-08 NP_036523 (OMIM: 608144) SAM pointed domain-contai ( 335) 305 57.2 8.9e-08 XP_005249045 (OMIM: 608144) PREDICTED: SAM pointed ( 407) 305 57.3 1.1e-07 NP_001155894 (OMIM: 164720) protein C-ets-1 isofor ( 225) 294 55.6 1.9e-07 XP_005260995 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07 NP_002031 (OMIM: 600609) GA-binding protein alpha ( 454) 300 56.5 2e-07 XP_011527823 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07 NP_001184226 (OMIM: 600609) GA-binding protein alp ( 454) 300 56.5 2e-07 XP_016883802 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07 XP_011527822 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07 NP_001317380 (OMIM: 164720) protein C-ets-1 isofor ( 354) 296 55.9 2.4e-07 XP_005260992 (OMIM: 164740) PREDICTED: protein C-e ( 469) 298 56.3 2.5e-07 NP_005230 (OMIM: 164740) protein C-ets-2 isoform 1 ( 469) 298 56.3 2.5e-07 XP_016883779 (OMIM: 164740) PREDICTED: protein C-e ( 469) 298 56.3 2.5e-07 XP_016872806 (OMIM: 164720) PREDICTED: protein C-e ( 398) 296 55.9 2.6e-07 XP_011540953 (OMIM: 164720) PREDICTED: protein C-e ( 432) 296 55.9 2.8e-07 NP_001243224 (OMIM: 164740) protein C-ets-2 isofor ( 609) 298 56.3 3.1e-07 >>XP_011533253 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related tra (560 aa) initn: 979 init1: 704 opt: 870 Z-score: 707.5 bits: 140.7 E(85289): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 1026; 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